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The map label for this gene is panF [C]

Identifier: 229586904

GI number: 229586904

Start: 820358

End: 821755

Strand: Direct

Name: panF [C]

Synonym: RAF_ORF0783

Alternate gene names: 229586904

Gene position: 820358-821755 (Clockwise)

Preceding gene: 229586903

Following gene: 229586913

Centisome position: 64.16

GC content: 30.76

Gene sequence:

>1398_bases
ATGTTTAATTTACCTATTGATAATATTATCGTATTCATATACCTAATATCTATTCTACTTATTGGTATATATTACCGAGC
TAAAAATAGTAGTTTTAAGAACTATGCAAATGTTGAAAGTAAAGCGCAAAATAGTAAGCTGTTATTAATAGCTACGATAT
TTGTAAGTTCTGTCGGAGGAGCCACCACTTTCGGCATTATGGAAAAGGCTTTTTTGGGACATGAATATTATGCTTACGCT
CTTATACTTACAATACCTATAGATATATTAATTGCAATCTATATAGTGCCTTTAATTGCCAAACATTACGGAGCTGAAAG
CATCGGCGATATCCTAAGTACATATTACGGTAATATAGGTCGTTTTATCGGAGGGGTTAGTTCGGTTATCGTTTCAGTGG
GGTTTTTGGCTGCTCAAATAAGCGTCAGCGGCTATATTTTTCAATATATCTTAGAAATAAATGATGTAAATGGGGTAATT
TTAAGTTATAGTATAGTACTTATATATACTACAATAGGCGGTTTACAATCTATTGTTTTTACTAATTTACTACAATTTTT
GGCGATGATAATCGCTATACCAACCATAACTTTTATCAGTTTAAATAAAATCGGTTTTGTAGATTTTATTAATAACCTAC
CTACGGAAAATGCAAATTTTGATCGGAGCAACCTACTTTCTTATACAATGGCAGCAGCTTTAAGTTTTAGCGTCATGAAT
CTATATCCTACATTTATTCAAAGAGCTTTAATTAATAAAAATCCTACGCAAACAACTAAAGCAATATATGCAAAATCCGC
TATATATTTTTTCTTCTTGATTTGCATTACTTTAAATGGTTTAATTGCTTATAAGCTTTATCCAAACCAACCGTCAAATT
TAGTATTACCTTATTTAATCAACCAAATCATCCCAACTTTAATTCAAGGGATAGTAATAAGTGGACTCTTAGCTGCCGTT
ATGTCTACTGCTGATTCTGATTTAAACGTTACTTCTATAGCTATTGTTAAAGATATAATCAATCCTATTTTTAAGGTTAA
AAATCAGCAAAAATTATTATTAATTGCTCGAATTATTAACATTATAATAGGAAGTTTTGCAATAATTGTAGCTTTAAAAT
TTAGTAATGTAATTGACTTAGTAGTATTCTTCACTGGTTTCTGGGGACCGGTAACATTAGTACCGTTAATAACAACGCTT
TTTGGTATCAGAACATCTAAAACTATAATGGTCTTATCATCACTTGGCGGAGCAGCTATCTTCTTAATATGGGAATATTA
TTCTTTATCGTTGCAATATTTCAACCTTAGAGGAGTGTTTATAGGGACAATGGTGAGTCTTGTGATATTTATTCTAGGAT
GGTGGTATTCTAATGTCATTACGAAGAAAGTCATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTTCTTGGAACAGATTATGACACATAATTATAAATCTAGCATTCTTGACTACATATATATTGTGAACAAATGCTAAGTT
TGAGCTTTAAAATCTAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATATATTATCTATTTACTTGCAGTTTTAAATAATTTAATATATTAACTCAAGGTTAATAATTGAATTATGAGGATTTTA
TGTCTAAGCAAAATAGTATT

Product: Sodium/pantothenate symporter

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 465; Mature: 465

Protein sequence:

>465_residues
MFNLPIDNIIVFIYLISILLIGIYYRAKNSSFKNYANVESKAQNSKLLLIATIFVSSVGGATTFGIMEKAFLGHEYYAYA
LILTIPIDILIAIYIVPLIAKHYGAESIGDILSTYYGNIGRFIGGVSSVIVSVGFLAAQISVSGYIFQYILEINDVNGVI
LSYSIVLIYTTIGGLQSIVFTNLLQFLAMIIAIPTITFISLNKIGFVDFINNLPTENANFDRSNLLSYTMAAALSFSVMN
LYPTFIQRALINKNPTQTTKAIYAKSAIYFFFLICITLNGLIAYKLYPNQPSNLVLPYLINQIIPTLIQGIVISGLLAAV
MSTADSDLNVTSIAIVKDIINPIFKVKNQQKLLLIARIINIIIGSFAIIVALKFSNVIDLVVFFTGFWGPVTLVPLITTL
FGIRTSKTIMVLSSLGGAAIFLIWEYYSLSLQYFNLRGVFIGTMVSLVIFILGWWYSNVITKKVI

Sequences:

>Translated_465_residues
MFNLPIDNIIVFIYLISILLIGIYYRAKNSSFKNYANVESKAQNSKLLLIATIFVSSVGGATTFGIMEKAFLGHEYYAYA
LILTIPIDILIAIYIVPLIAKHYGAESIGDILSTYYGNIGRFIGGVSSVIVSVGFLAAQISVSGYIFQYILEINDVNGVI
LSYSIVLIYTTIGGLQSIVFTNLLQFLAMIIAIPTITFISLNKIGFVDFINNLPTENANFDRSNLLSYTMAAALSFSVMN
LYPTFIQRALINKNPTQTTKAIYAKSAIYFFFLICITLNGLIAYKLYPNQPSNLVLPYLINQIIPTLIQGIVISGLLAAV
MSTADSDLNVTSIAIVKDIINPIFKVKNQQKLLLIARIINIIIGSFAIIVALKFSNVIDLVVFFTGFWGPVTLVPLITTL
FGIRTSKTIMVLSSLGGAAIFLIWEYYSLSLQYFNLRGVFIGTMVSLVIFILGWWYSNVITKKVI
>Mature_465_residues
MFNLPIDNIIVFIYLISILLIGIYYRAKNSSFKNYANVESKAQNSKLLLIATIFVSSVGGATTFGIMEKAFLGHEYYAYA
LILTIPIDILIAIYIVPLIAKHYGAESIGDILSTYYGNIGRFIGGVSSVIVSVGFLAAQISVSGYIFQYILEINDVNGVI
LSYSIVLIYTTIGGLQSIVFTNLLQFLAMIIAIPTITFISLNKIGFVDFINNLPTENANFDRSNLLSYTMAAALSFSVMN
LYPTFIQRALINKNPTQTTKAIYAKSAIYFFFLICITLNGLIAYKLYPNQPSNLVLPYLINQIIPTLIQGIVISGLLAAV
MSTADSDLNVTSIAIVKDIINPIFKVKNQQKLLLIARIINIIIGSFAIIVALKFSNVIDLVVFFTGFWGPVTLVPLITTL
FGIRTSKTIMVLSSLGGAAIFLIWEYYSLSLQYFNLRGVFIGTMVSLVIFILGWWYSNVITKKVI

Specific function: Unknown

COG id: COG0591

COG function: function code ER; Na+/proline symporter

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51388; Mature: 51388

Theoretical pI: Translated: 9.58; Mature: 9.58

Prosite motif: PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFNLPIDNIIVFIYLISILLIGIYYRAKNSSFKNYANVESKAQNSKLLLIATIFVSSVGG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCHHHCCCCCEEEEHHHHHHCCCC
ATTFGIMEKAFLGHEYYAYALILTIPIDILIAIYIVPLIAKHYGAESIGDILSTYYGNIG
CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RFIGGVSSVIVSVGFLAAQISVSGYIFQYILEINDVNGVILSYSIVLIYTTIGGLQSIVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TNLLQFLAMIIAIPTITFISLNKIGFVDFINNLPTENANFDRSNLLSYTMAAALSFSVMN
HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYPTFIQRALINKNPTQTTKAIYAKSAIYFFFLICITLNGLIAYKLYPNQPSNLVLPYLI
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCEEHHHHH
NQIIPTLIQGIVISGLLAAVMSTADSDLNVTSIAIVKDIINPIFKVKNQQKLLLIARIIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
IIIGSFAIIVALKFSNVIDLVVFFTGFWGPVTLVPLITTLFGIRTSKTIMVLSSLGGAAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHEECCCCCHHH
FLIWEYYSLSLQYFNLRGVFIGTMVSLVIFILGWWYSNVITKKVI
HHHHHHHHHEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MFNLPIDNIIVFIYLISILLIGIYYRAKNSSFKNYANVESKAQNSKLLLIATIFVSSVGG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCHHHCCCCCEEEEHHHHHHCCCC
ATTFGIMEKAFLGHEYYAYALILTIPIDILIAIYIVPLIAKHYGAESIGDILSTYYGNIG
CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RFIGGVSSVIVSVGFLAAQISVSGYIFQYILEINDVNGVILSYSIVLIYTTIGGLQSIVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TNLLQFLAMIIAIPTITFISLNKIGFVDFINNLPTENANFDRSNLLSYTMAAALSFSVMN
HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYPTFIQRALINKNPTQTTKAIYAKSAIYFFFLICITLNGLIAYKLYPNQPSNLVLPYLI
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCEEHHHHH
NQIIPTLIQGIVISGLLAAVMSTADSDLNVTSIAIVKDIINPIFKVKNQQKLLLIARIIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
IIIGSFAIIVALKFSNVIDLVVFFTGFWGPVTLVPLITTLFGIRTSKTIMVLSSLGGAAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHEECCCCCHHH
FLIWEYYSLSLQYFNLRGVFIGTMVSLVIFILGWWYSNVITKKVI
HHHHHHHHHEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA