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The map label for this gene is 23100625

Identifier: 23100625

GI number: 23100625

Start: 3301638

End: 3303044

Strand: Direct

Name: 23100625

Synonym: OB3170

Alternate gene names: NA

Gene position: 3301638-3303044 (Clockwise)

Preceding gene: 23100624

Following gene: 23100626

Centisome position: 90.94

GC content: 39.16

Gene sequence:

>1407_bases
ATGTCTTTACAAATTGTCGGTTTTTCTATCATTATATTAGCCGCCCTACTCGTTATTGGAAAACTGATCCGTCTTAAAGT
TCCCATCCTTCAAAAACTCTTCTTACCCACCTCATTAATCGGTGGATTTCTAGCATTATTATTAGGACCCGAAGTATTAG
GGAAACTAACTGGAGATGGCTTCCTTAATGCTGGCCTTTTCACCGATCAAATGGTAGAAGTCTGGGCTGGCCTACCTGAA
TTATTAATCAATGTTGTATTTGCTTGTTTATTTATAGGCTTTGTCTTACCAAAACCCAAAAAAATGTGGAGAATTGGTGG
ACCACAGATCGCTTTAGGTTATACGATGTCCTGGGCTCAATATGCAATAGGAATATTACTGGCGATTACAGTATTAACCC
CTCTACTTGGACTAAGTCCTGCAGCAGGTGCCCTTATTGAAATAGGTTTTGTTGGTGGTCATGGTACCGCAGCTGGTCTA
CAGAGCACTTTTGAAGAACTTGGATTTGCAGAAGGTTATGACCTGGCTATTGGTTTGGCGACTGTTGGTATATTATCCGG
TGTAATCGTTGGTATGATTATGGTTAACTGGGCAGCACGCAACGGAAAATCAAAAACACTACATCACCCAGATGAAATAT
CTTTTGAACAACAAACTGGAATTATCAATAAAGAACATCGTAAATCTGCAGGTACAAAGACAACATCATCACTATCGATT
GAACCATTTGCCCTTCATCTAGGATTAATTGGAATTTCTATATTTATTGGTTTTGTCCTGTTAGAAATATTAGTTTGGTT
AGAAGCTGTAACATATGGTGAAGCATTCGGTATTTATCTATTTGAATACGTACCTTTATTCCCATTTGCAATGATTGGAG
GTCTTCTCGTACAACTCTTCCTATCTCGATTTGACCGTCATGAATTAGTTGACCGAGATACAATTAACACGATACAAGGA
GTAGCGCTAGACTTTCTTATTATCAGTGCAATGGCAAGCCTGAGCTTGCAAGTTATTGGTGAAAATATTATCGCCTTTAT
ATTACTAGCAGTTGCTGGTATAGTTCTCAACACCTTCCTTTTCCTCTATTTAGGACCGAAGATGATTCCAAGCTATTGGT
TCGAACGAGGTATCGGTGACTTTGGCCAAAGTACTGGTGTAGCAGCAACAGGTATTATGCTTATGCGAATCGTTGATTCA
GAGAATAAATCTCCCGCTCTGAATGCATTCGGTTATAAGCAAATTCTATTTGAACCAATGGTTGGTGGCGGATTAGTAAC
AGCAGCTTCCGTCCCATTTATCATCCAATTTGGTGCAGTCCCTGTATTAATTGGGGTGACTCTACTAACAATCGCATTCT
GGTTATTAGGTACACTATACTTCGGAAAAATGAAAGAATCCGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTAAGTCATATGTTTGCCATAAAGTTATATCGGGTATTGCTTAATTCAATATTTTTTATTTTTTTACCCTTAAAATAGCT
TTATGAAAAGGAGTTTATCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGCGAAAGCAACAGCATGATTCATATTTCATGTTGTTGCTTTTTTCTCTTTATGATATCTTTAGAGAAACTTAGAATCGT
ATATTCCATCTATGAAAGTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Na+/Glutamate Symporter; Sodium/Solute Symporter Family Protein; SodiumSolute Symporter ESS Family; Sodium/Glutamate Symport Carrier Protein; Sodium/Glutamate Symporter Superfamily; Na+/Glutamate Symporter-Like Protein; Integral Membrane Protein

Number of amino acids: Translated: 468; Mature: 467

Protein sequence:

>468_residues
MSLQIVGFSIIILAALLVIGKLIRLKVPILQKLFLPTSLIGGFLALLLGPEVLGKLTGDGFLNAGLFTDQMVEVWAGLPE
LLINVVFACLFIGFVLPKPKKMWRIGGPQIALGYTMSWAQYAIGILLAITVLTPLLGLSPAAGALIEIGFVGGHGTAAGL
QSTFEELGFAEGYDLAIGLATVGILSGVIVGMIMVNWAARNGKSKTLHHPDEISFEQQTGIINKEHRKSAGTKTTSSLSI
EPFALHLGLIGISIFIGFVLLEILVWLEAVTYGEAFGIYLFEYVPLFPFAMIGGLLVQLFLSRFDRHELVDRDTINTIQG
VALDFLIISAMASLSLQVIGENIIAFILLAVAGIVLNTFLFLYLGPKMIPSYWFERGIGDFGQSTGVAATGIMLMRIVDS
ENKSPALNAFGYKQILFEPMVGGGLVTAASVPFIIQFGAVPVLIGVTLLTIAFWLLGTLYFGKMKESD

Sequences:

>Translated_468_residues
MSLQIVGFSIIILAALLVIGKLIRLKVPILQKLFLPTSLIGGFLALLLGPEVLGKLTGDGFLNAGLFTDQMVEVWAGLPE
LLINVVFACLFIGFVLPKPKKMWRIGGPQIALGYTMSWAQYAIGILLAITVLTPLLGLSPAAGALIEIGFVGGHGTAAGL
QSTFEELGFAEGYDLAIGLATVGILSGVIVGMIMVNWAARNGKSKTLHHPDEISFEQQTGIINKEHRKSAGTKTTSSLSI
EPFALHLGLIGISIFIGFVLLEILVWLEAVTYGEAFGIYLFEYVPLFPFAMIGGLLVQLFLSRFDRHELVDRDTINTIQG
VALDFLIISAMASLSLQVIGENIIAFILLAVAGIVLNTFLFLYLGPKMIPSYWFERGIGDFGQSTGVAATGIMLMRIVDS
ENKSPALNAFGYKQILFEPMVGGGLVTAASVPFIIQFGAVPVLIGVTLLTIAFWLLGTLYFGKMKESD
>Mature_467_residues
SLQIVGFSIIILAALLVIGKLIRLKVPILQKLFLPTSLIGGFLALLLGPEVLGKLTGDGFLNAGLFTDQMVEVWAGLPEL
LINVVFACLFIGFVLPKPKKMWRIGGPQIALGYTMSWAQYAIGILLAITVLTPLLGLSPAAGALIEIGFVGGHGTAAGLQ
STFEELGFAEGYDLAIGLATVGILSGVIVGMIMVNWAARNGKSKTLHHPDEISFEQQTGIINKEHRKSAGTKTTSSLSIE
PFALHLGLIGISIFIGFVLLEILVWLEAVTYGEAFGIYLFEYVPLFPFAMIGGLLVQLFLSRFDRHELVDRDTINTIQGV
ALDFLIISAMASLSLQVIGENIIAFILLAVAGIVLNTFLFLYLGPKMIPSYWFERGIGDFGQSTGVAATGIMLMRIVDSE
NKSPALNAFGYKQILFEPMVGGGLVTAASVPFIIQFGAVPVLIGVTLLTIAFWLLGTLYFGKMKESD

Specific function: Unknown

COG id: COG0786

COG function: function code E; Na+/glutamate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50288; Mature: 50156

Theoretical pI: Translated: 5.66; Mature: 5.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSLQIVGFSIIILAALLVIGKLIRLKVPILQKLFLPTSLIGGFLALLLGPEVLGKLTGDG
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCC
FLNAGLFTDQMVEVWAGLPELLINVVFACLFIGFVLPKPKKMWRIGGPQIALGYTMSWAQ
CEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHH
YAIGILLAITVLTPLLGLSPAAGALIEIGFVGGHGTAAGLQSTFEELGFAEGYDLAIGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
TVGILSGVIVGMIMVNWAARNGKSKTLHHPDEISFEQQTGIINKEHRKSAGTKTTSSLSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCC
EPFALHLGLIGISIFIGFVLLEILVWLEAVTYGEAFGIYLFEYVPLFPFAMIGGLLVQLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSRFDRHELVDRDTINTIQGVALDFLIISAMASLSLQVIGENIIAFILLAVAGIVLNTFL
HHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLYLGPKMIPSYWFERGIGDFGQSTGVAATGIMLMRIVDSENKSPALNAFGYKQILFEPM
HHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHC
VGGGLVTAASVPFIIQFGAVPVLIGVTLLTIAFWLLGTLYFGKMKESD
CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SLQIVGFSIIILAALLVIGKLIRLKVPILQKLFLPTSLIGGFLALLLGPEVLGKLTGDG
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCC
FLNAGLFTDQMVEVWAGLPELLINVVFACLFIGFVLPKPKKMWRIGGPQIALGYTMSWAQ
CEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHH
YAIGILLAITVLTPLLGLSPAAGALIEIGFVGGHGTAAGLQSTFEELGFAEGYDLAIGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
TVGILSGVIVGMIMVNWAARNGKSKTLHHPDEISFEQQTGIINKEHRKSAGTKTTSSLSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCC
EPFALHLGLIGISIFIGFVLLEILVWLEAVTYGEAFGIYLFEYVPLFPFAMIGGLLVQLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSRFDRHELVDRDTINTIQGVALDFLIISAMASLSLQVIGENIIAFILLAVAGIVLNTFL
HHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLYLGPKMIPSYWFERGIGDFGQSTGVAATGIMLMRIVDSENKSPALNAFGYKQILFEPM
HHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHC
VGGGLVTAASVPFIIQFGAVPVLIGVTLLTIAFWLLGTLYFGKMKESD
CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA