| Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 plasmid unnamed, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_012780 |
| Length | 626,744 |
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The map label for this gene is 238922076
Identifier: 238922076
GI number: 238922076
Start: 259136
End: 260560
Strand: Reverse
Name: 238922076
Synonym: EUBELI_20311
Alternate gene names: NA
Gene position: 260560-259136 (Counterclockwise)
Preceding gene: 238922077
Following gene: 238922075
Centisome position: 41.57
GC content: 25.33
Gene sequence:
>1425_bases ATGTATGAAAAAAAAATGATACGGACAAAGGAATTGGGCAAAAATACATTGATAATTACTATAGGAAGGATATCAACGCA ATTTATAACTTTTTTATTATTGCCTCTTTATACAGCACTCTTATCTACAGAAGAATATGGATCAGTAGATTTAGTGACAA CAATAGTACAATTGCTTGTTCCCATAGTGTCTATAATGATTGATCAAGGCGTGTTTAGATATCTATTAACATGTCAAAAA GAATCACAAAAAAAGAGTATCATATCAAATGCTTTTTTTATTTTATTTTTTTTGAATTTGTGTTTTTTATTGCTTTATAT TTTTTTAATACCAGTTAATAAGTTACAATATAAAGTATGGATTTTGCTTATTTTAACAATTACAACATTTAGTAATTTAT TTTTACAAATTTCAAGGGGATTGAAAAAAACGATTGAATATACCGTTGGAAGTTTTATATGCTCATTTATAACTATTATA TTAAATGTGTTATGTATCGCATTTATTAAAATGGGTGCAGTTGGAATGTTAATATCAACATTTATAGGAAATTTGTTTTG TTGTTTATTTATTTTTGTAAAGCTTAGAATATATAGGTACATATCAATATTTAGTATAAGTAAGATTGTTATAATTGAGG AAATAAAATATTCTATGCCTTTGGTTCCTAATCAACTATCGATATGGGTTATGAACAGTTCGGATAGATTAGTTGTAGCA TATTATGTTGGGGCTGCTGCTAATGGAGTGCTTGCTGTTTCACATAAATTTCCGACTGTTTTTATGACATTATTTAACAT ATTTTTATTAGCATGGCATGAAACAGGAGCAGTTCATTATTTCGATGAGGATAGAGATTCTTTTTTTACTAAAACAATAG AACAAATTATAACGATTTTCTCAACAATATGTGTTGGAATGATAGTTGTGTTGCCAATTATATTTGATTGGTTTATAAAT AAGTCATTTAGCGAGGCATATTATAATATTCCAATATATTTAATTGCATCATTGTTTAATGTTATTGTTGGATTATTAGG AGTAGTATATGTTGCTACTAAAAAAACATTTGAAATAGCAAAAACAACTATGATTTCAGCGGCAATAAATATAATAGTTA ATATTGTTCTAATTCCATATATTGGATTATATGCGGCTTCTTTATCTACATTTGTAGGATATTTGGTCGCAATGATATAT AGAATTATTGATACTAGAAAATATTTGTGTATTAAGTACAATATAAAAAAGTATTTAATACTATTGTTAGGAATCATTAC GAGTACAATAATATATTATATTAATAAAAAGATAATAACTATATTATTTATACCGTTTTACGCAATTTATGCTATTTGGC TTAATAGGGATTTTATTTGTCTTATCAAAAATTGTTTAATAAAAAGGAAGGAAAAATATGAGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATATCAATAAAAAATATTATTGAAGCACCTTATGGAGCAATAAAACAAGTAGGGAAAAAATATCAAAAAAGAATAAAAGA TAAATTAAGGTAGGCAAAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAAAATGTATTATATTAATACAGGGTATATTTATAATAATATTAATATTGACCGCAGTAATGATTAGGCATAGTAATA AGCCAATTAAGCCAGAAAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Exopolysacharide Protein Wzx; Polysaccharide Transporter; Polysaccharide Biosynthesis Protein; Flippase Wzx; Repeat Unit Transporter; Capsule Biosynthesis Repeating Unit Flippase Wzx; O-Antigen Translocase
Number of amino acids: Translated: 474; Mature: 474
Protein sequence:
>474_residues MYEKKMIRTKELGKNTLIITIGRISTQFITFLLLPLYTALLSTEEYGSVDLVTTIVQLLVPIVSIMIDQGVFRYLLTCQK ESQKKSIISNAFFILFFLNLCFLLLYIFLIPVNKLQYKVWILLILTITTFSNLFLQISRGLKKTIEYTVGSFICSFITII LNVLCIAFIKMGAVGMLISTFIGNLFCCLFIFVKLRIYRYISIFSISKIVIIEEIKYSMPLVPNQLSIWVMNSSDRLVVA YYVGAAANGVLAVSHKFPTVFMTLFNIFLLAWHETGAVHYFDEDRDSFFTKTIEQIITIFSTICVGMIVVLPIIFDWFIN KSFSEAYYNIPIYLIASLFNVIVGLLGVVYVATKKTFEIAKTTMISAAINIIVNIVLIPYIGLYAASLSTFVGYLVAMIY RIIDTRKYLCIKYNIKKYLILLLGIITSTIIYYINKKIITILFIPFYAIYAIWLNRDFICLIKNCLIKRKEKYE
Sequences:
>Translated_474_residues MYEKKMIRTKELGKNTLIITIGRISTQFITFLLLPLYTALLSTEEYGSVDLVTTIVQLLVPIVSIMIDQGVFRYLLTCQK ESQKKSIISNAFFILFFLNLCFLLLYIFLIPVNKLQYKVWILLILTITTFSNLFLQISRGLKKTIEYTVGSFICSFITII LNVLCIAFIKMGAVGMLISTFIGNLFCCLFIFVKLRIYRYISIFSISKIVIIEEIKYSMPLVPNQLSIWVMNSSDRLVVA YYVGAAANGVLAVSHKFPTVFMTLFNIFLLAWHETGAVHYFDEDRDSFFTKTIEQIITIFSTICVGMIVVLPIIFDWFIN KSFSEAYYNIPIYLIASLFNVIVGLLGVVYVATKKTFEIAKTTMISAAINIIVNIVLIPYIGLYAASLSTFVGYLVAMIY RIIDTRKYLCIKYNIKKYLILLLGIITSTIIYYINKKIITILFIPFYAIYAIWLNRDFICLIKNCLIKRKEKYE >Mature_474_residues MYEKKMIRTKELGKNTLIITIGRISTQFITFLLLPLYTALLSTEEYGSVDLVTTIVQLLVPIVSIMIDQGVFRYLLTCQK ESQKKSIISNAFFILFFLNLCFLLLYIFLIPVNKLQYKVWILLILTITTFSNLFLQISRGLKKTIEYTVGSFICSFITII LNVLCIAFIKMGAVGMLISTFIGNLFCCLFIFVKLRIYRYISIFSISKIVIIEEIKYSMPLVPNQLSIWVMNSSDRLVVA YYVGAAANGVLAVSHKFPTVFMTLFNIFLLAWHETGAVHYFDEDRDSFFTKTIEQIITIFSTICVGMIVVLPIIFDWFIN KSFSEAYYNIPIYLIASLFNVIVGLLGVVYVATKKTFEIAKTTMISAAINIIVNIVLIPYIGLYAASLSTFVGYLVAMIY RIIDTRKYLCIKYNIKKYLILLLGIITSTIIYYINKKIITILFIPFYAIYAIWLNRDFICLIKNCLIKRKEKYE
Specific function: Unknown
COG id: COG2244
COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 54532; Mature: 54532
Theoretical pI: Translated: 9.60; Mature: 9.60
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.1 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 4.4 %Cys+Met (Translated Protein) 2.1 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 4.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYEKKMIRTKELGKNTLIITIGRISTQFITFLLLPLYTALLSTEEYGSVDLVTTIVQLLV CCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH PIVSIMIDQGVFRYLLTCQKESQKKSIISNAFFILFFLNLCFLLLYIFLIPVNKLQYKVW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH ILLILTITTFSNLFLQISRGLKKTIEYTVGSFICSFITIILNVLCIAFIKMGAVGMLIST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIGNLFCCLFIFVKLRIYRYISIFSISKIVIIEEIKYSMPLVPNQLSIWVMNSSDRLVVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEE YYVGAAANGVLAVSHKFPTVFMTLFNIFLLAWHETGAVHYFDEDRDSFFTKTIEQIITIF EEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH STICVGMIVVLPIIFDWFINKSFSEAYYNIPIYLIASLFNVIVGLLGVVYVATKKTFEIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTTMISAAINIIVNIVLIPYIGLYAASLSTFVGYLVAMIYRIIDTRKYLCIKYNIKKYLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHH LLLGIITSTIIYYINKKIITILFIPFYAIYAIWLNRDFICLIKNCLIKRKEKYE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MYEKKMIRTKELGKNTLIITIGRISTQFITFLLLPLYTALLSTEEYGSVDLVTTIVQLLV CCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH PIVSIMIDQGVFRYLLTCQKESQKKSIISNAFFILFFLNLCFLLLYIFLIPVNKLQYKVW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHH ILLILTITTFSNLFLQISRGLKKTIEYTVGSFICSFITIILNVLCIAFIKMGAVGMLIST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIGNLFCCLFIFVKLRIYRYISIFSISKIVIIEEIKYSMPLVPNQLSIWVMNSSDRLVVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEE YYVGAAANGVLAVSHKFPTVFMTLFNIFLLAWHETGAVHYFDEDRDSFFTKTIEQIITIF EEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH STICVGMIVVLPIIFDWFINKSFSEAYYNIPIYLIASLFNVIVGLLGVVYVATKKTFEIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTTMISAAINIIVNIVLIPYIGLYAASLSTFVGYLVAMIYRIIDTRKYLCIKYNIKKYLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHH LLLGIITSTIIYYINKKIITILFIPFYAIYAIWLNRDFICLIKNCLIKRKEKYE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA