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The map label for this gene is cbaA [H]

Identifier: 222151338

GI number: 222151338

Start: 1200614

End: 1202269

Strand: Direct

Name: cbaA [H]

Synonym: MCCL_1091

Alternate gene names: 222151338

Gene position: 1200614-1202269 (Clockwise)

Preceding gene: 222151337

Following gene: 222151344

Centisome position: 57.11

GC content: 40.4

Gene sequence:

>1656_bases
ATGGAAGATCGAGTTGAAATGTCCAAACCAGATGGTAAGTTGGTTATGGCTCATATGTATGTCGCGATAGTCTGTTTAAT
TATTGGTGGATTGGCTGGATTAGTTCAGACTTTAGTCCGCTCTGGAACTTTAGAGTTACCTGCTGGTATTGGATATTATC
AGATTCTTACAGTACACGGTATCATTCTTGCATTAGTATTGACTACATTCTTTATCATGGGATTCCAGACTGCTGCAGTC
ATTCGTACTTGCGGAAAACTTAGTCCATTACAACGTCAGCTTGTGTGGATCGGTTTCTGGGTAATGCTCATCGGTACTAC
AATGGCAGCAACAATGGTTCTACTTAATAAAGCAACTGTGTTGTACACATTCTATGCTCCACTTAAAGCGCATGTTATCT
TCTATGTAGGTATGGCATTAGTCGTCGTCGGTTCATGGATTTCTGCAGCCGGACAAATTATGCGTTATGCACAGTGGAAA
AAAGAGCTTAAAGGCCAAAAATCACCCCTTTTATCTTACATGGTAACAATTAACAACGTCATGTGGATCGTATGTTCAAT
TGGTGTTGCTTCTACAGTATTATTCCAGATGATTCCATGGTCTCTAGGATTAGTTGAGCGCATCGATGTTTCACTTAGTC
GTACGTTATTCTGGTACTTCGGTCATGCGTTAGTATACTTCTGGTTACTGCCAGCCTATATGTCATGGTATGCAGTAGTA
CCAAAGATTATAGGTGCTAAAGCATTCAGTGATAACTTAGCACGTATGAGCTTTATGTTATTCTTATTCTTCTCAATTCC
TGTTGGTATTCACCACCAGTTAACAGAACCGGGAATTGACGTTACATGGAAGTATGTACAGGTCGTATTAACATTTATGG
TCGTTATCCCTTCTTTAATGACTGCATTCAGTCTCTTTGCTACATTTGAAGCATATGGACGAAATAAAGGTGCTAAAGGA
TTATTTGGATGGATTAAAACATTACCTTGGAACGATGCACGTTTCGTATTGCCATTTATCGGAATGGCCGCTTTCATCCC
TGGTGGCGCAGGTGGTTTAGTGAATGCTTCTGCTCAAATGGACCAAGTAGTGCATAATACAATCTGGATTACAGGCCACT
TCCATCTCACAGTTGCAACAGCTGTCATCTTAACATTCTTCGGCACTATGTACTGGTTAATTCCACATGCTACTGGCCGT
GTTATGACAAAAGCAATGAATAAACTCGCTATTGCACAAGGTGTGCTATGGGCAATCGGTATGTCAATCATGTCTGGTGC
AATGCACTACATTGGATTATTCGGTGCGCCACGTCGTTCAACATATTCTGAATATGGTGGCTCTAAAATAGCAGCAGAAT
GGATTCCGTACCAGGTAATTCAAGCGATTGGCGGAACAATTCTTTTCGTATCAATCATCTTAGTTGTTATCGTATTTATA
CAGCTTGCATTCTTTGCACCAAAAGGATATGAAGCATTTCCTGTATCAGTTGCAATGGATGAACAAGCACCAGTTTATAA
ATTCGTTGAAAACTGGAAATTCTTACTTGTAGTAACGATTGCATTAATTTTAGTTGCCTACACGGTACCAATCGGCCAAA
TGTTTATGGATCCACCACCTGGTGCAGCTGGTATGGGTGAAGGAAAACTTTGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATCAAACATTAAGGTGGTTGATCAATAATGAACGAATATAAATTGGATAGTGGTGCTTTTGATGAACGTGCTTCATTCA
GAAATCATCACAGAGAAGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GACAAAAACATCAAGCGCATGCTTGATGTTTTTTTATTCTTCGCTTTTAAGCTCCTCTACAATTTCTTTAATAGATTTAA
AACTTTCTATTTTTAGCGAA

Product: cytochrome c oxidase (b(o/a)3-type) chain I

Products: NA

Alternate protein names: Cytochrome c ba(3) subunit I; Cytochrome c oxidase polypeptide I; Cytochrome cba3 subunit 1 [H]

Number of amino acids: Translated: 551; Mature: 551

Protein sequence:

>551_residues
MEDRVEMSKPDGKLVMAHMYVAIVCLIIGGLAGLVQTLVRSGTLELPAGIGYYQILTVHGIILALVLTTFFIMGFQTAAV
IRTCGKLSPLQRQLVWIGFWVMLIGTTMAATMVLLNKATVLYTFYAPLKAHVIFYVGMALVVVGSWISAAGQIMRYAQWK
KELKGQKSPLLSYMVTINNVMWIVCSIGVASTVLFQMIPWSLGLVERIDVSLSRTLFWYFGHALVYFWLLPAYMSWYAVV
PKIIGAKAFSDNLARMSFMLFLFFSIPVGIHHQLTEPGIDVTWKYVQVVLTFMVVIPSLMTAFSLFATFEAYGRNKGAKG
LFGWIKTLPWNDARFVLPFIGMAAFIPGGAGGLVNASAQMDQVVHNTIWITGHFHLTVATAVILTFFGTMYWLIPHATGR
VMTKAMNKLAIAQGVLWAIGMSIMSGAMHYIGLFGAPRRSTYSEYGGSKIAAEWIPYQVIQAIGGTILFVSIILVVIVFI
QLAFFAPKGYEAFPVSVAMDEQAPVYKFVENWKFLLVVTIALILVAYTVPIGQMFMDPPPGAAGMGEGKLW

Sequences:

>Translated_551_residues
MEDRVEMSKPDGKLVMAHMYVAIVCLIIGGLAGLVQTLVRSGTLELPAGIGYYQILTVHGIILALVLTTFFIMGFQTAAV
IRTCGKLSPLQRQLVWIGFWVMLIGTTMAATMVLLNKATVLYTFYAPLKAHVIFYVGMALVVVGSWISAAGQIMRYAQWK
KELKGQKSPLLSYMVTINNVMWIVCSIGVASTVLFQMIPWSLGLVERIDVSLSRTLFWYFGHALVYFWLLPAYMSWYAVV
PKIIGAKAFSDNLARMSFMLFLFFSIPVGIHHQLTEPGIDVTWKYVQVVLTFMVVIPSLMTAFSLFATFEAYGRNKGAKG
LFGWIKTLPWNDARFVLPFIGMAAFIPGGAGGLVNASAQMDQVVHNTIWITGHFHLTVATAVILTFFGTMYWLIPHATGR
VMTKAMNKLAIAQGVLWAIGMSIMSGAMHYIGLFGAPRRSTYSEYGGSKIAAEWIPYQVIQAIGGTILFVSIILVVIVFI
QLAFFAPKGYEAFPVSVAMDEQAPVYKFVENWKFLLVVTIALILVAYTVPIGQMFMDPPPGAAGMGEGKLW
>Mature_551_residues
MEDRVEMSKPDGKLVMAHMYVAIVCLIIGGLAGLVQTLVRSGTLELPAGIGYYQILTVHGIILALVLTTFFIMGFQTAAV
IRTCGKLSPLQRQLVWIGFWVMLIGTTMAATMVLLNKATVLYTFYAPLKAHVIFYVGMALVVVGSWISAAGQIMRYAQWK
KELKGQKSPLLSYMVTINNVMWIVCSIGVASTVLFQMIPWSLGLVERIDVSLSRTLFWYFGHALVYFWLLPAYMSWYAVV
PKIIGAKAFSDNLARMSFMLFLFFSIPVGIHHQLTEPGIDVTWKYVQVVLTFMVVIPSLMTAFSLFATFEAYGRNKGAKG
LFGWIKTLPWNDARFVLPFIGMAAFIPGGAGGLVNASAQMDQVVHNTIWITGHFHLTVATAVILTFFGTMYWLIPHATGR
VMTKAMNKLAIAQGVLWAIGMSIMSGAMHYIGLFGAPRRSTYSEYGGSKIAAEWIPYQVIQAIGGTILFVSIILVVIVFI
QLAFFAPKGYEAFPVSVAMDEQAPVYKFVENWKFLLVVTIALILVAYTVPIGQMFMDPPPGAAGMGEGKLW

Specific function: Unknown

COG id: COG0843

COG function: function code C; Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the heme-copper respiratory oxidase family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI251831109, Length=269, Percent_Identity=26.0223048327138, Blast_Score=71, Evalue=2e-12,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6226519, Length=241, Percent_Identity=26.9709543568465, Blast_Score=73, Evalue=1e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000883 [H]

Pfam domain/function: PF00115 COX1 [H]

EC number: =1.9.3.1 [H]

Molecular weight: Translated: 60891; Mature: 60891

Theoretical pI: Translated: 9.79; Mature: 9.79

Prosite motif: PS50855 COX1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
5.4 %Met     (Translated Protein)
6.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
5.4 %Met     (Mature Protein)
6.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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CCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7657607; 10338009; 10775261 [H]