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The map label for this gene is ydgH [H]

Identifier: 229917308

GI number: 229917308

Start: 1534247

End: 1536901

Strand: Reverse

Name: ydgH [H]

Synonym: EAT1b_1583

Alternate gene names: 229917308

Gene position: 1536901-1534247 (Counterclockwise)

Preceding gene: 229917309

Following gene: 229917307

Centisome position: 51.23

GC content: 50.06

Gene sequence:

>2655_bases
ATGCATAAAATCATTCAATGGCGCTGGGGAATTTTCATTTCCCTCATCGTATTGACGGCAGCATTATTTGTCGCAGCACC
GAACTTAACGAAACAAGCAGAAGAGGCAGGGAGCTTCCAACTTGCGGACGACATGGACTCACAACGCGCACAAGCAATTT
TAGATGAAGCCGGGAAGAGTGATAAAACCATCTCCCTCGTCTATGAGTTCGAATCAATCGGTGAGACGGAGCGAACAGAT
GTCGCGCGTGTCATCGAAGAACTTAAACAAAATGAAACGGTCGTGACAGATGTTCTCGATCCGTTCGAAAACGAGGAGAC
AGAGGCACAGCTCGTCTCAGAAGACGGACGCATCGTTCTCGTCCCCATCACGGTAGAAGGTACGACGGAAGAAATCAATG
CGTTTGCTGATGATGTCCGTGAAAACGTGCTCCCGCAAGAGGAGACAGTATATATCACCGGGGAAGAAATCATTAACAAT
GATGTGAATCTAAGTGCACAGGAAGGGTTGAAAAAGACAGAAATCATCACGGTCGTGTTGATTTTTGGATTACTCCTTCT
CGTCTTCCGTTCCATCGTGACCCCGTTCATCCCGCTCATCGCGGTCGGATTCACTTATCTATTGAGTCAATCCTTTGTCG
CGTTCTTCGTGGATTGGTTCGGGTTCCCGGTGTCCAACTACACGCAGATCTTCCTTGTCGCCATCTTGTTCGGGATTGGG
ACAGACTACTGTATCCTGCTTCTTAGCCGTTATAAAGAAGAACTCAGTGCAGGACATGCCATCGAAGACGCCATCGTCAA
TACGTACAAGACGGCAGGACGGACGGTCCTCATCAGTGGACTCGCGGTCTTCGTCGGTTTTGCCGCCATCGGATTTGCTG
ATTTTCCAATCTTTAAATCAGCGGTCGCCGTCGCAGTCGGGATTGCGGTGTTGCTGCTGATTCTCTTCACGGTCGTCCCA
TTCTTTATGGCGACGCTCAAACAGCGACTGTTTTGGCCGTCGAAAAAGGCAGGCGAGCATCATGACAGCAAGCTTTGGGC
TAGCTTGAGCCGATTGTCGGTCAATCGCCCGTTCGTATCGATTTTGGTCGTCGGGTTGATTACAGTACCCGTCTTATTCA
CATATGACGATGCCCGTTCGTTCAATACGGTCGATGAGATTGGAGACGGGTACGATTCGGTTCGTGGACTGAATTTGATC
TCAGAAGGGTTCGGTCAAGGGGAATCCCTTCCGGTACAAGTCATTTTGAGACAAGATCAAGCCATTACAGAATCAGAAGT
TCCCTATATCGAAAAGTTTGCAAGTGAGCTTGAAAAAGTCGAAGGTGTGAATGGTGTCCGTGCGCTCACACGTCCTACTG
GTGAAGTCATCGACGATTTTTATGTCGATACGCAGCTCAGTGAAGTCAGCGATGGCTTGTCTGAAGCGCAGACGGGTCTC
GGGGATGTTCAAACTGGATTGGATGAGATTGAGCAAGGATTGAACGGGATTGTTGGACAACTACCAAGCGGTTCAACCAA
TGCCGGGGCACCGCTTGCAGAAGCAGCAGCGGGGCTGAATCAGTTGAATGGTCAACTTGGTCTCATTGGGCAAGGATTGA
CAGCGACTCAAAACATCCCGGCCGCAGTCGGACAGCTCGGTCAAGTATCAGCTGGCCTCACACAAATTGAGTCAGGAATC
AACGAAGCGGCGTCCGCTTTAAATGCACAAGGTTCTCAGGTCGGTGAACTTGGTAGTGGGTTAGCGCAACTGGCGACAGG
TGTCGCGGAAGCGAACGACGGGCTAGGGCAAATTGAGTCTGGTCTCGGCGAAGCCGTTTCATTCTTACAACAGTTGAGTG
AAGCAGATGCGCTTCGGGAGACTGGTGTGTATCTTCCGGAAGGGACGCTCACATCGGATGAGTTCTCACCTGCCGTCGAA
CGCTATGTCTTCGATGAAGGAATGGCGACTCAGCTCGAGGTCGTCTTAGAGATGGACCCGTATTCGCCAGAAGCGATTGA
TACCGTCGAGACAATCAAAGAGACGATGAATCGTGCCGTGACGGGAACACCATATGCGGATGCGACCATCGGATATGCCG
GGATTTCAAGTATCAATAGCGATTTAAATGAAACATCGACGAATGATTTCAATCGAACGGTAGCCATCATGCTCGTGACG
TTGTTCATCGTCTTGACAGCACTGTTCCGCTCGATGATCATGCCACTCTATATGATCGCTTCGCTTCTCTTGACGTACTA
TACGTCAGCGGCAATCACAGAGCTGATCTTTGTAGAAGGACTCGGCTATGACGGGATTAGCTGGGCCGTTCCATTCTTTG
GCTTTGTTATGTTGATTGCCCTTGGAATTGACTACTCCATCTTCTTGTTAGATCGATTCCGGGAAGAGACAATCAATGGG
AAGACGGTCCGTGAGGCGCTCATCCACTCGATGACGAAGATGGGTACCGTCATTATGACAGCCGCGGTCATCCTCGCCGG
GACGTTCGGTGCCATGATTCCGTCAGGCGTGCTCAGTCTCGTCCAAATCGCGACGATCGTCATCACCGGTTTGTTATTGT
ATGGCTTGATTGTGTTACCCCTCTTGATCCCAGCCATTACGATTTCATTTGGCGATGGTGTCTGGTGGCCATTCCGACAA
AAGAAAAAGTCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCCCTCATCGATGGAGAAGTAGACGAAATTGAAATCGAGCAGTTTGTTCGGACGTTCCGAAAAATAAAGCAATTGCTCC
GAATCGGGGAGGAATAACAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCAGAAACGGATGTCTCGTATGATGAGATATCCGTTTTTTGGGATAGATTGTAGTGGATTCGGGAACAGAAAGGCAGGTC
CATTATCTAAGGAGGAATAC

Product: MMPL domain protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 884; Mature: 884

Protein sequence:

>884_residues
MHKIIQWRWGIFISLIVLTAALFVAAPNLTKQAEEAGSFQLADDMDSQRAQAILDEAGKSDKTISLVYEFESIGETERTD
VARVIEELKQNETVVTDVLDPFENEETEAQLVSEDGRIVLVPITVEGTTEEINAFADDVRENVLPQEETVYITGEEIINN
DVNLSAQEGLKKTEIITVVLIFGLLLLVFRSIVTPFIPLIAVGFTYLLSQSFVAFFVDWFGFPVSNYTQIFLVAILFGIG
TDYCILLLSRYKEELSAGHAIEDAIVNTYKTAGRTVLISGLAVFVGFAAIGFADFPIFKSAVAVAVGIAVLLLILFTVVP
FFMATLKQRLFWPSKKAGEHHDSKLWASLSRLSVNRPFVSILVVGLITVPVLFTYDDARSFNTVDEIGDGYDSVRGLNLI
SEGFGQGESLPVQVILRQDQAITESEVPYIEKFASELEKVEGVNGVRALTRPTGEVIDDFYVDTQLSEVSDGLSEAQTGL
GDVQTGLDEIEQGLNGIVGQLPSGSTNAGAPLAEAAAGLNQLNGQLGLIGQGLTATQNIPAAVGQLGQVSAGLTQIESGI
NEAASALNAQGSQVGELGSGLAQLATGVAEANDGLGQIESGLGEAVSFLQQLSEADALRETGVYLPEGTLTSDEFSPAVE
RYVFDEGMATQLEVVLEMDPYSPEAIDTVETIKETMNRAVTGTPYADATIGYAGISSINSDLNETSTNDFNRTVAIMLVT
LFIVLTALFRSMIMPLYMIASLLLTYYTSAAITELIFVEGLGYDGISWAVPFFGFVMLIALGIDYSIFLLDRFREETING
KTVREALIHSMTKMGTVIMTAAVILAGTFGAMIPSGVLSLVQIATIVITGLLLYGLIVLPLLIPAITISFGDGVWWPFRQ
KKKS

Sequences:

>Translated_884_residues
MHKIIQWRWGIFISLIVLTAALFVAAPNLTKQAEEAGSFQLADDMDSQRAQAILDEAGKSDKTISLVYEFESIGETERTD
VARVIEELKQNETVVTDVLDPFENEETEAQLVSEDGRIVLVPITVEGTTEEINAFADDVRENVLPQEETVYITGEEIINN
DVNLSAQEGLKKTEIITVVLIFGLLLLVFRSIVTPFIPLIAVGFTYLLSQSFVAFFVDWFGFPVSNYTQIFLVAILFGIG
TDYCILLLSRYKEELSAGHAIEDAIVNTYKTAGRTVLISGLAVFVGFAAIGFADFPIFKSAVAVAVGIAVLLLILFTVVP
FFMATLKQRLFWPSKKAGEHHDSKLWASLSRLSVNRPFVSILVVGLITVPVLFTYDDARSFNTVDEIGDGYDSVRGLNLI
SEGFGQGESLPVQVILRQDQAITESEVPYIEKFASELEKVEGVNGVRALTRPTGEVIDDFYVDTQLSEVSDGLSEAQTGL
GDVQTGLDEIEQGLNGIVGQLPSGSTNAGAPLAEAAAGLNQLNGQLGLIGQGLTATQNIPAAVGQLGQVSAGLTQIESGI
NEAASALNAQGSQVGELGSGLAQLATGVAEANDGLGQIESGLGEAVSFLQQLSEADALRETGVYLPEGTLTSDEFSPAVE
RYVFDEGMATQLEVVLEMDPYSPEAIDTVETIKETMNRAVTGTPYADATIGYAGISSINSDLNETSTNDFNRTVAIMLVT
LFIVLTALFRSMIMPLYMIASLLLTYYTSAAITELIFVEGLGYDGISWAVPFFGFVMLIALGIDYSIFLLDRFREETING
KTVREALIHSMTKMGTVIMTAAVILAGTFGAMIPSGVLSLVQIATIVITGLLLYGLIVLPLLIPAITISFGDGVWWPFRQ
KKKS
>Mature_884_residues
MHKIIQWRWGIFISLIVLTAALFVAAPNLTKQAEEAGSFQLADDMDSQRAQAILDEAGKSDKTISLVYEFESIGETERTD
VARVIEELKQNETVVTDVLDPFENEETEAQLVSEDGRIVLVPITVEGTTEEINAFADDVRENVLPQEETVYITGEEIINN
DVNLSAQEGLKKTEIITVVLIFGLLLLVFRSIVTPFIPLIAVGFTYLLSQSFVAFFVDWFGFPVSNYTQIFLVAILFGIG
TDYCILLLSRYKEELSAGHAIEDAIVNTYKTAGRTVLISGLAVFVGFAAIGFADFPIFKSAVAVAVGIAVLLLILFTVVP
FFMATLKQRLFWPSKKAGEHHDSKLWASLSRLSVNRPFVSILVVGLITVPVLFTYDDARSFNTVDEIGDGYDSVRGLNLI
SEGFGQGESLPVQVILRQDQAITESEVPYIEKFASELEKVEGVNGVRALTRPTGEVIDDFYVDTQLSEVSDGLSEAQTGL
GDVQTGLDEIEQGLNGIVGQLPSGSTNAGAPLAEAAAGLNQLNGQLGLIGQGLTATQNIPAAVGQLGQVSAGLTQIESGI
NEAASALNAQGSQVGELGSGLAQLATGVAEANDGLGQIESGLGEAVSFLQQLSEADALRETGVYLPEGTLTSDEFSPAVE
RYVFDEGMATQLEVVLEMDPYSPEAIDTVETIKETMNRAVTGTPYADATIGYAGISSINSDLNETSTNDFNRTVAIMLVT
LFIVLTALFRSMIMPLYMIASLLLTYYTSAAITELIFVEGLGYDGISWAVPFFGFVMLIALGIDYSIFLLDRFREETING
KTVREALIHSMTKMGTVIMTAAVILAGTFGAMIPSGVLSLVQIATIVITGLLLYGLIVLPLLIPAITISFGDGVWWPFRQ
KKKS

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95325; Mature: 95325

Theoretical pI: Translated: 4.00; Mature: 4.00

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHKIIQWRWGIFISLIVLTAALFVAAPNLTKQAEEAGSFQLADDMDSQRAQAILDEAGKS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEHHCCHHHHHHHHHHHCCCC
DKTISLVYEFESIGETERTDVARVIEELKQNETVVTDVLDPFENEETEAQLVSEDGRIVL
CCEEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEE
VPITVEGTTEEINAFADDVRENVLPQEETVYITGEEIINNDVNLSAQEGLKKTEIITVVL
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHH
IFGLLLLVFRSIVTPFIPLIAVGFTYLLSQSFVAFFVDWFGFPVSNYTQIFLVAILFGIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
TDYCILLLSRYKEELSAGHAIEDAIVNTYKTAGRTVLISGLAVFVGFAAIGFADFPIFKS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVAVAVGIAVLLLILFTVVPFFMATLKQRLFWPSKKAGEHHDSKLWASLSRLSVNRPFVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
ILVVGLITVPVLFTYDDARSFNTVDEIGDGYDSVRGLNLISEGFGQGESLPVQVILRQDQ
HHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEEEECCC
AITESEVPYIEKFASELEKVEGVNGVRALTRPTGEVIDDFYVDTQLSEVSDGLSEAQTGL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC
GDVQTGLDEIEQGLNGIVGQLPSGSTNAGAPLAEAAAGLNQLNGQLGLIGQGLTATQNIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCC
AAVGQLGQVSAGLTQIESGINEAASALNAQGSQVGELGSGLAQLATGVAEANDGLGQIES
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
GLGEAVSFLQQLSEADALRETGVYLPEGTLTSDEFSPAVERYVFDEGMATQLEVVLEMDP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHEEHEEEEECC
YSPEAIDTVETIKETMNRAVTGTPYADATIGYAGISSINSDLNETSTNDFNRTVAIMLVT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
LFIVLTALFRSMIMPLYMIASLLLTYYTSAAITELIFVEGLGYDGISWAVPFFGFVMLIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LGIDYSIFLLDRFREETINGKTVREALIHSMTKMGTVIMTAAVILAGTFGAMIPSGVLSL
HCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VQIATIVITGLLLYGLIVLPLLIPAITISFGDGVWWPFRQKKKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MHKIIQWRWGIFISLIVLTAALFVAAPNLTKQAEEAGSFQLADDMDSQRAQAILDEAGKS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEHHCCHHHHHHHHHHHCCCC
DKTISLVYEFESIGETERTDVARVIEELKQNETVVTDVLDPFENEETEAQLVSEDGRIVL
CCEEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEE
VPITVEGTTEEINAFADDVRENVLPQEETVYITGEEIINNDVNLSAQEGLKKTEIITVVL
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHH
IFGLLLLVFRSIVTPFIPLIAVGFTYLLSQSFVAFFVDWFGFPVSNYTQIFLVAILFGIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
TDYCILLLSRYKEELSAGHAIEDAIVNTYKTAGRTVLISGLAVFVGFAAIGFADFPIFKS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVAVAVGIAVLLLILFTVVPFFMATLKQRLFWPSKKAGEHHDSKLWASLSRLSVNRPFVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
ILVVGLITVPVLFTYDDARSFNTVDEIGDGYDSVRGLNLISEGFGQGESLPVQVILRQDQ
HHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEEEECCC
AITESEVPYIEKFASELEKVEGVNGVRALTRPTGEVIDDFYVDTQLSEVSDGLSEAQTGL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC
GDVQTGLDEIEQGLNGIVGQLPSGSTNAGAPLAEAAAGLNQLNGQLGLIGQGLTATQNIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCC
AAVGQLGQVSAGLTQIESGINEAASALNAQGSQVGELGSGLAQLATGVAEANDGLGQIES
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
GLGEAVSFLQQLSEADALRETGVYLPEGTLTSDEFSPAVERYVFDEGMATQLEVVLEMDP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHEEHEEEEECC
YSPEAIDTVETIKETMNRAVTGTPYADATIGYAGISSINSDLNETSTNDFNRTVAIMLVT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
LFIVLTALFRSMIMPLYMIASLLLTYYTSAAITELIFVEGLGYDGISWAVPFFGFVMLIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LGIDYSIFLLDRFREETINGKTVREALIHSMTKMGTVIMTAAVILAGTFGAMIPSGVLSL
HCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VQIATIVITGLLLYGLIVLPLLIPAITISFGDGVWWPFRQKKKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]