| Definition | Wolbachia sp. wRi, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012416 |
| Length | 1,445,873 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 225630654
Identifier: 225630654
GI number: 225630654
Start: 1008926
End: 1011301
Strand: Direct
Name: 225630654
Synonym: WRi_009380
Alternate gene names: NA
Gene position: 1008926-1011301 (Clockwise)
Preceding gene: 225630653
Following gene: 225630655
Centisome position: 69.78
GC content: 31.06
Gene sequence:
>2376_bases ATGGCAGTAAAGCACATAAGAAAACGTTTATATCAAGCTATAATGTTACCACTTATAGCACTGTTCTTTATAGCAGCAGC TCCATTTGTAGCATTAAGTCTCTTGGTTTTTAACATCTGGAATACAGAAAGTATAAACAAAGCATTAAAGTATATTATTA TTGCTCCATTAGTAGTGCTATATTTGCCATGTGCAATGCTAGCTCTAGTGCTACATTTATCAATTAGTACTTTGTTGACA GTCGCAAAAATTACACTTTTTCCTGAGTTCTTTTTGTCTTTGCGAATTAAGGAAGGAATTAAGTTTAGTAGAGTTTTTAG CTTATCTATTACTCAATTCCATAATATGGATTTTTATGCATATATAAAAGACTCTAAAACTTTTTTTAAGATAAAAGATA GTAATAGAAAACTATTAGTAGCACTTCTTAAAGATAACGACTTTAGTATACAAGATGATACACCTTTCCATTTCTATGAA ACACACCTAGAGTTTGTGACAGATGTCACTACTAAGATTTCCGATAAAGAGAAATCAAAAATCATATTCGATTATTTAGG CCTAAGTAACTTAAAACCTTTAATCCAAAAAGATAGTTATGGTGAACGCCGTCTGTATGAAATTTATAACACACATGAAA AGCTTATTAAAGTAGTTAATGATATTGACATAGGATTACTTAAAACACTGCTCAAGTTAAATGAATCTTCAGTGAGAAAC CCGAAATATATGTGCATTTCGCGGTTATCCAATGTTATAGATTTGTTTGATAATAATGACTTAGTAAAAAACATGTCTGA TGCCTTTAGAAACAAACAAATACTTGCTGTGCAAATGGCTGAATACCTCTCCATATTTCTTGGACATGAGTACAATGGGT ACTACAGTAAGAAGGTAATGCAAGACAATTTAAAAAAGTTGTTTCTAAAAAAGGATTTAATTGATAATTTATCTTCTAAC TTGGGCGCACAATCTAGTTTAATGCTAATAATCAAATATTTTTTGCGTAAAGAGATGAGTGAACGCGAGTTTGATAACCT CACTTCAATGTTGGAAGATAAAAATATGATTGATAATTTAAAACATATTGATGATATTAACAATGTTCTGCCACATACAT TAGAATGCAATGGCTATAGCACTTTTTTGGGATTAAGGGAAATTTTTGATCTTAAAACAGCAGCTTCTGATATAAGTAAT CTGCACTTATTGTTAGCAAACAATAGGTTGTTTTATAAGTTCAGGGGCATCCCCATTGGAGTCCTTAGAAAAATCTGCAG TACCGAGCTATATGAAAACTGTGCAAATGTTGACGAAGTTTTAGCATTCTTTGATTGCTTGGGTGATAAAAGTAAAAATA AAAATATTTTAGATAATCTAATAGTTGCTTTTGAAAAAGATCCCGAAGCAACTCATGCACTTTTAAATAGTAAATTATTC AATTCTCGGAATGAAATACTACGGGTGCTTTCAGATGAAAAATTTGATGGTAATAAAGTGAGAGAAATATTGAATCACAT TAACTTGTTGTGGACGTTGCGAAAAAATAGTATGTTTAATAATGATATGGATCTAGAGGACAAGCTTTTTTATACATTTC GCCCACGTTTCATAAATAGTGAGTTTCGTGGATGTGCACAAGATTATGCTCTATTAAGTGGAATACATAATAATCAGCGA GCAGAAAGAGTTTTTTCTAAAAGTGTTAATCTGTTTCAGATTTTCCTCAAAGAAGCGATAAAAGATAGGTATGAACTAAT GTTTCCCATCATAGAAGACACTAAAGTTGAACATTTAGTTGATGGCAGATTTATCTCAAAAGTAAGAGATAAAATAAACC GCTACCTTTCTAACTTACTTATTTTTAAAGGGAACCTGTTTTCAGATGTAAGTAATATACTTAGATTACAGGTAATAATC ATCCTTTTTTTTCCGTTGTTTGAATTTGAGGAAGGTCTGCATACCACTCTAGAAGAACGATGGGAAAAAATACTGAAAAG AAAGTTTACAGAGCTTTTTGTGGCACAGAAGTATCAGCAAATTACACCAGAATCTTTAGCAAAAATTCAAGATTTAACAA TACAAGACTTATCAGCAATACCAGAAACTGAGGAGATAGAAGAATTTTTAAGAAAAAAAGGAATAACAAATTCAGATGAT CTGTCTTTACTAGCAAAATTGATAGAGGACAGTATTCATATTGCAAACGTAATTGGAGAAAGAGTAAGTCTTACACAAAA CATAACACAAACAATTTGTGATACATTTAAAGATATCTCTGTAAACCATAACACAAAACAAACACCACCATCTCTTCTTG ATTTATGCAAGACAAATATAATTGGGAGTTCTTTAACTGAGCAAATAAGCTGCTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCACAAACGAGATTGTGAGTACTAAACAGTTTAACATAAAAATTGACAAAGCTCGATTCTTAAAGTATGTTTAATTGAA GTAGTAATTACGAAACTATA
Downstream 100 bases:
>100_bases GCAGGATTTATTTTAAAACTTTTGGCATTCGGCGCCTTGATGCTTTACCGCAACGCTTTTGTTAAAATCTGTCATCTGGA AAATGATAGTTTTTCAAATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 791; Mature: 790
Protein sequence:
>791_residues MAVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVLYLPCAMLALVLHLSISTLLT VAKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYAYIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYE THLEFVTDVTTKISDKEKSKIIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRN PKYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVMQDNLKKLFLKKDLIDNLSSN LGAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNLKHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISN LHLLLANNRLFYKFRGIPIGVLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLF NSRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINSEFRGCAQDYALLSGIHNNQR AERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLVDGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVII ILFFPLFEFEEGLHTTLEERWEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDD LSLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNIIGSSLTEQISC
Sequences:
>Translated_791_residues MAVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVLYLPCAMLALVLHLSISTLLT VAKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYAYIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYE THLEFVTDVTTKISDKEKSKIIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRN PKYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVMQDNLKKLFLKKDLIDNLSSN LGAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNLKHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISN LHLLLANNRLFYKFRGIPIGVLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLF NSRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINSEFRGCAQDYALLSGIHNNQR AERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLVDGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVII ILFFPLFEFEEGLHTTLEERWEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDD LSLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNIIGSSLTEQISC >Mature_790_residues AVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVLYLPCAMLALVLHLSISTLLTV AKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYAYIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYET HLEFVTDVTTKISDKEKSKIIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRNP KYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVMQDNLKKLFLKKDLIDNLSSNL GAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNLKHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISNL HLLLANNRLFYKFRGIPIGVLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLFN SRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINSEFRGCAQDYALLSGIHNNQRA ERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLVDGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVIII LFFPLFEFEEGLHTTLEERWEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDDL SLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNIIGSSLTEQISC
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 91680; Mature: 91549
Theoretical pI: Translated: 7.59; Mature: 7.59
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLPCAMLALVLHLSISTLLTVAKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEHHHHCCCCEEE YIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYETHLEFVTDVTTKISDKEKSK EEECCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH IIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRN HHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCHHCCCC PKYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVM HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH QDNLKKLFLKKDLIDNLSSNLGAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISNLHLLLANNRLFYKFRGIPIG HHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCEEEEEECCCCHH VLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLF HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH NSRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINS CCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHCCH EFRGCAQDYALLSGIHNNQRAERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLV HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH DGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVIIILFFPLFEFEEGLHTTLEER HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHH LSLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH IGSSLTEQISC CCHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure AVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLPCAMLALVLHLSISTLLTVAKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEHHHHCCCCEEE YIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYETHLEFVTDVTTKISDKEKSK EEECCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH IIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRN HHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCHHCCCC PKYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVM HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH QDNLKKLFLKKDLIDNLSSNLGAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISNLHLLLANNRLFYKFRGIPIG HHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCEEEEEECCCCHH VLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLF HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH NSRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINS CCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHCCH EFRGCAQDYALLSGIHNNQRAERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLV HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH DGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVIIILFFPLFEFEEGLHTTLEER HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHH LSLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH IGSSLTEQISC CCHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA