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The map label for this gene is 226949706

Identifier: 226949706

GI number: 226949706

Start: 2666434

End: 2668593

Strand: Reverse

Name: 226949706

Synonym: CLM_2646

Alternate gene names: NA

Gene position: 2668593-2666434 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226949707

Following gene: 226949705

Centisome position: 64.22

GC content: 33.66

Gene sequence:

>2160_bases
ATGGCAACAGTATCTACTGCACTCAAAATGTTTGATCAAATGACGAGACCTCTCCAACAAGTTACGCAAGCTTTAAATTT
AACAATAAGTGCTATGGACCAAATGAATAATGCTGCAAATAAAGATATAAGAATAACTAATTCTTTAAACACTGCGAGGG
GAGCAATTCAAAGAGCTTCAGCTGGATTGCAAGAATTAGCTAGTGCTCAGGAGAAAGCTCAAAATAATCAAAACAAATTG
AATGATTCTTTTAATAGAGGATCTAGCGAAGCCAATGGGTTGATAAGCAAAGCAAAGAATCTGGTAGGTGCTTATTTAGG
GTTTCAAGCTGCTAAGAAAGGATTAGACTTAACTATAGGTGGGGGAGCAAGGTTAGAACAACAATTAATAACTATAAGTG
GTATGTTAGGTAATAAAGATATAGGTAAAGCTTTTTTTGGAGGTTTGAATAAATATGCCAATGAGAGTGTATATGGGTTA
AAAGAATTTAATACTATAACTAGGAGTTTTATTCAATTTACGAAAAATACAGATAAACTTATGGACTTAAATAAGACAGC
TGAAAAATTGGCGTTCTTAGATCCAACGCAGGGATTAGAAGGTGCTGGATTTGCATTAAAAGAAGCCTTAGGTGGAGACT
TTATGTCTCTAAAGAGTAGATTTGGATTTGGTAAAGCTGATGCAGAAATATTAAAGGCATCTAAAAGTATGGATGAGTTT
ATAAGCAAGTTTGATGAATTATTAGCTAAAAAAGGTGCTAGTGATAAAGCTTTGGAAGAATTTAATCAATCCGCGATAGC
TCAACTTAATAACCTTAAATCAAACATAGAAACTGCGTTTGCACAGGCAAGTGAAACCGCGTTAGAAGTTTTAAAACCTT
TGCTTAGCAGAATAAATGAAGGATTTAAAAATGGAAGTTTTGAAGGTTTTTTTAATGGCATAAGCGTAGGATTAGATATA
ATTGTGAATTTAACGATGGAAGCTATGGATATTATTACATCATTAAGTCAAACATTTATTGATAATTGGAGCATAATTAG
TCCTATCATTTGGGGAATTGTATTTGCAATGATAGCTTATAATGCGACAATGGGAATTGCATGGTTAACAACTATACAAA
CTACTATTGCTAAGATTGCCCACACTATTGCGTCTTGGGCAGAAACAGCTGCTATACTTGCCTTAATAATAGCTCAAGAT
GGATTAAATGCAGCATTATTAGCCTGCCCTTTAACATGGATTATTATTGCAATAATTATATTAATAGCTTTATTTTATGC
AGCTGTAGCAGGGGTGAATCATTTAGCGGGTACAAGTATTTCAGCAACTGGAGTTATTGCGGGATCATTTATGGTGGCAC
TTGCATTTATAGGAAATCTATTCGTAACACTTTATAATTTAGTTGTTGATATTATAGCTTTGTTTTATAATCATTTTACT
GCATTTGCGGAATTTTTCGCTAATGTATTTAATGATCCTATAGGTTCTATAATTAGGCTATTTGCAGCAATGGCAGATGA
AGTTTTAGGGATACTTAAAAGTATAGCCTCCGCTATAGATACGATATTCGGCTCTAATCTTGCCAATGCAGTAGGTAATT
GGCAAAATGGACTTCAAGGTGCTGTTGATAAATTAGTTGGTAAACCTAAAATTCAATTTCAAAAGATGGATTCTTCTGCA
ATGCATCTAGATAGGTTTGAATATGGTAAGGCATATGATTCAGGGTATGGAGTGGGTAAAAACATAGGTGATAAATTTGA
TTTAGGAAATATATTTAATAAGGGTAATATTCCAGACATGGGTAAAATGCCAGATATGGCGGCATGGAATAAAGCACAAG
GACCAGGAACATTAGGAACTGTAGGAGATGATGGTAAAAATAAAGGTAGTAAATCCCCAAGTGGAAACAAAGGATTGAAA
GATGCTAACAATCATCTTAAAAATATAGACGATAAAATAGACATTAGCAATGAACACTTAGAAATGATGAGGGATTTAGC
AGAAATGGAAAGCATACAAAACTTTGTAACTCTAACTCCAACAGTACAAGTTACTACTGGAGATATTAAAGAAGAAGCAG
ACATAAACAAAATAATATCTAAAATAGAGAATTACATGGAAAATGAATTGACTAACAGCGCCGAGGGGGTATATGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TACGTTGTTAGATAAAATTATTTTTTATATAGAAATAAGAGCTTAAAGCACTTACTTTAATGTAGGTGCTTTTATTATTG
TTTGAAAGCGGGGTGAATAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAACTATACAATGTATTTAGGAATTAATGATGGTGAAGAAGGATTTATACTCCCAGTGTTACCAGAGAAGATTGAATTT
GATGAAGATGGAAATAATAA

Product: putative tail length tape measure protein

Products: NA

Alternate protein names: Tail Length Tape Measure Protein; Phage Membrane Protein; Phage Tail Tape Measure Protein; Tape Measure Domain Protein

Number of amino acids: Translated: 719; Mature: 718

Protein sequence:

>719_residues
MATVSTALKMFDQMTRPLQQVTQALNLTISAMDQMNNAANKDIRITNSLNTARGAIQRASAGLQELASAQEKAQNNQNKL
NDSFNRGSSEANGLISKAKNLVGAYLGFQAAKKGLDLTIGGGARLEQQLITISGMLGNKDIGKAFFGGLNKYANESVYGL
KEFNTITRSFIQFTKNTDKLMDLNKTAEKLAFLDPTQGLEGAGFALKEALGGDFMSLKSRFGFGKADAEILKASKSMDEF
ISKFDELLAKKGASDKALEEFNQSAIAQLNNLKSNIETAFAQASETALEVLKPLLSRINEGFKNGSFEGFFNGISVGLDI
IVNLTMEAMDIITSLSQTFIDNWSIISPIIWGIVFAMIAYNATMGIAWLTTIQTTIAKIAHTIASWAETAAILALIIAQD
GLNAALLACPLTWIIIAIIILIALFYAAVAGVNHLAGTSISATGVIAGSFMVALAFIGNLFVTLYNLVVDIIALFYNHFT
AFAEFFANVFNDPIGSIIRLFAAMADEVLGILKSIASAIDTIFGSNLANAVGNWQNGLQGAVDKLVGKPKIQFQKMDSSA
MHLDRFEYGKAYDSGYGVGKNIGDKFDLGNIFNKGNIPDMGKMPDMAAWNKAQGPGTLGTVGDDGKNKGSKSPSGNKGLK
DANNHLKNIDDKIDISNEHLEMMRDLAEMESIQNFVTLTPTVQVTTGDIKEEADINKIISKIENYMENELTNSAEGVYA

Sequences:

>Translated_719_residues
MATVSTALKMFDQMTRPLQQVTQALNLTISAMDQMNNAANKDIRITNSLNTARGAIQRASAGLQELASAQEKAQNNQNKL
NDSFNRGSSEANGLISKAKNLVGAYLGFQAAKKGLDLTIGGGARLEQQLITISGMLGNKDIGKAFFGGLNKYANESVYGL
KEFNTITRSFIQFTKNTDKLMDLNKTAEKLAFLDPTQGLEGAGFALKEALGGDFMSLKSRFGFGKADAEILKASKSMDEF
ISKFDELLAKKGASDKALEEFNQSAIAQLNNLKSNIETAFAQASETALEVLKPLLSRINEGFKNGSFEGFFNGISVGLDI
IVNLTMEAMDIITSLSQTFIDNWSIISPIIWGIVFAMIAYNATMGIAWLTTIQTTIAKIAHTIASWAETAAILALIIAQD
GLNAALLACPLTWIIIAIIILIALFYAAVAGVNHLAGTSISATGVIAGSFMVALAFIGNLFVTLYNLVVDIIALFYNHFT
AFAEFFANVFNDPIGSIIRLFAAMADEVLGILKSIASAIDTIFGSNLANAVGNWQNGLQGAVDKLVGKPKIQFQKMDSSA
MHLDRFEYGKAYDSGYGVGKNIGDKFDLGNIFNKGNIPDMGKMPDMAAWNKAQGPGTLGTVGDDGKNKGSKSPSGNKGLK
DANNHLKNIDDKIDISNEHLEMMRDLAEMESIQNFVTLTPTVQVTTGDIKEEADINKIISKIENYMENELTNSAEGVYA
>Mature_718_residues
ATVSTALKMFDQMTRPLQQVTQALNLTISAMDQMNNAANKDIRITNSLNTARGAIQRASAGLQELASAQEKAQNNQNKLN
DSFNRGSSEANGLISKAKNLVGAYLGFQAAKKGLDLTIGGGARLEQQLITISGMLGNKDIGKAFFGGLNKYANESVYGLK
EFNTITRSFIQFTKNTDKLMDLNKTAEKLAFLDPTQGLEGAGFALKEALGGDFMSLKSRFGFGKADAEILKASKSMDEFI
SKFDELLAKKGASDKALEEFNQSAIAQLNNLKSNIETAFAQASETALEVLKPLLSRINEGFKNGSFEGFFNGISVGLDII
VNLTMEAMDIITSLSQTFIDNWSIISPIIWGIVFAMIAYNATMGIAWLTTIQTTIAKIAHTIASWAETAAILALIIAQDG
LNAALLACPLTWIIIAIIILIALFYAAVAGVNHLAGTSISATGVIAGSFMVALAFIGNLFVTLYNLVVDIIALFYNHFTA
FAEFFANVFNDPIGSIIRLFAAMADEVLGILKSIASAIDTIFGSNLANAVGNWQNGLQGAVDKLVGKPKIQFQKMDSSAM
HLDRFEYGKAYDSGYGVGKNIGDKFDLGNIFNKGNIPDMGKMPDMAAWNKAQGPGTLGTVGDDGKNKGSKSPSGNKGLKD
ANNHLKNIDDKIDISNEHLEMMRDLAEMESIQNFVTLTPTVQVTTGDIKEEADINKIISKIENYMENELTNSAEGVYA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77428; Mature: 77296

Theoretical pI: Translated: 5.12; Mature: 5.12

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MATVSTALKMFDQMTRPLQQVTQALNLTISAMDQMNNAANKDIRITNSLNTARGAIQRAS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHH
AGLQELASAQEKAQNNQNKLNDSFNRGSSEANGLISKAKNLVGAYLGFQAAKKGLDLTIG
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC
GGARLEQQLITISGMLGNKDIGKAFFGGLNKYANESVYGLKEFNTITRSFIQFTKNTDKL
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
MDLNKTAEKLAFLDPTQGLEGAGFALKEALGGDFMSLKSRFGFGKADAEILKASKSMDEF
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ISKFDELLAKKGASDKALEEFNQSAIAQLNNLKSNIETAFAQASETALEVLKPLLSRINE
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFKNGSFEGFFNGISVGLDIIVNLTMEAMDIITSLSQTFIDNWSIISPIIWGIVFAMIAY
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NATMGIAWLTTIQTTIAKIAHTIASWAETAAILALIIAQDGLNAALLACPLTWIIIAIII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIALFYAAVAGVNHLAGTSISATGVIAGSFMVALAFIGNLFVTLYNLVVDIIALFYNHFT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFAEFFANVFNDPIGSIIRLFAAMADEVLGILKSIASAIDTIFGSNLANAVGNWQNGLQG
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
AVDKLVGKPKIQFQKMDSSAMHLDRFEYGKAYDSGYGVGKNIGDKFDLGNIFNKGNIPDM
HHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
GKMPDMAAWNKAQGPGTLGTVGDDGKNKGSKSPSGNKGLKDANNHLKNIDDKIDISNEHL
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH
EMMRDLAEMESIQNFVTLTPTVQVTTGDIKEEADINKIISKIENYMENELTNSAEGVYA
HHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ATVSTALKMFDQMTRPLQQVTQALNLTISAMDQMNNAANKDIRITNSLNTARGAIQRAS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHH
AGLQELASAQEKAQNNQNKLNDSFNRGSSEANGLISKAKNLVGAYLGFQAAKKGLDLTIG
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC
GGARLEQQLITISGMLGNKDIGKAFFGGLNKYANESVYGLKEFNTITRSFIQFTKNTDKL
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
MDLNKTAEKLAFLDPTQGLEGAGFALKEALGGDFMSLKSRFGFGKADAEILKASKSMDEF
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ISKFDELLAKKGASDKALEEFNQSAIAQLNNLKSNIETAFAQASETALEVLKPLLSRINE
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GFKNGSFEGFFNGISVGLDIIVNLTMEAMDIITSLSQTFIDNWSIISPIIWGIVFAMIAY
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NATMGIAWLTTIQTTIAKIAHTIASWAETAAILALIIAQDGLNAALLACPLTWIIIAIII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIALFYAAVAGVNHLAGTSISATGVIAGSFMVALAFIGNLFVTLYNLVVDIIALFYNHFT
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AFAEFFANVFNDPIGSIIRLFAAMADEVLGILKSIASAIDTIFGSNLANAVGNWQNGLQG
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
AVDKLVGKPKIQFQKMDSSAMHLDRFEYGKAYDSGYGVGKNIGDKFDLGNIFNKGNIPDM
HHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
GKMPDMAAWNKAQGPGTLGTVGDDGKNKGSKSPSGNKGLKDANNHLKNIDDKIDISNEHL
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH
EMMRDLAEMESIQNFVTLTPTVQVTTGDIKEEADINKIISKIENYMENELTNSAEGVYA
HHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA