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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 23100623

GI number: 23100623

Start: 3299531

End: 3300736

Strand: Reverse

Name: yfiS [H]

Synonym: OB3168

Alternate gene names: 23100623

Gene position: 3300736-3299531 (Counterclockwise)

Preceding gene: 23100629

Following gene: 23100615

Centisome position: 90.92

GC content: 37.15

Gene sequence:

>1206_bases
ATGGCAACACAGTCATTATTACGGAATAGAATATTTGTCTTGCTCTTTGTTGCTGGAATATTTGCGGTTGTTAGTTTCAG
TATGTTTTTAACAACAACGACATGGTTTGTAATCAGTGAAAGCAATTCTGCTGGTTCACTTGGGTTAGTGCTTATCGCTG
CAACGGTTCCACGAATCGCAATGATGGTATTTGGTGGGATTTTAGCAGATCGCTATAAGAAAACTTCTATTATGTTTGTA
ACTAATTTCATGCAAGGGGTATTATTGTTAACTTTATTTTTACTTGTATGGAATGATGCGGCATCTATTATGATGTTATT
AATCTTAGCAGCAGGCTTTGGGATGTTGGATGCTTTCTTTGGTCCAGCAAGCTCATCGTTAATTCCTAAGATTGTAGAGA
AGAGGCAGTTACAACAAGCGAATGCTATTTTTCAAGGAGCGGACCAGATCGCATTTATAGCGGGTCCTATACTTGCAGGG
GTTTTAATGGAAACAGTGGGGGTAGCTGGGAGCTATTTTGTTGCCACGATATTTGCTTTCTTATCTGCTGTCATTATTTA
TCCAAAATTTATAAAGGAAGCTCCAGTAGAACATGAAGTGCAACAACAGCCAGTGAAGGAAATGAAAGAAGGTTTTCAGT
ATATCCGCAAGTCGAATTTTTTGTTGACGGGGTTAGTTGTTTTAATTACCCTAAACTTTTTTGTCTTCGGTACATTGCAC
ATTGCAATACCATTGCTAGTAGAAAGTTACGGAGGCTCACCATTAAATTTAAGTTATATGGAGTCGAGTCTTGGAATTGG
TCTCCTCATTGGTACTGGAATATTAAGTTCGATACTCATTAAAAACAAAGGAAAGACATCTTTGATTGGTTTAACAGGCG
CCATTATTGCTTACCTTATATTCGCTTTAGTTCCTAACCTAACATTACTAACTATTGTGGTATTCTTTATTGGCTTTTCC
ATGTCGTTTGTGTTTGTACCATTTTTTACAGCTGCACAAGAAATTACAGAAGATCACATTATGGGAAGGGTAATGAGTAT
TATATTCTTAGCTATGAATGGCTTCGATCCACTCGCCTATGCAATTGTTTCTGGATTAGCGGCGATGGAAATTTCCATAC
AGGTCATTCTATTTAGTTTTGGAACCATTGGAGCGATTATCACGATTCTTTTATTTGTAAAAGCAAAAACCTACCAAAGC
AAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTCATCTAACAACGACCGTTCGGTAGGTTGGTCGTTTAGTACACTAATTATTAATAGTATATCTTGTTCAATTTTATA
TGCAAAGGCGGAGGATAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGAATGAAAAAAGGAGTGTCGTTTTGAAGGGAAAGCAACAAAAACAAGATATAGACAAGATTAAAATAAAGTAAGCACC
TTGCTTGGATGATAACTTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 401; Mature: 400

Protein sequence:

>401_residues
MATQSLLRNRIFVLLFVAGIFAVVSFSMFLTTTTWFVISESNSAGSLGLVLIAATVPRIAMMVFGGILADRYKKTSIMFV
TNFMQGVLLLTLFLLVWNDAASIMMLLILAAGFGMLDAFFGPASSSLIPKIVEKRQLQQANAIFQGADQIAFIAGPILAG
VLMETVGVAGSYFVATIFAFLSAVIIYPKFIKEAPVEHEVQQQPVKEMKEGFQYIRKSNFLLTGLVVLITLNFFVFGTLH
IAIPLLVESYGGSPLNLSYMESSLGIGLLIGTGILSSILIKNKGKTSLIGLTGAIIAYLIFALVPNLTLLTIVVFFIGFS
MSFVFVPFFTAAQEITEDHIMGRVMSIIFLAMNGFDPLAYAIVSGLAAMEISIQVILFSFGTIGAIITILLFVKAKTYQS
K

Sequences:

>Translated_401_residues
MATQSLLRNRIFVLLFVAGIFAVVSFSMFLTTTTWFVISESNSAGSLGLVLIAATVPRIAMMVFGGILADRYKKTSIMFV
TNFMQGVLLLTLFLLVWNDAASIMMLLILAAGFGMLDAFFGPASSSLIPKIVEKRQLQQANAIFQGADQIAFIAGPILAG
VLMETVGVAGSYFVATIFAFLSAVIIYPKFIKEAPVEHEVQQQPVKEMKEGFQYIRKSNFLLTGLVVLITLNFFVFGTLH
IAIPLLVESYGGSPLNLSYMESSLGIGLLIGTGILSSILIKNKGKTSLIGLTGAIIAYLIFALVPNLTLLTIVVFFIGFS
MSFVFVPFFTAAQEITEDHIMGRVMSIIFLAMNGFDPLAYAIVSGLAAMEISIQVILFSFGTIGAIITILLFVKAKTYQS
K
>Mature_400_residues
ATQSLLRNRIFVLLFVAGIFAVVSFSMFLTTTTWFVISESNSAGSLGLVLIAATVPRIAMMVFGGILADRYKKTSIMFVT
NFMQGVLLLTLFLLVWNDAASIMMLLILAAGFGMLDAFFGPASSSLIPKIVEKRQLQQANAIFQGADQIAFIAGPILAGV
LMETVGVAGSYFVATIFAFLSAVIIYPKFIKEAPVEHEVQQQPVKEMKEGFQYIRKSNFLLTGLVVLITLNFFVFGTLHI
AIPLLVESYGGSPLNLSYMESSLGIGLLIGTGILSSILIKNKGKTSLIGLTGAIIAYLIFALVPNLTLLTIVVFFIGFSM
SFVFVPFFTAAQEITEDHIMGRVMSIIFLAMNGFDPLAYAIVSGLAAMEISIQVILFSFGTIGAIITILLFVKAKTYQSK

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43473; Mature: 43342

Theoretical pI: Translated: 9.41; Mature: 9.41

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MATQSLLRNRIFVLLFVAGIFAVVSFSMFLTTTTWFVISESNSAGSLGLVLIAATVPRIA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
MMVFGGILADRYKKTSIMFVTNFMQGVLLLTLFLLVWNDAASIMMLLILAAGFGMLDAFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHC
GPASSSLIPKIVEKRQLQQANAIFQGADQIAFIAGPILAGVLMETVGVAGSYFVATIFAF
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LSAVIIYPKFIKEAPVEHEVQQQPVKEMKEGFQYIRKSNFLLTGLVVLITLNFFVFGTLH
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAIPLLVESYGGSPLNLSYMESSLGIGLLIGTGILSSILIKNKGKTSLIGLTGAIIAYLI
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FALVPNLTLLTIVVFFIGFSMSFVFVPFFTAAQEITEDHIMGRVMSIIFLAMNGFDPLAY
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
AIVSGLAAMEISIQVILFSFGTIGAIITILLFVKAKTYQSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
ATQSLLRNRIFVLLFVAGIFAVVSFSMFLTTTTWFVISESNSAGSLGLVLIAATVPRIA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
MMVFGGILADRYKKTSIMFVTNFMQGVLLLTLFLLVWNDAASIMMLLILAAGFGMLDAFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHC
GPASSSLIPKIVEKRQLQQANAIFQGADQIAFIAGPILAGVLMETVGVAGSYFVATIFAF
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LSAVIIYPKFIKEAPVEHEVQQQPVKEMKEGFQYIRKSNFLLTGLVVLITLNFFVFGTLH
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAIPLLVESYGGSPLNLSYMESSLGIGLLIGTGILSSILIKNKGKTSLIGLTGAIIAYLI
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FALVPNLTLLTIVVFFIGFSMSFVFVPFFTAAQEITEDHIMGRVMSIIFLAMNGFDPLAY
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
AIVSGLAAMEISIQVILFSFGTIGAIITILLFVKAKTYQSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]