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The map label for this gene is pbuO [H]

Identifier: 226948988

GI number: 226948988

Start: 1947611

End: 1948951

Strand: Direct

Name: pbuO [H]

Synonym: CLM_1902

Alternate gene names: 226948988

Gene position: 1947611-1948951 (Clockwise)

Preceding gene: 226948987

Following gene: 226948989

Centisome position: 46.87

GC content: 29.31

Gene sequence:

>1341_bases
GTGGGTGGGAGAGGGATAAAAGAAAAGGACGAAGGAGAAGTGGAAAATAAATTTAATAGTTTATTCAATATTAAGAAGTA
TAATACTACAGTCAAAGGAGAAATATTAGCAGGTTTTACCTCATTTTTTGCAATTGTATATATAATTGCTGTAAATGCAT
CTATATTATCCGATGCAGGTTTGCCTTTAGAAGGAGCAATAATAGCTACAATACTATCCTCATTTGTAGGATGTATATTA
GTTGGAGTCATAAGTAATGCACCACTAATTTTAGTTCCAGGCATGGGAGTTAATGCTCTTTTTTCCTATACTATTGTAGG
TTCTATGGGGCTTTCATGGCAGCAAGCATTAGCAGCGGTATTTGTATCAGGAGTTGTATTTTCCATAATAGCTTTTACAA
GGTTTTCTAAAACCCTCATAGAATCAATCCCAACTTCCTTAAAGGAAGCTATAACTGTGGGAATTGGTGTTTTAATTACA
TTTATAGGATTACAAAAAAGTGGGATTGTAATAGGAAGTACGACAACTTTTGTTGCATTAGGAAATTTTAATAATCCACT
AGTATATGTAACTTTTATTAATTTAATAATTACATTAATATTATTTATAAAAAATGTGCCAGGAAATTTTTTAATAAGCA
TGATTGTTGGAACGATTATATCATATTTTTTGGGACTTATAGATATGGCAAAGCTTACTTTTTCAAATTTTTCATTAGGC
GCTTATAAAGAGGTTTTCTTTAAAATGGATTTTAGTAGCGCTACTTCCATAACCTTTTGGATAGCAGTATTTTCATTAAC
GCTAGTACTTGTATTTGAAAATTTAGGGCTTTTACATGCTCATATAAATGTTATGTTAAAGGAAGAAAATAAATTTAAAA
CTTCTTTTAAAGCTTGTTCGCTATCTGCTATTACTTGTGGATTTTTTGGAACGAGTCCTACAGTAGCTACTATAGAAACT
GCAGCTGGGATAACTGCAGGAGGAAAAACTGGATTAACATCTATTTTTACAGGAATTTTATTTTTATTATCATTATTTTT
ACTTCCAATTATAAAAATCATACCTAATAGTGCTATTTCACCTATACTTATTGTTATAGGAGGATTAATGATAAAAAATA
TATTAAGTATTAATTTTAATGATTTTTCAGAAGGTTTTCCTGCTTTTTTAATTATAGTTATGATTCCACTAACTTTTAGT
ATTGTAGATGGTATGGCTTTTGGATTTATTTGCTATCCGATTGTAAAGTTAGCGGGAAAAAAATCAAAAGAAATTTCTTA
TGCAATGTATATAATTTCACTTATGTTCTTGTTAAATTTTATATTACATGCAGTAAGCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGGTTCTTTAATAATTGAATTTTATAAATATATAGGAAATATAATTGATTATATTAATAGTTTTTAATATAATATTTA
ATGCATTATAAAAATATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTTATAATTGTCTATTTTAAAAATAAATAATGAACCCTGTTTAATTATTGAGAAGCATAACTAAACAGGGTTTTAATTT
TGCTTCATATATATAAAGTT

Product: xanthine/uracil permease family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 446; Mature: 445

Protein sequence:

>446_residues
MGGRGIKEKDEGEVENKFNSLFNIKKYNTTVKGEILAGFTSFFAIVYIIAVNASILSDAGLPLEGAIIATILSSFVGCIL
VGVISNAPLILVPGMGVNALFSYTIVGSMGLSWQQALAAVFVSGVVFSIIAFTRFSKTLIESIPTSLKEAITVGIGVLIT
FIGLQKSGIVIGSTTTFVALGNFNNPLVYVTFINLIITLILFIKNVPGNFLISMIVGTIISYFLGLIDMAKLTFSNFSLG
AYKEVFFKMDFSSATSITFWIAVFSLTLVLVFENLGLLHAHINVMLKEENKFKTSFKACSLSAITCGFFGTSPTVATIET
AAGITAGGKTGLTSIFTGILFLLSLFLLPIIKIIPNSAISPILIVIGGLMIKNILSINFNDFSEGFPAFLIIVMIPLTFS
IVDGMAFGFICYPIVKLAGKKSKEISYAMYIISLMFLLNFILHAVS

Sequences:

>Translated_446_residues
MGGRGIKEKDEGEVENKFNSLFNIKKYNTTVKGEILAGFTSFFAIVYIIAVNASILSDAGLPLEGAIIATILSSFVGCIL
VGVISNAPLILVPGMGVNALFSYTIVGSMGLSWQQALAAVFVSGVVFSIIAFTRFSKTLIESIPTSLKEAITVGIGVLIT
FIGLQKSGIVIGSTTTFVALGNFNNPLVYVTFINLIITLILFIKNVPGNFLISMIVGTIISYFLGLIDMAKLTFSNFSLG
AYKEVFFKMDFSSATSITFWIAVFSLTLVLVFENLGLLHAHINVMLKEENKFKTSFKACSLSAITCGFFGTSPTVATIET
AAGITAGGKTGLTSIFTGILFLLSLFLLPIIKIIPNSAISPILIVIGGLMIKNILSINFNDFSEGFPAFLIIVMIPLTFS
IVDGMAFGFICYPIVKLAGKKSKEISYAMYIISLMFLLNFILHAVS
>Mature_445_residues
GGRGIKEKDEGEVENKFNSLFNIKKYNTTVKGEILAGFTSFFAIVYIIAVNASILSDAGLPLEGAIIATILSSFVGCILV
GVISNAPLILVPGMGVNALFSYTIVGSMGLSWQQALAAVFVSGVVFSIIAFTRFSKTLIESIPTSLKEAITVGIGVLITF
IGLQKSGIVIGSTTTFVALGNFNNPLVYVTFINLIITLILFIKNVPGNFLISMIVGTIISYFLGLIDMAKLTFSNFSLGA
YKEVFFKMDFSSATSITFWIAVFSLTLVLVFENLGLLHAHINVMLKEENKFKTSFKACSLSAITCGFFGTSPTVATIETA
AGITAGGKTGLTSIFTGILFLLSLFLLPIIKIIPNSAISPILIVIGGLMIKNILSINFNDFSEGFPAFLIIVMIPLTFSI
VDGMAFGFICYPIVKLAGKKSKEISYAMYIISLMFLLNFILHAVS

Specific function: Involved in the uptake of the purine bases hypoxanthine and guanine. May work at purine concentrations higher than 100 uM [H]

COG id: COG2252

COG function: function code R; Permeases

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the xanthine/uracil permease family. AzgA purine transporter (TC 2.A.1.40) subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790150, Length=440, Percent_Identity=31.8181818181818, Blast_Score=237, Evalue=1e-63,
Organism=Escherichia coli, GI87082309, Length=451, Percent_Identity=31.7073170731707, Blast_Score=237, Evalue=1e-63,
Organism=Escherichia coli, GI48994909, Length=448, Percent_Identity=30.8035714285714, Blast_Score=181, Evalue=1e-46,
Organism=Escherichia coli, GI1790499, Length=437, Percent_Identity=30.2059496567506, Blast_Score=175, Evalue=6e-45,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006043 [H]

Pfam domain/function: PF00860 Xan_ur_permease [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47901; Mature: 47770

Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGGRGIKEKDEGEVENKFNSLFNIKKYNTTVKGEILAGFTSFFAIVYIIAVNASILSDAG
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LPLEGAIIATILSSFVGCILVGVISNAPLILVPGMGVNALFSYTIVGSMGLSWQQALAAV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
FVSGVVFSIIAFTRFSKTLIESIPTSLKEAITVGIGVLITFIGLQKSGIVIGSTTTFVAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCEEEEEE
GNFNNPLVYVTFINLIITLILFIKNVPGNFLISMIVGTIISYFLGLIDMAKLTFSNFSLG
CCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
AYKEVFFKMDFSSATSITFWIAVFSLTLVLVFENLGLLHAHINVMLKEENKFKTSFKACS
HHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHH
LSAITCGFFGTSPTVATIETAAGITAGGKTGLTSIFTGILFLLSLFLLPIIKIIPNSAIS
HHHEEEECCCCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
PILIVIGGLMIKNILSINFNDFSEGFPAFLIIVMIPLTFSIVDGMAFGFICYPIVKLAGK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KSKEISYAMYIISLMFLLNFILHAVS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
GGRGIKEKDEGEVENKFNSLFNIKKYNTTVKGEILAGFTSFFAIVYIIAVNASILSDAG
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LPLEGAIIATILSSFVGCILVGVISNAPLILVPGMGVNALFSYTIVGSMGLSWQQALAAV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
FVSGVVFSIIAFTRFSKTLIESIPTSLKEAITVGIGVLITFIGLQKSGIVIGSTTTFVAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCEEEEEE
GNFNNPLVYVTFINLIITLILFIKNVPGNFLISMIVGTIISYFLGLIDMAKLTFSNFSLG
CCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
AYKEVFFKMDFSSATSITFWIAVFSLTLVLVFENLGLLHAHINVMLKEENKFKTSFKACS
HHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHH
LSAITCGFFGTSPTVATIETAAGITAGGKTGLTSIFTGILFLLSLFLLPIIKIIPNSAIS
HHHEEEECCCCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
PILIVIGGLMIKNILSINFNDFSEGFPAFLIIVMIPLTFSIVDGMAFGFICYPIVKLAGK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KSKEISYAMYIISLMFLLNFILHAVS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9387221; 9384377; 11591660 [H]