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The map label for this gene is ydgH [H]

Identifier: 227814244

GI number: 227814244

Start: 1518690

End: 1521113

Strand: Direct

Name: ydgH [H]

Synonym: BAMEG_1652

Alternate gene names: 227814244

Gene position: 1518690-1521113 (Clockwise)

Preceding gene: 227814243

Following gene: 227814245

Centisome position: 29.04

GC content: 33.42

Gene sequence:

>2424_bases
ATGAGCAAGCTGAAAAATTGGAGAAGTTTATCTTTTCTATTATGGATAGTTATTACTATTACAATGATCGTAACGATGCC
TAATATGGATAAATTAGTGAAAGAAAAAGGGCACATTACGATTCCTAATACAGAACAAAGTAGTATTGCTGACAAAATGA
TAAAAGAAATGAATAAAGACGGGACAGAAAAGTATGACATTATAGCAGTTTTTAATAGTGGTAGTAAAACAGCTTTAACG
ACTGAACAAAAAGAGGAAATAACAAAAACAATCAACGCTTTGCAAAATGAAAAGGAACAATTAGGAATTAAAGAAGTTGT
TTCACATTTAGATAATAAAGAATTAGAGAAACAATTAGTTTCTAAAGATAATACGACTATTTTAACGCAAATATCGATAG
ATAAAAAACATGGTGAAATATCGAAAGTTTCAAATAATCTTCATAATAAAGTGAAAACGAAAGGGGTAAAAACGTACTTA
ACAGGAAGTGACTTAATCGCGGGTGATTTTCTTACATCTTCTCAAGAGGGAGTGAAAAAGACTGAAGTTATTTCAATCAT
TTTCATTCTAGTTATATTAATCATTGTATTTCGTTCACCGATTGTTCCAATTGTTTCTCTTCTTACTGTTGGGGTATCAT
ATTTAGTTTCAATGGGGATTATTGCTCATCTTGTAGATCAATTTAATTTTCCGTTTTCTAACTTTACACAAGTGTTTGTA
GTTGTTGTCCTGTTTGGGGTTGGAACGGACTATAACATTTTATTATTTACGAGATTTAAAGAAGAATTAAGTAAACAAGA
AAACGCATTTTTGGCTACGAAAGAAACATTTAAATCGGCAGGGAAAACTGTTTTATATAGTGGGATAGCAGTACTAATTG
GTTTTGCATCTCTTGCTTTAGCGAGCTTTAAATTATATCAATCTACTTCAGCGGTAGCAATTGGTGTCGCAGTATTATTA
CTCGTATTAACTACGTTAAATCCATTTTTCATGGTGCTTCTAGGAAAAGGGATGTTTTATCCAGTTAAAACATTTAAAGG
TCATGAAGATAGTCGCCTATGGGGATTCTTTGCGAAAAATTCAGTTGCAAGACCGTTTGTCGCTTTAATTATTGTATTCG
TGATATCGATTCCTATCGTATTAAAGTATTCTAATACACTTAATTACAACGATTTATTTGAAGTAGACAATAAATATGAG
TCGAAAATGGGGATTAACGTAATAGAAGAACATTTTCCACCTGGTTTTTCTTCACCAAGTACGTTAGTCATTCAATCGAA
TAATAAGTTAGATGAGGCGAGTTCGCTTCAAACTTTAGATGAACTAACTGAAAAGATTTTGAAAGTGAAAGGTGTTTCAG
AAGTATATGCACCGACACGTCCAACTGGTGAAAGAATTAAAGAACTATATATAAATAAACAAGCGGATGAACTAAATACA
GGTTTAGGAGATGCCAATGGTGGTATAAAGGAAATTAATGATGGATTAACTACTGCGAAAGATAAAATGGGTAGTAAGGA
TTCAAATAGTCTTGCAAACGTTCAAAAGTTAATTGATGGAACAAATGAAGCGAAAAATGGTGTGTCGGCATTAGGAACAG
CTTTAAATCAACTATCAAATGGCATAAATGACGGAGCAAAAGGTGCGCAGCAAATTGAGAGGGGGTTAACTTCAGTAAAT
GAAAATATAAGTGTATTATCTAATGCAACTTCACAACTTCATGCTGGCTATACACAGTTAGAGAAAGGTTTAAGTTCTTA
CGATCAATACTTCGGAAGTATTTCTCAAGCGATTGACGGTGCGAAGAAAGGTTATGAACAAATTGAAATGTTAATGACCA
ATTTCATTCAAATGAAACCAGAATTAGCAAATGATCCTAACATTCTGCAGACGATAGGAATTGCTAAAGAGGCTCAAAAG
CAATTAGGTGGGCTGTCAAATGAATTAAATCAATTAGCAACGCAGCATAATGCGGCGATGGGATCATTTAAAGAAGCGAA
TCAATCGTTATTGAAAGTGGATAACGGCTTAAAAGAAATGAGCAATGGAGTTACTAAGTTACAAAAAGGAGCAGCTGATC
TTAAAAATGGATTAAATGAAGGTGCTTCAGGTTCAAAACAAATTGCGAACAAGTCATCTGAGTTACAAACCGGATTAACG
AAAATAAACGATGGGCAAGGACAGGTATTAACAGGACTGAAAGACTTGCAAGAACAGATGGGACAATTACAATCAGGACT
ATCTAAAAGTACAGAAGGCCTTGAAAAGGTAAGTAATGGCTTAGGGGATGCTCAGAAATATTTAGGAGAACTAAATGAAT
CAAAAAGCTCTGAGAAATTTTATATTCCAAAAGAAGTTTTGGAGGGAGAAGATTTCCAAAAAGCTTTGAATACGTACATG
TCACATGATAGAAAGACTGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGGAATGAATGTTCATTCCGAAAAGGTGTTTTCAAAATAATAGGAATGAATATTCATTCCGTAACTAATATAAAATTTT
AATCGCGGGAGATGATCCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGACAATCATTTTAGACGTAAATCCGTATTCAAAAGAAGCGATGCCAATTATTCAAGAAATCAATAAAACGATAGATGG
TACTTTGAAGGGGACAGAAT

Product: membrane protein, MmpL family

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 807; Mature: 806

Protein sequence:

>807_residues
MSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALT
TEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYL
TGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFV
VVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLL
LVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYE
SKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADELNT
GLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIERGLTSVN
ENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQK
QLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQTGLT
KINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYM
SHDRKTA

Sequences:

>Translated_807_residues
MSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALT
TEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYL
TGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFV
VVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLL
LVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYE
SKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADELNT
GLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIERGLTSVN
ENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQK
QLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQTGLT
KINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYM
SHDRKTA
>Mature_806_residues
SKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALTT
EQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLT
GSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFVV
VVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLL
VLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYES
KMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADELNTG
LGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIERGLTSVNE
NISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQ
LGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQTGLTK
INDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMS
HDRKTA

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88223; Mature: 88092

Theoretical pI: Translated: 7.11; Mature: 7.11

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKD
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCC
GTEKYDIIAVFNSGSKTALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLV
CCCCEEEEEEECCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHH
SKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKK
CCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHCCCHHCHHH
TEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
VVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLAL
HHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKN
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHC
SVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCC
TLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADELNT
EEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHC
GLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSN
CCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GINDGAKGAQQIERGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
GSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQTGLT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHH
KINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKF
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCE
YIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTA
ECCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCC
GTEKYDIIAVFNSGSKTALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLV
CCCCEEEEEEECCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHH
SKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKK
CCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHCCCHHCHHH
TEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
VVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLAL
HHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKN
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHC
SVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCC
TLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADELNT
EEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHC
GLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSN
CCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GINDGAKGAQQIERGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
GSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQTGLT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHH
KINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKF
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCE
YIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTA
ECCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]