Definition Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome.
Accession NC_011999
Length 2,102,324

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The map label for this gene is 222151939

Identifier: 222151939

GI number: 222151939

Start: 1833129

End: 1834286

Strand: Direct

Name: 222151939

Synonym: MCCL_1696

Alternate gene names: NA

Gene position: 1833129-1834286 (Clockwise)

Preceding gene: 222151937

Following gene: 222151940

Centisome position: 87.2

GC content: 38.43

Gene sequence:

>1158_bases
ATGATTAAAGAACCAATCATTGCTACAACCATGCTATTCGCTTTAATAGCACTTGGAGAAATTATTTCCATCTATACGCG
TGCGCGTGTTCCTATGTTATTAACCGCTATGTTAGGATACCTCGTTTTATCATGGCTCGGTGTTTTTCCCTCTAGAATAC
TTGAATATTCTACAGTCCCAGCATTAGGTGCTGTACTTATAGGTCCTTTGATCTTACATATGGGCACAATTATGCCACTT
CATGTTCTCAAGTCACAATGGAAAGCTGTTATCATCTCTTTATCCGGTTTAGTTGGTGCAACGATTCTTATTCTCGGTAT
TATCACCCCTATCTACGGTTTTCCGACTGCGGCTAGTGGTCTTGGGCCAGTTGCTGGTGGTATTATCGCTTTACTGATCA
CTAATGAGAAGTTAACTGCGCTTGGTATGTCTGCTTTAATTGTAGTGCCGTCACTTGTACAGGCATTACAAGGGGTTATC
GGCATGCCGCTTGCTTCGCATTTCATGAATCAATATGTAAAGAAGGATTATATTCATCGATTAAGAAACACACCTGCAGA
TCTGCGTGTTTTAACTGATGATACTTATGCACAATCTAAGATTTCGATTTTAAATAATAATACGATTCGTTTGTTTATTG
TCTTTGTATTTGCAGCTATAGGTGTATGGTTAGGTAAAGTAACTGGTATTCATTTCACCATTTTCTGTTTATTTTTCGGT
GTACTTTTATTAAATACTAAAGTGTTACCTCAAAATACGTTAGAGAAGGCGAATTCTCTTAATTTCTTTATCATCGCAGT
AATATTTGTAGTTATCGGTTCAATGGGTGGTGTCAAACCTGAGGATGTTATGAACAATATCTTACCTGTGCTTTGTATAT
TAGGGTTAGGTGCGCTCGGTATTGTATTAGGCGGCTTTGTTGCTTCAAAGCTACTGAAGTGGCCGATTCATAAGGGAATG
CCTGTTGCTTTAACTGCATTGTTCGGTTTCCCTGGAGATTATATATTATGTCAGGAAGTTGCACGTAGCCACGGGCAGAC
GGATGAAGAAGTTGAAAGTATTTTGAACGAGCTTGTCACTCCGATGCTAATAGGTGGCTTTGTGACAGTTACGATTTCTT
CTGTTATTATCGCAAATGTTGTTATGGATTTAATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATAATTTTCTTAATAAACAGAATTTTCAGTTTTATTGTTGACAGAACGCTTTAAAGTGTTAAACTAATCAGTAATTTA
AATTTGAAAGGACTGATGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTTAGTGGAGGGTTTATATGAAGACTTTAATTAATAATGTTAATATTCTTGATGTTGAACGCGGTGCATATATGAATCA
TCGCTCTGTTGTAATTGAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 385; Mature: 385

Protein sequence:

>385_residues
MIKEPIIATTMLFALIALGEIISIYTRARVPMLLTAMLGYLVLSWLGVFPSRILEYSTVPALGAVLIGPLILHMGTIMPL
HVLKSQWKAVIISLSGLVGATILILGIITPIYGFPTAASGLGPVAGGIIALLITNEKLTALGMSALIVVPSLVQALQGVI
GMPLASHFMNQYVKKDYIHRLRNTPADLRVLTDDTYAQSKISILNNNTIRLFIVFVFAAIGVWLGKVTGIHFTIFCLFFG
VLLLNTKVLPQNTLEKANSLNFFIIAVIFVVIGSMGGVKPEDVMNNILPVLCILGLGALGIVLGGFVASKLLKWPIHKGM
PVALTALFGFPGDYILCQEVARSHGQTDEEVESILNELVTPMLIGGFVTVTISSVIIANVVMDLI

Sequences:

>Translated_385_residues
MIKEPIIATTMLFALIALGEIISIYTRARVPMLLTAMLGYLVLSWLGVFPSRILEYSTVPALGAVLIGPLILHMGTIMPL
HVLKSQWKAVIISLSGLVGATILILGIITPIYGFPTAASGLGPVAGGIIALLITNEKLTALGMSALIVVPSLVQALQGVI
GMPLASHFMNQYVKKDYIHRLRNTPADLRVLTDDTYAQSKISILNNNTIRLFIVFVFAAIGVWLGKVTGIHFTIFCLFFG
VLLLNTKVLPQNTLEKANSLNFFIIAVIFVVIGSMGGVKPEDVMNNILPVLCILGLGALGIVLGGFVASKLLKWPIHKGM
PVALTALFGFPGDYILCQEVARSHGQTDEEVESILNELVTPMLIGGFVTVTISSVIIANVVMDLI
>Mature_385_residues
MIKEPIIATTMLFALIALGEIISIYTRARVPMLLTAMLGYLVLSWLGVFPSRILEYSTVPALGAVLIGPLILHMGTIMPL
HVLKSQWKAVIISLSGLVGATILILGIITPIYGFPTAASGLGPVAGGIIALLITNEKLTALGMSALIVVPSLVQALQGVI
GMPLASHFMNQYVKKDYIHRLRNTPADLRVLTDDTYAQSKISILNNNTIRLFIVFVFAAIGVWLGKVTGIHFTIFCLFFG
VLLLNTKVLPQNTLEKANSLNFFIIAVIFVVIGSMGGVKPEDVMNNILPVLCILGLGALGIVLGGFVASKLLKWPIHKGM
PVALTALFGFPGDYILCQEVARSHGQTDEEVESILNELVTPMLIGGFVTVTISSVIIANVVMDLI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41326; Mature: 41326

Theoretical pI: Translated: 8.77; Mature: 8.77

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKEPIIATTMLFALIALGEIISIYTRARVPMLLTAMLGYLVLSWLGVFPSRILEYSTVP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALGAVLIGPLILHMGTIMPLHVLKSQWKAVIISLSGLVGATILILGIITPIYGFPTAASG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
LGPVAGGIIALLITNEKLTALGMSALIVVPSLVQALQGVIGMPLASHFMNQYVKKDYIHR
CCHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRNTPADLRVLTDDTYAQSKISILNNNTIRLFIVFVFAAIGVWLGKVTGIHFTIFCLFFG
HHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLLLNTKVLPQNTLEKANSLNFFIIAVIFVVIGSMGGVKPEDVMNNILPVLCILGLGALG
HHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVLGGFVASKLLKWPIHKGMPVALTALFGFPGDYILCQEVARSHGQTDEEVESILNELVT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
PMLIGGFVTVTISSVIIANVVMDLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MIKEPIIATTMLFALIALGEIISIYTRARVPMLLTAMLGYLVLSWLGVFPSRILEYSTVP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALGAVLIGPLILHMGTIMPLHVLKSQWKAVIISLSGLVGATILILGIITPIYGFPTAASG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
LGPVAGGIIALLITNEKLTALGMSALIVVPSLVQALQGVIGMPLASHFMNQYVKKDYIHR
CCHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRNTPADLRVLTDDTYAQSKISILNNNTIRLFIVFVFAAIGVWLGKVTGIHFTIFCLFFG
HHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLLLNTKVLPQNTLEKANSLNFFIIAVIFVVIGSMGGVKPEDVMNNILPVLCILGLGALG
HHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVLGGFVASKLLKWPIHKGMPVALTALFGFPGDYILCQEVARSHGQTDEEVESILNELVT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
PMLIGGFVTVTISSVIIANVVMDLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA