| Definition | Oceanobacillus iheyensis HTE831, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004193 |
| Length | 3,630,528 |
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The map label for this gene is 23097745
Identifier: 23097745
GI number: 23097745
Start: 322898
End: 324067
Strand: Direct
Name: 23097745
Synonym: OB0290
Alternate gene names: NA
Gene position: 322898-324067 (Clockwise)
Preceding gene: 23097744
Following gene: 23097747
Centisome position: 8.89
GC content: 34.79
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TGTGGCATCGAAGTTGATTGGAAAATAGATGTTGATCTATTTTCTTTATTTTAAGCTTTTTACTATAATGAACGTTCTAT CTAAATAAGGAGGATGCACA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGACTTAGTAACTGGCTGGAAAAGTAATTTGTTCATGACGTAATGACATTTAAGGATGAACCATATATGATTGATTTATT GACGGACGGAGGATTGACTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Facilitator Transporter; Sugar Phosphate Permease; MFS Family Transporter; Mfs Transporter; Facilitator Superfamily; Arabinose Efflux Permease Family Protein; Sugar Efflux Permease MFS-Like; Facilitator Superfamily Transporter
Number of amino acids: Translated: 389; Mature: 389
Protein sequence:
>389_residues MKSRTLIMAGLPMIAVTYGLSRFSFGLMLPYIRESLTISQSVSGVISSLSYFAYCIAIIMAMIFAVKIGSKNIIMIAGLF SITGLGLIAGSNNSLLLGMGVFIAGLSTGLASPPYADIVSTKINTDKKDQTNSWINSGTSIGTAFTGMIALTMTNDWRQV YIIFAIVAFAVLLVNYFSLPRKNISKKEASPLSFFPYKQEWKNAIGLISASILLGISSAVYWTFSRDYIIGIEQLPTLLG DLFWVLIGLSGLAGGTAGYFVSKIGLSKAYVITVIMLSTASLLLGLFPTNTLSGIISPILFGSSYIFVTGLLIVWGTNTF ITNASFGLGVPFLLLALGQVFGSIIAGTISEAMGYPFLFIFSALIGYLTIFIWPKAKNKQETEQLSGLH
Sequences:
>Translated_389_residues MKSRTLIMAGLPMIAVTYGLSRFSFGLMLPYIRESLTISQSVSGVISSLSYFAYCIAIIMAMIFAVKIGSKNIIMIAGLF SITGLGLIAGSNNSLLLGMGVFIAGLSTGLASPPYADIVSTKINTDKKDQTNSWINSGTSIGTAFTGMIALTMTNDWRQV YIIFAIVAFAVLLVNYFSLPRKNISKKEASPLSFFPYKQEWKNAIGLISASILLGISSAVYWTFSRDYIIGIEQLPTLLG DLFWVLIGLSGLAGGTAGYFVSKIGLSKAYVITVIMLSTASLLLGLFPTNTLSGIISPILFGSSYIFVTGLLIVWGTNTF ITNASFGLGVPFLLLALGQVFGSIIAGTISEAMGYPFLFIFSALIGYLTIFIWPKAKNKQETEQLSGLH >Mature_389_residues MKSRTLIMAGLPMIAVTYGLSRFSFGLMLPYIRESLTISQSVSGVISSLSYFAYCIAIIMAMIFAVKIGSKNIIMIAGLF SITGLGLIAGSNNSLLLGMGVFIAGLSTGLASPPYADIVSTKINTDKKDQTNSWINSGTSIGTAFTGMIALTMTNDWRQV YIIFAIVAFAVLLVNYFSLPRKNISKKEASPLSFFPYKQEWKNAIGLISASILLGISSAVYWTFSRDYIIGIEQLPTLLG DLFWVLIGLSGLAGGTAGYFVSKIGLSKAYVITVIMLSTASLLLGLFPTNTLSGIISPILFGSSYIFVTGLLIVWGTNTF ITNASFGLGVPFLLLALGQVFGSIIAGTISEAMGYPFLFIFSALIGYLTIFIWPKAKNKQETEQLSGLH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 41796; Mature: 41796
Theoretical pI: Translated: 9.86; Mature: 9.86
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKSRTLIMAGLPMIAVTYGLSRFSFGLMLPYIRESLTISQSVSGVISSLSYFAYCIAIIM CCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AMIFAVKIGSKNIIMIAGLFSITGLGLIAGSNNSLLLGMGVFIAGLSTGLASPPYADIVS HHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHCCEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH TKINTDKKDQTNSWINSGTSIGTAFTGMIALTMTNDWRQVYIIFAIVAFAVLLVNYFSLP CCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC RKNISKKEASPLSFFPYKQEWKNAIGLISASILLGISSAVYWTFSRDYIIGIEQLPTLLG CCCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEHHHHHHHHH DLFWVLIGLSGLAGGTAGYFVSKIGLSKAYVITVIMLSTASLLLGLFPTNTLSGIISPIL HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH FGSSYIFVTGLLIVWGTNTFITNASFGLGVPFLLLALGQVFGSIIAGTISEAMGYPFLFI HCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH FSALIGYLTIFIWPKAKNKQETEQLSGLH HHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKSRTLIMAGLPMIAVTYGLSRFSFGLMLPYIRESLTISQSVSGVISSLSYFAYCIAIIM CCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AMIFAVKIGSKNIIMIAGLFSITGLGLIAGSNNSLLLGMGVFIAGLSTGLASPPYADIVS HHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHCCEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH TKINTDKKDQTNSWINSGTSIGTAFTGMIALTMTNDWRQVYIIFAIVAFAVLLVNYFSLP CCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC RKNISKKEASPLSFFPYKQEWKNAIGLISASILLGISSAVYWTFSRDYIIGIEQLPTLLG CCCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEHHHHHHHHH DLFWVLIGLSGLAGGTAGYFVSKIGLSKAYVITVIMLSTASLLLGLFPTNTLSGIISPIL HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH FGSSYIFVTGLLIVWGTNTFITNASFGLGVPFLLLALGQVFGSIIAGTISEAMGYPFLFI HCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH FSALIGYLTIFIWPKAKNKQETEQLSGLH HHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA