| Definition | Oceanobacillus iheyensis HTE831, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004193 |
| Length | 3,630,528 |
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The map label for this gene is 23099824
Identifier: 23099824
GI number: 23099824
Start: 2419450
End: 2421018
Strand: Reverse
Name: 23099824
Synonym: OB2369
Alternate gene names: NA
Gene position: 2421018-2419450 (Counterclockwise)
Preceding gene: 23099825
Following gene: 23099823
Centisome position: 66.69
GC content: 35.63
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TCGTTGTTTTTTTTGTGCTTAAAAATAGCAACGTTGCTTTACATCAAGAGCATTTCGGGTATTATCTCCATCACCAAATA ATTATTTGGAGGTAACAACT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGAAATTTGAAATCACATGAGGTAATAGGATTACTATTACTCATGTGATTTTTTTAAATGTAAATAAACGCCTATTAAAT TATCAGAACCGTTTGACAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 522; Mature: 522
Protein sequence:
>522_residues MEGTIYSLIPAVIMLLLVIITRNVLISLGTGIIVGALLIHNFNILSSITEIWEVFYTIFYADGEWQIGNIFLLSFLILLG ILTAFLQASGGSRAFGDWMMKRVKTRTGAQVMTAVIGIIIFIDDYFNSLAVGQIARPLTDRHRISRAKLAYFIDSSSAPV TVLAPISSWGAYIIGTLGTLFAANEITEYQPFEAFIQMIPLNFYAISAIILVFIVAYFHLDLGPMHTHEKRAEKDGELLS PEQDNVAGDLGDVFDPHKDGKVYHLLVPIIVLFIVTIGSMYTTGVIEASSYGLIDAFANTNVNLSLILGGLSSVIVAAVF YFSQRVPRSEFGKILIEGTKTMMPAINILLLAWMIGSIIGSIGTGDYLAGLVENASINVSLLPVILFIISAIMALATGTS WGTFGIMLPIAANIMVNTDESLLLPALAAVLAGAVFGDHCSPISDTTVLSSTGAGANHIDHVLTQLPYAIIAAVSAIVGF TLVGYTHSTLLSLLVTILLMSIIVIVLKKSVVDRRKEKTTMK
Sequences:
>Translated_522_residues MEGTIYSLIPAVIMLLLVIITRNVLISLGTGIIVGALLIHNFNILSSITEIWEVFYTIFYADGEWQIGNIFLLSFLILLG ILTAFLQASGGSRAFGDWMMKRVKTRTGAQVMTAVIGIIIFIDDYFNSLAVGQIARPLTDRHRISRAKLAYFIDSSSAPV TVLAPISSWGAYIIGTLGTLFAANEITEYQPFEAFIQMIPLNFYAISAIILVFIVAYFHLDLGPMHTHEKRAEKDGELLS PEQDNVAGDLGDVFDPHKDGKVYHLLVPIIVLFIVTIGSMYTTGVIEASSYGLIDAFANTNVNLSLILGGLSSVIVAAVF YFSQRVPRSEFGKILIEGTKTMMPAINILLLAWMIGSIIGSIGTGDYLAGLVENASINVSLLPVILFIISAIMALATGTS WGTFGIMLPIAANIMVNTDESLLLPALAAVLAGAVFGDHCSPISDTTVLSSTGAGANHIDHVLTQLPYAIIAAVSAIVGF TLVGYTHSTLLSLLVTILLMSIIVIVLKKSVVDRRKEKTTMK >Mature_522_residues MEGTIYSLIPAVIMLLLVIITRNVLISLGTGIIVGALLIHNFNILSSITEIWEVFYTIFYADGEWQIGNIFLLSFLILLG ILTAFLQASGGSRAFGDWMMKRVKTRTGAQVMTAVIGIIIFIDDYFNSLAVGQIARPLTDRHRISRAKLAYFIDSSSAPV TVLAPISSWGAYIIGTLGTLFAANEITEYQPFEAFIQMIPLNFYAISAIILVFIVAYFHLDLGPMHTHEKRAEKDGELLS PEQDNVAGDLGDVFDPHKDGKVYHLLVPIIVLFIVTIGSMYTTGVIEASSYGLIDAFANTNVNLSLILGGLSSVIVAAVF YFSQRVPRSEFGKILIEGTKTMMPAINILLLAWMIGSIIGSIGTGDYLAGLVENASINVSLLPVILFIISAIMALATGTS WGTFGIMLPIAANIMVNTDESLLLPALAAVLAGAVFGDHCSPISDTTVLSSTGAGANHIDHVLTQLPYAIIAAVSAIVGF TLVGYTHSTLLSLLVTILLMSIIVIVLKKSVVDRRKEKTTMK
Specific function: Unknown
COG id: COG1757
COG function: function code C; Na+/H+ antiporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018461 [H]
Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56282; Mature: 56282
Theoretical pI: Translated: 5.75; Mature: 5.75
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEGTIYSLIPAVIMLLLVIITRNVLISLGTGIIVGALLIHNFNILSSITEIWEVFYTIFY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE ADGEWQIGNIFLLSFLILLGILTAFLQASGGSRAFGDWMMKRVKTRTGAQVMTAVIGIII ECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIDDYFNSLAVGQIARPLTDRHRISRAKLAYFIDSSSAPVTVLAPISSWGAYIIGTLGTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHH FAANEITEYQPFEAFIQMIPLNFYAISAIILVFIVAYFHLDLGPMHTHEKRAEKDGELLS HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCC PEQDNVAGDLGDVFDPHKDGKVYHLLVPIIVLFIVTIGSMYTTGVIEASSYGLIDAFANT CCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCEEHHCCC NVNLSLILGGLSSVIVAAVFYFSQRVPRSEFGKILIEGTKTMMPAINILLLAWMIGSIIG CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SIGTGDYLAGLVENASINVSLLPVILFIISAIMALATGTSWGTFGIMLPIAANIMVNTDE CCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCEEEECCCH SLLLPALAAVLAGAVFGDHCSPISDTTVLSSTGAGANHIDHVLTQLPYAIIAAVSAIVGF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLVGYTHSTLLSLLVTILLMSIIVIVLKKSVVDRRKEKTTMK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MEGTIYSLIPAVIMLLLVIITRNVLISLGTGIIVGALLIHNFNILSSITEIWEVFYTIFY CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE ADGEWQIGNIFLLSFLILLGILTAFLQASGGSRAFGDWMMKRVKTRTGAQVMTAVIGIII ECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIDDYFNSLAVGQIARPLTDRHRISRAKLAYFIDSSSAPVTVLAPISSWGAYIIGTLGTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHH FAANEITEYQPFEAFIQMIPLNFYAISAIILVFIVAYFHLDLGPMHTHEKRAEKDGELLS HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCC PEQDNVAGDLGDVFDPHKDGKVYHLLVPIIVLFIVTIGSMYTTGVIEASSYGLIDAFANT CCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCEEHHCCC NVNLSLILGGLSSVIVAAVFYFSQRVPRSEFGKILIEGTKTMMPAINILLLAWMIGSIIG CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCEEHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SIGTGDYLAGLVENASINVSLLPVILFIISAIMALATGTSWGTFGIMLPIAANIMVNTDE CCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCEEEECCCH SLLLPALAAVLAGAVFGDHCSPISDTTVLSSTGAGANHIDHVLTQLPYAIIAAVSAIVGF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLVGYTHSTLLSLLVTILLMSIIVIVLKKSVVDRRKEKTTMK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]