| Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012778 |
| Length | 2,144,190 |
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The map label for this gene is 238915999
Identifier: 238915999
GI number: 238915999
Start: 31559
End: 33943
Strand: Direct
Name: 238915999
Synonym: EUBELI_00032
Alternate gene names: NA
Gene position: 31559-33943 (Clockwise)
Preceding gene: 238915998
Following gene: 238916000
Centisome position: 1.47
GC content: 40.46
Gene sequence:
>2385_bases ATGGTAAAGAAGAATTTATTCAGATATAGTTCAGTTTTAATGTGTGTTGTTCTTACTGCGGCAAGTCTTGTTGGCTGCGG TGCTAATACAGCTGCAACAACAGGAACGGATACAGCTTATGTAACAGAGATGGCAGCAGGCAGTACAGAGGCTACGATTA CACAGGCAATAACTAATGAGCTTGCAGTGTCTAACAAGAGCACACTTGCAACTAACACAAGACAGGAAACTGTTTATGTA TTCAATGACGCTTCAGGTAACAAGAATCACATCACTGTCAACGAAAAGATTACAGACGCTAACGGCAATGAGACTCTTAA TAAGACTGAGTCAAGTGAAAATGCGCCAGTAACAATGAAGGTTACTTACAAGCTTGATGGCAAGGAAATTAAGCCGGAAG ACCTGGCTGGAAAGAGCGGAAAGGTTACAATACGCTTTGATTACACTAATAATCAGAAGAAAACTGTAACAATTAATGGT AAAAAGCAGACAGTTGCCGTACCATTTACAATGATTACAGGCATGATGCTTCCAACAGATGTATTCTCAAATGTTGAGGT TACTAATGGTAAGCTTACTAAGGTCGGTGATAATATTGTGGCAGTCGGTATGACAATGCCAGGACTTAAGGATACTATGA ATCTTAAGTTTAATGATAAGTCACTTGACCTTGATATTCCTGAGTATTTTGAATTAACAGCAGATGTTAAGAATTTCTCA CTTGATATGACAATGTCTGTTGCAACATCTAATCTTCTTTCAGATATGAATGCTGATGACATTACTTTAGATGATTTAAA GAAAACTGTTGCTTCATTAGATGATGCAGCAACACAGCTTGCAGACGGAACGGTTACATTACAGGATGGAACACAGCAGT TAAGTGATGCAATTCCGGCACTTACTGATGGTGTTGACCAGTTAAATACAGGTGCTTCTTCTCTTAAGGATGGTATATAT GCATACGCAGATGGCGCTGCAAGTGCATATGAGGGTTCAGTTTCACTTAATGACAACATGAAGACATATGCGGACGGAAT CGGAACTCTTTATAATACTCTTAAGGATAACAATCTTGACAGCAGTGTTGCTTCGGCAGCTAAGGGGGCAGGTGATCTGG CAGCAGGCGCTGCAACACTTGATGCAGGAATTGATAGTGCTTTATCTGGTGCAGGAGCGCTTGTTACTGGGGCAAAGTCA TTGACAGATGGAACGGGAGAATTGGCAACGGGTGCAGCAGCATTAGCTGAAGGAGCAGATAAAATAGGTGGAACATTAAC ATCAGGAATGACAGAAGCAAAACAAAAATATGATAATGCGTATGACAGTTTTTATCAGTTAGCAATGGCAGTTATTGGTG GAAAATTAGGATATAATCCGGCTGCAATGACAGGTGAGCAGAAAATTACAGCTGCGACAACACTTGCTAATGTAGGTATA TCTGCTACAGCAGATATTACAGATGAAAATCAGTGTACCAAGGCAGCCGCATTTATAATGCAGAACTATAATGATACAGA CATTACAACAGGTAAGATTGGTATAAGAACAGCAATGGTTAGTGCATTAACAGCTAAATATGCAGCAGCAGATACAGAAC ACAAATATACATTAGATCAATTAAAAGCAAAGGCAAATAGTGATTCAGACGCAAATCTTGTAGCTATTTCCAGTGGACTT TCACAGGCTTATAAGGCATACGGTCTACTTAATGATACGATGACATCCCTTACAGCTGGCGGAGAGAACAGTTTCTTTAA TGGAATTACTAAATTGAATGAAGGAGCAGGTCAGGTTAATACTGGTGCAAATGCCCTTAAAGCAGGAATTGACCAGTTAA GCGCTGGTGCAGGACAGTTAAGTGCAGGTTCTAAGCAGCTTAAAGCAGGCCTTGGTACATTAAGCACAGGTCTTAACACA CTCAGCACATCAGTTGGTTCATTCTCAACTTACAAGGAGGGAACTCTCTGCTCAAGTTTATATGCATTAAATCTTAATGC AGGAAAGTTACAGCAGGAAGGAACAGAAGCCCTTCAGAGCGGACTTTCACAGCTTACAGCTAATAATGATACATTAAAGA GTGGAGCTTCACAGCTTGCTGATGGAACAGCTACCTTAAAGGATAGTTCAGGAACACTTGCAGATGGAGTTACACAGTTA AACGAAGGTGCAATTACATTAAAGGATGGAATGGCACAGTTTAACAGCGAAGCAATTGAGCCTATCACAAAGCTTGTAGA CTCAGACGCACAGACAGCCGTTGATACAATCAAGGCAGTAGTTAAGGCAGGTCAGGAATACAATTCATTCTTAGGCAAGT CAGATGACAAAGCCGGAAGTGTAACATTTGTCTATAAGACAGCAGGCATCACAGCCAATAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTTCCATCACTTTTCGTATTGCTTGATAAGGTGATTATTCATACAAGTTTAGGTTTTAAGCCGAAGAAGAACAGTCAAAA TTAAATTAGGAGGATTTATT
Downstream 100 bases:
>100_bases GCTTTTTTCTTTCAAACACTTTCATATAAAGATGGAACAGCCACCCGCGGGGAAACCTAAGGGTGGCTGTTTCCATATGT TATATATGAATAAATGTTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 794; Mature: 794
Protein sequence:
>794_residues MVKKNLFRYSSVLMCVVLTAASLVGCGANTAATTGTDTAYVTEMAAGSTEATITQAITNELAVSNKSTLATNTRQETVYV FNDASGNKNHITVNEKITDANGNETLNKTESSENAPVTMKVTYKLDGKEIKPEDLAGKSGKVTIRFDYTNNQKKTVTING KKQTVAVPFTMITGMMLPTDVFSNVEVTNGKLTKVGDNIVAVGMTMPGLKDTMNLKFNDKSLDLDIPEYFELTADVKNFS LDMTMSVATSNLLSDMNADDITLDDLKKTVASLDDAATQLADGTVTLQDGTQQLSDAIPALTDGVDQLNTGASSLKDGIY AYADGAASAYEGSVSLNDNMKTYADGIGTLYNTLKDNNLDSSVASAAKGAGDLAAGAATLDAGIDSALSGAGALVTGAKS LTDGTGELATGAAALAEGADKIGGTLTSGMTEAKQKYDNAYDSFYQLAMAVIGGKLGYNPAAMTGEQKITAATTLANVGI SATADITDENQCTKAAAFIMQNYNDTDITTGKIGIRTAMVSALTAKYAAADTEHKYTLDQLKAKANSDSDANLVAISSGL SQAYKAYGLLNDTMTSLTAGGENSFFNGITKLNEGAGQVNTGANALKAGIDQLSAGAGQLSAGSKQLKAGLGTLSTGLNT LSTSVGSFSTYKEGTLCSSLYALNLNAGKLQQEGTEALQSGLSQLTANNDTLKSGASQLADGTATLKDSSGTLADGVTQL NEGAITLKDGMAQFNSEAIEPITKLVDSDAQTAVDTIKAVVKAGQEYNSFLGKSDDKAGSVTFVYKTAGITANK
Sequences:
>Translated_794_residues MVKKNLFRYSSVLMCVVLTAASLVGCGANTAATTGTDTAYVTEMAAGSTEATITQAITNELAVSNKSTLATNTRQETVYV FNDASGNKNHITVNEKITDANGNETLNKTESSENAPVTMKVTYKLDGKEIKPEDLAGKSGKVTIRFDYTNNQKKTVTING KKQTVAVPFTMITGMMLPTDVFSNVEVTNGKLTKVGDNIVAVGMTMPGLKDTMNLKFNDKSLDLDIPEYFELTADVKNFS LDMTMSVATSNLLSDMNADDITLDDLKKTVASLDDAATQLADGTVTLQDGTQQLSDAIPALTDGVDQLNTGASSLKDGIY AYADGAASAYEGSVSLNDNMKTYADGIGTLYNTLKDNNLDSSVASAAKGAGDLAAGAATLDAGIDSALSGAGALVTGAKS LTDGTGELATGAAALAEGADKIGGTLTSGMTEAKQKYDNAYDSFYQLAMAVIGGKLGYNPAAMTGEQKITAATTLANVGI SATADITDENQCTKAAAFIMQNYNDTDITTGKIGIRTAMVSALTAKYAAADTEHKYTLDQLKAKANSDSDANLVAISSGL SQAYKAYGLLNDTMTSLTAGGENSFFNGITKLNEGAGQVNTGANALKAGIDQLSAGAGQLSAGSKQLKAGLGTLSTGLNT LSTSVGSFSTYKEGTLCSSLYALNLNAGKLQQEGTEALQSGLSQLTANNDTLKSGASQLADGTATLKDSSGTLADGVTQL NEGAITLKDGMAQFNSEAIEPITKLVDSDAQTAVDTIKAVVKAGQEYNSFLGKSDDKAGSVTFVYKTAGITANK >Mature_794_residues MVKKNLFRYSSVLMCVVLTAASLVGCGANTAATTGTDTAYVTEMAAGSTEATITQAITNELAVSNKSTLATNTRQETVYV FNDASGNKNHITVNEKITDANGNETLNKTESSENAPVTMKVTYKLDGKEIKPEDLAGKSGKVTIRFDYTNNQKKTVTING KKQTVAVPFTMITGMMLPTDVFSNVEVTNGKLTKVGDNIVAVGMTMPGLKDTMNLKFNDKSLDLDIPEYFELTADVKNFS LDMTMSVATSNLLSDMNADDITLDDLKKTVASLDDAATQLADGTVTLQDGTQQLSDAIPALTDGVDQLNTGASSLKDGIY AYADGAASAYEGSVSLNDNMKTYADGIGTLYNTLKDNNLDSSVASAAKGAGDLAAGAATLDAGIDSALSGAGALVTGAKS LTDGTGELATGAAALAEGADKIGGTLTSGMTEAKQKYDNAYDSFYQLAMAVIGGKLGYNPAAMTGEQKITAATTLANVGI SATADITDENQCTKAAAFIMQNYNDTDITTGKIGIRTAMVSALTAKYAAADTEHKYTLDQLKAKANSDSDANLVAISSGL SQAYKAYGLLNDTMTSLTAGGENSFFNGITKLNEGAGQVNTGANALKAGIDQLSAGAGQLSAGSKQLKAGLGTLSTGLNT LSTSVGSFSTYKEGTLCSSLYALNLNAGKLQQEGTEALQSGLSQLTANNDTLKSGASQLADGTATLKDSSGTLADGVTQL NEGAITLKDGMAQFNSEAIEPITKLVDSDAQTAVDTIKAVVKAGQEYNSFLGKSDDKAGSVTFVYKTAGITANK
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 81947; Mature: 81947
Theoretical pI: Translated: 4.37; Mature: 4.37
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVKKNLFRYSSVLMCVVLTAASLVGCGANTAATTGTDTAYVTEMAAGSTEATITQAITNE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LAVSNKSTLATNTRQETVYVFNDASGNKNHITVNEKITDANGNETLNKTESSENAPVTMK HHCCCCCCEECCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEE VTYKLDGKEIKPEDLAGKSGKVTIRFDYTNNQKKTVTINGKKQTVAVPFTMITGMMLPTD EEEEECCCCCCCHHCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEECHHHHHCHHCCHH VFSNVEVTNGKLTKVGDNIVAVGMTMPGLKDTMNLKFNDKSLDLDIPEYFELTADVKNFS HHCCCEECCCEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHCE LDMTMSVATSNLLSDMNADDITLDDLKKTVASLDDAATQLADGTVTLQDGTQQLSDAIPA EEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHH LTDGVDQLNTGASSLKDGIYAYADGAASAYEGSVSLNDNMKTYADGIGTLYNTLKDNNLD HHCCHHHHCCCHHHHHCCCEEEECCCCHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC SSVASAAKGAGDLAAGAATLDAGIDSALSGAGALVTGAKSLTDGTGELATGAAALAEGAD HHHHHHHCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH KIGGTLTSGMTEAKQKYDNAYDSFYQLAMAVIGGKLGYNPAAMTGEQKITAATTLANVGI HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC SATADITDENQCTKAAAFIMQNYNDTDITTGKIGIRTAMVSALTAKYAAADTEHKYTLDQ EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH LKAKANSDSDANLVAISSGLSQAYKAYGLLNDTMTSLTAGGENSFFNGITKLNEGAGQVN HHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC TGANALKAGIDQLSAGAGQLSAGSKQLKAGLGTLSTGLNTLSTSVGSFSTYKEGTLCSSL CCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHEE YALNLNAGKLQQEGTEALQSGLSQLTANNDTLKSGASQLADGTATLKDSSGTLADGVTQL EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHH NEGAITLKDGMAQFNSEAIEPITKLVDSDAQTAVDTIKAVVKAGQEYNSFLGKSDDKAGS CCCCEEEHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCC VTFVYKTAGITANK EEEEEEECCCCCCC >Mature Secondary Structure MVKKNLFRYSSVLMCVVLTAASLVGCGANTAATTGTDTAYVTEMAAGSTEATITQAITNE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LAVSNKSTLATNTRQETVYVFNDASGNKNHITVNEKITDANGNETLNKTESSENAPVTMK HHCCCCCCEECCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEE VTYKLDGKEIKPEDLAGKSGKVTIRFDYTNNQKKTVTINGKKQTVAVPFTMITGMMLPTD EEEEECCCCCCCHHCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEECHHHHHCHHCCHH VFSNVEVTNGKLTKVGDNIVAVGMTMPGLKDTMNLKFNDKSLDLDIPEYFELTADVKNFS HHCCCEECCCEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHCE LDMTMSVATSNLLSDMNADDITLDDLKKTVASLDDAATQLADGTVTLQDGTQQLSDAIPA EEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHH LTDGVDQLNTGASSLKDGIYAYADGAASAYEGSVSLNDNMKTYADGIGTLYNTLKDNNLD HHCCHHHHCCCHHHHHCCCEEEECCCCHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC SSVASAAKGAGDLAAGAATLDAGIDSALSGAGALVTGAKSLTDGTGELATGAAALAEGAD HHHHHHHCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH KIGGTLTSGMTEAKQKYDNAYDSFYQLAMAVIGGKLGYNPAAMTGEQKITAATTLANVGI HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC SATADITDENQCTKAAAFIMQNYNDTDITTGKIGIRTAMVSALTAKYAAADTEHKYTLDQ EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH LKAKANSDSDANLVAISSGLSQAYKAYGLLNDTMTSLTAGGENSFFNGITKLNEGAGQVN HHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC TGANALKAGIDQLSAGAGQLSAGSKQLKAGLGTLSTGLNTLSTSVGSFSTYKEGTLCSSL CCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHEE YALNLNAGKLQQEGTEALQSGLSQLTANNDTLKSGASQLADGTATLKDSSGTLADGVTQL EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHH NEGAITLKDGMAQFNSEAIEPITKLVDSDAQTAVDTIKAVVKAGQEYNSFLGKSDDKAGS CCCCEEEHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCC VTFVYKTAGITANK EEEEEEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA