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The map label for this gene is yjbQ [H]

Identifier: 226949064

GI number: 226949064

Start: 2044819

End: 2046252

Strand: Direct

Name: yjbQ [H]

Synonym: CLM_1980

Alternate gene names: 226949064

Gene position: 2044819-2046252 (Clockwise)

Preceding gene: 226949059

Following gene: 226949070

Centisome position: 49.21

GC content: 25.24

Gene sequence:

>1434_bases
TTGGAACATATTAATTATGACTCATTACTTATACTTTCTTTGCTTGCATTTATAACTCCACTTTTTATAAATTCTTTTAA
AAAATATAAGGTTCCCTTTGTAGTTGGAGAACTTTTTGTAGGTATTATAATTGGAAAAAGTTTTTTAAATTTAATACAAG
TAGATCCTTGGATACAATTTCTATCTAATTTAGGGCTAGCCTATTTAATGTTTTTAAGTGGCTTAGAAATTGATGTCCAT
AGTATAAAAATTAGTAAAGATAGTAAAGGAGCAAATAATATAATTATTTGTTTTATAATGTCTTTACTATCTATAGTAGT
TTCTTTTGTTATATGTAAATTTTTATATTCTTTAGGACTTATTAAAAATTCTATTTTTATGACTTTTTTATTTTCTGCAG
CAGCTCCTGGGTTTTTAGTACCATTTCTAAAACAAAAGGGTATATTAAAAACAGAGTTTGGGCAGATACTATTAATATTT
TCACTTATAGGAGAGTTTGTAAGCTTAATTGCTATGACTATTATATCTTCCAAGCTAACTTATGGATTAAGTTATAAAAG
CTTTTTATTTTTAATAGTTATTATAGTTTCGTTTTTTATATATATAGTATTAAGTAAATTACAGGGAAAATATGATTTTG
CTACTTTGGCAACTAATAATACTCATTTAGAAGTAAGAGCAGCCTTTGCATTGATATTAACTTTGGTTACTATATCAAAT
AAAACTGGTACCGAAATAGCTCTAGGCTCATTTTTAGCCGGAGTTATATTCACATTATTGACGGACAAAAGCCATGAGGA
AGATTTAAAATATAAATTAGATATTATAGGTTATGGTTTTTTAATTCCTATATTTTTCATAATGGTAGGGGTAAATCTAG
ATATAACTACTATATTTGAAAATCCTAAAAGTTTAATATCAATTCCTTTACTTATATTAATAATTTATGTAACTAAGTTT
ATTCCTTCCTTGGTATTAAAATATAAGTTTGATACTAATAAAGCATTATCTTCATCAATTATTTTATCTAGTCAGCTAAG
TATACTTATAGTTGGAGCTCAAATTGCTTTTAATTTAAAATTAATTCCTCAGGAAGGTTACTCAGCTTTAATTTTGACTG
CTGTAGTATCCTGTATGCTATTTCCTTTCATATTTGATAAAGTTATGAAGTATGATGATTTGGAGAAAACTGTAGAATCT
AACACCAATAAAATTTGTGTAAGAGAAGTGGTTCCAACTAATAAAAAAATATTCAATAAACCTTTAAAAGATTTAAATAT
TCCCCAAGGCGCTAGAATATTTTTAATTCTTAGAGATGAAAAAGAAATACTTCCAGATGGTAATTCTGAAATACTGGAAG
GAGATGTATTATTAATTGCAGGACTTTCTGATAAATCTTTAGATTTTTTAAAAATATTAAAAAATGAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATTCTAAAATATTTAATTTCTAAAATTAATGTGTTATAATTAATAAATTCTAATTTTGTATGTGACTAATAATTTAT
TTTAAAGGAGAGATTTTCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTGGTATACGATAAAGATTAAATTAAAAGGCTATAATTTCTAGAATATTATATTCTTAGAAGTTATAGCCTTTTGATTA
TAAAATAAGTTTTAGAATTT

Product: CPA2 family transporter

Products: Proton [Cytoplasm]; K (I) [Periplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 477; Mature: 477

Protein sequence:

>477_residues
MEHINYDSLLILSLLAFITPLFINSFKKYKVPFVVGELFVGIIIGKSFLNLIQVDPWIQFLSNLGLAYLMFLSGLEIDVH
SIKISKDSKGANNIIICFIMSLLSIVVSFVICKFLYSLGLIKNSIFMTFLFSAAAPGFLVPFLKQKGILKTEFGQILLIF
SLIGEFVSLIAMTIISSKLTYGLSYKSFLFLIVIIVSFFIYIVLSKLQGKYDFATLATNNTHLEVRAAFALILTLVTISN
KTGTEIALGSFLAGVIFTLLTDKSHEEDLKYKLDIIGYGFLIPIFFIMVGVNLDITTIFENPKSLISIPLLILIIYVTKF
IPSLVLKYKFDTNKALSSSIILSSQLSILIVGAQIAFNLKLIPQEGYSALILTAVVSCMLFPFIFDKVMKYDDLEKTVES
NTNKICVREVVPTNKKIFNKPLKDLNIPQGARIFLILRDEKEILPDGNSEILEGDVLLIAGLSDKSLDFLKILKNEN

Sequences:

>Translated_477_residues
MEHINYDSLLILSLLAFITPLFINSFKKYKVPFVVGELFVGIIIGKSFLNLIQVDPWIQFLSNLGLAYLMFLSGLEIDVH
SIKISKDSKGANNIIICFIMSLLSIVVSFVICKFLYSLGLIKNSIFMTFLFSAAAPGFLVPFLKQKGILKTEFGQILLIF
SLIGEFVSLIAMTIISSKLTYGLSYKSFLFLIVIIVSFFIYIVLSKLQGKYDFATLATNNTHLEVRAAFALILTLVTISN
KTGTEIALGSFLAGVIFTLLTDKSHEEDLKYKLDIIGYGFLIPIFFIMVGVNLDITTIFENPKSLISIPLLILIIYVTKF
IPSLVLKYKFDTNKALSSSIILSSQLSILIVGAQIAFNLKLIPQEGYSALILTAVVSCMLFPFIFDKVMKYDDLEKTVES
NTNKICVREVVPTNKKIFNKPLKDLNIPQGARIFLILRDEKEILPDGNSEILEGDVLLIAGLSDKSLDFLKILKNEN
>Mature_477_residues
MEHINYDSLLILSLLAFITPLFINSFKKYKVPFVVGELFVGIIIGKSFLNLIQVDPWIQFLSNLGLAYLMFLSGLEIDVH
SIKISKDSKGANNIIICFIMSLLSIVVSFVICKFLYSLGLIKNSIFMTFLFSAAAPGFLVPFLKQKGILKTEFGQILLIF
SLIGEFVSLIAMTIISSKLTYGLSYKSFLFLIVIIVSFFIYIVLSKLQGKYDFATLATNNTHLEVRAAFALILTLVTISN
KTGTEIALGSFLAGVIFTLLTDKSHEEDLKYKLDIIGYGFLIPIFFIMVGVNLDITTIFENPKSLISIPLLILIIYVTKF
IPSLVLKYKFDTNKALSSSIILSSQLSILIVGAQIAFNLKLIPQEGYSALILTAVVSCMLFPFIFDKVMKYDDLEKTVES
NTNKICVREVVPTNKKIFNKPLKDLNIPQGARIFLILRDEKEILPDGNSEILEGDVLLIAGLSDKSLDFLKILKNEN

Specific function: Probable Na(+)/H(+) antiporter [H]

COG id: COG0475

COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 RCK N-terminal domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153
- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR006037
- InterPro:   IPR003148 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger; PF02080 TrkA_C; PF02254 TrkA_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53286; Mature: 53286

Theoretical pI: Translated: 8.74; Mature: 8.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEHINYDSLLILSLLAFITPLFINSFKKYKVPFVVGELFVGIIIGKSFLNLIQVDPWIQF
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
LSNLGLAYLMFLSGLEIDVHSIKISKDSKGANNIIICFIMSLLSIVVSFVICKFLYSLGL
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKNSIFMTFLFSAAAPGFLVPFLKQKGILKTEFGQILLIFSLIGEFVSLIAMTIISSKLT
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGLSYKSFLFLIVIIVSFFIYIVLSKLQGKYDFATLATNNTHLEVRAAFALILTLVTISN
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCC
KTGTEIALGSFLAGVIFTLLTDKSHEEDLKYKLDIIGYGFLIPIFFIMVGVNLDITTIFE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC
NPKSLISIPLLILIIYVTKFIPSLVLKYKFDTNKALSSSIILSSQLSILIVGAQIAFNLK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEEEE
LIPQEGYSALILTAVVSCMLFPFIFDKVMKYDDLEKTVESNTNKICVREVVPTNKKIFNK
EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHC
PLKDLNIPQGARIFLILRDEKEILPDGNSEILEGDVLLIAGLSDKSLDFLKILKNEN
CHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHCCCCCCCEEECCEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MEHINYDSLLILSLLAFITPLFINSFKKYKVPFVVGELFVGIIIGKSFLNLIQVDPWIQF
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
LSNLGLAYLMFLSGLEIDVHSIKISKDSKGANNIIICFIMSLLSIVVSFVICKFLYSLGL
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKNSIFMTFLFSAAAPGFLVPFLKQKGILKTEFGQILLIFSLIGEFVSLIAMTIISSKLT
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGLSYKSFLFLIVIIVSFFIYIVLSKLQGKYDFATLATNNTHLEVRAAFALILTLVTISN
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCC
KTGTEIALGSFLAGVIFTLLTDKSHEEDLKYKLDIIGYGFLIPIFFIMVGVNLDITTIFE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEC
NPKSLISIPLLILIIYVTKFIPSLVLKYKFDTNKALSSSIILSSQLSILIVGAQIAFNLK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEEEEE
LIPQEGYSALILTAVVSCMLFPFIFDKVMKYDDLEKTVESNTNKICVREVVPTNKKIFNK
EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHC
PLKDLNIPQGARIFLILRDEKEILPDGNSEILEGDVLLIAGLSDKSLDFLKILKNEN
CHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHCCCCCCCEEECCEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; K (I) [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + K (I) [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + K (I) [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]