Definition Shewanella oneidensis MR-1, complete genome.
Accession NC_004347
Length 4,969,803

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Identifier: 24372022

GI number:

Start: 444828

End: 449303

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: SO_0427

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 24372021

Following gene: 24372023

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>4476_bases
ATGAAAAAAATAATAATTCACTTCCTTTTGGCATCTATGTTGGTTTTCTGCTCTGGTCTGTATTCAGCTTGGGCTGGTAA
TTTTGTGCAGCGGGTTTTTACCGATAGGGACGGACTTGAAGCAACCAGTATTCGAGCGCTCACACTCGATGACCATGGCT
TTATCTGGGCGGCAACGGAGCAAGGTTTATATCGAGTTAGTAATTCTAAAGTGAGGCGGATTGATAAAACCGGTTCCGAG
TTACGCCTTGCCGATGAGTTTATAACGACCGTCGTCAATATTGATCGAGATTTATTGTTGCTGAGTACCAATGCGGCAAC
CTATCTGTATAACATCGCCAAAAATCAGTTTATTCAAATGGGTTCGCCCAATTTATTCCCACATTTTTCAGGTGGCGTGT
TAATTTCTGCTGTTCGTAAAAATGCCCAAGAATGGCGCTTGTTGATTGATAACGGCCAGATTTACGATTTATCGACCGCA
ACGTTAACCTTAACCTTAGTCACTCAGTTACCCGTTAATCGTGATTTACCTTGGCGCAAGTTGCTGAGCATGCCGGATGG
TCAGATCCTTGTCGCAGGGCAATTCCAATTGTTGCTTCTTAATCACTTGGGGGAAAAGCTAGTTGATTATCAATGGACTG
AGTCCATGGGTAACATTCTGGATATGCTTGAGGATTCAAAGCAGCGCATTTGGATTGCGACCAGTCGAGGCGTTTATCGA
TTTGAACCTCAGACCTTGCAGATTTCGCCAGTGCCTGAATTACCGGATTGGAGCACGGCTATGGTTGAAGACCGTCATGG
TGAGATTTGGTTTTCAAGCCGCGCGGGATTATTGAAGTGGTCACCAGATACTCATCAGCTTGAAAATTATCAACAAGAGC
TTAAGGCTCAAGCCAATATGGAAACATTAAAGGCAATCTTGTTTGATAAATCAGGTTTGATGTGGGTCGGTGGTTCTGGA
GATGGTTTAGCTTTACTGGCTTCACAGCCGGATTTCATTCTCGACACTTTCACCAGTGAACCGCCCCATGAATTATCGGA
TGCTATGGTATGGTCGGTGTTTGCAAGTGATGAAGGGTTATGGTTTGGTGCTTCACACCTCAGCTTTATCGCTCGAAATA
GCCAAAAAGCCGTGACCATAGACATTGATGGATTAAAGCCCCATGAGAGTATCTATGGGATCAGTGATTTTATTGATCAC
TACTTATTAGTTTCTACCACCAGTGGTTTGTTTGTTGTGGATAAGCTGACCTTAAAAGGGAGCAGTTTTGCCCAGTGGGC
GCATGGAAGTGAAGCATTTAAAAATAAAGTCATCTATGGCACCTATGCCGATCCCAAGCTAAAAGGACGATTTTGGATTG
CATCGGCTACGGGCCTGTATTTTTGGGAGCAGGGGCTATTTGAGCCGCAGCCTTTTAACATTGATGGGCCAACGGGGGAT
GATTCGCCTGAGCTCAAGCGGCCAACAATCCGTACTTTGTATCGTGCTTCCGATGGTAAGTTATGGATAAGTGGACGAAA
AGTTTTTGGTTATATTGACGAGCAAAATCTTTTCCATGATCAAAGGCAATTGTTTAGCGGCTTAAATTCTGAGCCGTCAA
TTAGTCATCTTGAAGAAATATCTCCCGGAGTGATGTGGTTTGGCTCCTACGAGAGGGGCTTATTCGAGTACCACCTCCAA
GATGGCAAACTTGTTTCACTCACTTTACAGTGGCAAGTTAACTGTAGTTCAGTGTTTTTCATACAAAAGACCACTAATGC
CAACATAGTGGCCTGCGCTGATTCGCTTATTCGCCAAGATAGGGCGTCTGGGCAAATCGCGATGTTTACTCAGCTTGATG
GCCTGATTTCTAACGAGATGAATGAAGGCGCCTATTTTTACTCTCCAGGGGCTGGATTATATATTGGTACGCCAGAAGGG
GTGATGCATCTCGATGCCGATAAGCTGACGAACCGCATTGCTGATGATCATGTGATGTTAGAGTCGGTATCGGTTTATTA
CGACAATAACACCCAAGTCTCACTATTGCCTCAGCCCATGATGGTGATTAAACCTGGCGCCAATATGGTGAGTCTGCAAA
TTACCAATTTGGATTACCTTGATGATTCTCCTATTCAATTTAAATATCGGCTTAGATACCAAGGTGACGAAGATAACTAT
GTACTCCTTCAGGGGGAATCGCAGATTAACCTTGCAGGTTTAGCTGCTGGGGAATATGTACTTGAGGTCTTAAGCCAAGT
TAACGGTATTTGGTCGGATAAGCCCTTCACCTTTCCTTTCTATGTTGAGCAGCATTGGTGGCTCTCTCAAGGATTTAAAG
GCATCTTGCTGTTAGTCTTTTCGATTATTGCACTGGGTTTAGCTTGGTACCGCCAGCGTCAGGTTCGCACCTTTATGGCC
ATGAACCAAGCGTTAACCGAAAGTGATGATCGCCTCAGACAATCGTTACGGGGCAGTGACTCGGATTTGTGGGAATGGCA
CAGGGATACCCAGTGTTTTTACCTCGATAACCGCGGTTATGTATTGGGAAACCATGCAAACGAAATTGTACTTACCCTTG
AAACGCTTCCCGTTCATCCTTTGGATCGAGAAAAAGTGCTTATACAGTGGAATCGTATGTTAAGTGGTGACCTCGATCGA
TTTGAAGCCGAATATCGCTATCATCGCAGAGATGGCAATTGGGGGTGGTTGCGGGTGCGTGGGCGTCCTGTGGCTCGCAA
TAAACAGACTCAGGAAATTGAGCGGGTTGCGGGGATTTATAGTGATATTACCCTACGACGTCAGCTTGAAGATGAGGTAA
GCCTCTTAGCCCAAGCATTTGAAAATACATCTGAAGGTGTGTTGATTTTAGATGTGGATGAAAATATTCGAGTTGCCAAC
CATGCCGCACAGCACATTATTGGCTCTGAACAAAAGAGTCTTGTCGGCTTATCGTTTTCGCAGTTTGTCCAAATGAAAGA
TGGATTGTCTACTGAGGTGGCCCAGTTGCTTGGTCAGGAAACCTCATGGACGGGGGAACGTGAGTTAGTGGGGCAAAATG
GCTTGGTATGTCCAGTGTGGCTTAACGTGTCAGTGATGCAGTCAGTGAATCAAAATGCCATTCATTATGTAGTTGTATTT
TCTGATATTACCGAGCGTAAGCGTACAGAGGCGGATCTTAGACGTCTGGCCAATTACGATGTATTAACAGGGCTACCTAA
TCGCTCTTTATTCTCGAATCGGTTGATGCAATCGATACAAGCGGCGGAGCAAAACGGTGAAAAATTAGCGTTATTGTTCC
TTGACCTCGATAGATTTAAGCATGTGAATGACTCCTATGGCCACAGTATGGGGGATGCACTCTTAGTTGAGGCATCAAAT
CGGCTACAGTCTTGTATCGGGAGTGAGCATTTACTCTGTCGTTTTGGCGGTGATGAGTTTGTTATTTTATTAAAGAATGT
CAAAGAATTATCCGATATCAACCATTTGGCTGAGCAGCTACTCGCACAAATCGTAGCCCCCTTTAGGTTGTTTGGTCGCG
AGTTTTACATTTCAACCAGTATTGGGATCAGTATTTGGCCCGATGATGCAATGCAGCCAGAAGCCTTCATTAAAAATGCG
GATCTGGCCATGTATCACGCCAAGGAGGAAGGGCGCGGTAACTTCAAATATTATTCATCAGAGCGTAATGCCCAAGCGTT
ATACCATTTACGGCTAGAGGCCGATTTACGTAAAGCGATAGAGCGGCAAGAATTTGAACTGTATTACCAACCACAAATTG
ATATTTTGCGGGGGGATAAATTTATTGGGATGGAAGCGCTCATTCGCTGGCAGCATCCCGTCGATGGCTTTGTTCGCCCG
GATATTTTTATTAAAGTTGCTGAAGCTTGTGGTTTAGTCGTTGATATTGATCGCTGGGTCTTGCGCTGTGCGTGTTTGGA
TGGGGCAAGATGGGCTAAACAAACGATAGAGCCGTTTAAAATGTCGGTTAACATTTCAGCCGTGCATTTCCGTCAACCCG
ACTTTATTGACGGTGTAAAGAAAATACTTGATGCTACCCACATGCCAGCTTCGTCTTTGTGTTTAGAAATTACTGAAGGG
GTATTAATGAAAGAGTTGCAAGTGGCCAAGACCCATTTAAAGCAACTTGATGACCTAGGAATTGAAGTTGCGATTGACGA
CTTTGGTACTGGATACTCCTCTTTAGCTTATTTGCGTAATTTTGAAGTGGATACACTTAAAATTGACCGTTCGTTTTTGA
TCGATATCGCCTCAAATGGTGCAGATCAGGCTATTGTGAGCAGTATTATTGAGCTGGCGCGTAATTTAAAGTTAACCGTT
ATCGCTGAAGGGGTTGAGACCGTAGAACAGTTAGAGCAGCTTTTTAGCCGTGGCTGTTATATTGTTCAGGGATATTATTT
TGCTAAGCCTATGTCTGTCAGTGATTTTGAGAAATATCTACAGTCGCAGTATCCGCTTGATTCATTGCAATCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTATTGCCTAAGTAAAGATGTGACGTTAATGTGAATGTGTGAGTGTATTCAGGCTGTTGAACTGTTACTGTACAACTAT
GGTGTGAAGTAAGTCGTCAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTGCAATTTTAGCTGGTTTAATTGTACTTCATCTATCTAGGTTAATACTCAAGGATGAAACCTTTCAATCATCCGATTG
ATAGGTGGGTCTTAAGCGGA

