Definition Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 chromosome, complete genome.
Accession NC_004461
Length 2,499,279

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is polC

Identifier: 27467858

GI number:

Start: 942392

End: 946720

Strand: Direct

Name: polC

Synonym: SE0940

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 27467857

Following gene: 27467859

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>4329_bases
GTGGTTATTATTTTGGCAATGACAAATCGAGAAAAGTTTAAAGTGCTTGCCGATCAAATAAAAATATCAAATCAACTAGA
ACAAGATATTCTTGAACAAGGTGAACTCACTCGTATAGATGTTTCAAATAAAAACAGAACATGGACTTTCCAAATATCAC
TCCCACATTTTTTATCTCATGAAGATTATCTTCTTTTTACACATGCAATTGAAGAAGAATTTAAAGAAATAGCTACAGTA
GCAATTGATTTTTCAATTAAAGATACCAACAATCAAGATGAGTTTGCTTTAAAATATTTCGGACATTGTATTGATCAAAC
ACGATTGTCGCCAAAAGTGAAAGGTCAATTGAAACAAAAAAAACTCATTATGAGTGGAAATGTTTTAAAAGTCTTAGTTT
CAAATGACATTGAGAGAAATCATTTTGATAAGGCATGTAATGGTAGTTTGGTTAAAGCATTTAGACAGTGTGGCTTTGAA
ATTGATAAAGTCGTTTTTGAAACAGATTCAACAAATCACGATGATGACCTTGCATCGTTAGAAGCACATATTCAACAAGA
AGATGAACAAAGTGCAAGAGAAGCAACTGAAAAATTAGAAAAAATGAAAGCAGAAAAAGCGAAACAACAAGATAATAATG
AAAGTACAGTGGAAAAATGTCAGATTGGAAAACCAATTCAGATTGAAAATATAAAACCAATTGAATCAATTATTGAAGAA
GAATTCAAAGTAGCTATTGAAGGTGTTATATTTGATATTAACCTAAAAGAACTTAAAAGTGGACGTCATATAGTTGAGCT
TAAAGTTACTGATTACACAGATTCACTTGTATTAAAAATGTTTACAAGAAAAAATAAAGATGACTTGGACCACTTTAAGG
CACTTAGTGTTGGTAAATGGGTTAGAGCTCAAGGTCGTATTGAAGAAGATACTTTTGTTAGGGATCTTGTCATGATGATG
TCAGATATTGAAGAAATTAAAAAGACACCTAAACAAGATAAAGCAGAAGATAAGCGTGTAGAGTTTCATTTACATACGTC
TATGAGTCAAATGGATGGTATTCCTAATATTAGTGCATATGTTGAACAAGCTGCTAAATGGGGGCACCAAGCTTTAGCAG
TAACAGATCACAACGTAGTACAAGCTTTTCCTGATGCACATAATGCTGCCGAAAAACATGGTATTAAGATGATTTATGGT
ATGGAAGGTATGCTAGTAGACGATGGTGTTCCTATAGCTTATAAACCAACAGACCGTAATTTAAAAGATGCAACATATGT
GGTGTTTGACGTAGAGACAACAGGTCTTTCTAATCAATATGATAAAATTATTGAATTAGCTGCAGTAAAAGTGCATAACG
GTGAAATTATAGATAAGTTTGAACGTTTTAGTAATCCACACGAAAGATTATCTGAAACCATTATCAACCTTACACATATC
ACTGATGATATGTTAACTGATGCTCCCGAAATTGAAGAAGTGTTAACTGAATTTAAAGAGTGGGTTGGAGATGCTATATT
TGTAGCTCATAATGCTTCATTTGATATGGGATTTATTGACACAGGATATGAAAGGTTAGGCTTTGGACCTTCTACAAACG
GTGTAATTGATACACTTGAGCTTTCACGTACAATTAATACCGAATATGGGAAACATGGTTTGAATTTCCTTGCCAAAAAA
TATGGTGTCGAATTAACGCAACATCATAGAGCGATTTATGATACAGAAGCAACAGCTTATATTTTTATAAAAATGGTTCA
ACAAATGAAAGAACTAGGTGTGAACAACCATCTAGAAATTAATAAAAAATTAACTAATGAAGATGCATATAAAAGAGCTC
GTCCATCTCACGTTACACTCATTGTTCAAAATCAAGAAGGTCTTAAAAATTTATTTAAAATAGTTAGTGCTTCATTAGTT
AAGTATTATTACCGTACGCCAAGAATTCCACGTTCTCTTTTAAATGAATATCGAGAAGGGATCTTGATTGGTACAGCTTG
TGATGAGGGTGAATTATTCACAGCAGTAATGCAGAAGGATCAGTCGGAAGTAGAAAAAATAGCAAAGTTCTATGATTTTA
TAGAAGTTCAACCGCCTGCGCTTTATCAAGATTTAATGGATAGAGAATTAATACGAGATAATGAAACGTTAACACAAATT
TACAAGCGATTAATAGATGCTGGTAAAAGCGCTAATATCCCAGTGATTGCTACTGGTAACGCGCATTATCTATATGAACA
TGATGCTATAGCCAGAAAAATTTTAATTGCATCCCAACCAGGGAATCCATTAAATCGTTCAACATTACCAGAAGCTCACT
TTAGAACCACTGATGAAATGTTAGATGATTTTCACTTCTTAGGTGAAGAAAAAGCATATGAAATCGTTGTAACAAATACA
AATGAGCTCGCTAATAAAATTGAAAAAGTGGTTCCTATAAAAGATAAACTATTTACGCCAAGAATGGATGGGGCTAATGA
AGAAATTCGTGAGTTGAGTTATTCTAATGCGAAAAAACTATATGGTGAAGATTTACCACAAATTGTTATAGATCGCCTTG
AAAAGGAATTAGATAGTATTATTGGTAATGGCTTTTCTGTTATTTACCTCATATCTCAACGTTTGGTGAAGAAATCGCTA
GATGATGGTTATTTAGTTGGATCGCGTGGTTCAGTTGGTTCTAGTTTCGTAGCAACAATGACTGAAATTACAGAAGTTAA
TCCGCTTCCACCACACTACATTTGTTCACATTGTAAGACAAGTGAGTTCTTTGATGATGGTTCGGTTGGATCTGGATTCG
ATTTACCAGATAAAAAATGTCCTACTTGTGGTAATGAATTAATTAAAGAAGGACAAGATATCCCTTTTGAGACATTCCTT
GGATTTAAAGGAGATAAAGTTCCAGATATTGATTTGAACTTTAGTGGTGAATATCAACCTAACGCTCATAATTACACAAA
AGTATTGTTTGGTGAAGATAAAGTATTTCGTGCTGGAACAATAGGTACTGTTGCTGAAAAAACAGCTTTTGGTTTCGTAA
AAGGTTACTTAAATGATCAAGGTATTCACAAACGTGGTGCTGAAATTGATCGGTTGGTTAAAGGTTGTACAGGGGTCAAA
CGTACAACTGGTCAACATCCTGGAGGAATCATTGTTGTACCGGATTACATGGATATTTATGATTTTACACCGATTCAATT
CCCAGCAGACGACCAAAGTGCAGCGTGGATGACAACCCATTTCGACTTCCATTCAATACACGATAATGTCTTAAAATTAG
ATATATTAGGACATGATGACCCAACGATGATTCGTATGTTACAAGACTTATCAGGAATTGACCCCAAAACTATACCAGTA
GATGATAAAGAAACAATGCAAATATTTAGTGGTCCTGAGAGTTTAGGTGTTACAGAAGACGAAATATTATGTAAGACAGG
TACATTTGGTGTACCAGAATTTGGTACTGGATTTGTACGTCAAATGCTTGAAGATACTAAGCCAACGACATTCTCAGAAT
TAGTTCAAATTTCAGGTTTATCTCATGGTACGGACGTTTGGTTAGGTAATGCACAAGAGTTAATTCGTCAAGGGATATGT
GACTTATCTAGTGTGATAGGCTGTCGTGATGATATCATGGTATATCTGATGTATGCTGGACTTGAACCGTCAATGGCTTT
TAAAACGATGGAATTTGTACGTAAAGGTCGTGGCTTAACAGATGAAATGGTTGAAGCGATGAAGGAAAATAACGTGCCAG
ATTGGTATTTAGATTCTTGTCGTAAAATTAAATATATGTTCCCTAAAGCTCATGCCGCTGCTTATGTACTGATGGCTGTA
AGAATTGCATACTTTAAAGTACATCATCCACTATATTATTATGCAGCATACTTTACCATAAGAGCTTCCGATTTTGACCT
TATAACAATGATTAAAGATAAAACGAGTATTCGTAATACAGTTAAAGATATGTATTCACGATATATGGATTTAGGGAAAA
AAGAGAAAGATGTATTAACTGTATTAGAAATAATGAATGAAATGGCGCATCGAGGTTTTCGATTGCAACCGATTAGTTTA
GAAAAAAGCCAAGCTTTTGACTTCATCATTGAAGGGGATACATTGATTCCTCCATTCATTTCAGTGCCAGGACTTGGAGA
AAACGTTGCACAAAGAATTGTTGAAGCGAGAGAAGAGGGACCATTTTTATCCAAAGAAGATTTAAATAAAAAAGCCGGCT
TATCTCAAAAGGTTATTGACTATTTAGATGAATTAGGCTCATTGCCAGATTTACCTGACAAGGCACAATTGTCGATATTT
GATATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATCAGTAGTATAATATGAAACGAATTTATTTAGTGACTTTATGAGCAGTTGTAACATATCCAATGATGTTTAATAGTTT
TAAATTTAGTATTAATTAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCATTTCTAATTACTAAATTGATATCATATATGTTCAATCATCTTTATTAGTAACCCTATATCAGTTTGTTTACTTATTA
GACTTGTGATATACTAAATA

Product: DNA polymerase III PolC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1442_residues
MVIILAMTNREKFKVLADQIKISNQLEQDILEQGELTRIDVSNKNRTWTFQISLPHFLSHEDYLLFTHAIEEEFKEIATV
AIDFSIKDTNNQDEFALKYFGHCIDQTRLSPKVKGQLKQKKLIMSGNVLKVLVSNDIERNHFDKACNGSLVKAFRQCGFE
IDKVVFETDSTNHDDDLASLEAHIQQEDEQSAREATEKLEKMKAEKAKQQDNNESTVEKCQIGKPIQIENIKPIESIIEE
EFKVAIEGVIFDINLKELKSGRHIVELKVTDYTDSLVLKMFTRKNKDDLDHFKALSVGKWVRAQGRIEEDTFVRDLVMMM
SDIEEIKKTPKQDKAEDKRVEFHLHTSMSQMDGIPNISAYVEQAAKWGHQALAVTDHNVVQAFPDAHNAAEKHGIKMIYG
MEGMLVDDGVPIAYKPTDRNLKDATYVVFDVETTGLSNQYDKIIELAAVKVHNGEIIDKFERFSNPHERLSETIINLTHI
TDDMLTDAPEIEEVLTEFKEWVGDAIFVAHNASFDMGFIDTGYERLGFGPSTNGVIDTLELSRTINTEYGKHGLNFLAKK
YGVELTQHHRAIYDTEATAYIFIKMVQQMKELGVNNHLEINKKLTNEDAYKRARPSHVTLIVQNQEGLKNLFKIVSASLV
KYYYRTPRIPRSLLNEYREGILIGTACDEGELFTAVMQKDQSEVEKIAKFYDFIEVQPPALYQDLMDRELIRDNETLTQI
YKRLIDAGKSANIPVIATGNAHYLYEHDAIARKILIASQPGNPLNRSTLPEAHFRTTDEMLDDFHFLGEEKAYEIVVTNT
NELANKIEKVVPIKDKLFTPRMDGANEEIRELSYSNAKKLYGEDLPQIVIDRLEKELDSIIGNGFSVIYLISQRLVKKSL
DDGYLVGSRGSVGSSFVATMTEITEVNPLPPHYICSHCKTSEFFDDGSVGSGFDLPDKKCPTCGNELIKEGQDIPFETFL
GFKGDKVPDIDLNFSGEYQPNAHNYTKVLFGEDKVFRAGTIGTVAEKTAFGFVKGYLNDQGIHKRGAEIDRLVKGCTGVK
RTTGQHPGGIIVVPDYMDIYDFTPIQFPADDQSAAWMTTHFDFHSIHDNVLKLDILGHDDPTMIRMLQDLSGIDPKTIPV
DDKETMQIFSGPESLGVTEDEILCKTGTFGVPEFGTGFVRQMLEDTKPTTFSELVQISGLSHGTDVWLGNAQELIRQGIC
DLSSVIGCRDDIMVYLMYAGLEPSMAFKTMEFVRKGRGLTDEMVEAMKENNVPDWYLDSCRKIKYMFPKAHAAAYVLMAV
RIAYFKVHHPLYYYAAYFTIRASDFDLITMIKDKTSIRNTVKDMYSRYMDLGKKEKDVLTVLEIMNEMAHRGFRLQPISL
EKSQAFDFIIEGDTLIPPFISVPGLGENVAQRIVEAREEGPFLSKEDLNKKAGLSQKVIDYLDELGSLPDLPDKAQLSIF
DM

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: COG2176

COG function: function code L; DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type)

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA