Definition Wolbachia sp. wRi, complete genome.
Accession NC_012416
Length 1,445,873

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The map label for this gene is 225630654

Identifier: 225630654

GI number: 225630654

Start: 1008926

End: 1011301

Strand: Direct

Name: 225630654

Synonym: WRi_009380

Alternate gene names: NA

Gene position: 1008926-1011301 (Clockwise)

Preceding gene: 225630653

Following gene: 225630655

Centisome position: 69.78

GC content: 31.06

Gene sequence:

>2376_bases
ATGGCAGTAAAGCACATAAGAAAACGTTTATATCAAGCTATAATGTTACCACTTATAGCACTGTTCTTTATAGCAGCAGC
TCCATTTGTAGCATTAAGTCTCTTGGTTTTTAACATCTGGAATACAGAAAGTATAAACAAAGCATTAAAGTATATTATTA
TTGCTCCATTAGTAGTGCTATATTTGCCATGTGCAATGCTAGCTCTAGTGCTACATTTATCAATTAGTACTTTGTTGACA
GTCGCAAAAATTACACTTTTTCCTGAGTTCTTTTTGTCTTTGCGAATTAAGGAAGGAATTAAGTTTAGTAGAGTTTTTAG
CTTATCTATTACTCAATTCCATAATATGGATTTTTATGCATATATAAAAGACTCTAAAACTTTTTTTAAGATAAAAGATA
GTAATAGAAAACTATTAGTAGCACTTCTTAAAGATAACGACTTTAGTATACAAGATGATACACCTTTCCATTTCTATGAA
ACACACCTAGAGTTTGTGACAGATGTCACTACTAAGATTTCCGATAAAGAGAAATCAAAAATCATATTCGATTATTTAGG
CCTAAGTAACTTAAAACCTTTAATCCAAAAAGATAGTTATGGTGAACGCCGTCTGTATGAAATTTATAACACACATGAAA
AGCTTATTAAAGTAGTTAATGATATTGACATAGGATTACTTAAAACACTGCTCAAGTTAAATGAATCTTCAGTGAGAAAC
CCGAAATATATGTGCATTTCGCGGTTATCCAATGTTATAGATTTGTTTGATAATAATGACTTAGTAAAAAACATGTCTGA
TGCCTTTAGAAACAAACAAATACTTGCTGTGCAAATGGCTGAATACCTCTCCATATTTCTTGGACATGAGTACAATGGGT
ACTACAGTAAGAAGGTAATGCAAGACAATTTAAAAAAGTTGTTTCTAAAAAAGGATTTAATTGATAATTTATCTTCTAAC
TTGGGCGCACAATCTAGTTTAATGCTAATAATCAAATATTTTTTGCGTAAAGAGATGAGTGAACGCGAGTTTGATAACCT
CACTTCAATGTTGGAAGATAAAAATATGATTGATAATTTAAAACATATTGATGATATTAACAATGTTCTGCCACATACAT
TAGAATGCAATGGCTATAGCACTTTTTTGGGATTAAGGGAAATTTTTGATCTTAAAACAGCAGCTTCTGATATAAGTAAT
CTGCACTTATTGTTAGCAAACAATAGGTTGTTTTATAAGTTCAGGGGCATCCCCATTGGAGTCCTTAGAAAAATCTGCAG
TACCGAGCTATATGAAAACTGTGCAAATGTTGACGAAGTTTTAGCATTCTTTGATTGCTTGGGTGATAAAAGTAAAAATA
AAAATATTTTAGATAATCTAATAGTTGCTTTTGAAAAAGATCCCGAAGCAACTCATGCACTTTTAAATAGTAAATTATTC
AATTCTCGGAATGAAATACTACGGGTGCTTTCAGATGAAAAATTTGATGGTAATAAAGTGAGAGAAATATTGAATCACAT
TAACTTGTTGTGGACGTTGCGAAAAAATAGTATGTTTAATAATGATATGGATCTAGAGGACAAGCTTTTTTATACATTTC
GCCCACGTTTCATAAATAGTGAGTTTCGTGGATGTGCACAAGATTATGCTCTATTAAGTGGAATACATAATAATCAGCGA
GCAGAAAGAGTTTTTTCTAAAAGTGTTAATCTGTTTCAGATTTTCCTCAAAGAAGCGATAAAAGATAGGTATGAACTAAT
GTTTCCCATCATAGAAGACACTAAAGTTGAACATTTAGTTGATGGCAGATTTATCTCAAAAGTAAGAGATAAAATAAACC
GCTACCTTTCTAACTTACTTATTTTTAAAGGGAACCTGTTTTCAGATGTAAGTAATATACTTAGATTACAGGTAATAATC
ATCCTTTTTTTTCCGTTGTTTGAATTTGAGGAAGGTCTGCATACCACTCTAGAAGAACGATGGGAAAAAATACTGAAAAG
AAAGTTTACAGAGCTTTTTGTGGCACAGAAGTATCAGCAAATTACACCAGAATCTTTAGCAAAAATTCAAGATTTAACAA
TACAAGACTTATCAGCAATACCAGAAACTGAGGAGATAGAAGAATTTTTAAGAAAAAAAGGAATAACAAATTCAGATGAT
CTGTCTTTACTAGCAAAATTGATAGAGGACAGTATTCATATTGCAAACGTAATTGGAGAAAGAGTAAGTCTTACACAAAA
CATAACACAAACAATTTGTGATACATTTAAAGATATCTCTGTAAACCATAACACAAAACAAACACCACCATCTCTTCTTG
ATTTATGCAAGACAAATATAATTGGGAGTTCTTTAACTGAGCAAATAAGCTGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCACAAACGAGATTGTGAGTACTAAACAGTTTAACATAAAAATTGACAAAGCTCGATTCTTAAAGTATGTTTAATTGAA
GTAGTAATTACGAAACTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCAGGATTTATTTTAAAACTTTTGGCATTCGGCGCCTTGATGCTTTACCGCAACGCTTTTGTTAAAATCTGTCATCTGGA
AAATGATAGTTTTTCAAATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 791; Mature: 790

Protein sequence:

>791_residues
MAVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVLYLPCAMLALVLHLSISTLLT
VAKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYAYIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYE
THLEFVTDVTTKISDKEKSKIIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRN
PKYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVMQDNLKKLFLKKDLIDNLSSN
LGAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNLKHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISN
LHLLLANNRLFYKFRGIPIGVLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLF
NSRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINSEFRGCAQDYALLSGIHNNQR
AERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLVDGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVII
ILFFPLFEFEEGLHTTLEERWEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDD
LSLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNIIGSSLTEQISC

Sequences:

>Translated_791_residues
MAVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVLYLPCAMLALVLHLSISTLLT
VAKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYAYIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYE
THLEFVTDVTTKISDKEKSKIIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRN
PKYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVMQDNLKKLFLKKDLIDNLSSN
LGAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNLKHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISN
LHLLLANNRLFYKFRGIPIGVLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLF
NSRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINSEFRGCAQDYALLSGIHNNQR
AERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLVDGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVII
ILFFPLFEFEEGLHTTLEERWEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDD
LSLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNIIGSSLTEQISC
>Mature_790_residues
AVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVLYLPCAMLALVLHLSISTLLTV
AKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYAYIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYET
HLEFVTDVTTKISDKEKSKIIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRNP
KYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVMQDNLKKLFLKKDLIDNLSSNL
GAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNLKHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISNL
HLLLANNRLFYKFRGIPIGVLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLFN
SRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINSEFRGCAQDYALLSGIHNNQRA
ERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLVDGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVIII
LFFPLFEFEEGLHTTLEERWEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDDL
SLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNIIGSSLTEQISC

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91680; Mature: 91549

Theoretical pI: Translated: 7.59; Mature: 7.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLPCAMLALVLHLSISTLLTVAKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEHHHHCCCCEEE
YIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYETHLEFVTDVTTKISDKEKSK
EEECCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
IIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRN
HHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCHHCCCC
PKYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVM
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
QDNLKKLFLKKDLIDNLSSNLGAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISNLHLLLANNRLFYKFRGIPIG
HHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCEEEEEECCCCHH
VLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLF
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
NSRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINS
CCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHCCH
EFRGCAQDYALLSGIHNNQRAERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLV
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
DGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVIIILFFPLFEFEEGLHTTLEER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHH
LSLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
IGSSLTEQISC
CCHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
AVKHIRKRLYQAIMLPLIALFFIAAAPFVALSLLVFNIWNTESINKALKYIIIAPLVVL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLPCAMLALVLHLSISTLLTVAKITLFPEFFLSLRIKEGIKFSRVFSLSITQFHNMDFYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEHHHHCCCCEEE
YIKDSKTFFKIKDSNRKLLVALLKDNDFSIQDDTPFHFYETHLEFVTDVTTKISDKEKSK
EEECCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
IIFDYLGLSNLKPLIQKDSYGERRLYEIYNTHEKLIKVVNDIDIGLLKTLLKLNESSVRN
HHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCHHCCCC
PKYMCISRLSNVIDLFDNNDLVKNMSDAFRNKQILAVQMAEYLSIFLGHEYNGYYSKKVM
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
QDNLKKLFLKKDLIDNLSSNLGAQSSLMLIIKYFLRKEMSEREFDNLTSMLEDKNMIDNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KHIDDINNVLPHTLECNGYSTFLGLREIFDLKTAASDISNLHLLLANNRLFYKFRGIPIG
HHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCEEEEEECCCCHH
VLRKICSTELYENCANVDEVLAFFDCLGDKSKNKNILDNLIVAFEKDPEATHALLNSKLF
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NSRNEILRVLSDEKFDGNKVREILNHINLLWTLRKNSMFNNDMDLEDKLFYTFRPRFINS
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EFRGCAQDYALLSGIHNNQRAERVFSKSVNLFQIFLKEAIKDRYELMFPIIEDTKVEHLV
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
DGRFISKVRDKINRYLSNLLIFKGNLFSDVSNILRLQVIIILFFPLFEFEEGLHTTLEER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WEKILKRKFTELFVAQKYQQITPESLAKIQDLTIQDLSAIPETEEIEEFLRKKGITNSDD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHH
LSLLAKLIEDSIHIANVIGERVSLTQNITQTICDTFKDISVNHNTKQTPPSLLDLCKTNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
IGSSLTEQISC
CCHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA