Definition Eubacterium eligens ATCC 27750 plasmid unnamed, complete sequence.
Accession NC_012780
Length 626,744

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 238922076

Identifier: 238922076

GI number: 238922076

Start: 259136

End: 260560

Strand: Reverse

Name: 238922076

Synonym: EUBELI_20311

Alternate gene names: NA

Gene position: 260560-259136 (Counterclockwise)

Preceding gene: 238922077

Following gene: 238922075

Centisome position: 41.57

GC content: 25.33

Gene sequence:

>1425_bases
ATGTATGAAAAAAAAATGATACGGACAAAGGAATTGGGCAAAAATACATTGATAATTACTATAGGAAGGATATCAACGCA
ATTTATAACTTTTTTATTATTGCCTCTTTATACAGCACTCTTATCTACAGAAGAATATGGATCAGTAGATTTAGTGACAA
CAATAGTACAATTGCTTGTTCCCATAGTGTCTATAATGATTGATCAAGGCGTGTTTAGATATCTATTAACATGTCAAAAA
GAATCACAAAAAAAGAGTATCATATCAAATGCTTTTTTTATTTTATTTTTTTTGAATTTGTGTTTTTTATTGCTTTATAT
TTTTTTAATACCAGTTAATAAGTTACAATATAAAGTATGGATTTTGCTTATTTTAACAATTACAACATTTAGTAATTTAT
TTTTACAAATTTCAAGGGGATTGAAAAAAACGATTGAATATACCGTTGGAAGTTTTATATGCTCATTTATAACTATTATA
TTAAATGTGTTATGTATCGCATTTATTAAAATGGGTGCAGTTGGAATGTTAATATCAACATTTATAGGAAATTTGTTTTG
TTGTTTATTTATTTTTGTAAAGCTTAGAATATATAGGTACATATCAATATTTAGTATAAGTAAGATTGTTATAATTGAGG
AAATAAAATATTCTATGCCTTTGGTTCCTAATCAACTATCGATATGGGTTATGAACAGTTCGGATAGATTAGTTGTAGCA
TATTATGTTGGGGCTGCTGCTAATGGAGTGCTTGCTGTTTCACATAAATTTCCGACTGTTTTTATGACATTATTTAACAT
ATTTTTATTAGCATGGCATGAAACAGGAGCAGTTCATTATTTCGATGAGGATAGAGATTCTTTTTTTACTAAAACAATAG
AACAAATTATAACGATTTTCTCAACAATATGTGTTGGAATGATAGTTGTGTTGCCAATTATATTTGATTGGTTTATAAAT
AAGTCATTTAGCGAGGCATATTATAATATTCCAATATATTTAATTGCATCATTGTTTAATGTTATTGTTGGATTATTAGG
AGTAGTATATGTTGCTACTAAAAAAACATTTGAAATAGCAAAAACAACTATGATTTCAGCGGCAATAAATATAATAGTTA
ATATTGTTCTAATTCCATATATTGGATTATATGCGGCTTCTTTATCTACATTTGTAGGATATTTGGTCGCAATGATATAT
AGAATTATTGATACTAGAAAATATTTGTGTATTAAGTACAATATAAAAAAGTATTTAATACTATTGTTAGGAATCATTAC
GAGTACAATAATATATTATATTAATAAAAAGATAATAACTATATTATTTATACCGTTTTACGCAATTTATGCTATTTGGC
TTAATAGGGATTTTATTTGTCTTATCAAAAATTGTTTAATAAAAAGGAAGGAAAAATATGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATCAATAAAAAATATTATTGAAGCACCTTATGGAGCAATAAAACAAGTAGGGAAAAAATATCAAAAAAGAATAAAAGA
TAAATTAAGGTAGGCAAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAAATGTATTATATTAATACAGGGTATATTTATAATAATATTAATATTGACCGCAGTAATGATTAGGCATAGTAATA
AGCCAATTAAGCCAGAAAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Exopolysacharide Protein Wzx; Polysaccharide Transporter; Polysaccharide Biosynthesis Protein; Flippase Wzx; Repeat Unit Transporter; Capsule Biosynthesis Repeating Unit Flippase Wzx; O-Antigen Translocase

Number of amino acids: Translated: 474; Mature: 474

Protein sequence:

>474_residues
MYEKKMIRTKELGKNTLIITIGRISTQFITFLLLPLYTALLSTEEYGSVDLVTTIVQLLVPIVSIMIDQGVFRYLLTCQK
ESQKKSIISNAFFILFFLNLCFLLLYIFLIPVNKLQYKVWILLILTITTFSNLFLQISRGLKKTIEYTVGSFICSFITII
LNVLCIAFIKMGAVGMLISTFIGNLFCCLFIFVKLRIYRYISIFSISKIVIIEEIKYSMPLVPNQLSIWVMNSSDRLVVA
YYVGAAANGVLAVSHKFPTVFMTLFNIFLLAWHETGAVHYFDEDRDSFFTKTIEQIITIFSTICVGMIVVLPIIFDWFIN
KSFSEAYYNIPIYLIASLFNVIVGLLGVVYVATKKTFEIAKTTMISAAINIIVNIVLIPYIGLYAASLSTFVGYLVAMIY
RIIDTRKYLCIKYNIKKYLILLLGIITSTIIYYINKKIITILFIPFYAIYAIWLNRDFICLIKNCLIKRKEKYE

Sequences:

>Translated_474_residues
MYEKKMIRTKELGKNTLIITIGRISTQFITFLLLPLYTALLSTEEYGSVDLVTTIVQLLVPIVSIMIDQGVFRYLLTCQK
ESQKKSIISNAFFILFFLNLCFLLLYIFLIPVNKLQYKVWILLILTITTFSNLFLQISRGLKKTIEYTVGSFICSFITII
LNVLCIAFIKMGAVGMLISTFIGNLFCCLFIFVKLRIYRYISIFSISKIVIIEEIKYSMPLVPNQLSIWVMNSSDRLVVA
YYVGAAANGVLAVSHKFPTVFMTLFNIFLLAWHETGAVHYFDEDRDSFFTKTIEQIITIFSTICVGMIVVLPIIFDWFIN
KSFSEAYYNIPIYLIASLFNVIVGLLGVVYVATKKTFEIAKTTMISAAINIIVNIVLIPYIGLYAASLSTFVGYLVAMIY
RIIDTRKYLCIKYNIKKYLILLLGIITSTIIYYINKKIITILFIPFYAIYAIWLNRDFICLIKNCLIKRKEKYE
>Mature_474_residues
MYEKKMIRTKELGKNTLIITIGRISTQFITFLLLPLYTALLSTEEYGSVDLVTTIVQLLVPIVSIMIDQGVFRYLLTCQK
ESQKKSIISNAFFILFFLNLCFLLLYIFLIPVNKLQYKVWILLILTITTFSNLFLQISRGLKKTIEYTVGSFICSFITII
LNVLCIAFIKMGAVGMLISTFIGNLFCCLFIFVKLRIYRYISIFSISKIVIIEEIKYSMPLVPNQLSIWVMNSSDRLVVA
YYVGAAANGVLAVSHKFPTVFMTLFNIFLLAWHETGAVHYFDEDRDSFFTKTIEQIITIFSTICVGMIVVLPIIFDWFIN
KSFSEAYYNIPIYLIASLFNVIVGLLGVVYVATKKTFEIAKTTMISAAINIIVNIVLIPYIGLYAASLSTFVGYLVAMIY
RIIDTRKYLCIKYNIKKYLILLLGIITSTIIYYINKKIITILFIPFYAIYAIWLNRDFICLIKNCLIKRKEKYE

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54532; Mature: 54532

Theoretical pI: Translated: 9.60; Mature: 9.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.1 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
2.1 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYEKKMIRTKELGKNTLIITIGRISTQFITFLLLPLYTALLSTEEYGSVDLVTTIVQLLV
CCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
PIVSIMIDQGVFRYLLTCQKESQKKSIISNAFFILFFLNLCFLLLYIFLIPVNKLQYKVW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH
ILLILTITTFSNLFLQISRGLKKTIEYTVGSFICSFITIILNVLCIAFIKMGAVGMLIST
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIGNLFCCLFIFVKLRIYRYISIFSISKIVIIEEIKYSMPLVPNQLSIWVMNSSDRLVVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEE
YYVGAAANGVLAVSHKFPTVFMTLFNIFLLAWHETGAVHYFDEDRDSFFTKTIEQIITIF
EEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
STICVGMIVVLPIIFDWFINKSFSEAYYNIPIYLIASLFNVIVGLLGVVYVATKKTFEIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTTMISAAINIIVNIVLIPYIGLYAASLSTFVGYLVAMIYRIIDTRKYLCIKYNIKKYLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHH
LLLGIITSTIIYYINKKIITILFIPFYAIYAIWLNRDFICLIKNCLIKRKEKYE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MYEKKMIRTKELGKNTLIITIGRISTQFITFLLLPLYTALLSTEEYGSVDLVTTIVQLLV
CCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
PIVSIMIDQGVFRYLLTCQKESQKKSIISNAFFILFFLNLCFLLLYIFLIPVNKLQYKVW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH
ILLILTITTFSNLFLQISRGLKKTIEYTVGSFICSFITIILNVLCIAFIKMGAVGMLIST
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIGNLFCCLFIFVKLRIYRYISIFSISKIVIIEEIKYSMPLVPNQLSIWVMNSSDRLVVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEE
YYVGAAANGVLAVSHKFPTVFMTLFNIFLLAWHETGAVHYFDEDRDSFFTKTIEQIITIF
EEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
STICVGMIVVLPIIFDWFINKSFSEAYYNIPIYLIASLFNVIVGLLGVVYVATKKTFEIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTTMISAAINIIVNIVLIPYIGLYAASLSTFVGYLVAMIYRIIDTRKYLCIKYNIKKYLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHH
LLLGIITSTIIYYINKKIITILFIPFYAIYAIWLNRDFICLIKNCLIKRKEKYE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA