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The map label for this gene is 227814710

Identifier: 227814710

GI number: 227814710

Start: 1929318

End: 1931657

Strand: Reverse

Name: 227814710

Synonym: BAMEG_2120

Alternate gene names: NA

Gene position: 1931657-1929318 (Counterclockwise)

Preceding gene: 227814711

Following gene: 227814709

Centisome position: 36.93

GC content: 29.15

Gene sequence:

>2340_bases
ATGATTAGGAGAATGTTAAAAAGAGATTTCTCTCAAAATAAAATGATAATTACCATATTGTTTATGTTTATCATGTTATC
AAGTCTTTTAATGGCTAGTGCTTCAAGTAACGTTATTACTCTATTGAACTCAATGGATCAATTGGTTAAAGTATCAAACG
CACCGCACTTCGTACAAATGCATGCCGGAGAGGTAAATCAAAAGTCAATTGATTCCTTTGTAGAAAAAAATCCGTTTGTA
AAAAAACAGCAAACGGCTGAGATGGTTCAAATAAATGGATCTAACATTTTTATTAAAAAGAAAAATCAAGCAGAACATAA
TAGTGTAATGGACATTAGTTTCGTGAAACAAAATAGTAAGTTTGATTTTTTATTAAATTTAAATAATGAAGTGGTCGATG
TTACGAAAGGGGAAATAGGTGTACCCATTTATTATATGCAAAAATATAATTTGCGTATGGGAGATAAAATATGGGTTATT
AAAGATAATAATGAACTAGAATTTACGATTTCAGCATTTGTTCGTGATGTTCAAATGAACCCATCAATCGTTAGTTCAAA
ACGATTTGTAATAAGCAATAAAGATTTTGAAAGAATAAAAAGAAATTTTGGAGAAAGCGAATATCTTATTGAATTCCAGC
TAACAGACGAAAATAAAATAAATGAATTTGAAAATCTATATAAGTCATCGAACTTACCACAAAAAGGTCCCTCTATTACG
TATTCACTATTTAAAACACTCAATTCATTAACAGATGGAATAATAGCTGCAGTACTTATCATAATAAGTGGATTATTAAT
GTTAATTGCAATGTTATGTATTAGATTTACGATCATTACTTCGATGGAAGAAGATTATCGAGAAATTGGTGTTATGAAAG
CAATTGGGATTCATAATAAAGATATTCAAAAATTATATATAATAAAATATATTTTTATTTCAGCTGGTGGATGTATATGT
GGATATATACTCTCACTATTTGTTACAAAAATCTTCACTTCAAATATCACCCTTTATATGGGGGCGGCAAATAAAAGCAT
TTTACACAATATTGTGCCATTCATAATTACAACATTGTTATTTTTAGTCGTTATCCTGTTCTGTCGTATCATTTTACGGA
ATTTTAGAAGAATTACAGCAATAGACGCTTTACAATCAAGAGATAAACTAGGAAAAAGAAAGATTAGAAAATCCTTTTCA
CTCAAACAAACTAAATTTACAAATGTAAATATATTTATTGGTATACAAGATGTTGTTAAAAGATTTAAGTTATATCGGGT
ATTAAGTATCGTATTAATAATAGCTGTGTTCATGATTGTTGTACCCGTTAACTTTTTGTATACGATTCAGTCACCGAATT
TTGTAAATTATATGGGGACAGGAAAAAGTGATATTCGAATAGATTTACAGCAAACTGAAAATATAGAGAAACGTTTTAAG
GGTGTTATTTCATATGTAAAAAATGATAAAGAAGTAGAAAAATATGCAACATTTGTTACGAGTACATTTAAAATGGTAAA
CGCTGATGGTACACATGAAAACTTAAATGTAGAAATGGGAGACTTCACTACATTTCCATTAGACTATATCCAAGGTAGGG
CACCAAAAAATGAAAATGAAATTGCTCTTTCTTATATGAACGCAAATGAATTAAAAAAGAGTGTAGGGGATTATATCTTT
TTATTTGTAGATGGGAAAGAGAAAGGACTAGCGATTAGTGGTATATATCAAGATGTAACGAATGGTGGCAAAACAGCTAA
AGCTAGTTTTTCTAATAATAATGAAAATATATTATGGTATGTAGTAAATGTAGATATGAAGCCTAAAGTGGACTTGCAAG
AAAAAGTAAAGGAGTATAAACAAAATTTTAGTTCTGCAAAAATAACAGATACAAATGATTATGTAACGCAAACTTTAGGA
GAAACAATTAAACAATTAAGACTTGTGACGCAAGTGGCTATTTTGATTGCGATATTGATATCAGTTTTAATTACTGCGAT
GTTTTTTAAAATGTTATTAGCAAAAGATTCTTCGCAAATTTTAATTATGAAAAATATCGGTTTTTCTAGTAAAGATATTC
GTATACAGTATATAACACGTTCTATCGTCATTGTATTATTAGGCATTTTGATAGGGACATGTATAGCTGCTACATTTGGT
GAAATGTTAGTAAGTTGGTTAGGGTCATTTATGGGAGCAGCTCATATAAAGTTTGTCGTAAATCCTATCGTTTCTTATAT
AATATGTCCAGCTATTTTATTTATACCTGTGACTGCAACAACACTTTTCAGTAGTTTTACTATGAAGCAAACAAACGATG
TAAAGCCAAATGGGGAGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATGAAGATTTATTTACCGATATTAGCTATTAGTTTCATAATGATATTATTAGCGGTTGTGACGAAGAAAATATTATCGA
ATGAAGGGAACTAGCTTTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGGTGTATCACTTGAAAAAAATTTTAGAAGTAAAGCAAGTAAACAAAACATATTCAATGGATGGAAATGCAAATTATCAC
GTGCTAAAAAATATAGATTT

Product: ABC transporter, permease protein

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein; Peptide ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease Component

Number of amino acids: Translated: 779; Mature: 779

Protein sequence:

>779_residues
MIRRMLKRDFSQNKMIITILFMFIMLSSLLMASASSNVITLLNSMDQLVKVSNAPHFVQMHAGEVNQKSIDSFVEKNPFV
KKQQTAEMVQINGSNIFIKKKNQAEHNSVMDISFVKQNSKFDFLLNLNNEVVDVTKGEIGVPIYYMQKYNLRMGDKIWVI
KDNNELEFTISAFVRDVQMNPSIVSSKRFVISNKDFERIKRNFGESEYLIEFQLTDENKINEFENLYKSSNLPQKGPSIT
YSLFKTLNSLTDGIIAAVLIIISGLLMLIAMLCIRFTIITSMEEDYREIGVMKAIGIHNKDIQKLYIIKYIFISAGGCIC
GYILSLFVTKIFTSNITLYMGAANKSILHNIVPFIITTLLFLVVILFCRIILRNFRRITAIDALQSRDKLGKRKIRKSFS
LKQTKFTNVNIFIGIQDVVKRFKLYRVLSIVLIIAVFMIVVPVNFLYTIQSPNFVNYMGTGKSDIRIDLQQTENIEKRFK
GVISYVKNDKEVEKYATFVTSTFKMVNADGTHENLNVEMGDFTTFPLDYIQGRAPKNENEIALSYMNANELKKSVGDYIF
LFVDGKEKGLAISGIYQDVTNGGKTAKASFSNNNENILWYVVNVDMKPKVDLQEKVKEYKQNFSSAKITDTNDYVTQTLG
ETIKQLRLVTQVAILIAILISVLITAMFFKMLLAKDSSQILIMKNIGFSSKDIRIQYITRSIVIVLLGILIGTCIAATFG
EMLVSWLGSFMGAAHIKFVVNPIVSYIICPAILFIPVTATTLFSSFTMKQTNDVKPNGE

Sequences:

>Translated_779_residues
MIRRMLKRDFSQNKMIITILFMFIMLSSLLMASASSNVITLLNSMDQLVKVSNAPHFVQMHAGEVNQKSIDSFVEKNPFV
KKQQTAEMVQINGSNIFIKKKNQAEHNSVMDISFVKQNSKFDFLLNLNNEVVDVTKGEIGVPIYYMQKYNLRMGDKIWVI
KDNNELEFTISAFVRDVQMNPSIVSSKRFVISNKDFERIKRNFGESEYLIEFQLTDENKINEFENLYKSSNLPQKGPSIT
YSLFKTLNSLTDGIIAAVLIIISGLLMLIAMLCIRFTIITSMEEDYREIGVMKAIGIHNKDIQKLYIIKYIFISAGGCIC
GYILSLFVTKIFTSNITLYMGAANKSILHNIVPFIITTLLFLVVILFCRIILRNFRRITAIDALQSRDKLGKRKIRKSFS
LKQTKFTNVNIFIGIQDVVKRFKLYRVLSIVLIIAVFMIVVPVNFLYTIQSPNFVNYMGTGKSDIRIDLQQTENIEKRFK
GVISYVKNDKEVEKYATFVTSTFKMVNADGTHENLNVEMGDFTTFPLDYIQGRAPKNENEIALSYMNANELKKSVGDYIF
LFVDGKEKGLAISGIYQDVTNGGKTAKASFSNNNENILWYVVNVDMKPKVDLQEKVKEYKQNFSSAKITDTNDYVTQTLG
ETIKQLRLVTQVAILIAILISVLITAMFFKMLLAKDSSQILIMKNIGFSSKDIRIQYITRSIVIVLLGILIGTCIAATFG
EMLVSWLGSFMGAAHIKFVVNPIVSYIICPAILFIPVTATTLFSSFTMKQTNDVKPNGE
>Mature_779_residues
MIRRMLKRDFSQNKMIITILFMFIMLSSLLMASASSNVITLLNSMDQLVKVSNAPHFVQMHAGEVNQKSIDSFVEKNPFV
KKQQTAEMVQINGSNIFIKKKNQAEHNSVMDISFVKQNSKFDFLLNLNNEVVDVTKGEIGVPIYYMQKYNLRMGDKIWVI
KDNNELEFTISAFVRDVQMNPSIVSSKRFVISNKDFERIKRNFGESEYLIEFQLTDENKINEFENLYKSSNLPQKGPSIT
YSLFKTLNSLTDGIIAAVLIIISGLLMLIAMLCIRFTIITSMEEDYREIGVMKAIGIHNKDIQKLYIIKYIFISAGGCIC
GYILSLFVTKIFTSNITLYMGAANKSILHNIVPFIITTLLFLVVILFCRIILRNFRRITAIDALQSRDKLGKRKIRKSFS
LKQTKFTNVNIFIGIQDVVKRFKLYRVLSIVLIIAVFMIVVPVNFLYTIQSPNFVNYMGTGKSDIRIDLQQTENIEKRFK
GVISYVKNDKEVEKYATFVTSTFKMVNADGTHENLNVEMGDFTTFPLDYIQGRAPKNENEIALSYMNANELKKSVGDYIF
LFVDGKEKGLAISGIYQDVTNGGKTAKASFSNNNENILWYVVNVDMKPKVDLQEKVKEYKQNFSSAKITDTNDYVTQTLG
ETIKQLRLVTQVAILIAILISVLITAMFFKMLLAKDSSQILIMKNIGFSSKDIRIQYITRSIVIVLLGILIGTCIAATFG
EMLVSWLGSFMGAAHIKFVVNPIVSYIICPAILFIPVTATTLFSSFTMKQTNDVKPNGE

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88451; Mature: 88451

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIRRMLKRDFSQNKMIITILFMFIMLSSLLMASASSNVITLLNSMDQLVKVSNAPHFVQM
CCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
HAGEVNQKSIDSFVEKNPFVKKQQTAEMVQINGSNIFIKKKNQAEHNSVMDISFVKQNSK
ECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCEEEECCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCC
FDFLLNLNNEVVDVTKGEIGVPIYYMQKYNLRMGDKIWVIKDNNELEFTISAFVRDVQMN
EEEEEECCCCEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHCCC
PSIVSSKRFVISNKDFERIKRNFGESEYLIEFQLTDENKINEFENLYKSSNLPQKGPSIT
CCHHCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
YSLFKTLNSLTDGIIAAVLIIISGLLMLIAMLCIRFTIITSMEEDYREIGVMKAIGIHNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DIQKLYIIKYIFISAGGCICGYILSLFVTKIFTSNITLYMGAANKSILHNIVPFIITTLL
CHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
FLVVILFCRIILRNFRRITAIDALQSRDKLGKRKIRKSFSLKQTKFTNVNIFIGIQDVVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECEEEEEEEHHHHHH
RFKLYRVLSIVLIIAVFMIVVPVNFLYTIQSPNFVNYMGTGKSDIRIDLQQTENIEKRFK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEECCCCCCCEEEEHHHHCCHHHHHH
GVISYVKNDKEVEKYATFVTSTFKMVNADGTHENLNVEMGDFTTFPLDYIQGRAPKNENE
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCEECCHHHHCCCCCCCCCC
IALSYMNANELKKSVGDYIFLFVDGKEKGLAISGIYQDVTNGGKTAKASFSNNNENILWY
EEEEECCHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEEE
VVNVDMKPKVDLQEKVKEYKQNFSSAKITDTNDYVTQTLGETIKQLRLVTQVAILIAILI
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVLITAMFFKMLLAKDSSQILIMKNIGFSSKDIRIQYITRSIVIVLLGILIGTCIAATFG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EMLVSWLGSFMGAAHIKFVVNPIVSYIICPAILFIPVTATTLFSSFTMKQTNDVKPNGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIRRMLKRDFSQNKMIITILFMFIMLSSLLMASASSNVITLLNSMDQLVKVSNAPHFVQM
CCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
HAGEVNQKSIDSFVEKNPFVKKQQTAEMVQINGSNIFIKKKNQAEHNSVMDISFVKQNSK
ECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCEEEECCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCC
FDFLLNLNNEVVDVTKGEIGVPIYYMQKYNLRMGDKIWVIKDNNELEFTISAFVRDVQMN
EEEEEECCCCEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHCCC
PSIVSSKRFVISNKDFERIKRNFGESEYLIEFQLTDENKINEFENLYKSSNLPQKGPSIT
CCHHCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
YSLFKTLNSLTDGIIAAVLIIISGLLMLIAMLCIRFTIITSMEEDYREIGVMKAIGIHNK
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DIQKLYIIKYIFISAGGCICGYILSLFVTKIFTSNITLYMGAANKSILHNIVPFIITTLL
CHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
FLVVILFCRIILRNFRRITAIDALQSRDKLGKRKIRKSFSLKQTKFTNVNIFIGIQDVVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECEEEEEEEHHHHHH
RFKLYRVLSIVLIIAVFMIVVPVNFLYTIQSPNFVNYMGTGKSDIRIDLQQTENIEKRFK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEECCCCCCCEEEEHHHHCCHHHHHH
GVISYVKNDKEVEKYATFVTSTFKMVNADGTHENLNVEMGDFTTFPLDYIQGRAPKNENE
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCEECCHHHHCCCCCCCCCC
IALSYMNANELKKSVGDYIFLFVDGKEKGLAISGIYQDVTNGGKTAKASFSNNNENILWY
EEEEECCHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEEE
VVNVDMKPKVDLQEKVKEYKQNFSSAKITDTNDYVTQTLGETIKQLRLVTQVAILIAILI
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVLITAMFFKMLLAKDSSQILIMKNIGFSSKDIRIQYITRSIVIVLLGILIGTCIAATFG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EMLVSWLGSFMGAAHIKFVVNPIVSYIICPAILFIPVTATTLFSSFTMKQTNDVKPNGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA