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The map label for this gene is alsT [H]

Identifier: 222151260

GI number: 222151260

Start: 1118704

End: 1120191

Strand: Direct

Name: alsT [H]

Synonym: MCCL_1013

Alternate gene names: 222151260

Gene position: 1118704-1120191 (Clockwise)

Preceding gene: 222151259

Following gene: 222151262

Centisome position: 53.21

GC content: 37.97

Gene sequence:

>1488_bases
TTGAATATATCAAAAGTAAATTTTGATGCGTGGATACCGGAATGGTTTAAGATGATAGTATCTACCGGAAATGATATGAT
TTGGTCACAATTTTTAATAGGATTATTATTGCTTGCTGGCTTTTTCTTTAGTTTAAGTTCTAGATTCATACAGCTTCGCT
GGTTACCAGAGATGTTTAGAGTCATCGGTGAGAAACCAGAGACATTGGAAGATGGACAAAAAGGCATATCTTCTTTCCAG
GCGTTTGCTATTAGTGCAGCGAGTCGAGTAGGGACCGGAAATATTGCAGGTGTTGCCACTGCTATTGTTCTTGGTGGACC
TGGGGCTGTGTTCTGGATGTGGGTTATTGCTTTTTTTGGTGCAGCAAGCGCATTCTTTGAGGCGACGTTAGCACAAGTTT
ATAAGGTTAAAGATGAAAATGGTGGTTTCCGTGGGGGTCCTGCTTATTATATGGAATATGGTCTTGGACAAAAATGGTTA
GGGGCAACATTCGCCATTTTAATTACGATTACATTTGCATTTGTCTTTAATACTGTGCAATCAAATACGATTGCCGAAAG
TTTAAATACACAGTATGATACACCTGCATGGATCACAGGATTAATTCTAGCAATCATTACAGCCATCGTAATTTTCGGTG
GTGTACGATGGATTGCAAATGTATCTTCAACTATCGTTCCTATCATGGCAATTTTTTATATTCTGCTTGTGCTCTTTATT
TTAATAATGCATATTGGTGATGTAATTCCCATGATAATCAGTATTATTAAAGGTGCATTCGGTATGGAACAGGCATTTGG
TGGTGCATTAGGTTTTACAATCATGCAGGGGATTAAGCGTGGATTATTCTCAAATGAAGCTGGTATGGGATCAGCACCTA
ATGCTGCTGCAACGGCTGCTGTCAGTCATCCAGTGAAACAAGGTCTAATTCAGTCGTTAGGTGTATTCTTTGATACGATG
ATTGTATGTACTGCAACTGCGATTATGATCTTATTATACTCAGGATTAGAGTTTGGAGAAAAAGCGCCACAAGGTGTGGC
CGTTACACAAGCGGCCCTTAATAATCATGTCGGTAGTTTCGGTGGATTCTTTCTGACAGTAGCTGTATTCTTATTTGCGT
ATTCATCAGTTATCGGTAACTATTATTATGGTCAATCAAATATTGAATATTTAACAAAGAATAAAGTGATCATGTTTATT
TTCAGATCGTTTGTTGTAGTTATGGTGTTTTTTGGTGCTGTCATTAAAGTGGAGACGGTCTGGGCAACTGCAGACTTGTT
TATGGGACTTATGGCAATCTTAAATATTACTGCGATTATCGGTTTAGCACATGTTGTATTTGAAGTTGCTAAAGATTATG
GAGAACAGCGTAAGAAAGGACTTAATCCTGTATTTAGAACAGAGAATGTCAGGGCTGATCTATCCGATGTCGAGACTTGG
GGAGATAACCCGTATCATTTTAAAGATAAAGAAATAAATCATAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAATTCTGTAGATTTATAATGTTTGTGTAGACCCTTTCATTATCTATGGTAAAATAGTTTTAGTTTTATTTTACTTTG
AATAGTGGAGGGTTTTTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATACTAAGCTGCAGCTGCAGCTTAGTATTTTTATTTGAAAAGGTTCGCTATCCAGTCGATTATAGACTGGATGAAGTTC
ATGATCTTATCCCAGAACCC

Product: Na+/alanine symporter family protein

Products: Na (I) [Cytoplasm]; L-alanine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 495; Mature: 495

Protein sequence:

>495_residues
MNISKVNFDAWIPEWFKMIVSTGNDMIWSQFLIGLLLLAGFFFSLSSRFIQLRWLPEMFRVIGEKPETLEDGQKGISSFQ
AFAISAASRVGTGNIAGVATAIVLGGPGAVFWMWVIAFFGAASAFFEATLAQVYKVKDENGGFRGGPAYYMEYGLGQKWL
GATFAILITITFAFVFNTVQSNTIAESLNTQYDTPAWITGLILAIITAIVIFGGVRWIANVSSTIVPIMAIFYILLVLFI
LIMHIGDVIPMIISIIKGAFGMEQAFGGALGFTIMQGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATAAVSHPVKQGLIQSLGVFFDTM
IVCTATAIMILLYSGLEFGEKAPQGVAVTQAALNNHVGSFGGFFLTVAVFLFAYSSVIGNYYYGQSNIEYLTKNKVIMFI
FRSFVVVMVFFGAVIKVETVWATADLFMGLMAILNITAIIGLAHVVFEVAKDYGEQRKKGLNPVFRTENVRADLSDVETW
GDNPYHFKDKEINHK

Sequences:

>Translated_495_residues
MNISKVNFDAWIPEWFKMIVSTGNDMIWSQFLIGLLLLAGFFFSLSSRFIQLRWLPEMFRVIGEKPETLEDGQKGISSFQ
AFAISAASRVGTGNIAGVATAIVLGGPGAVFWMWVIAFFGAASAFFEATLAQVYKVKDENGGFRGGPAYYMEYGLGQKWL
GATFAILITITFAFVFNTVQSNTIAESLNTQYDTPAWITGLILAIITAIVIFGGVRWIANVSSTIVPIMAIFYILLVLFI
LIMHIGDVIPMIISIIKGAFGMEQAFGGALGFTIMQGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATAAVSHPVKQGLIQSLGVFFDTM
IVCTATAIMILLYSGLEFGEKAPQGVAVTQAALNNHVGSFGGFFLTVAVFLFAYSSVIGNYYYGQSNIEYLTKNKVIMFI
FRSFVVVMVFFGAVIKVETVWATADLFMGLMAILNITAIIGLAHVVFEVAKDYGEQRKKGLNPVFRTENVRADLSDVETW
GDNPYHFKDKEINHK
>Mature_495_residues
MNISKVNFDAWIPEWFKMIVSTGNDMIWSQFLIGLLLLAGFFFSLSSRFIQLRWLPEMFRVIGEKPETLEDGQKGISSFQ
AFAISAASRVGTGNIAGVATAIVLGGPGAVFWMWVIAFFGAASAFFEATLAQVYKVKDENGGFRGGPAYYMEYGLGQKWL
GATFAILITITFAFVFNTVQSNTIAESLNTQYDTPAWITGLILAIITAIVIFGGVRWIANVSSTIVPIMAIFYILLVLFI
LIMHIGDVIPMIISIIKGAFGMEQAFGGALGFTIMQGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATAAVSHPVKQGLIQSLGVFFDTM
IVCTATAIMILLYSGLEFGEKAPQGVAVTQAALNNHVGSFGGFFLTVAVFLFAYSSVIGNYYYGQSNIEYLTKNKVIMFI
FRSFVVVMVFFGAVIKVETVWATADLFMGLMAILNITAIIGLAHVVFEVAKDYGEQRKKGLNPVFRTENVRADLSDVETW
GDNPYHFKDKEINHK

Specific function: Unknown

COG id: COG1115

COG function: function code E; Na+/alanine symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:alanine (SAF) symporter family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786188, Length=481, Percent_Identity=40.7484407484407, Blast_Score=343, Evalue=1e-95,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001463 [H]

Pfam domain/function: PF01235 Na_Ala_symp [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54092; Mature: 54092

Theoretical pI: Translated: 6.80; Mature: 6.80

Prosite motif: PS00873 NA_ALANINE_SYMP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNISKVNFDAWIPEWFKMIVSTGNDMIWSQFLIGLLLLAGFFFSLSSRFIQLRWLPEMFR
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIGEKPETLEDGQKGISSFQAFAISAASRVGTGNIAGVATAIVLGGPGAVFWMWVIAFFG
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
AASAFFEATLAQVYKVKDENGGFRGGPAYYMEYGLGQKWLGATFAILITITFAFVFNTVQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNTIAESLNTQYDTPAWITGLILAIITAIVIFGGVRWIANVSSTIVPIMAIFYILLVLFI
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIMHIGDVIPMIISIIKGAFGMEQAFGGALGFTIMQGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH
VSHPVKQGLIQSLGVFFDTMIVCTATAIMILLYSGLEFGEKAPQGVAVTQAALNNHVGSF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHH
GGFFLTVAVFLFAYSSVIGNYYYGQSNIEYLTKNKVIMFIFRSFVVVMVFFGAVIKVETV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WATADLFMGLMAILNITAIIGLAHVVFEVAKDYGEQRKKGLNPVFRTENVRADLSDVETW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHC
GDNPYHFKDKEINHK
CCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNISKVNFDAWIPEWFKMIVSTGNDMIWSQFLIGLLLLAGFFFSLSSRFIQLRWLPEMFR
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIGEKPETLEDGQKGISSFQAFAISAASRVGTGNIAGVATAIVLGGPGAVFWMWVIAFFG
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
AASAFFEATLAQVYKVKDENGGFRGGPAYYMEYGLGQKWLGATFAILITITFAFVFNTVQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNTIAESLNTQYDTPAWITGLILAIITAIVIFGGVRWIANVSSTIVPIMAIFYILLVLFI
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIMHIGDVIPMIISIIKGAFGMEQAFGGALGFTIMQGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH
VSHPVKQGLIQSLGVFFDTMIVCTATAIMILLYSGLEFGEKAPQGVAVTQAALNNHVGSF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHH
GGFFLTVAVFLFAYSSVIGNYYYGQSNIEYLTKNKVIMFIFRSFVVVMVFFGAVIKVETV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WATADLFMGLMAILNITAIIGLAHVVFEVAKDYGEQRKKGLNPVFRTENVRADLSDVETW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHC
GDNPYHFKDKEINHK
CCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; L-alanine [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + L-alanine [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + L-alanine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969507; 9384377; 7710280 [H]