| Definition | Kosmotoga olearia TBF 19.5.1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012785 |
| Length | 2,302,126 |
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The map label for this gene is 239617112
Identifier: 239617112
GI number: 239617112
Start: 767214
End: 768593
Strand: Direct
Name: 239617112
Synonym: Kole_0715
Alternate gene names: NA
Gene position: 767214-768593 (Clockwise)
Preceding gene: 239617111
Following gene: 239617113
Centisome position: 33.33
GC content: 39.28
Gene sequence:
>1380_bases TTGGAAAATGAGTCGTTTGTCCAAACAAAAAAATTATCGATCCTGGAAGGGATCGCTTTTAATGGCGTATTTATACTAAC GCAGGGCTTCCTCCTAACGGGGTTGGCCCTGCAATTTAACGTTTCGGAGAAAATTCTCGCAATTCTCGGTGTTATTCCTA TGCTATCCCAAATGTTCCAGATACTCTCTCCAAAGCTCTTGAGACTCGCCAAAAGTAGAAAGAAAGCGATGCTCATTTCA GCTTCAATCTCGAGACCTTTGTTCCTCATTATCCCAATTCTGCTCACGCTTAATTTGAGAAATCAATATCTCCTCCTTTT GATAATGTTGGTATTCGGAGCTTTTAACAGCCTCACAGGAAATTTCTGGGTATCCATTATGAGAGATATCGTATCCCAGG AATCCTCTGGAAGGTTCTTTGGAGTTAGAAACCTGTTGATCTCGCTGTTTTCTATGGTAATGATTTATTTTTATTCCTGG ATAATCGACAGTATGGGAGAATCTGCAGGATTCATAACTATTACTATAATAGGAAGTATATTTTCTCTCAGTTCTTATTT TATGCTCAGGAAATATGAAGATCCTCCCAAAAAGGAGTACCTTACTGGTAACATATTTAAAGAAGCTTTTTCAGACGAAA ATTTCAAAAAGTTCATCATTTTCTCCTTCTTCTGGAATTTCACCATAGCTATTAGCGGTCCGTTTTTTTCCTATCACCAG ATCGTCAACCTGAAACTCGACTATTCCTATATGAGTATCCTTGCTTTCATAGCCACTGGTATATCTATGGTTTTTTACAT AATATGGGGAAAGATTTCTGACAAAATAGGCCATCAGAGCGTAGCAGAATTTTCGGTTTTCCTTGCTTCGCTAGTTTCTT TTATTTGGGTATTCATGAATCCCCTAACCCAGGGCTATCTCCTGGTAATTGATGCTTTTATAACCGGACTTGCCTGGAGC GGGATCAACTTAACACTATTCACTATAATGCTTGGAATAGTTAACCCCGGAAATGTAGAAGCTTATTTTGCCGTACTGTC GCTTACTAACGGCATAGGAGCATTGACAGGCTCTTTGATCAGTGGGCTTTCCGCGACTCTTCTAAAAGATATCTACTTCG AAATCGGCGGAATGCCGTTTTACGGGATACAATTTCTTTTCCTCACAAGTGGTATATTGCGTGCAATTTCATGGCTTCTC CTCAAAAAGGTTAAAACCAGAAAAGAAGTATCTGTTCCGGGGTACTTTTTCAACGCCCTGTACATCGTTGGCAGAAGGGC AGTATCACGTCCTTACGAATACGCCTCTATCTTAGCCAAAACAGGAAGACAGCTAAAAAAGAAGATTTTTAAGAAAAAAT CTATCAAACCACAAAAATAA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GTTAATCGCTCTAAATTATTCTTGCCAATTTTCCATGATCAATACAAACCCTCTTACTTTTTTGATTTGACAGTAAAATG TGCTAAAATATAGGTAACCC
Product: major facilitator superfamily MFS_1
Products: NA
Alternate protein names: Facilitator Superfamily Protein; Facilitator Family Transporter; Transporter Facilitator Family
Number of amino acids: Translated: 459; Mature: 459
Protein sequence:
>459_residues MENESFVQTKKLSILEGIAFNGVFILTQGFLLTGLALQFNVSEKILAILGVIPMLSQMFQILSPKLLRLAKSRKKAMLIS ASISRPLFLIIPILLTLNLRNQYLLLLIMLVFGAFNSLTGNFWVSIMRDIVSQESSGRFFGVRNLLISLFSMVMIYFYSW IIDSMGESAGFITITIIGSIFSLSSYFMLRKYEDPPKKEYLTGNIFKEAFSDENFKKFIIFSFFWNFTIAISGPFFSYHQ IVNLKLDYSYMSILAFIATGISMVFYIIWGKISDKIGHQSVAEFSVFLASLVSFIWVFMNPLTQGYLLVIDAFITGLAWS GINLTLFTIMLGIVNPGNVEAYFAVLSLTNGIGALTGSLISGLSATLLKDIYFEIGGMPFYGIQFLFLTSGILRAISWLL LKKVKTRKEVSVPGYFFNALYIVGRRAVSRPYEYASILAKTGRQLKKKIFKKKSIKPQK
Sequences:
>Translated_459_residues MENESFVQTKKLSILEGIAFNGVFILTQGFLLTGLALQFNVSEKILAILGVIPMLSQMFQILSPKLLRLAKSRKKAMLIS ASISRPLFLIIPILLTLNLRNQYLLLLIMLVFGAFNSLTGNFWVSIMRDIVSQESSGRFFGVRNLLISLFSMVMIYFYSW IIDSMGESAGFITITIIGSIFSLSSYFMLRKYEDPPKKEYLTGNIFKEAFSDENFKKFIIFSFFWNFTIAISGPFFSYHQ IVNLKLDYSYMSILAFIATGISMVFYIIWGKISDKIGHQSVAEFSVFLASLVSFIWVFMNPLTQGYLLVIDAFITGLAWS GINLTLFTIMLGIVNPGNVEAYFAVLSLTNGIGALTGSLISGLSATLLKDIYFEIGGMPFYGIQFLFLTSGILRAISWLL LKKVKTRKEVSVPGYFFNALYIVGRRAVSRPYEYASILAKTGRQLKKKIFKKKSIKPQK >Mature_459_residues MENESFVQTKKLSILEGIAFNGVFILTQGFLLTGLALQFNVSEKILAILGVIPMLSQMFQILSPKLLRLAKSRKKAMLIS ASISRPLFLIIPILLTLNLRNQYLLLLIMLVFGAFNSLTGNFWVSIMRDIVSQESSGRFFGVRNLLISLFSMVMIYFYSW IIDSMGESAGFITITIIGSIFSLSSYFMLRKYEDPPKKEYLTGNIFKEAFSDENFKKFIIFSFFWNFTIAISGPFFSYHQ IVNLKLDYSYMSILAFIATGISMVFYIIWGKISDKIGHQSVAEFSVFLASLVSFIWVFMNPLTQGYLLVIDAFITGLAWS GINLTLFTIMLGIVNPGNVEAYFAVLSLTNGIGALTGSLISGLSATLLKDIYFEIGGMPFYGIQFLFLTSGILRAISWLL LKKVKTRKEVSVPGYFFNALYIVGRRAVSRPYEYASILAKTGRQLKKKIFKKKSIKPQK
Specific function: Unknown
COG id: COG0477
COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 51781; Mature: 51781
Theoretical pI: Translated: 10.37; Mature: 10.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
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Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MENESFVQTKKLSILEGIAFNGVFILTQGFLLTGLALQFNVSEKILAILGVIPMLSQMFQ CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILSPKLLRLAKSRKKAMLISASISRPLFLIIPILLTLNLRNQYLLLLIMLVFGAFNSLTG HHCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH NFWVSIMRDIVSQESSGRFFGVRNLLISLFSMVMIYFYSWIIDSMGESAGFITITIIGSI HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHH FSLSSYFMLRKYEDPPKKEYLTGNIFKEAFSDENFKKFIIFSFFWNFTIAISGPFFSYHQ HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHEEHHCEEEEECCCCCEEEH IVNLKLDYSYMSILAFIATGISMVFYIIWGKISDKIGHQSVAEFSVFLASLVSFIWVFMN EEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLTQGYLLVIDAFITGLAWSGINLTLFTIMLGIVNPGNVEAYFAVLSLTNGIGALTGSLI HHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH SGLSATLLKDIYFEIGGMPFYGIQFLFLTSGILRAISWLLLKKVKTRKEVSVPGYFFNAL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH YIVGRRAVSRPYEYASILAKTGRQLKKKIFKKKSIKPQK HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MENESFVQTKKLSILEGIAFNGVFILTQGFLLTGLALQFNVSEKILAILGVIPMLSQMFQ CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILSPKLLRLAKSRKKAMLISASISRPLFLIIPILLTLNLRNQYLLLLIMLVFGAFNSLTG HHCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH NFWVSIMRDIVSQESSGRFFGVRNLLISLFSMVMIYFYSWIIDSMGESAGFITITIIGSI HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHH FSLSSYFMLRKYEDPPKKEYLTGNIFKEAFSDENFKKFIIFSFFWNFTIAISGPFFSYHQ HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHEEHHCEEEEECCCCCEEEH IVNLKLDYSYMSILAFIATGISMVFYIIWGKISDKIGHQSVAEFSVFLASLVSFIWVFMN EEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLTQGYLLVIDAFITGLAWSGINLTLFTIMLGIVNPGNVEAYFAVLSLTNGIGALTGSLI HHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH SGLSATLLKDIYFEIGGMPFYGIQFLFLTSGILRAISWLLLKKVKTRKEVSVPGYFFNAL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH YIVGRRAVSRPYEYASILAKTGRQLKKKIFKKKSIKPQK HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA