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Definition Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome, complete genome.
Accession NC_012588
Length 2,608,832

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The map label for this gene is 227828862

Identifier: 227828862

GI number: 227828862

Start: 2452423

End: 2454399

Strand: Direct

Name: 227828862

Synonym: M1425_2635

Alternate gene names: NA

Gene position: 2452423-2454399 (Clockwise)

Preceding gene: 227828861

Following gene: 227828863

Centisome position: 94.0

GC content: 34.8

Gene sequence:

>1977_bases
GTGGCTGAAAGAAGAATTAAATTGGCTAGCATAATCTCATATGATTTCTTGTTTCTAGTTTTACTAGCGGGTTTACTAGA
TTTAATCATTACGTTATTTAGAGAACGAATTCTATACGTAATTTCTAGTTTCTTTCAATATATAGTAATCAACCCTTCAG
TAGCTCTTGGAGACGCATTAGGTTTTCTATTTGTCCTTCAAGCCTCGCTTTTAGGTCTATTTATTGGTGGTATAGTTATT
TTAAGTATAAGTTTTACAATAAATTTAACACGGATAAGGAGTGAATATGAAGAGGGTGTTCCTTTATCAACTATTCTGAA
GTCTAGGATAATTACAAGCAGTAGATTAGGTTTCATAGCAAATTGGATAAGCGAGCGTATTAAGAGGTATATTAACGCAA
GTGCTGACTTGGAAAGTCCTACTGAAGTCGGTGTTAGATACGTCGCATATTTTTTGATCTCATTACTTCTCGTAATACCG
ATATCACTAGCACTAAGTATAATATTACTGTCTCCACTACCATTTCTATTATTACTTTTTCCGTTCATTTTTGTCTTTTA
TCCAGAACAGAAATACAAAAGTAGGGCTAGGGAAGTAAGAGACAGCATCCAAGATGAGATCCCTTTCTTTGTGACCTTAA
TTACTATCATTAACGCCAGCGGTACGACTATATATGAGGGAATGAGAAAAATTGTACAGTTTCCATTATTTAAAGCTATG
AAAAAGGAAGCATTGCTCATTATAAGAGATATAGATTTCTTCGGAAAATCTCCACTTGACGCTTTAGAGCATAGAGCTCG
TTTAACGTTTAATAGAGATTACTCTTGGTTTTTGGCAGGTTATACTTCGATTATAAGGAGTGGTGGCGATATTGAAGCAT
ACCTTTTTCAAAAAGCTAGAGAGTTTCTTAATTGGCTCCAGTTTCGTTGGAGGTTTTACTCAGAAAGAACCTCATTCCTA
GGAGAATTAATAGTAATCCTATTCCTCATTTTCCCCATGTTCTTAATTGTATTAGCGTTCTTCACAAATGGTGCAGTTAT
ATCGTTCTTGCTTGTAATACCAATATTATTTGGTACAATATTATACATAATTACAACTAGCAATAGACCTCGATATATGG
ATAATATAGGTCTTAACAAGATACAGCTGCTAATGGCCTTTCTTGCTGCACTTCTAGTAGCGGGAACAGTTGAAATATTT
CTTAATGAAATATATTACGCAATTGGTTTAGGACTATTGGTGTTCTCTATAACCTCAACAATATTCATGTACAACCAAAT
AAGAGAAATTAACGACATAGAGAACTCACTACCGCAATTTCTGAGAGATATTACAGAGTTCAGAAAGATAGGTTACGATC
TAAGTAGGGCTATCAAAACATTGGCTGGGGAAAAGAAATATAGAAGGGAGTTTAATAGGGTTCTAGACGAGATAGTAAAA
CAAGATTCCATGGGGATTCCAATAACTAGAGCTAAAATAAACACTAGAAGCTGGTTAGGCAAGTTCTCTCTTACCACTGT
TCAGATATTGATAGAGGGCGGTGCAGTAAGACCAGATCTATTAGAATATCTAACTGAATTTACACTTAACTTTATACAAT
CCAAGAGAGAAGCATTCTCAAGGATGAGAGCCTATCAAGTTTTAGGAATTCTGACACCTATCCTCCTAATTGTCACTATA
CTTATAGCGATTGTAATCATTAGCTCATTCACAGTAGTAACTTTGCCAGCAAACACATTGGGTATACCTCAATTCCCAAA
CATAATTACCCAATTTATTTTATCTTCGTTTATCCTAGCTGAAATGTTCATATTCATTTTAATGTCGACCTTCGCCATAG
GATTGCTGGTAGCTAAAGCACTATATGGTACTGTACAATACATGATAATGCCGTTAATTGGGTTAGTCCTCGCATTACTC
TCAATACACTTCTTTAGCGTATTAGAACCAATAATCTTGAGATTCTTCTCGATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATAGACTGTTATTAATAAGGGGGCTTGCTGAAAGGGGAGTTTACGACTACGACGCATTGGCAAAAGAGTTAGTTAAATA
TTATATAAATGGTGATAGGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACGTTTATATTTTCTCTTTCCGTAATTTTATTAATGCAAGATAGTTTAGGATTACTTGCAATAACTCTAGCGGTTATACT
ACTATTTTTCATTTTAGCTG

Product: type II secretion system protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 658; Mature: 657

Protein sequence:

>658_residues
MAERRIKLASIISYDFLFLVLLAGLLDLIITLFRERILYVISSFFQYIVINPSVALGDALGFLFVLQASLLGLFIGGIVI
LSISFTINLTRIRSEYEEGVPLSTILKSRIITSSRLGFIANWISERIKRYINASADLESPTEVGVRYVAYFLISLLLVIP
ISLALSIILLSPLPFLLLLFPFIFVFYPEQKYKSRAREVRDSIQDEIPFFVTLITIINASGTTIYEGMRKIVQFPLFKAM
KKEALLIIRDIDFFGKSPLDALEHRARLTFNRDYSWFLAGYTSIIRSGGDIEAYLFQKAREFLNWLQFRWRFYSERTSFL
GELIVILFLIFPMFLIVLAFFTNGAVISFLLVIPILFGTILYIITTSNRPRYMDNIGLNKIQLLMAFLAALLVAGTVEIF
LNEIYYAIGLGLLVFSITSTIFMYNQIREINDIENSLPQFLRDITEFRKIGYDLSRAIKTLAGEKKYRREFNRVLDEIVK
QDSMGIPITRAKINTRSWLGKFSLTTVQILIEGGAVRPDLLEYLTEFTLNFIQSKREAFSRMRAYQVLGILTPILLIVTI
LIAIVIISSFTVVTLPANTLGIPQFPNIITQFILSSFILAEMFIFILMSTFAIGLLVAKALYGTVQYMIMPLIGLVLALL
SIHFFSVLEPIILRFFSI

Sequences:

>Translated_658_residues
MAERRIKLASIISYDFLFLVLLAGLLDLIITLFRERILYVISSFFQYIVINPSVALGDALGFLFVLQASLLGLFIGGIVI
LSISFTINLTRIRSEYEEGVPLSTILKSRIITSSRLGFIANWISERIKRYINASADLESPTEVGVRYVAYFLISLLLVIP
ISLALSIILLSPLPFLLLLFPFIFVFYPEQKYKSRAREVRDSIQDEIPFFVTLITIINASGTTIYEGMRKIVQFPLFKAM
KKEALLIIRDIDFFGKSPLDALEHRARLTFNRDYSWFLAGYTSIIRSGGDIEAYLFQKAREFLNWLQFRWRFYSERTSFL
GELIVILFLIFPMFLIVLAFFTNGAVISFLLVIPILFGTILYIITTSNRPRYMDNIGLNKIQLLMAFLAALLVAGTVEIF
LNEIYYAIGLGLLVFSITSTIFMYNQIREINDIENSLPQFLRDITEFRKIGYDLSRAIKTLAGEKKYRREFNRVLDEIVK
QDSMGIPITRAKINTRSWLGKFSLTTVQILIEGGAVRPDLLEYLTEFTLNFIQSKREAFSRMRAYQVLGILTPILLIVTI
LIAIVIISSFTVVTLPANTLGIPQFPNIITQFILSSFILAEMFIFILMSTFAIGLLVAKALYGTVQYMIMPLIGLVLALL
SIHFFSVLEPIILRFFSI
>Mature_657_residues
AERRIKLASIISYDFLFLVLLAGLLDLIITLFRERILYVISSFFQYIVINPSVALGDALGFLFVLQASLLGLFIGGIVIL
SISFTINLTRIRSEYEEGVPLSTILKSRIITSSRLGFIANWISERIKRYINASADLESPTEVGVRYVAYFLISLLLVIPI
SLALSIILLSPLPFLLLLFPFIFVFYPEQKYKSRAREVRDSIQDEIPFFVTLITIINASGTTIYEGMRKIVQFPLFKAMK
KEALLIIRDIDFFGKSPLDALEHRARLTFNRDYSWFLAGYTSIIRSGGDIEAYLFQKAREFLNWLQFRWRFYSERTSFLG
ELIVILFLIFPMFLIVLAFFTNGAVISFLLVIPILFGTILYIITTSNRPRYMDNIGLNKIQLLMAFLAALLVAGTVEIFL
NEIYYAIGLGLLVFSITSTIFMYNQIREINDIENSLPQFLRDITEFRKIGYDLSRAIKTLAGEKKYRREFNRVLDEIVKQ
DSMGIPITRAKINTRSWLGKFSLTTVQILIEGGAVRPDLLEYLTEFTLNFIQSKREAFSRMRAYQVLGILTPILLIVTIL
IAIVIISSFTVVTLPANTLGIPQFPNIITQFILSSFILAEMFIFILMSTFAIGLLVAKALYGTVQYMIMPLIGLVLALLS
IHFFSVLEPIILRFFSI

Specific function: Unknown

COG id: COG2064

COG function: function code NU; Flp pilus assembly protein TadC

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75124; Mature: 74993

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAERRIKLASIISYDFLFLVLLAGLLDLIITLFRERILYVISSFFQYIVINPSVALGDAL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
GFLFVLQASLLGLFIGGIVILSISFTINLTRIRSEYEEGVPLSTILKSRIITSSRLGFIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NWISERIKRYINASADLESPTEVGVRYVAYFLISLLLVIPISLALSIILLSPLPFLLLLF
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PFIFVFYPEQKYKSRAREVRDSIQDEIPFFVTLITIINASGTTIYEGMRKIVQFPLFKAM
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKEALLIIRDIDFFGKSPLDALEHRARLTFNRDYSWFLAGYTSIIRSGGDIEAYLFQKAR
HHHHHHHEEECHHCCCCCHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
EFLNWLQFRWRFYSERTSFLGELIVILFLIFPMFLIVLAFFTNGAVISFLLVIPILFGTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYIITTSNRPRYMDNIGLNKIQLLMAFLAALLVAGTVEIFLNEIYYAIGLGLLVFSITST
HHHHCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFMYNQIREINDIENSLPQFLRDITEFRKIGYDLSRAIKTLAGEKKYRREFNRVLDEIVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
QDSMGIPITRAKINTRSWLGKFSLTTVQILIEGGAVRPDLLEYLTEFTLNFIQSKREAFS
CCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RMRAYQVLGILTPILLIVTILIAIVIISSFTVVTLPANTLGIPQFPNIITQFILSSFILA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
EMFIFILMSTFAIGLLVAKALYGTVQYMIMPLIGLVLALLSIHFFSVLEPIILRFFSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
AERRIKLASIISYDFLFLVLLAGLLDLIITLFRERILYVISSFFQYIVINPSVALGDAL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
GFLFVLQASLLGLFIGGIVILSISFTINLTRIRSEYEEGVPLSTILKSRIITSSRLGFIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NWISERIKRYINASADLESPTEVGVRYVAYFLISLLLVIPISLALSIILLSPLPFLLLLF
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PFIFVFYPEQKYKSRAREVRDSIQDEIPFFVTLITIINASGTTIYEGMRKIVQFPLFKAM
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKEALLIIRDIDFFGKSPLDALEHRARLTFNRDYSWFLAGYTSIIRSGGDIEAYLFQKAR
HHHHHHHEEECHHCCCCCHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
EFLNWLQFRWRFYSERTSFLGELIVILFLIFPMFLIVLAFFTNGAVISFLLVIPILFGTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYIITTSNRPRYMDNIGLNKIQLLMAFLAALLVAGTVEIFLNEIYYAIGLGLLVFSITST
HHHHCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFMYNQIREINDIENSLPQFLRDITEFRKIGYDLSRAIKTLAGEKKYRREFNRVLDEIVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
QDSMGIPITRAKINTRSWLGKFSLTTVQILIEGGAVRPDLLEYLTEFTLNFIQSKREAFS
CCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RMRAYQVLGILTPILLIVTILIAIVIISSFTVVTLPANTLGIPQFPNIITQFILSSFILA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
EMFIFILMSTFAIGLLVAKALYGTVQYMIMPLIGLVLALLSIHFFSVLEPIILRFFSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA