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The map label for this gene is 226950089

Identifier: 226950089

GI number: 226950089

Start: 3040043

End: 3041473

Strand: Reverse

Name: 226950089

Synonym: CLM_3042

Alternate gene names: NA

Gene position: 3041473-3040043 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226950090

Following gene: 226950088

Centisome position: 73.2

GC content: 19.57

Gene sequence:

>1431_bases
ATGTTAACAAAATTTAAAAATATATTTAAAAACAATAAGTTTAATGTGATTTTCAAATATTCTTTTATTAAGTATATTGC
ATTAGTAATAGGTTTTTTAAAAGAAATAGTAAATGCTAGGGCTTTGGGGCCAGAGTTATTAGGGGTTTTAGGAAATTTAT
TGTTAATATTAAATTATTTATCCTATGCTAATTTAGGGATTTTATATTCTATGAATAGAGAATATGTACTTTATAAGGAT
AAAGATGAAATAAAGGCTAGACAGGTTGTTTATACTTCTTTTACAAGCTTATTTATACTCTCTGTTTTTTTTATACTATG
TGGTTTTTTATCAAAATTATTTATTTTTAAGGGTGTTACAGGAGAATATTTGATATATATTTTTTTTATTGCTATTTTTC
AACAGTTTAAAATGTTTTTTATTAATTATTTTAGATTGATTGACGATTTTACCAAAATCAACATTATTGAATTGATTAAT
AATGCAGGAACGTTTTTATTAATAATATTATTTATAAAGAATTATAAAATAAATGCAGTATTGTATTCTATGATTATTTG
TGGATTTATAACTTTAATATATGGTATTATTAATTGCGAAAAGTTAAAAATTAATATAAATTACAATATATTAAAGGACT
TAATTTATATAGGAATACCTTTATTGATTTATAATTTAGGATTTTATATTTTAACAACAGTGGATAGGATAATGATTTTA
AAATATTTAAACTATGAAGAATTAGGGTATTATACATTTTCAAATCAAATAGTTAGTGCAACATTAGTTTTTATAACATC
TATTTTATTTTTATATTACCCTAAAGCTATAAAAATACTAAATATAAATGAAAATTTTAATGGGAAAAAGATTTATAATA
GCATAGAAAATTATACAAAATATGTGGAATTATTAGGGGTTTTGTTGTGTGTAGTAGGTGTAATTTTTATAAAGCCTTTT
GTAAATATTGTTGTGCCTAACTATGAAGCTAGTATAAATATTTATAGAGTATTAGTACTGGGTGCGATAGCCTCACAGGT
TTCATATTTTGCAAATGTTTTTATAGTGTCAAATAAGAAACAAATGTATTTAATTTTTCTTCAATTTTTAACTATAATAT
TATCCATAATATTAAATTATATATTTTTAAAATTAGGTTTTAAGGTTATGGGCATATCTATAGCTACTATGATTACTAAT
ATAATATATTCTGCAATGCAGTATTTAATTTTCTTAAAAATATTAAATCAAAAAAAAGGTTATTTTAATATAATGTTAAA
AACTTATTATAAATTTATTTTATTTATAATTATATTATTAATTATAAGTAATTTAAAAATAAATTATTACATATATATAA
TGATTTTGTTGGTATCTGTATTTATGTTATATAAAAAAGATATTAGTGATGCTGTTAAAAAGTATATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAATATAATTTACAAAAGGGGCTTATAAAAACTATAAATTATTATAAAGACAATATATAGGATAATGCTTATTTAAAAG
TATTACATAAGGTGATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAATGGGATAAGTTTACTAAATAATAATATATTATTAATATAAGAGTAAAAAGAGTGTGTTAAAATGATATAATATTT
CTGTTAATCATATTATGATG

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 476; Mature: 476

Protein sequence:

>476_residues
MLTKFKNIFKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNARALGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYVLYKD
KDEIKARQVVYTSFTSLFILSVFFILCGFLSKLFIFKGVTGEYLIYIFFIAIFQQFKMFFINYFRLIDDFTKINIIELIN
NAGTFLLIILFIKNYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYIGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
KYLNYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNGKKIYNSIENYTKYVELLGVLLCVVGVIFIKPF
VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGISIATMITN
IIYSAMQYLIFLKILNQKKGYFNIMLKTYYKFILFIIILLIISNLKINYYIYIMILLVSVFMLYKKDISDAVKKYI

Sequences:

>Translated_476_residues
MLTKFKNIFKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNARALGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYVLYKD
KDEIKARQVVYTSFTSLFILSVFFILCGFLSKLFIFKGVTGEYLIYIFFIAIFQQFKMFFINYFRLIDDFTKINIIELIN
NAGTFLLIILFIKNYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYIGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
KYLNYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNGKKIYNSIENYTKYVELLGVLLCVVGVIFIKPF
VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGISIATMITN
IIYSAMQYLIFLKILNQKKGYFNIMLKTYYKFILFIIILLIISNLKINYYIYIMILLVSVFMLYKKDISDAVKKYI
>Mature_476_residues
MLTKFKNIFKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNARALGPELLGVLGNLLLILNYLSYANLGILYSMNREYVLYKD
KDEIKARQVVYTSFTSLFILSVFFILCGFLSKLFIFKGVTGEYLIYIFFIAIFQQFKMFFINYFRLIDDFTKINIIELIN
NAGTFLLIILFIKNYKINAVLYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYIGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
KYLNYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNGKKIYNSIENYTKYVELLGVLLCVVGVIFIKPF
VNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKKQMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGISIATMITN
IIYSAMQYLIFLKILNQKKGYFNIMLKTYYKFILFIIILLIISNLKINYYIYIMILLVSVFMLYKKDISDAVKKYI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55668; Mature: 55668

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLTKFKNIFKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNARALGPELLGVLGNLLLILNYL
CCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYANLGILYSMNREYVLYKDKDEIKARQVVYTSFTSLFILSVFFILCGFLSKLFIFKGVT
HHHCCCEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GEYLIYIFFIAIFQQFKMFFINYFRLIDDFTKINIIELINNAGTFLLIILFIKNYKINAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH
LYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYIGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYLNYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNGKKIYNSIENYTK
HHCCHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH
YVELLGVLLCVVGVIFIKPFVNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCC
QMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGISIATMITNIIYSAMQYLIFLKILNQKKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
YFNIMLKTYYKFILFIIILLIISNLKINYYIYIMILLVSVFMLYKKDISDAVKKYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLTKFKNIFKNNKFNVIFKYSFIKYIALVIGFLKEIVNARALGPELLGVLGNLLLILNYL
CCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYANLGILYSMNREYVLYKDKDEIKARQVVYTSFTSLFILSVFFILCGFLSKLFIFKGVT
HHHCCCEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GEYLIYIFFIAIFQQFKMFFINYFRLIDDFTKINIIELINNAGTFLLIILFIKNYKINAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH
LYSMIICGFITLIYGIINCEKLKININYNILKDLIYIGIPLLIYNLGFYILTTVDRIMIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYLNYEELGYYTFSNQIVSATLVFITSILFLYYPKAIKILNINENFNGKKIYNSIENYTK
HHCCHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH
YVELLGVLLCVVGVIFIKPFVNIVVPNYEASINIYRVLVLGAIASQVSYFANVFIVSNKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCC
QMYLIFLQFLTIILSIILNYIFLKLGFKVMGISIATMITNIIYSAMQYLIFLKILNQKKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
YFNIMLKTYYKFILFIIILLIISNLKINYYIYIMILLVSVFMLYKKDISDAVKKYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA