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The map label for this gene is yodF [H]

Identifier: 227826756

GI number: 227826756

Start: 311451

End: 313031

Strand: Direct

Name: yodF [H]

Synonym: M1425_0358

Alternate gene names: 227826756

Gene position: 311451-313031 (Clockwise)

Preceding gene: 227826755

Following gene: 227826760

Centisome position: 11.94

GC content: 37.89

Gene sequence:

>1581_bases
ATGGACGGGTTACATGTCTCAATTCTTTCAATAGTACTGTTTATATTTTTATTCGTAATTTTTGTATATTTAGGTTTCTA
CGGAAGCAGATGGAGAAGAGGAGATCTATCAAAGCTTCATGAATGGGCACTAGCAGGAAGAAGATTAGGGCCATACTTAA
TGTGGTTCCTCCTCACTGCAGATTTATACACTGCATACACGTTTATTGCAGTACCCTCTCTAGTTCTAGCGAGTGGTCCA
GTTGGATTTTTCGCAGCCTTCTATTCTGCAGTCACTCCTTTCATAGCCCTACTCTTCATGCCCAGATTATGGACAATTGC
TAAAAACAGGGGATATATTACAGCAGCGGATTTTATTAAGGATAGATTTAACAACAAGATTCTAGCTGGACTTGTCGCAA
TTACCGGAGTGGTTGCTGAATTGCCCTATATAGCGTTACAAATAGTGGGTATGCAAGTAGCATTACTTATCCTATTATTA
GGTTTAGGAGTTAGTAACATTGCGCTAGCAAGTGATCTAAGCCTTTTGGTAGCCTTTATAATCTTGGCAGCGTTCGTATT
TACGAGTGGTCTTAGGGGTGCAGCGTTAACTGCAGTATATAAGGATATCATAATTTTAGGTACAGTAATAAGTATTGCAA
TATATGTCCCACTAGCTTTTGGAGGATTTTCGGGTGCATTTCATAACGCTCAAACATTAAGTTCACAGATTAATTTGGCA
TTAAATAATGTTAATAAGCCAATTTTCTATAACTATTTACCTAACACCCTAGCTGCACATACTGCTTATATTTCTTTAGC
TATTGGAAGCGCATTCGCCCTTTATCTATATCCTCATGCCGTGAATGCAAGTGTAAGTTCAGATTCTAAGAAATCCCTTA
AATTATCCCTAGCATTACAACCCTTCTACTCGATCATATTAGCCATTATAGCTCTATTTGGCATCCTAGCCTACGCCAAT
CCCAATGTGATTAGTTTTATCGCTAAAACACATTCTGGTGCAGTAACTGTTCCCGCTCTAATAGGGTATTCAATGCCAGA
TTGGTTTGTTGGAATAGCATTATTGGGAATTTTCATAGGAGGTCTAGTTCCTGCAGCCATAATGGCAATTGGAGCAGCTA
ATTTACTTACTAGGAACATCATAAAGGAGTTTAAACCCAATATGTCTCCTAGTACAGAATCAGCATTAGCTAAATGGATT
TCTACTGCATTTAAATTTTTAGCCTTAGCTCTCGTATTCGCTACACCATCAACATATGCCATACAGTTACAATTATTGGG
TGGTATAATTATTTTACAAACTTTACCTTCAGTGTTTCTAGGACTTTATACTAATAAGCTCCATGGTTATGCGTTAGTGG
GAGGTTGGGTGGGAGGAATGTTTAGCGGGATATATCTAACATTGTTGGCTAATCACTTTGGTCCACTTAAAACCTCGTCT
TTCTTAACACCTTTAGGACAAATGTATATAGGAGTAATATCAACTCTTATCAACTTAGCCATAGGATTAATTGGGACTGC
AATAGCTTACGGAGTTGGATGGAGACCAGTAAGCAATATAAGAGCAGAAGAAATAGGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCCTAGGACTACCGTTATTTTATTGGTATCAAATTATCCTAATGCCAATAGGGGCTCTTGTATTCTACGCAGTTGTCAT
GATTATAAGGGATTGAGAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTCTTTTTTAAAAATTCGAATTATGTTATCATTTAAAAACTAACACCTATTGATTAACCTCTCAGCGTTATGCTCCAAT
ATTTTATCCTTGATATCTTG

Product: Na+/solute symporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 526; Mature: 526

Protein sequence:

>526_residues
MDGLHVSILSIVLFIFLFVIFVYLGFYGSRWRRGDLSKLHEWALAGRRLGPYLMWFLLTADLYTAYTFIAVPSLVLASGP
VGFFAAFYSAVTPFIALLFMPRLWTIAKNRGYITAADFIKDRFNNKILAGLVAITGVVAELPYIALQIVGMQVALLILLL
GLGVSNIALASDLSLLVAFIILAAFVFTSGLRGAALTAVYKDIIILGTVISIAIYVPLAFGGFSGAFHNAQTLSSQINLA
LNNVNKPIFYNYLPNTLAAHTAYISLAIGSAFALYLYPHAVNASVSSDSKKSLKLSLALQPFYSIILAIIALFGILAYAN
PNVISFIAKTHSGAVTVPALIGYSMPDWFVGIALLGIFIGGLVPAAIMAIGAANLLTRNIIKEFKPNMSPSTESALAKWI
STAFKFLALALVFATPSTYAIQLQLLGGIIILQTLPSVFLGLYTNKLHGYALVGGWVGGMFSGIYLTLLANHFGPLKTSS
FLTPLGQMYIGVISTLINLAIGLIGTAIAYGVGWRPVSNIRAEEIG

Sequences:

>Translated_526_residues
MDGLHVSILSIVLFIFLFVIFVYLGFYGSRWRRGDLSKLHEWALAGRRLGPYLMWFLLTADLYTAYTFIAVPSLVLASGP
VGFFAAFYSAVTPFIALLFMPRLWTIAKNRGYITAADFIKDRFNNKILAGLVAITGVVAELPYIALQIVGMQVALLILLL
GLGVSNIALASDLSLLVAFIILAAFVFTSGLRGAALTAVYKDIIILGTVISIAIYVPLAFGGFSGAFHNAQTLSSQINLA
LNNVNKPIFYNYLPNTLAAHTAYISLAIGSAFALYLYPHAVNASVSSDSKKSLKLSLALQPFYSIILAIIALFGILAYAN
PNVISFIAKTHSGAVTVPALIGYSMPDWFVGIALLGIFIGGLVPAAIMAIGAANLLTRNIIKEFKPNMSPSTESALAKWI
STAFKFLALALVFATPSTYAIQLQLLGGIIILQTLPSVFLGLYTNKLHGYALVGGWVGGMFSGIYLTLLANHFGPLKTSS
FLTPLGQMYIGVISTLINLAIGLIGTAIAYGVGWRPVSNIRAEEIG
>Mature_526_residues
MDGLHVSILSIVLFIFLFVIFVYLGFYGSRWRRGDLSKLHEWALAGRRLGPYLMWFLLTADLYTAYTFIAVPSLVLASGP
VGFFAAFYSAVTPFIALLFMPRLWTIAKNRGYITAADFIKDRFNNKILAGLVAITGVVAELPYIALQIVGMQVALLILLL
GLGVSNIALASDLSLLVAFIILAAFVFTSGLRGAALTAVYKDIIILGTVISIAIYVPLAFGGFSGAFHNAQTLSSQINLA
LNNVNKPIFYNYLPNTLAAHTAYISLAIGSAFALYLYPHAVNASVSSDSKKSLKLSLALQPFYSIILAIIALFGILAYAN
PNVISFIAKTHSGAVTVPALIGYSMPDWFVGIALLGIFIGGLVPAAIMAIGAANLLTRNIIKEFKPNMSPSTESALAKWI
STAFKFLALALVFATPSTYAIQLQLLGGIIILQTLPSVFLGLYTNKLHGYALVGGWVGGMFSGIYLTLLANHFGPLKTSS
FLTPLGQMYIGVISTLINLAIGLIGTAIAYGVGWRPVSNIRAEEIG

Specific function: Unknown

COG id: COG0591

COG function: function code ER; Na+/proline symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001734 [H]

Pfam domain/function: PF00474 SSF [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56390; Mature: 56390

Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95

Prosite motif: PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9734814; 9384377 [H]