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The map label for this gene is yueF [H]

Identifier: 226949096

GI number: 226949096

Start: 2081352

End: 2082446

Strand: Direct

Name: yueF [H]

Synonym: CLM_2012

Alternate gene names: 226949096

Gene position: 2081352-2082446 (Clockwise)

Preceding gene: 226949088

Following gene: 226949098

Centisome position: 50.09

GC content: 22.28

Gene sequence:

>1095_bases
GTGACAAAAAATAAAAAAATACCATTCCTAGAATTCATACCTATAATAGTTATATCCTTTCTACTTTTAAAATTTATAAA
CAACATAGAAAATATTTATTCTTTTATGAAATCTTTTTTATCAATATTAGTACCATTTATTTGGGCTTTTGGAATTGCCT
ATATATTAAATCCATTAATGAAATATTTTCAAAATAAATTTAAATTAAAAAGGATATTTAGTATTATTATAACTTACATA
ATTGTAATCGGACTTTTGATATTATTTATAAATACTTTTGTTCCTAAAATTATAAAAAATATTGGAGATCTTTTCGTCCA
TAGTCCTGATTATATTAATCAAACAATTCAATGGTTTAATGATAATATAAAATATTCAAAGGTATATGATATGTTAATGG
AAAATTATCAAATAAGCAATAATATACCTAATCTATTAAATAAAATTTCTAATTTGACTAATACATTTTTAAATACATTT
TTAAATACTACAATAAAATTTACTTCATTTTTAGTTAGGTTTGTATTTGGATTGATTATTTCTATATACCTTTTACTAGA
TAAGGAAAGTCTCATAGAAAACTTAAAAAAATTTATATTAGCACTATCCGGTGAAAAAAATTATTCAAAAATTTTGAGTT
TCTTCAAAGAGGTAGACATAGTTTTTTCAAAATACATAATAGGCAAATCTATAGATTCTCTAATAATTGGATTGATGTGT
TTTGCGGGATTAACAATAATGAAAGTTCCTTATGCTGCTTTAATATCTTTTATTGTAGGAATAACAAATATGATTCCTTA
TTTTGGTCCTTTTATAGGAATGATACCTGCTTTTATAATAACATTATTTTTTAATTATATAAAAGCTATTTGGGTGTTAA
TTTTTATAATAATACTTCAACAATTTGATGGTTGGTATTTAGGTCCTAAGATTCTTGGCAATCAGGTTGGATTAAGTCCT
ATATGGATAATATTTGCAATAACTATTGGTGGAGGAACTTTTGGTGTAATGGGTATGTTTTTATCTGTGCCTATTGCAGC
TATCATAAAAATTTATTTAGATAAATACATAGAAATGAAATTAAATAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATGTATTTATAATACCATATAGGTTGTAAAATCTATTACAATATAGTAAAATTTATAAAGCACAAGGCTATTATTATC
TATAATTGGAGGTTAAAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAGATTAAAACAACAATAAAGGGATATCTCAAAATTAAAATAGATTTAATTTTAAAGCTCGAAATATAAAAATTAAAT
CTATTTTGAGACATCCCTCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 364; Mature: 363

Protein sequence:

>364_residues
MTKNKKIPFLEFIPIIVISFLLLKFINNIENIYSFMKSFLSILVPFIWAFGIAYILNPLMKYFQNKFKLKRIFSIIITYI
IVIGLLILFINTFVPKIIKNIGDLFVHSPDYINQTIQWFNDNIKYSKVYDMLMENYQISNNIPNLLNKISNLTNTFLNTF
LNTTIKFTSFLVRFVFGLIISIYLLLDKESLIENLKKFILALSGEKNYSKILSFFKEVDIVFSKYIIGKSIDSLIIGLMC
FAGLTIMKVPYAALISFIVGITNMIPYFGPFIGMIPAFIITLFFNYIKAIWVLIFIIILQQFDGWYLGPKILGNQVGLSP
IWIIFAITIGGGTFGVMGMFLSVPIAAIIKIYLDKYIEMKLNKK

Sequences:

>Translated_364_residues
MTKNKKIPFLEFIPIIVISFLLLKFINNIENIYSFMKSFLSILVPFIWAFGIAYILNPLMKYFQNKFKLKRIFSIIITYI
IVIGLLILFINTFVPKIIKNIGDLFVHSPDYINQTIQWFNDNIKYSKVYDMLMENYQISNNIPNLLNKISNLTNTFLNTF
LNTTIKFTSFLVRFVFGLIISIYLLLDKESLIENLKKFILALSGEKNYSKILSFFKEVDIVFSKYIIGKSIDSLIIGLMC
FAGLTIMKVPYAALISFIVGITNMIPYFGPFIGMIPAFIITLFFNYIKAIWVLIFIIILQQFDGWYLGPKILGNQVGLSP
IWIIFAITIGGGTFGVMGMFLSVPIAAIIKIYLDKYIEMKLNKK
>Mature_363_residues
TKNKKIPFLEFIPIIVISFLLLKFINNIENIYSFMKSFLSILVPFIWAFGIAYILNPLMKYFQNKFKLKRIFSIIITYII
VIGLLILFINTFVPKIIKNIGDLFVHSPDYINQTIQWFNDNIKYSKVYDMLMENYQISNNIPNLLNKISNLTNTFLNTFL
NTTIKFTSFLVRFVFGLIISIYLLLDKESLIENLKKFILALSGEKNYSKILSFFKEVDIVFSKYIIGKSIDSLIIGLMCF
AGLTIMKVPYAALISFIVGITNMIPYFGPFIGMIPAFIITLFFNYIKAIWVLIFIIILQQFDGWYLGPKILGNQVGLSPI
WIIFAITIGGGTFGVMGMFLSVPIAAIIKIYLDKYIEMKLNKK

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=330, Percent_Identity=23.030303030303, Blast_Score=94, Evalue=1e-20,
Organism=Escherichia coli, GI1787885, Length=317, Percent_Identity=23.6593059936909, Blast_Score=66, Evalue=3e-12,
Organism=Escherichia coli, GI87082271, Length=133, Percent_Identity=29.3233082706767, Blast_Score=65, Evalue=6e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41977; Mature: 41845

Theoretical pI: Translated: 10.12; Mature: 10.12

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKNKKIPFLEFIPIIVISFLLLKFINNIENIYSFMKSFLSILVPFIWAFGIAYILNPLM
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYFQNKFKLKRIFSIIITYIIVIGLLILFINTFVPKIIKNIGDLFVHSPDYINQTIQWFN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
DNIKYSKVYDMLMENYQISNNIPNLLNKISNLTNTFLNTFLNTTIKFTSFLVRFVFGLII
CCCHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIYLLLDKESLIENLKKFILALSGEKNYSKILSFFKEVDIVFSKYIIGKSIDSLIIGLMC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAGLTIMKVPYAALISFIVGITNMIPYFGPFIGMIPAFIITLFFNYIKAIWVLIFIIILQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFDGWYLGPKILGNQVGLSPIWIIFAITIGGGTFGVMGMFLSVPIAAIIKIYLDKYIEMK
HHCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNKK
CCCC
>Mature Secondary Structure 
TKNKKIPFLEFIPIIVISFLLLKFINNIENIYSFMKSFLSILVPFIWAFGIAYILNPLM
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH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CCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]