Definition Kosmotoga olearia TBF 19.5.1, complete genome.
Accession NC_012785
Length 2,302,126

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The map label for this gene is 239617889

Identifier: 239617889

GI number: 239617889

Start: 1628103

End: 1629659

Strand: Direct

Name: 239617889

Synonym: Kole_1517

Alternate gene names: NA

Gene position: 1628103-1629659 (Clockwise)

Preceding gene: 239617888

Following gene: 239617890

Centisome position: 70.72

GC content: 40.33

Gene sequence:

>1557_bases
ATGAACGATCTCTTGTTGCTTTTGAAATACAGGTTTCGAAACACCGGTTTCAGTAAGAATCGTGGAAAAAGGTCCGGAAA
ATTATGGGGCATCTGGTTCAACTTTATCATTCTTATAATGGCATTTGGTGTACCGCTTTTTCCTGTGGCACTGACAACTT
TCGAAAAACTCTCAGCGTTTTCTGTTGCCTCTGGATTTAATATGGCCGATGTCTATTTTTCAGTTCTTTCTCTCGTGATG
CTTACGATGGCAGCGATGAATTTTATTCCTTACCTATTGTACAGCTTTTACGATTGGGAAGAACTGCATTTTCTAATGGG
ATTACCGATCAGGCGCAGCACCATATTCTTTTATAAATGTACGGAAGCCTTCATAGGCACTTTTATGTCATTTGCCATTT
ATCTTCCAATTGCTGCAGCCTATGGATATTCCCGGAGAACAGCTGGTCTTGTTCTCGCAATTCCGGCTGCATTTCTGGGA
TTTGCCTTTGTGTTAGGGATTTCTCTCTTTATTTCGGCTCTGCTTACTTCAAGGATATCCAGAGCCATGGCAAAACGTAT
GAACGGGATCGTGATTCTTCTCAACGCGGGTGTTTTTCTTTTATTGTTGAATCTTCTCTCGGGAGAGGCTTTGAACGGAG
AAACACTGTATAAGATGATAAATCTTGGACTCAATAGATTCCTTCCTTCAACATGGCTTATGAAAGCCACCAAAGGCGGG
TTATTGGAATGGGTTTTCCTGTTTCTTTTTACTTTATGGTTATTCAGAATAGCAACGAGGATCTCTTCAGCGAATTTTTA
TGAACCATCGCATTCTAAGGTCAACAGCCAAAGAGCAGCTAAAGCACGAAAAATAGGGTTGTTGAAAAAAGAATGGCTCA
TTATGATGCGCAGTGAACACGCCGCTTTTTTTCTTCTATATCCGGTTGCTTTTTCTGCTATTATGCTGGTAACAACAAAG
AACTTTTTGAGTGCCACTCTTTTCATGGTTATGATAGCTGCCTTTTATTCTTCACAGATGGTGATAATAAGCCTATCTTC
CGAATTTCAAGCCTGGCCTTTGCCTTTTATACTGCCGGTGAACTTCAAAAAGGTCGTTAGAAGCAAGATATTCATCGTTT
CCGGGATGTTCAGCGTACTTTACTCCATTATCGTTATTTTCTCGATTTTCTATATACAGCTTTCTATATTATTACTGTTC
ACGATTGTGGCTGCGATGACGACCTTTTACATCTCTTCCGCTCTTGGTGCAACGCTTTATATGACCTCGGGAGCATATCG
ATCCGGTGCACATAAAAGAAGGCTTGGCTTTTCTGCCACGCTTCTTCTTGAAATCTTAACCTTTGTTACCGGGGCTGGTA
ATATCATAGTTCTGGCGTTGTATATGCAATCACGCACAGACGCCATGATGAAAGAAACACTTTTGAGGTTTTTGAAAAGC
GAGCTTTTGCTGAATACGCTTGGAGTTTCAATTCCTTTGGTTGTTTCTGTTATTGGTATAATTTGGGTTACAAGGTGTAT
TAATAAAGAATTGGATAAGCTTAAAGAAGGGAAGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCCGGCGATAAAAAGTCAAGTCTGGAAGACCTTTTCCTGGAACTCACCGGTGGTAACGAATTCAAAGATATAATCGATC
AGCTCGGAGAGTGATATGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAAAATGCAGGTTTCGCTTGAACAGTTACTTTCTGCTTTGATAGCAAAGGTCGATGCCCTTGAAGCAAGTGTGGATGAT
TTAAGGGTTCGAACAAATAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 518; Mature: 518

Protein sequence:

>518_residues
MNDLLLLLKYRFRNTGFSKNRGKRSGKLWGIWFNFIILIMAFGVPLFPVALTTFEKLSAFSVASGFNMADVYFSVLSLVM
LTMAAMNFIPYLLYSFYDWEELHFLMGLPIRRSTIFFYKCTEAFIGTFMSFAIYLPIAAAYGYSRRTAGLVLAIPAAFLG
FAFVLGISLFISALLTSRISRAMAKRMNGIVILLNAGVFLLLLNLLSGEALNGETLYKMINLGLNRFLPSTWLMKATKGG
LLEWVFLFLFTLWLFRIATRISSANFYEPSHSKVNSQRAAKARKIGLLKKEWLIMMRSEHAAFFLLYPVAFSAIMLVTTK
NFLSATLFMVMIAAFYSSQMVIISLSSEFQAWPLPFILPVNFKKVVRSKIFIVSGMFSVLYSIIVIFSIFYIQLSILLLF
TIVAAMTTFYISSALGATLYMTSGAYRSGAHKRRLGFSATLLLEILTFVTGAGNIIVLALYMQSRTDAMMKETLLRFLKS
ELLLNTLGVSIPLVVSVIGIIWVTRCINKELDKLKEGK

Sequences:

>Translated_518_residues
MNDLLLLLKYRFRNTGFSKNRGKRSGKLWGIWFNFIILIMAFGVPLFPVALTTFEKLSAFSVASGFNMADVYFSVLSLVM
LTMAAMNFIPYLLYSFYDWEELHFLMGLPIRRSTIFFYKCTEAFIGTFMSFAIYLPIAAAYGYSRRTAGLVLAIPAAFLG
FAFVLGISLFISALLTSRISRAMAKRMNGIVILLNAGVFLLLLNLLSGEALNGETLYKMINLGLNRFLPSTWLMKATKGG
LLEWVFLFLFTLWLFRIATRISSANFYEPSHSKVNSQRAAKARKIGLLKKEWLIMMRSEHAAFFLLYPVAFSAIMLVTTK
NFLSATLFMVMIAAFYSSQMVIISLSSEFQAWPLPFILPVNFKKVVRSKIFIVSGMFSVLYSIIVIFSIFYIQLSILLLF
TIVAAMTTFYISSALGATLYMTSGAYRSGAHKRRLGFSATLLLEILTFVTGAGNIIVLALYMQSRTDAMMKETLLRFLKS
ELLLNTLGVSIPLVVSVIGIIWVTRCINKELDKLKEGK
>Mature_518_residues
MNDLLLLLKYRFRNTGFSKNRGKRSGKLWGIWFNFIILIMAFGVPLFPVALTTFEKLSAFSVASGFNMADVYFSVLSLVM
LTMAAMNFIPYLLYSFYDWEELHFLMGLPIRRSTIFFYKCTEAFIGTFMSFAIYLPIAAAYGYSRRTAGLVLAIPAAFLG
FAFVLGISLFISALLTSRISRAMAKRMNGIVILLNAGVFLLLLNLLSGEALNGETLYKMINLGLNRFLPSTWLMKATKGG
LLEWVFLFLFTLWLFRIATRISSANFYEPSHSKVNSQRAAKARKIGLLKKEWLIMMRSEHAAFFLLYPVAFSAIMLVTTK
NFLSATLFMVMIAAFYSSQMVIISLSSEFQAWPLPFILPVNFKKVVRSKIFIVSGMFSVLYSIIVIFSIFYIQLSILLLF
TIVAAMTTFYISSALGATLYMTSGAYRSGAHKRRLGFSATLLLEILTFVTGAGNIIVLALYMQSRTDAMMKETLLRFLKS
ELLLNTLGVSIPLVVSVIGIIWVTRCINKELDKLKEGK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58360; Mature: 58360

Theoretical pI: Translated: 10.65; Mature: 10.65

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.6 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.6 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNDLLLLLKYRFRNTGFSKNRGKRSGKLWGIWFNFIILIMAFGVPLFPVALTTFEKLSAF
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SVASGFNMADVYFSVLSLVMLTMAAMNFIPYLLYSFYDWEELHFLMGLPIRRSTIFFYKC
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEECCEEEEEEH
TEAFIGTFMSFAIYLPIAAAYGYSRRTAGLVLAIPAAFLGFAFVLGISLFISALLTSRIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RAMAKRMNGIVILLNAGVFLLLLNLLSGEALNGETLYKMINLGLNRFLPSTWLMKATKGG
HHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCC
LLEWVFLFLFTLWLFRIATRISSANFYEPSHSKVNSQRAAKARKIGLLKKEWLIMMRSEH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC
AAFFLLYPVAFSAIMLVTTKNFLSATLFMVMIAAFYSSQMVIISLSSEFQAWPLPFILPV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEECC
NFKKVVRSKIFIVSGMFSVLYSIIVIFSIFYIQLSILLLFTIVAAMTTFYISSALGATLY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
MTSGAYRSGAHKRRLGFSATLLLEILTFVTGAGNIIVLALYMQSRTDAMMKETLLRFLKS
EECCCHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELLLNTLGVSIPLVVSVIGIIWVTRCINKELDKLKEGK
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MNDLLLLLKYRFRNTGFSKNRGKRSGKLWGIWFNFIILIMAFGVPLFPVALTTFEKLSAF
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SVASGFNMADVYFSVLSLVMLTMAAMNFIPYLLYSFYDWEELHFLMGLPIRRSTIFFYKC
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEECCEEEEEEH
TEAFIGTFMSFAIYLPIAAAYGYSRRTAGLVLAIPAAFLGFAFVLGISLFISALLTSRIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RAMAKRMNGIVILLNAGVFLLLLNLLSGEALNGETLYKMINLGLNRFLPSTWLMKATKGG
HHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCC
LLEWVFLFLFTLWLFRIATRISSANFYEPSHSKVNSQRAAKARKIGLLKKEWLIMMRSEH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC
AAFFLLYPVAFSAIMLVTTKNFLSATLFMVMIAAFYSSQMVIISLSSEFQAWPLPFILPV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEECC
NFKKVVRSKIFIVSGMFSVLYSIIVIFSIFYIQLSILLLFTIVAAMTTFYISSALGATLY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
MTSGAYRSGAHKRRLGFSATLLLEILTFVTGAGNIIVLALYMQSRTDAMMKETLLRFLKS
EECCCHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELLLNTLGVSIPLVVSVIGIIWVTRCINKELDKLKEGK
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA