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The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 238922168

GI number: 238922168

Start: 361902

End: 363263

Strand: Reverse

Name: mepA [H]

Synonym: EUBELI_20403

Alternate gene names: 238922168

Gene position: 363263-361902 (Counterclockwise)

Preceding gene: 238922169

Following gene: 238922167

Centisome position: 57.96

GC content: 37.3

Gene sequence:

>1362_bases
ATGAGTAATACAATGAAAGAAAATAAAATGGGTACAATGCCTGTTAATAAGCTGCTTATTAATATGGCTCTGCCAATGAT
GATATCAATGCTTGTACAGGCACTGTATAATATTGTTGACAGTATATTTGTTGCAAGAATAAGTGAGGAAGCGCTTACAG
CGGTTTCAATGGCATTTCCAATGCAGAATCTTATGATTGGTGTTGCAGGTGGCGTGGGTGTAGGTACTAATGCGCTGCTT
TCAAGGGCATTAGGAGAAGGAAGGCATGAAGAAGCTGATAAGATGGCTGTGCAGGGTATATTCATAACGGCTTGCAGCTA
TATAATATTTCTTGCCATAGGGCTTTTCTTTGCCAGAGAGTTTTTTGTTATTCAGGGTGCTAATGAAGTGATAGCTGACT
ATGGTTATGATTATCTTTCAGTTATTCTTATAGTCAGCTTTGGTTGTCTGTTCCAGATGATATTTGAGAGGTTATTACAG
GCTACAGGAAGAACATTTTACAGCATGATTACACAGGGTACAGGTGCAATAATTAATATTATTGTTGACCCGATACTTAT
ATTTGGTCTGTTTGGTGCACCAAAGCTTGGTATTGTAGGTGCAGCAGTAGCTACGGTTGCGGGCCAGATTGTTGCAGCCG
TTATGGCAGTGATATTTAATATTAAGGTTAATAAAGAGATACATATTACTTTTAAGGGATTCAGACCATCAGGAAAAAGA
ATTTGCAATATCTTGTTCATAGGAATTCCATCAGTTATTATGATGGCAATTGGTTCTGTTATGACATTCTGCATGAATAA
GATTCTGGTTGTATTCACATCAACAGCGGTTGCTGTATTTGGTGTGTATTTTAAGTTGCAGAGCTTTGCATTTATGCCAA
TATTTGGTATGAACAGTGGAATGGTTCCTATAATAGCTTTTAATTATGGGGCCAAGAGAGAAGACAGAGTTATACAGACA
CTTAAGCTTGCAGTAATGTATGCAGAGATAATAATGATACTTTTTATGATTGCAGTTCAGATATTCCCGGTTCCAATGCT
GTCAATATTCAGTGCATCGTCAGATATGATACGAATGGGAGTTCCTGCTTTAAGGACTATATCAATAAGTTTTATATTTG
CAGGAATATGTATTATATGCAGTTCGTTCTTTCAGGCACTTGGAAGCAGCATATACAGCATGCTTGTATCATTTGTAAGA
CAGATTATATTCCTTGTGCCATGTGCTTATATTTTTTCGAAAACAGGGAATGTTAATCTTGTATGGTGGGCATGGCCTAT
TGCAGAGCTTGCTTCAGTCGCGTTAAGTGTATTCTTCTTTATCAGGGTAAGAAAGAAGAAGTTCGCATTTATGGAACAGT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAAGGGGCTTGGCAATGCTATTGACGAGCAGAATAAAACCAAAGATAATATGAAAGAATACGAATATTTTGACGAGGA
GAATAAGGGGGAAGAATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGGATATAATTCAGAAAGATGAGGATAAGATATGAACAGACATATAGAAAAAGCTAAAGAACTCCGTTCACCTGAAAAAT
GTTATAACTGTGCAGAAACT

Product: multidrug resistance protein, MATE family

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 453; Mature: 452

Protein sequence:

>453_residues
MSNTMKENKMGTMPVNKLLINMALPMMISMLVQALYNIVDSIFVARISEEALTAVSMAFPMQNLMIGVAGGVGVGTNALL
SRALGEGRHEEADKMAVQGIFITACSYIIFLAIGLFFAREFFVIQGANEVIADYGYDYLSVILIVSFGCLFQMIFERLLQ
ATGRTFYSMITQGTGAIINIIVDPILIFGLFGAPKLGIVGAAVATVAGQIVAAVMAVIFNIKVNKEIHITFKGFRPSGKR
ICNILFIGIPSVIMMAIGSVMTFCMNKILVVFTSTAVAVFGVYFKLQSFAFMPIFGMNSGMVPIIAFNYGAKREDRVIQT
LKLAVMYAEIIMILFMIAVQIFPVPMLSIFSASSDMIRMGVPALRTISISFIFAGICIICSSFFQALGSSIYSMLVSFVR
QIIFLVPCAYIFSKTGNVNLVWWAWPIAELASVALSVFFFIRVRKKKFAFMEQ

Sequences:

>Translated_453_residues
MSNTMKENKMGTMPVNKLLINMALPMMISMLVQALYNIVDSIFVARISEEALTAVSMAFPMQNLMIGVAGGVGVGTNALL
SRALGEGRHEEADKMAVQGIFITACSYIIFLAIGLFFAREFFVIQGANEVIADYGYDYLSVILIVSFGCLFQMIFERLLQ
ATGRTFYSMITQGTGAIINIIVDPILIFGLFGAPKLGIVGAAVATVAGQIVAAVMAVIFNIKVNKEIHITFKGFRPSGKR
ICNILFIGIPSVIMMAIGSVMTFCMNKILVVFTSTAVAVFGVYFKLQSFAFMPIFGMNSGMVPIIAFNYGAKREDRVIQT
LKLAVMYAEIIMILFMIAVQIFPVPMLSIFSASSDMIRMGVPALRTISISFIFAGICIICSSFFQALGSSIYSMLVSFVR
QIIFLVPCAYIFSKTGNVNLVWWAWPIAELASVALSVFFFIRVRKKKFAFMEQ
>Mature_452_residues
SNTMKENKMGTMPVNKLLINMALPMMISMLVQALYNIVDSIFVARISEEALTAVSMAFPMQNLMIGVAGGVGVGTNALLS
RALGEGRHEEADKMAVQGIFITACSYIIFLAIGLFFAREFFVIQGANEVIADYGYDYLSVILIVSFGCLFQMIFERLLQA
TGRTFYSMITQGTGAIINIIVDPILIFGLFGAPKLGIVGAAVATVAGQIVAAVMAVIFNIKVNKEIHITFKGFRPSGKRI
CNILFIGIPSVIMMAIGSVMTFCMNKILVVFTSTAVAVFGVYFKLQSFAFMPIFGMNSGMVPIIAFNYGAKREDRVIQTL
KLAVMYAEIIMILFMIAVQIFPVPMLSIFSASSDMIRMGVPALRTISISFIFAGICIICSSFFQALGSSIYSMLVSFVRQ
IIFLVPCAYIFSKTGNVNLVWWAWPIAELASVALSVFFFIRVRKKKFAFMEQ

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49754; Mature: 49623

Theoretical pI: Translated: 9.59; Mature: 9.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
6.6 %Met     (Translated Protein)
8.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
6.4 %Met     (Mature Protein)
8.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNTMKENKMGTMPVNKLLINMALPMMISMLVQALYNIVDSIFVARISEEALTAVSMAFP
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MQNLMIGVAGGVGVGTNALLSRALGEGRHEEADKMAVQGIFITACSYIIFLAIGLFFARE
HHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFVIQGANEVIADYGYDYLSVILIVSFGCLFQMIFERLLQATGRTFYSMITQGTGAIINI
HHEEECCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHH
IVDPILIFGLFGAPKLGIVGAAVATVAGQIVAAVMAVIFNIKVNKEIHITFKGFRPSGKR
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEEEECCCCCCHH
ICNILFIGIPSVIMMAIGSVMTFCMNKILVVFTSTAVAVFGVYFKLQSFAFMPIFGMNSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCC
MVPIIAFNYGAKREDRVIQTLKLAVMYAEIIMILFMIAVQIFPVPMLSIFSASSDMIRMG
CCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCHHHHC
VPALRTISISFIFAGICIICSSFFQALGSSIYSMLVSFVRQIIFLVPCAYIFSKTGNVNL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
VWWAWPIAELASVALSVFFFIRVRKKKFAFMEQ
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SNTMKENKMGTMPVNKLLINMALPMMISMLVQALYNIVDSIFVARISEEALTAVSMAFP
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MQNLMIGVAGGVGVGTNALLSRALGEGRHEEADKMAVQGIFITACSYIIFLAIGLFFARE
HHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFVIQGANEVIADYGYDYLSVILIVSFGCLFQMIFERLLQATGRTFYSMITQGTGAIINI
HHEEECCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHH
IVDPILIFGLFGAPKLGIVGAAVATVAGQIVAAVMAVIFNIKVNKEIHITFKGFRPSGKR
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEEEECCCCCCHH
ICNILFIGIPSVIMMAIGSVMTFCMNKILVVFTSTAVAVFGVYFKLQSFAFMPIFGMNSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCC
MVPIIAFNYGAKREDRVIQTLKLAVMYAEIIMILFMIAVQIFPVPMLSIFSASSDMIRMG
CCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCHHHHC
VPALRTISISFIFAGICIICSSFFQALGSSIYSMLVSFVRQIIFLVPCAYIFSKTGNVNL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
VWWAWPIAELASVALSVFFFIRVRKKKFAFMEQ
EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA