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The map label for this gene is spoVB [H]

Identifier: 23099484

GI number: 23099484

Start: 2057848

End: 2059395

Strand: Direct

Name: spoVB [H]

Synonym: OB2029

Alternate gene names: 23099484

Gene position: 2057848-2059395 (Clockwise)

Preceding gene: 23099473

Following gene: 23099486

Centisome position: 56.68

GC content: 34.95

Gene sequence:

>1548_bases
ATGACCAAACAATCATTTCTACAAGGAGCTTTAATATTAATTGTTGCTGGAATGATCACCCGATTTATGGGGTTTATTAA
CCGGATAGTTGTTGCAAGATTGATGGGAGAAGAAGGTGTCGGACTATACATGATGGCATTACCAACTTTATTTTTGGTAA
TGACATTAACACAGTTCGGACTTCCAGTTGCTATTTCAAAACGGGTTGCAGAAGCTGATGCACAAAATGATCAACATAGA
ATTAAAAAGATAGTCGTTGTATCGTTAGCTATTACTCTAACAGCTAGTATTGTCTTTACTGCAATATTAATACTTGTAGC
ACCTTTAGTTGCATCAACATTGCTAACCGATGAACGAGTTATGGTTCCACTTATTGTAATTAGTCCTATTATTCCAATTG
CAGCTATGTCAGCAGTATTACGAGGATATTTTCAAGGAAAGCAAAATATGACCCCTCAAAGTGTAGCTCAAGTTATTGAA
CAAATAGTAAGAATTATCTGTGTTGCTGTATTTATTCAATTACTACTCCCTTATGGAGTAGAATACGCTGCTGCTGGAGC
AATGTTTAGTGTAATTCTTGGTGAATTTATTTCTTTACTTTATATGGTCCGTAAGTTTAAACGAAAACGAACCGTTAAAG
TTAGGAATAATTTTTTTAGAGTGTTAAGTGAAGGAAAACAAACTGCTAAGGACTTATTTTCTATCTCACTCCCCACCTTA
GGCAGCAGAATGATTGGTTCCTTCTCTAACTTTTTAGATCCTATTTTAGTAGTTCAAAGTCTCGCAATCGCCGGAGTAAC
TGCTACTGTCGCCACTAAGCAATACGGTGAGCTCACCGGATATGCGATGCCATTGTTATTTCTACCAACATTTATAACAA
GTTCATTATCTATTGCACTTGTACCTTCTATTGCAGAAGCAGAAGCTAATAAACAAATAAGCGTGATTCACAATCGTATC
CACCAATCAATACGAATCTCCTTTGCATCTGGAGCAATTTCAACTGTTGTCCTTACGGTTTTTGCTACAGAAATACTCAC
GTATATGTACGGTACAGATTCTGCAAGTAAATTTTTATTGTTAATGGCACCCTTCTTCTTGTTTCTTTATATACAAGCTC
CCCTACAATCTGCTCTACAGGCTCTTGATTTGGCCAGACCGGCTATGTGGAATAGCCTTATCGGTATGGGGTTAAAATTC
ATAGTAATGATTTTGTTTGCATCTAATCCTTCATTTGGTATTTTAGGTGCTGCAATGGCAATTTGTGTAAGTGTCGTAAT
TGTAACTCTCCTTCATTTAGCAGTATTGAAGAAAAACATTAATTATATGATTCCGTTTATTGATTTTGTAAAGATGATTA
TTTTAGTTGGTCTTACATTCTGGATCGGATATTCATTAAAACAATTCATCCCAAATCTAGACGGGCAGATATTTATATTC
GGAACTTTATTAATTGCATTACTATCTATCTATATCCTATTGCTATTTATATTGAAATTTATAACAAAGCAAGAGCTTCA
GCAAATTCCCTTATTTAGAAAGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCCATTATAGATGGGAACAACTGTCATGCTTTGTCCACCTAATTGCATATATATCATTGTATATCAATTTTAAATATTT
GAGAAGGCAGGTCGACAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCTTAAAACAAGCTACTTTGAAAAATAGAAAACAAAAGAACGACCAATATAGAGGATATATGTATACTATCCAACTTTAT
TGGTCGTTCTTTACTTATTT

Product: stage V sporulation protein B

Products: NA

Alternate protein names: Stage III sporulation protein F [H]

Number of amino acids: Translated: 515; Mature: 514

Protein sequence:

>515_residues
MTKQSFLQGALILIVAGMITRFMGFINRIVVARLMGEEGVGLYMMALPTLFLVMTLTQFGLPVAISKRVAEADAQNDQHR
IKKIVVVSLAITLTASIVFTAILILVAPLVASTLLTDERVMVPLIVISPIIPIAAMSAVLRGYFQGKQNMTPQSVAQVIE
QIVRIICVAVFIQLLLPYGVEYAAAGAMFSVILGEFISLLYMVRKFKRKRTVKVRNNFFRVLSEGKQTAKDLFSISLPTL
GSRMIGSFSNFLDPILVVQSLAIAGVTATVATKQYGELTGYAMPLLFLPTFITSSLSIALVPSIAEAEANKQISVIHNRI
HQSIRISFASGAISTVVLTVFATEILTYMYGTDSASKFLLLMAPFFLFLYIQAPLQSALQALDLARPAMWNSLIGMGLKF
IVMILFASNPSFGILGAAMAICVSVVIVTLLHLAVLKKNINYMIPFIDFVKMIILVGLTFWIGYSLKQFIPNLDGQIFIF
GTLLIALLSIYILLLFILKFITKQELQQIPLFRKK

Sequences:

>Translated_515_residues
MTKQSFLQGALILIVAGMITRFMGFINRIVVARLMGEEGVGLYMMALPTLFLVMTLTQFGLPVAISKRVAEADAQNDQHR
IKKIVVVSLAITLTASIVFTAILILVAPLVASTLLTDERVMVPLIVISPIIPIAAMSAVLRGYFQGKQNMTPQSVAQVIE
QIVRIICVAVFIQLLLPYGVEYAAAGAMFSVILGEFISLLYMVRKFKRKRTVKVRNNFFRVLSEGKQTAKDLFSISLPTL
GSRMIGSFSNFLDPILVVQSLAIAGVTATVATKQYGELTGYAMPLLFLPTFITSSLSIALVPSIAEAEANKQISVIHNRI
HQSIRISFASGAISTVVLTVFATEILTYMYGTDSASKFLLLMAPFFLFLYIQAPLQSALQALDLARPAMWNSLIGMGLKF
IVMILFASNPSFGILGAAMAICVSVVIVTLLHLAVLKKNINYMIPFIDFVKMIILVGLTFWIGYSLKQFIPNLDGQIFIF
GTLLIALLSIYILLLFILKFITKQELQQIPLFRKK
>Mature_514_residues
TKQSFLQGALILIVAGMITRFMGFINRIVVARLMGEEGVGLYMMALPTLFLVMTLTQFGLPVAISKRVAEADAQNDQHRI
KKIVVVSLAITLTASIVFTAILILVAPLVASTLLTDERVMVPLIVISPIIPIAAMSAVLRGYFQGKQNMTPQSVAQVIEQ
IVRIICVAVFIQLLLPYGVEYAAAGAMFSVILGEFISLLYMVRKFKRKRTVKVRNNFFRVLSEGKQTAKDLFSISLPTLG
SRMIGSFSNFLDPILVVQSLAIAGVTATVATKQYGELTGYAMPLLFLPTFITSSLSIALVPSIAEAEANKQISVIHNRIH
QSIRISFASGAISTVVLTVFATEILTYMYGTDSASKFLLLMAPFFLFLYIQAPLQSALQALDLARPAMWNSLIGMGLKFI
VMILFASNPSFGILGAAMAICVSVVIVTLLHLAVLKKNINYMIPFIDFVKMIILVGLTFWIGYSLKQFIPNLDGQIFIFG
TLLIALLSIYILLLFILKFITKQELQQIPLFRKK

Specific function: Involved, directly or indirectly, in spore cortex biosynthesis. Affects only indirectly the expression of late sporulation genes [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR002797
- InterPro:   IPR014249 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56701; Mature: 56569

Theoretical pI: Translated: 10.44; Mature: 10.44

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKQSFLQGALILIVAGMITRFMGFINRIVVARLMGEEGVGLYMMALPTLFLVMTLTQFG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LPVAISKRVAEADAQNDQHRIKKIVVVSLAITLTASIVFTAILILVAPLVASTLLTDERV
CCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
MVPLIVISPIIPIAAMSAVLRGYFQGKQNMTPQSVAQVIEQIVRIICVAVFIQLLLPYGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
EYAAAGAMFSVILGEFISLLYMVRKFKRKRTVKVRNNFFRVLSEGKQTAKDLFSISLPTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
GSRMIGSFSNFLDPILVVQSLAIAGVTATVATKQYGELTGYAMPLLFLPTFITSSLSIAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHC
VPSIAEAEANKQISVIHNRIHQSIRISFASGAISTVVLTVFATEILTYMYGTDSASKFLL
CCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LMAPFFLFLYIQAPLQSALQALDLARPAMWNSLIGMGLKFIVMILFASNPSFGILGAAMA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
ICVSVVIVTLLHLAVLKKNINYMIPFIDFVKMIILVGLTFWIGYSLKQFIPNLDGQIFIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHH
GTLLIALLSIYILLLFILKFITKQELQQIPLFRKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TKQSFLQGALILIVAGMITRFMGFINRIVVARLMGEEGVGLYMMALPTLFLVMTLTQFG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LPVAISKRVAEADAQNDQHRIKKIVVVSLAITLTASIVFTAILILVAPLVASTLLTDERV
CCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
MVPLIVISPIIPIAAMSAVLRGYFQGKQNMTPQSVAQVIEQIVRIICVAVFIQLLLPYGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
EYAAAGAMFSVILGEFISLLYMVRKFKRKRTVKVRNNFFRVLSEGKQTAKDLFSISLPTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
GSRMIGSFSNFLDPILVVQSLAIAGVTATVATKQYGELTGYAMPLLFLPTFITSSLSIAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHC
VPSIAEAEANKQISVIHNRIHQSIRISFASGAISTVVLTVFATEILTYMYGTDSASKFLL
CCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LMAPFFLFLYIQAPLQSALQALDLARPAMWNSLIGMGLKFIVMILFASNPSFGILGAAMA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
ICVSVVIVTLLHLAVLKKNINYMIPFIDFVKMIILVGLTFWIGYSLKQFIPNLDGQIFIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHH
GTLLIALLSIYILLLFILKFITKQELQQIPLFRKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1744050; 9384377 [H]