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The map label for this gene is yvqJ [H]

Identifier: 227813954

GI number: 227813954

Start: 1239065

End: 1240324

Strand: Reverse

Name: yvqJ [H]

Synonym: BAMEG_1360

Alternate gene names: 227813954

Gene position: 1240324-1239065 (Counterclockwise)

Preceding gene: 227813955

Following gene: 227813950

Centisome position: 23.72

GC content: 38.57

Gene sequence:

>1260_bases
ATGGATATATTGAAAAACCGGAATTTCCTCTTATTATTTTTAGGAAGAATTTTCACCAACATAGGAGATAGCTTGTACTA
TGTAGCCGCGATGTGGCTCGTATATAAGCTAAGTGGTAATCCTTTTTATTCTGGATTGGCTGGTTTCCTTACGTTACTAC
CTTCTGCATTACAATTTCTTACCGGTCCATTCGTTGATAGATGGCCAATAAAAAACACCCTCGTCATCACACAAGTACTG
CAATGCATTCTAATATTAATCATTCCTATTACACACTACTTCGACCTATTAACCGTCCAACTACTACTCATCATCATGCC
CATCGTAGCCTTTATCGAACAATTCGCCTATCCTGCACAGTCAAAAGCTTTACCACTTCTACTGCATAAAACACAATTAT
TAAAAGGAAACTCTCTCTTCTCATTTGCGTATCAAGGCATTGATTTAATTTGTACGACGCTTTCTGGAATATTAGTAGCA
CTATTTGGCGCGATCACTTTATATGTAATTGACTCTTTCACATTCGCGATTACTGCCCTTTTGTTCTTTTCATTGAAAAT
GCCAAAACAAACCGAAACAGGTACAACACTTTCAACTAAACAATATTTCTCTGATTTAAAAGAAGGTTTTTCAATCGTCT
TTCGTTCCTTAATGGGCGTATTCTTAATCGGTTCCGTTGTTGCCAATTTTTCTATCGGTATGACGATGGCAATACTCCCT
TCTTTCGCTGATTCTTTAGGTGGTGTGAAATCATATGGTTTCTTCTTAGCTGCTATATCAGCAGGTAGTTTAATTGGAGC
ATTATTCAGTTCATGGGTTGGCAAACGTAACGTTGGCCGCGCTTCTATTATTAGCTTTGCAACTGGTGCTATCTTTTGGT
TTCTCTCTACGGTTGTACCGTTTCAATGGTTATCTATTTTCTTATTCGGCCTAGCTTGGGTACCGATTGGTGCAACCAAC
ATATTATTTGCGACAATTAGTCAAATTTTAATTCCAAATCGATATATTGGACGCATCAACTCAGTGATGCGAAGTATGGG
CACAATTGCTATGCCATTCGGTTCTTTAATTGGTGGATATGCTGCAAATATATTTAGTAGCCAACTCATTTTCGCACTCG
CTAGCATCGGGATTTTATTTATTTCTCTCGTATGGCTACTCCATCCGAAATTACGAGCATTGCCGAAAGCTGATGAAATT
ACAGCGGATACTTTTGGGGTGCAGTTTAAGGAAGAGCATGGGAAAGGTGCGGCTTTATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAATTTGTTAAAGAAGAAGAAAAATCGTAATACGATTTTTTTTACATAAACGGTCAAATTTATTTTACCGAATAAATTT
ATTATAAAGGAGTAGATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAGGAATGAGAGTACGTGAAATTTATATCGGCGATTTTTCAAATATATCAGCGCAACTCGAATTATATCGGCGATTTTCA
CAATATATCGGCGCAACTCA

Product: putative permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 419; Mature: 419

Protein sequence:

>419_residues
MDILKNRNFLLLFLGRIFTNIGDSLYYVAAMWLVYKLSGNPFYSGLAGFLTLLPSALQFLTGPFVDRWPIKNTLVITQVL
QCILILIIPITHYFDLLTVQLLLIIMPIVAFIEQFAYPAQSKALPLLLHKTQLLKGNSLFSFAYQGIDLICTTLSGILVA
LFGAITLYVIDSFTFAITALLFFSLKMPKQTETGTTLSTKQYFSDLKEGFSIVFRSLMGVFLIGSVVANFSIGMTMAILP
SFADSLGGVKSYGFFLAAISAGSLIGALFSSWVGKRNVGRASIISFATGAIFWFLSTVVPFQWLSIFLFGLAWVPIGATN
ILFATISQILIPNRYIGRINSVMRSMGTIAMPFGSLIGGYAANIFSSQLIFALASIGILFISLVWLLHPKLRALPKADEI
TADTFGVQFKEEHGKGAAL

Sequences:

>Translated_419_residues
MDILKNRNFLLLFLGRIFTNIGDSLYYVAAMWLVYKLSGNPFYSGLAGFLTLLPSALQFLTGPFVDRWPIKNTLVITQVL
QCILILIIPITHYFDLLTVQLLLIIMPIVAFIEQFAYPAQSKALPLLLHKTQLLKGNSLFSFAYQGIDLICTTLSGILVA
LFGAITLYVIDSFTFAITALLFFSLKMPKQTETGTTLSTKQYFSDLKEGFSIVFRSLMGVFLIGSVVANFSIGMTMAILP
SFADSLGGVKSYGFFLAAISAGSLIGALFSSWVGKRNVGRASIISFATGAIFWFLSTVVPFQWLSIFLFGLAWVPIGATN
ILFATISQILIPNRYIGRINSVMRSMGTIAMPFGSLIGGYAANIFSSQLIFALASIGILFISLVWLLHPKLRALPKADEI
TADTFGVQFKEEHGKGAAL
>Mature_419_residues
MDILKNRNFLLLFLGRIFTNIGDSLYYVAAMWLVYKLSGNPFYSGLAGFLTLLPSALQFLTGPFVDRWPIKNTLVITQVL
QCILILIIPITHYFDLLTVQLLLIIMPIVAFIEQFAYPAQSKALPLLLHKTQLLKGNSLFSFAYQGIDLICTTLSGILVA
LFGAITLYVIDSFTFAITALLFFSLKMPKQTETGTTLSTKQYFSDLKEGFSIVFRSLMGVFLIGSVVANFSIGMTMAILP
SFADSLGGVKSYGFFLAAISAGSLIGALFSSWVGKRNVGRASIISFATGAIFWFLSTVVPFQWLSIFLFGLAWVPIGATN
ILFATISQILIPNRYIGRINSVMRSMGTIAMPFGSLIGGYAANIFSSQLIFALASIGILFISLVWLLHPKLRALPKADEI
TADTFGVQFKEEHGKGAAL

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45919; Mature: 45919

Theoretical pI: Translated: 9.96; Mature: 9.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCHHHHCCEEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCHHHHCCEEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9639930; 9384377 [H]