Product: sensory box protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1491_residues
MKKIIIHFLLASMLVFCSGLYSAWAGNFVQRVFTDRDGLEATSIRALTLDDHGFIWAATEQGLYRVSNSKVRRIDKTGSE
LRLADEFITTVVNIDRDLLLLSTNAATYLYNIAKNQFIQMGSPNLFPHFSGGVLISAVRKNAQEWRLLIDNGQIYDLSTA
TLTLTLVTQLPVNRDLPWRKLLSMPDGQILVAGQFQLLLLNHLGEKLVDYQWTESMGNILDMLEDSKQRIWIATSRGVYR
FEPQTLQISPVPELPDWSTAMVEDRHGEIWFSSRAGLLKWSPDTHQLENYQQELKAQANMETLKAILFDKSGLMWVGGSG
DGLALLASQPDFILDTFTSEPPHELSDAMVWSVFASDEGLWFGASHLSFIARNSQKAVTIDIDGLKPHESIYGISDFIDH
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DSPELKRPTIRTLYRASDGKLWISGRKVFGYIDEQNLFHDQRQLFSGLNSEPSISHLEEISPGVMWFGSYERGLFEYHLQ
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VLLQGESQINLAGLAAGEYVLEVLSQVNGIWSDKPFTFPFYVEQHWWLSQGFKGILLLVFSIIALGLAWYRQRQVRTFMA
MNQALTESDDRLRQSLRGSDSDLWEWHRDTQCFYLDNRGYVLGNHANEIVLTLETLPVHPLDREKVLIQWNRMLSGDLDR
FEAEYRYHRRDGNWGWLRVRGRPVARNKQTQEIERVAGIYSDITLRRQLEDEVSLLAQAFENTSEGVLILDVDENIRVAN
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RLQSCIGSEHLLCRFGGDEFVILLKNVKELSDINHLAEQLLAQIVAPFRLFGREFYISTSIGISIWPDDAMQPEAFIKNA
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VLMKELQVAKTHLKQLDDLGIEVAIDDFGTGYSSLAYLRNFEVDTLKIDRSFLIDIASNGADQAIVSSIIELARNLKLTV
IAEGVETVEQLEQLFSRGCYIVQGYYFAKPMSVSDFEKYLQSQYPLDSLQS

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: COG5001

COG function: function code T; Predicted signal transduction protein containing a membrane domain, an EAL and a GGDEF domain

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA