| Definition | Oceanobacillus iheyensis HTE831, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004193 |
| Length | 3,630,528 |
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The map label for this gene is pip [H]
Identifier: 23100190
GI number: 23100190
Start: 2803221
End: 2805383
Strand: Direct
Name: pip [H]
Synonym: OB2735
Alternate gene names: 23100190
Gene position: 2803221-2805383 (Clockwise)
Preceding gene: 23100189
Following gene: 23100197
Centisome position: 77.21
GC content: 36.89
Gene sequence:
>2163_bases ATGAGAAACATATGGAATATTTTTTCGACCGATGTTCGTAAAACAGGTACGAATTGGATTGCACTTATTATTCTAGGCGG TCTATTAATTTTACCGTCCTTATATGCATGGTTAAATATTAAAGCTGCCTGGGATCCTTATAGTCAGGTCGATGAAGTAC CAGTTGGAATTGTAAATGAAGACATCGGTGCAGAAGTGCGTGGGGAAAAAATTCATATTGGAGACGAACTTATATCCACT TTAAAAGAGGATAACTCCATGAATTGGCAATTTGATGACAGAGAAGGCGCGATGAAACACATTGAAAATGGTGACTATTA TGCAGTCATAATTATCCCAGAAGACTTCTCTAAAAAACTAGGAACCGTTACCACAGGAAACCCTGAGAAAGCAAATGTAG AATACTATGTGAATGAAAAGGTAAATGCAATTACTCCACAAATGACCAACCGTGGTGCAAGCACAATTGTTGAAAATGTG AGTAGTCAGTTTGTATCAACGGTAAATGGTGTTATTTTTGATTTATTTAATCAAATTGGTGTACAACTAGAAAATGATTT ACCAGATATTGAACGATTTGAAGAATACTTATTTAATGTGGAAGCTAGTTTACCGGAAATAGAAGAACTGTTATCAAGTA CCTTAGCCGATGCAGAGAATGCAGCTAATTTAATTAATGAAGCACAAGGGTTAATTCCTCGTGTAGAAGTTACAACGAAT GATGGACTAACTACAATAGATGATACGATATCTTTCCTTCATGATGCAGAGGACCGTTTGAACGAAATGGCTCCACAAAT TCAACAAGATTTAGAAACGATTCAGGAAGTGACACAGTCAACAAATGATTTCTTACAAGATGTTCAAGATTCTACTATCG ACATTGGTAATGGTAATGACATAGCACAACAAGTTGATACACAAATAGAAGATGGATTAGAACGCCTTACAACAATAGAA GATGCACTAACTCAAGTACAAGAACAATTAGATCCTGAGCAGCCTGAATATGAACAAATTCAACATTCACTTGATCAGAT AGTTTCTTTAAGAGAAACTTTAGAAACTGTCCAAGCAGATGCCAAAGAAATTAATACTGTTATGCAGAACGCACAAGACG AAGTATCCACTTTACTTGATGATTTAAAAGAACGTGCTCAAACCGTTAATGAACAAGTAGATGCGTTTGTTGTTGAATAT AACGATACGATTGAACCAACGGTACGTCAAACAGTTGATGAAGCTCTTGGCACATTACAACAAGCAAGGGGAATACTCGT AGATATTCAAACAACTATCCCAGAAGTGGAATCGATTCTTGCTTCTACAGACGGGAATTTACAGGAAGGGACCGATACAA TTAATACTGTACTCGGTGAATTCCCTTATGTGAGTACGAAAGTAAATGAATTAGCGGATCGCATTCGCGAAATACAAGAT GAAGCCGATTTACAAGAAATCATTGAGTTACTTCAGAATGACCCTGAGGCAGAGCAAAGCTTTTTCCAAGAACCAGTAAC CGTAGATGAGACTGAGATATTTCCGATTGCCAATTATGGAGCGGGAATGACACCTTTCTATACGGTTCTCGCAATCTGGG TTGGTGGACTATTATTAATTTCATTGTTGTCGACTGAAGTTCACCATGTATCAAACTTCACACTTCGCCAAGAATACTTC GGTAAGTTGATGACTTTCTTAGTAATCGGGATAATTCAAACCATCATTATTACATTCGGAGATATTTTTATTCTTGGAGT AGAGATGGCACATCCTTTATGGTTTATCGTGTTTGGGTTATTTATAAGTTTCATGTTCATTACGATTATTTACACGCTTG TCTCTGTATTTGGAGACGTTGGTAAAGCAATGGTTATCGTTTTTCTTGTATTACAAATTGCTGGTTCTGGGGGAACGTAC CCAGCGATGTTATTACCAGAGTTCTTCCAAGCGATTAATCCATTCTTACCGTTCACGTATGCAATAGATTTATTACGTGA AGCAGTCGGCGGGATTATCTGGAGCAAAGCGATTAAAGATATGCTTGTGTTAGCATTATTTGGTTTTATATTCTTTGCTT TAGGAGCTTTCTTTAAGCAACCAATTAACAAACATACGAGAAAATTAGCGAAAAAATCACGCGAATCCGGATTATTCCAT TAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GGCTATCAAGAATTGTTCTCGCGTACTTACTAGTTTTTTTAAAAAAAGTTTGGTATAGTGTTACTCGTATGAACAAATTA ACTTGATAGGAAGACATAGA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAAAAGAGTGATAGTACAGATTCAGCCAATTTGAAAAAGAAATTTCTCTTTCAAATTGGCTGATATTATTACATAAAAC CTAACTCATATTCTGTCTTT
Product: phage infection protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 720; Mature: 720
Protein sequence:
>720_residues MRNIWNIFSTDVRKTGTNWIALIILGGLLILPSLYAWLNIKAAWDPYSQVDEVPVGIVNEDIGAEVRGEKIHIGDELIST LKEDNSMNWQFDDREGAMKHIENGDYYAVIIIPEDFSKKLGTVTTGNPEKANVEYYVNEKVNAITPQMTNRGASTIVENV SSQFVSTVNGVIFDLFNQIGVQLENDLPDIERFEEYLFNVEASLPEIEELLSSTLADAENAANLINEAQGLIPRVEVTTN DGLTTIDDTISFLHDAEDRLNEMAPQIQQDLETIQEVTQSTNDFLQDVQDSTIDIGNGNDIAQQVDTQIEDGLERLTTIE DALTQVQEQLDPEQPEYEQIQHSLDQIVSLRETLETVQADAKEINTVMQNAQDEVSTLLDDLKERAQTVNEQVDAFVVEY NDTIEPTVRQTVDEALGTLQQARGILVDIQTTIPEVESILASTDGNLQEGTDTINTVLGEFPYVSTKVNELADRIREIQD EADLQEIIELLQNDPEAEQSFFQEPVTVDETEIFPIANYGAGMTPFYTVLAIWVGGLLLISLLSTEVHHVSNFTLRQEYF GKLMTFLVIGIIQTIIITFGDIFILGVEMAHPLWFIVFGLFISFMFITIIYTLVSVFGDVGKAMVIVFLVLQIAGSGGTY PAMLLPEFFQAINPFLPFTYAIDLLREAVGGIIWSKAIKDMLVLALFGFIFFALGAFFKQPINKHTRKLAKKSRESGLFH
Sequences:
>Translated_720_residues MRNIWNIFSTDVRKTGTNWIALIILGGLLILPSLYAWLNIKAAWDPYSQVDEVPVGIVNEDIGAEVRGEKIHIGDELIST LKEDNSMNWQFDDREGAMKHIENGDYYAVIIIPEDFSKKLGTVTTGNPEKANVEYYVNEKVNAITPQMTNRGASTIVENV SSQFVSTVNGVIFDLFNQIGVQLENDLPDIERFEEYLFNVEASLPEIEELLSSTLADAENAANLINEAQGLIPRVEVTTN DGLTTIDDTISFLHDAEDRLNEMAPQIQQDLETIQEVTQSTNDFLQDVQDSTIDIGNGNDIAQQVDTQIEDGLERLTTIE DALTQVQEQLDPEQPEYEQIQHSLDQIVSLRETLETVQADAKEINTVMQNAQDEVSTLLDDLKERAQTVNEQVDAFVVEY NDTIEPTVRQTVDEALGTLQQARGILVDIQTTIPEVESILASTDGNLQEGTDTINTVLGEFPYVSTKVNELADRIREIQD EADLQEIIELLQNDPEAEQSFFQEPVTVDETEIFPIANYGAGMTPFYTVLAIWVGGLLLISLLSTEVHHVSNFTLRQEYF GKLMTFLVIGIIQTIIITFGDIFILGVEMAHPLWFIVFGLFISFMFITIIYTLVSVFGDVGKAMVIVFLVLQIAGSGGTY PAMLLPEFFQAINPFLPFTYAIDLLREAVGGIIWSKAIKDMLVLALFGFIFFALGAFFKQPINKHTRKLAKKSRESGLFH >Mature_720_residues MRNIWNIFSTDVRKTGTNWIALIILGGLLILPSLYAWLNIKAAWDPYSQVDEVPVGIVNEDIGAEVRGEKIHIGDELIST LKEDNSMNWQFDDREGAMKHIENGDYYAVIIIPEDFSKKLGTVTTGNPEKANVEYYVNEKVNAITPQMTNRGASTIVENV SSQFVSTVNGVIFDLFNQIGVQLENDLPDIERFEEYLFNVEASLPEIEELLSSTLADAENAANLINEAQGLIPRVEVTTN DGLTTIDDTISFLHDAEDRLNEMAPQIQQDLETIQEVTQSTNDFLQDVQDSTIDIGNGNDIAQQVDTQIEDGLERLTTIE DALTQVQEQLDPEQPEYEQIQHSLDQIVSLRETLETVQADAKEINTVMQNAQDEVSTLLDDLKERAQTVNEQVDAFVVEY NDTIEPTVRQTVDEALGTLQQARGILVDIQTTIPEVESILASTDGNLQEGTDTINTVLGEFPYVSTKVNELADRIREIQD EADLQEIIELLQNDPEAEQSFFQEPVTVDETEIFPIANYGAGMTPFYTVLAIWVGGLLLISLLSTEVHHVSNFTLRQEYF GKLMTFLVIGIIQTIIITFGDIFILGVEMAHPLWFIVFGLFISFMFITIIYTLVSVFGDVGKAMVIVFLVLQIAGSGGTY PAMLLPEFFQAINPFLPFTYAIDLLREAVGGIIWSKAIKDMLVLALFGFIFFALGAFFKQPINKHTRKLAKKSRESGLFH
Specific function: Required for phage infection [H]
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80566; Mature: 80566
Theoretical pI: Translated: 3.90; Mature: 3.90
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRNIWNIFSTDVRKTGTNWIALIILGGLLILPSLYAWLNIKAAWDPYSQVDEVPVGIVNE CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCC DIGAEVRGEKIHIGDELISTLKEDNSMNWQFDDREGAMKHIENGDYYAVIIIPEDFSKKL CCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHC GTVTTGNPEKANVEYYVNEKVNAITPQMTNRGASTIVENVSSQFVSTVNGVIFDLFNQIG CCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC VQLENDLPDIERFEEYLFNVEASLPEIEELLSSTLADAENAANLINEAQGLIPRVEVTTN CEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECC DGLTTIDDTISFLHDAEDRLNEMAPQIQQDLETIQEVTQSTNDFLQDVQDSTIDIGNGND CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCH IAQQVDTQIEDGLERLTTIEDALTQVQEQLDPEQPEYEQIQHSLDQIVSLRETLETVQAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKEINTVMQNAQDEVSTLLDDLKERAQTVNEQVDAFVVEYNDTIEPTVRQTVDEALGTLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH QARGILVDIQTTIPEVESILASTDGNLQEGTDTINTVLGEFPYVSTKVNELADRIREIQD HHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH EADLQEIIELLQNDPEAEQSFFQEPVTVDETEIFPIANYGAGMTPFYTVLAIWVGGLLLI HCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SLLSTEVHHVSNFTLRQEYFGKLMTFLVIGIIQTIIITFGDIFILGVEMAHPLWFIVFGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FISFMFITIIYTLVSVFGDVGKAMVIVFLVLQIAGSGGTYPAMLLPEFFQAINPFLPFTY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH AIDLLREAVGGIIWSKAIKDMLVLALFGFIFFALGAFFKQPINKHTRKLAKKSRESGLFH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MRNIWNIFSTDVRKTGTNWIALIILGGLLILPSLYAWLNIKAAWDPYSQVDEVPVGIVNE CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCC DIGAEVRGEKIHIGDELISTLKEDNSMNWQFDDREGAMKHIENGDYYAVIIIPEDFSKKL CCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHC GTVTTGNPEKANVEYYVNEKVNAITPQMTNRGASTIVENVSSQFVSTVNGVIFDLFNQIG CCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC VQLENDLPDIERFEEYLFNVEASLPEIEELLSSTLADAENAANLINEAQGLIPRVEVTTN CEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECC DGLTTIDDTISFLHDAEDRLNEMAPQIQQDLETIQEVTQSTNDFLQDVQDSTIDIGNGND CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCH IAQQVDTQIEDGLERLTTIEDALTQVQEQLDPEQPEYEQIQHSLDQIVSLRETLETVQAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKEINTVMQNAQDEVSTLLDDLKERAQTVNEQVDAFVVEYNDTIEPTVRQTVDEALGTLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH QARGILVDIQTTIPEVESILASTDGNLQEGTDTINTVLGEFPYVSTKVNELADRIREIQD HHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH EADLQEIIELLQNDPEAEQSFFQEPVTVDETEIFPIANYGAGMTPFYTVLAIWVGGLLLI HCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SLLSTEVHHVSNFTLRQEYFGKLMTFLVIGIIQTIIITFGDIFILGVEMAHPLWFIVFGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FISFMFITIIYTLVSVFGDVGKAMVIVFLVLQIAGSGGTYPAMLLPEFFQAINPFLPFTY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH AIDLLREAVGGIIWSKAIKDMLVLALFGFIFFALGAFFKQPINKHTRKLAKKSRESGLFH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8366036 [H]