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The map label for this gene is yjbB [H]

Identifier: 226950896

GI number: 226950896

Start: 3953707

End: 3955323

Strand: Reverse

Name: yjbB [H]

Synonym: CLM_3911

Alternate gene names: 226950896

Gene position: 3955323-3953707 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226950897

Following gene: 226950895

Centisome position: 95.19

GC content: 29.5

Gene sequence:

>1617_bases
ATGAATGTATTTGCTATGTTAACAGGTCTTATTGGTGGATTAGGTTTATTCATCTATGGCATGAACTTAATGGGAGATGG
ATTGCAAAATGTAGCAGGAGAAAGAGTAAAGGTTTTTTTTGAAAAAGTAACTTCTAACCCTATAAAAGGAGTCCTAACAG
GAGTAGTAGTAACAGGAGTAATCCAAAGTAGTAGTGCTACTACAGTTATGGTTGTTGGATTTGTAAATGCAGGTTTAATG
ACTTTAACCCAAGCTGCAGGTGTAATTATGGGAGCTAACATAGGTACTACAGTTACAGGACAATTAGTTGCTTTTAATGT
TACTGCTGGAGCTCCATTATTTGTAGGAGTAGGAACTGCAATAGTTCTATTTGCCAAAAAGAAAAAGACTAAAGAAATAG
GTAATATAATACTAGGTTTTGGTATATTATTCATGGGAATGGAAATAATGAAAGAAGCTATGGCTCCATTAGGACAAAGT
GAAGCATTTAAAAGTTTAGCTTTATCATTATCACATAATGTATTTTTAGGAATAGTTGTAGGTATGGGAATGACAGCTAT
AGTGCAAAGTTCCTCCGCTACTATAGGTATATTAATAGCTTTATCAAGTAATGGAGTACTTCCATTATCAGCAGCATTAC
CAATATTATTTGGAGATAACATAGGTACTTGTGTAACAGCACTATTAGCTAGTATTGGCGCATCTAAAAATGCAAGAAAA
GCAGCATTGTTTCACTTAACATTTAATGTTATAGGAACAGTAATATTTGCATTTATTTTAGTACCATTAACTCCATTTGT
TAGAATAGTTACTAATTTGACCCCAGGAGATGTAGGAAGACAAATTGCTAATGCACACACAATGTTTAATTTAATTAATA
CATTTATACAAATATGGTTTATAAAATATATCGTTGCATTTGTTAATAAAATGATACCAGGTAGTGATCCATATGAAAAG
ATGGCTCCTAAGTACATAGACGAAAGATTATTAGAAAATCCTACAATAGCTATTAATCAAACTATAAAAGAAGTAGTAAG
AATGGCGAATAAAGCCAAAGAAAATTTGCAATTATCCATAGATGCATTTGAAAAAAATGATTTAGAATTAGTAAGTAAAG
TATATGAGAACGAAAAACTTATAAATATACTAAATAAGAGTATAACTACATATTTGGTTAAATTAAATAACTTAAAATTA
TCTGATAAGCAGTTAAATTTAGTAGGTTCTATGTTTCATGTGGTAAATGATATAGAAAGAATAGGGGATCATGCAGAAAA
CATAATAGATTTAACTAGTGAAAAGATAGAAAAAAGGATTCAATTTTCAGATGATGCTGCATATGATATAAAACATTTGT
TTAATTATACATTAGATTCATTAACAAGAACTATTGAAGGCTTTGAAAGTAACGATGTAGAAAGATCTCAAAGTGTTATG
TATATTGAAGAAAAAATAGATAGTTTAGAAGAACAATTAAGAGAAACTAATATAAAAAGATTAAATAAGGGAACTTGCAA
TGCCAATGCTAGTGCTATATTTTTAGATATTATAAATAATTTTGAAAGAGTTGGAGATCATTGTACAAATATAGCACAAA
CCGTTATAAACAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTCTATGTTAATTCTATGTTAAAAGTATTTTAAATTATCTTAATATCTACTATAATAATAAGGTATGGGATGACAATA
TTTAAATTAGGAGGACAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATATAATAGCTCAATTAAAAAGTTATATTTAAAATATTAGTTTAAGATTAATATTAATATTATATTGTGAAAAACTCTG
CTTAGTTAATAAGTAGAGTT

Product: Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 538; Mature: 538

Protein sequence:

>538_residues
MNVFAMLTGLIGGLGLFIYGMNLMGDGLQNVAGERVKVFFEKVTSNPIKGVLTGVVVTGVIQSSSATTVMVVGFVNAGLM
TLTQAAGVIMGANIGTTVTGQLVAFNVTAGAPLFVGVGTAIVLFAKKKKTKEIGNIILGFGILFMGMEIMKEAMAPLGQS
EAFKSLALSLSHNVFLGIVVGMGMTAIVQSSSATIGILIALSSNGVLPLSAALPILFGDNIGTCVTALLASIGASKNARK
AALFHLTFNVIGTVIFAFILVPLTPFVRIVTNLTPGDVGRQIANAHTMFNLINTFIQIWFIKYIVAFVNKMIPGSDPYEK
MAPKYIDERLLENPTIAINQTIKEVVRMANKAKENLQLSIDAFEKNDLELVSKVYENEKLINILNKSITTYLVKLNNLKL
SDKQLNLVGSMFHVVNDIERIGDHAENIIDLTSEKIEKRIQFSDDAAYDIKHLFNYTLDSLTRTIEGFESNDVERSQSVM
YIEEKIDSLEEQLRETNIKRLNKGTCNANASAIFLDIINNFERVGDHCTNIAQTVINR

Sequences:

>Translated_538_residues
MNVFAMLTGLIGGLGLFIYGMNLMGDGLQNVAGERVKVFFEKVTSNPIKGVLTGVVVTGVIQSSSATTVMVVGFVNAGLM
TLTQAAGVIMGANIGTTVTGQLVAFNVTAGAPLFVGVGTAIVLFAKKKKTKEIGNIILGFGILFMGMEIMKEAMAPLGQS
EAFKSLALSLSHNVFLGIVVGMGMTAIVQSSSATIGILIALSSNGVLPLSAALPILFGDNIGTCVTALLASIGASKNARK
AALFHLTFNVIGTVIFAFILVPLTPFVRIVTNLTPGDVGRQIANAHTMFNLINTFIQIWFIKYIVAFVNKMIPGSDPYEK
MAPKYIDERLLENPTIAINQTIKEVVRMANKAKENLQLSIDAFEKNDLELVSKVYENEKLINILNKSITTYLVKLNNLKL
SDKQLNLVGSMFHVVNDIERIGDHAENIIDLTSEKIEKRIQFSDDAAYDIKHLFNYTLDSLTRTIEGFESNDVERSQSVM
YIEEKIDSLEEQLRETNIKRLNKGTCNANASAIFLDIINNFERVGDHCTNIAQTVINR
>Mature_538_residues
MNVFAMLTGLIGGLGLFIYGMNLMGDGLQNVAGERVKVFFEKVTSNPIKGVLTGVVVTGVIQSSSATTVMVVGFVNAGLM
TLTQAAGVIMGANIGTTVTGQLVAFNVTAGAPLFVGVGTAIVLFAKKKKTKEIGNIILGFGILFMGMEIMKEAMAPLGQS
EAFKSLALSLSHNVFLGIVVGMGMTAIVQSSSATIGILIALSSNGVLPLSAALPILFGDNIGTCVTALLASIGASKNARK
AALFHLTFNVIGTVIFAFILVPLTPFVRIVTNLTPGDVGRQIANAHTMFNLINTFIQIWFIKYIVAFVNKMIPGSDPYEK
MAPKYIDERLLENPTIAINQTIKEVVRMANKAKENLQLSIDAFEKNDLELVSKVYENEKLINILNKSITTYLVKLNNLKL
SDKQLNLVGSMFHVVNDIERIGDHAENIIDLTSEKIEKRIQFSDDAAYDIKHLFNYTLDSLTRTIEGFESNDVERSQSVM
YIEEKIDSLEEQLRETNIKRLNKGTCNANASAIFLDIINNFERVGDHCTNIAQTVINR

Specific function: Unknown

COG id: COG1283

COG function: function code P; Na+/phosphate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis yqeW [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=550, Percent_Identity=23.2727272727273, Blast_Score=162, Evalue=4e-41,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003841
- InterPro:   IPR004633 [H]

Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58472; Mature: 58472

Theoretical pI: Translated: 7.20; Mature: 7.20

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNVFAMLTGLIGGLGLFIYGMNLMGDGLQNVAGERVKVFFEKVTSNPIKGVLTGVVVTGV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
IQSSSATTVMVVGFVNAGLMTLTQAAGVIMGANIGTTVTGQLVAFNVTAGAPLFVGVGTA
HCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCEECEEEEEEECCCCCHHEEHHHH
IVLFAKKKKTKEIGNIILGFGILFMGMEIMKEAMAPLGQSEAFKSLALSLSHNVFLGIVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
GMGMTAIVQSSSATIGILIALSSNGVLPLSAALPILFGDNIGTCVTALLASIGASKNARK
HCCHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCEEHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
AALFHLTFNVIGTVIFAFILVPLTPFVRIVTNLTPGDVGRQIANAHTMFNLINTFIQIWF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKYIVAFVNKMIPGSDPYEKMAPKYIDERLLENPTIAINQTIKEVVRMANKAKENLQLSI
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
DAFEKNDLELVSKVYENEKLINILNKSITTYLVKLNNLKLSDKQLNLVGSMFHVVNDIER
ECCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGDHAENIIDLTSEKIEKRIQFSDDAAYDIKHLFNYTLDSLTRTIEGFESNDVERSQSVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
YIEEKIDSLEEQLRETNIKRLNKGTCNANASAIFLDIINNFERVGDHCTNIAQTVINR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNVFAMLTGLIGGLGLFIYGMNLMGDGLQNVAGERVKVFFEKVTSNPIKGVLTGVVVTGV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
IQSSSATTVMVVGFVNAGLMTLTQAAGVIMGANIGTTVTGQLVAFNVTAGAPLFVGVGTA
HCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCEECEEEEEEECCCCCHHEEHHHH
IVLFAKKKKTKEIGNIILGFGILFMGMEIMKEAMAPLGQSEAFKSLALSLSHNVFLGIVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
GMGMTAIVQSSSATIGILIALSSNGVLPLSAALPILFGDNIGTCVTALLASIGASKNARK
HCCHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCEEHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
AALFHLTFNVIGTVIFAFILVPLTPFVRIVTNLTPGDVGRQIANAHTMFNLINTFIQIWF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKYIVAFVNKMIPGSDPYEKMAPKYIDERLLENPTIAINQTIKEVVRMANKAKENLQLSI
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
DAFEKNDLELVSKVYENEKLINILNKSITTYLVKLNNLKLSDKQLNLVGSMFHVVNDIER
ECCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGDHAENIIDLTSEKIEKRIQFSDDAAYDIKHLFNYTLDSLTRTIEGFESNDVERSQSVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
YIEEKIDSLEEQLRETNIKRLNKGTCNANASAIFLDIINNFERVGDHCTNIAQTVINR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]