| Definition | Oceanobacillus iheyensis HTE831, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004193 |
| Length | 3,630,528 |
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The map label for this gene is 23097668
Identifier: 23097668
GI number: 23097668
Start: 230282
End: 232138
Strand: Direct
Name: 23097668
Synonym: OB0213
Alternate gene names: NA
Gene position: 230282-232138 (Clockwise)
Preceding gene: 23097667
Following gene: 23097669
Centisome position: 6.34
GC content: 34.95
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases GTTAGAAAAGGTTGATATCAGTCATAAAGATGTTACTACTGAGCAAAAGAAAATGGCAGTAGTCGCTGAGAGAGTTAATA AAAGAGAGGAGGTGCAATAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAGGGGGAAAGTATATGTATTTATTTACTGATACAACTCCTAGAGAGGAGCCTTTTATAGGCTCCTTTTCTCTACAAAC CATTTTCAATAACATGAATA
Product: bacteriophage minor tail subunit
Products: NA
Alternate protein names: Minor Tail -Like; Phage Tail Tape Measure Protein; Tail Protein; Phage-Related Minor Tail Protein; Bacteriophage Minor Tail Subunit; Prophage LambdaSa1 PblA Protein InteRNAl Deletion; Phage Tale Measure Protein; Bacteriophage Protein; TMP Repeat Protein; Tape Measure Protein; Minor Tail Protein Gp; Phage Protein; Phage-Related Protein Gp
Number of amino acids: Translated: 618; Mature: 617
Protein sequence:
>618_residues MSVNLSIDHYLEITGVKSYVNQFKNMTNEVGTLGNQLIDTGSSVKVLVDNLSAASGGIGPFKQLQDYLQSDTVQSFAGVF TGLVGAVDNTTAAIQSMQDVAQSIPNAFNSIQSTGKKLWGVLKANPILTIVSVIAGLIGVLFQLYQTNETVRGAIDSAWA AIQSVFTGTVDSMSNIDISGIISTIVTTLTTMLPVMLETGISFLQGFINGVLQQAPLLIEMVMSLIQTILNTFTTMIPLL IEVFSGVVTTLIDSIVMMLPLLITTIITLITTITETIILYLPMILNMGIQLINAIINGLIVALPMIIQAGISILTSLING ITTVIPQLLNVGMQLITSLVNTVVQLLPSLIQTGIQLLMSLIQGVLQVLPSLISMGIQLIIQLANSILSMLPQLLSAGIQ IVLSLLKGIGSLLVQVLSIGRDLVTRVLSGIAEKITGLATAGKNMVFKAIEGVKEASDRFVTAGKDLISGMITGIKDKAK DLVSTAVQAAKDAVNGVLSFLGIKSPSRLFMGIGDDTMEGFIVGVNQMSGKLSKAMVNVTNGATKAFHAEMSPNLDLAGE VNNVHQFSNPQSVAVQSNIEQANQPAYINLRIGNSDFQSFVEDISNVQERKAFRTRRV
Sequences:
>Translated_618_residues MSVNLSIDHYLEITGVKSYVNQFKNMTNEVGTLGNQLIDTGSSVKVLVDNLSAASGGIGPFKQLQDYLQSDTVQSFAGVF TGLVGAVDNTTAAIQSMQDVAQSIPNAFNSIQSTGKKLWGVLKANPILTIVSVIAGLIGVLFQLYQTNETVRGAIDSAWA AIQSVFTGTVDSMSNIDISGIISTIVTTLTTMLPVMLETGISFLQGFINGVLQQAPLLIEMVMSLIQTILNTFTTMIPLL IEVFSGVVTTLIDSIVMMLPLLITTIITLITTITETIILYLPMILNMGIQLINAIINGLIVALPMIIQAGISILTSLING ITTVIPQLLNVGMQLITSLVNTVVQLLPSLIQTGIQLLMSLIQGVLQVLPSLISMGIQLIIQLANSILSMLPQLLSAGIQ IVLSLLKGIGSLLVQVLSIGRDLVTRVLSGIAEKITGLATAGKNMVFKAIEGVKEASDRFVTAGKDLISGMITGIKDKAK DLVSTAVQAAKDAVNGVLSFLGIKSPSRLFMGIGDDTMEGFIVGVNQMSGKLSKAMVNVTNGATKAFHAEMSPNLDLAGE VNNVHQFSNPQSVAVQSNIEQANQPAYINLRIGNSDFQSFVEDISNVQERKAFRTRRV >Mature_617_residues SVNLSIDHYLEITGVKSYVNQFKNMTNEVGTLGNQLIDTGSSVKVLVDNLSAASGGIGPFKQLQDYLQSDTVQSFAGVFT GLVGAVDNTTAAIQSMQDVAQSIPNAFNSIQSTGKKLWGVLKANPILTIVSVIAGLIGVLFQLYQTNETVRGAIDSAWAA IQSVFTGTVDSMSNIDISGIISTIVTTLTTMLPVMLETGISFLQGFINGVLQQAPLLIEMVMSLIQTILNTFTTMIPLLI EVFSGVVTTLIDSIVMMLPLLITTIITLITTITETIILYLPMILNMGIQLINAIINGLIVALPMIIQAGISILTSLINGI TTVIPQLLNVGMQLITSLVNTVVQLLPSLIQTGIQLLMSLIQGVLQVLPSLISMGIQLIIQLANSILSMLPQLLSAGIQI VLSLLKGIGSLLVQVLSIGRDLVTRVLSGIAEKITGLATAGKNMVFKAIEGVKEASDRFVTAGKDLISGMITGIKDKAKD LVSTAVQAAKDAVNGVLSFLGIKSPSRLFMGIGDDTMEGFIVGVNQMSGKLSKAMVNVTNGATKAFHAEMSPNLDLAGEV NNVHQFSNPQSVAVQSNIEQANQPAYINLRIGNSDFQSFVEDISNVQERKAFRTRRV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 65778; Mature: 65646
Theoretical pI: Translated: 5.05; Mature: 5.05
Prosite motif: PS00445 FGGY_KINASES_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 4.0 %Met (Translated Protein) 4.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 3.9 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSVNLSIDHYLEITGVKSYVNQFKNMTNEVGTLGNQLIDTGSSVKVLVDNLSAASGGIGP CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC FKQLQDYLQSDTVQSFAGVFTGLVGAVDNTTAAIQSMQDVAQSIPNAFNSIQSTGKKLWG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLKANPILTIVSVIAGLIGVLFQLYQTNETVRGAIDSAWAAIQSVFTGTVDSMSNIDISG HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH IISTIVTTLTTMLPVMLETGISFLQGFINGVLQQAPLLIEMVMSLIQTILNTFTTMIPLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEVFSGVVTTLIDSIVMMLPLLITTIITLITTITETIILYLPMILNMGIQLINAIINGLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VALPMIIQAGISILTSLINGITTVIPQLLNVGMQLITSLVNTVVQLLPSLIQTGIQLLMS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIQGVLQVLPSLISMGIQLIIQLANSILSMLPQLLSAGIQIVLSLLKGIGSLLVQVLSIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RDLVTRVLSGIAEKITGLATAGKNMVFKAIEGVKEASDRFVTAGKDLISGMITGIKDKAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLVSTAVQAAKDAVNGVLSFLGIKSPSRLFMGIGDDTMEGFIVGVNQMSGKLSKAMVNVT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEECCCHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHC NGATKAFHAEMSPNLDLAGEVNNVHQFSNPQSVAVQSNIEQANQPAYINLRIGNSDFQSF CCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHH VEDISNVQERKAFRTRRV HHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure SVNLSIDHYLEITGVKSYVNQFKNMTNEVGTLGNQLIDTGSSVKVLVDNLSAASGGIGP CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC FKQLQDYLQSDTVQSFAGVFTGLVGAVDNTTAAIQSMQDVAQSIPNAFNSIQSTGKKLWG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLKANPILTIVSVIAGLIGVLFQLYQTNETVRGAIDSAWAAIQSVFTGTVDSMSNIDISG HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH IISTIVTTLTTMLPVMLETGISFLQGFINGVLQQAPLLIEMVMSLIQTILNTFTTMIPLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEVFSGVVTTLIDSIVMMLPLLITTIITLITTITETIILYLPMILNMGIQLINAIINGLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VALPMIIQAGISILTSLINGITTVIPQLLNVGMQLITSLVNTVVQLLPSLIQTGIQLLMS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIQGVLQVLPSLISMGIQLIIQLANSILSMLPQLLSAGIQIVLSLLKGIGSLLVQVLSIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RDLVTRVLSGIAEKITGLATAGKNMVFKAIEGVKEASDRFVTAGKDLISGMITGIKDKAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLVSTAVQAAKDAVNGVLSFLGIKSPSRLFMGIGDDTMEGFIVGVNQMSGKLSKAMVNVT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEECCCHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHC NGATKAFHAEMSPNLDLAGEVNNVHQFSNPQSVAVQSNIEQANQPAYINLRIGNSDFQSF CCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHH VEDISNVQERKAFRTRRV HHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA