Definition Listeria monocytogenes Clip81459, complete genome.
Accession NC_012488
Length 2,912,690

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The map label for this gene is ytgP [H]

Identifier: 226224226

GI number: 226224226

Start: 1651541

End: 1653154

Strand: Reverse

Name: ytgP [H]

Synonym: Lm4b_01636

Alternate gene names: 226224226

Gene position: 1653154-1651541 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226224227

Following gene: 226224225

Centisome position: 56.76

GC content: 37.24

Gene sequence:

>1614_bases
ATGAGTTCAAAATTAATGCGAGGAACGGCTGTGCTTACCGCTGGAACATTGCTTTCAAAAATCTTAGGGATTTTATATGT
TATTCCATTTTACTGGATTGCCGGCGGGGAACAAGCAACGATTCTCTATCAATATGGATATGTCCCTTACCAAATTTTCT
TAAATATCGCGACAGCTGGAGTACCTTTAGCAGTTGCCAAATATATTTCGAAGTATAATTCGTTAAATGAATATGCTTTA
AGTCAGCGATTGTATAGATCAAGTACGTATTTAATGATATTCACAGGGATTGTTAGTTTTTTAATAATGTATATTTTTGC
CCCGATACTCGCGGGGATGCAAGAGGTTAGTGGCGGAACGAGTATTGAAGATATTACGACGGTTATTCGCGCAGTAAGTT
TTGCATTACTTATTATTCCTGTAATGAGTTTACTTCGGGGGTATTTCCAAGGATTTCATTCGATGGGACCTTCTGCCGTG
TCACAAGTAATTGAACAAATAGCGAGAATTGTATTTTTACTTGCTAGTACGTATATTGTCTTACATTTAATTGGTGGAAG
TCTTGTTACAGCGATGAGTTTAGCGACTTTTGCGGCTTTTGTTGGTGCGTTTTTCAGCTTGATTTGTCTCATTTGGTATT
ACCGGAAACGGAAGCCGGGTATTCAAAAAATGATTGCTGGCAGTGACAACAAGTTGCGCGTTTCGACTTTTCATCTATTA
AAAGAAATTTCGATATCTGCGGTGCCATTTATTATTGTTGGAATGGCGATGTCGCTTTATCAGCAAATTGATTTATTTAC
GTTTGCTCGTGTTTTAACCTACGATGGTATGGACGGGAAAACAGCGGAGGATTTGCTTTCAATTTTCAACTTTTCCGTTC
AAAAAATTATTATGATACCGGGAACTTTAGCCTTGGCATTTTCGATGACACTTGTGCCTTTAGTGGCGGCATCTTTCCAT
AAAGGACGAATTCGGGAAGTTCATCATCATTTGACGGCCGTTTTCCAAGTGTTACTATTTTTAGTTGTGCCAGCTTGTTT
AGGAATTGCCCTTTTAGCGGATCCGCTTTACACCATTTTTTATGGTTATAATGCAGATGGTTCGATGTTACTTCAGTTTT
TTGCGCCATTTGCCATATTCTTCTCGTTATTTAGTGTAACAGCCGCGATTTTGCAAGGAATTGATGAACAACGGTACACT
GTTCTTAGTCTCTTACTTGGTTTACTGACAAAATCAGTGTTGCAAATGCCATTAATTTTGCTTTTAGGGGCAAAAGGTGG
GGCATTAGCTACGGGACTTGGTTATATTGTTTCCGTAGTATTCACCGTTTTTATTATTAAAAAATATGCGAAGTACTCGT
TTAAATATTTATTTAGACGGCTTATACTTATTTTAGGAATTAGTGCGGTGATGCTTCTTAGTGTCTGGTTGATTTATCAT
GGCTTGATTTTATTTTTAAATCCACATGCAAGATTAACAGCACTAGTTATTGTTTTTGTTTCAGCCGGCTTTGGTGCCTA
TATTTATGCGTTTTTGGCTGCAAAAGCAGGTCTGTTAAACTATATTTTAGGGGACCGAATGTATAAAATTCGTAAAAAAC
TTCATTTGATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGAAGAATGCGATAAAAGTAGTAGTGTAAGAATGATTTTTACATAACCCGATTTAACAGACAGACTTAAAAGAAAAAAT
CAATCGAGGTAACAGAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTTTTTGTAAAGAACAAGCCGATATTTATTTGGGTTTGTTCTTTTTTTTTAAAAGAGTTAATGGTAAAGTAAACAAGGA
TATATAATTTAATGTAAAGG

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 537; Mature: 536

Protein sequence:

>537_residues
MSSKLMRGTAVLTAGTLLSKILGILYVIPFYWIAGGEQATILYQYGYVPYQIFLNIATAGVPLAVAKYISKYNSLNEYAL
SQRLYRSSTYLMIFTGIVSFLIMYIFAPILAGMQEVSGGTSIEDITTVIRAVSFALLIIPVMSLLRGYFQGFHSMGPSAV
SQVIEQIARIVFLLASTYIVLHLIGGSLVTAMSLATFAAFVGAFFSLICLIWYYRKRKPGIQKMIAGSDNKLRVSTFHLL
KEISISAVPFIIVGMAMSLYQQIDLFTFARVLTYDGMDGKTAEDLLSIFNFSVQKIIMIPGTLALAFSMTLVPLVAASFH
KGRIREVHHHLTAVFQVLLFLVVPACLGIALLADPLYTIFYGYNADGSMLLQFFAPFAIFFSLFSVTAAILQGIDEQRYT
VLSLLLGLLTKSVLQMPLILLLGAKGGALATGLGYIVSVVFTVFIIKKYAKYSFKYLFRRLILILGISAVMLLSVWLIYH
GLILFLNPHARLTALVIVFVSAGFGAYIYAFLAAKAGLLNYILGDRMYKIRKKLHLI

Sequences:

>Translated_537_residues
MSSKLMRGTAVLTAGTLLSKILGILYVIPFYWIAGGEQATILYQYGYVPYQIFLNIATAGVPLAVAKYISKYNSLNEYAL
SQRLYRSSTYLMIFTGIVSFLIMYIFAPILAGMQEVSGGTSIEDITTVIRAVSFALLIIPVMSLLRGYFQGFHSMGPSAV
SQVIEQIARIVFLLASTYIVLHLIGGSLVTAMSLATFAAFVGAFFSLICLIWYYRKRKPGIQKMIAGSDNKLRVSTFHLL
KEISISAVPFIIVGMAMSLYQQIDLFTFARVLTYDGMDGKTAEDLLSIFNFSVQKIIMIPGTLALAFSMTLVPLVAASFH
KGRIREVHHHLTAVFQVLLFLVVPACLGIALLADPLYTIFYGYNADGSMLLQFFAPFAIFFSLFSVTAAILQGIDEQRYT
VLSLLLGLLTKSVLQMPLILLLGAKGGALATGLGYIVSVVFTVFIIKKYAKYSFKYLFRRLILILGISAVMLLSVWLIYH
GLILFLNPHARLTALVIVFVSAGFGAYIYAFLAAKAGLLNYILGDRMYKIRKKLHLI
>Mature_536_residues
SSKLMRGTAVLTAGTLLSKILGILYVIPFYWIAGGEQATILYQYGYVPYQIFLNIATAGVPLAVAKYISKYNSLNEYALS
QRLYRSSTYLMIFTGIVSFLIMYIFAPILAGMQEVSGGTSIEDITTVIRAVSFALLIIPVMSLLRGYFQGFHSMGPSAVS
QVIEQIARIVFLLASTYIVLHLIGGSLVTAMSLATFAAFVGAFFSLICLIWYYRKRKPGIQKMIAGSDNKLRVSTFHLLK
EISISAVPFIIVGMAMSLYQQIDLFTFARVLTYDGMDGKTAEDLLSIFNFSVQKIIMIPGTLALAFSMTLVPLVAASFHK
GRIREVHHHLTAVFQVLLFLVVPACLGIALLADPLYTIFYGYNADGSMLLQFFAPFAIFFSLFSVTAAILQGIDEQRYTV
LSLLLGLLTKSVLQMPLILLLGAKGGALATGLGYIVSVVFTVFIIKKYAKYSFKYLFRRLILILGISAVMLLSVWLIYHG
LILFLNPHARLTALVIVFVSAGFGAYIYAFLAAKAGLLNYILGDRMYKIRKKLHLI

Specific function: May play a role in cell division, although it is not essential for growth [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential). Note=Localizes at the septum [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59345; Mature: 59214

Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSSKLMRGTAVLTAGTLLSKILGILYVIPFYWIAGGEQATILYQYGYVPYQIFLNIATAG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCC
VPLAVAKYISKYNSLNEYALSQRLYRSSTYLMIFTGIVSFLIMYIFAPILAGMQEVSGGT
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SIEDITTVIRAVSFALLIIPVMSLLRGYFQGFHSMGPSAVSQVIEQIARIVFLLASTYIV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LHLIGGSLVTAMSLATFAAFVGAFFSLICLIWYYRKRKPGIQKMIAGSDNKLRVSTFHLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCEEHHHHHHH
KEISISAVPFIIVGMAMSLYQQIDLFTFARVLTYDGMDGKTAEDLLSIFNFSVQKIIMIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GTLALAFSMTLVPLVAASFHKGRIREVHHHLTAVFQVLLFLVVPACLGIALLADPLYTIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGYNADGSMLLQFFAPFAIFFSLFSVTAAILQGIDEQRYTVLSLLLGLLTKSVLQMPLIL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLGAKGGALATGLGYIVSVVFTVFIIKKYAKYSFKYLFRRLILILGISAVMLLSVWLIYH
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLILFLNPHARLTALVIVFVSAGFGAYIYAFLAAKAGLLNYILGDRMYKIRKKLHLI
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SSKLMRGTAVLTAGTLLSKILGILYVIPFYWIAGGEQATILYQYGYVPYQIFLNIATAG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCC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HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9387221; 9384377 [H]