Definition Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome.
Accession NC_011999
Length 2,102,324

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The map label for this gene is 222151223

Identifier: 222151223

GI number: 222151223

Start: 1065567

End: 1068200

Strand: Direct

Name: 222151223

Synonym: MCCL_0974

Alternate gene names: NA

Gene position: 1065567-1068200 (Clockwise)

Preceding gene: 222151222

Following gene: 222151224

Centisome position: 50.69

GC content: 36.07

Gene sequence:

>2634_bases
ATGGCTAACATACAAGAAATAGGCACTAAATTTACGATGTCTGTAGATGGGATGTTGAATAAGTTCAAGGTACTTGAACA
GAACTTTGATAATTTGCCAAAAGTTGCTGAAAAATCAACAAAGCGTATGGATAAAGCATTTGGTGCTATAGATGATTCAC
TTAAGACATTTGACAAGCGTTTATCTGAAACGGGTAAAGATTTCGACACTAAGAAGTTGCAGTCTGAATTACAAAAGGCT
CAAAAGGAATTTAAAGATACAGGTAATATCAATAAAGAGACGATGCAATCACTTCAAAAGGAAATTAAGAGTGTTGATTG
GAAGTCTTTAGATGCAAATTCACGTGATACATTTAAAACTGTTATTCGTAATGTTAACAGTGTAGAGCGCAATATGAATA
AGCTGAATGATGTTAAGTTTCTTGAAGGACTACCTGATGATGCGAAAGAAGCAGGTAAGCATTTACTAGCACTACAAAAA
GATGTTGAGAAGACAAGTAAATCACTTGAGAAAACTGATGATAAGGTTGATTTTAATAAGCTCAATAGTGAGCTCAATAA
AGCTAAAAAAGAATTACAATCAACGGGTAAGGTTGCAGATAACACACTTGATCAGATAAATAAGGATATTAAAGATGTTG
ATTTTGAATCGATGTCTATGAGTGCTAATGTAGCATTCGGTAAGGTCGAAGAACGTGCTGAACAACTCGATAGAAAACTT
AGGAACGTTGGAGAGGATGTTAATCTATCTAATTCTACTAAAAACATTTCTGAGGACATTGATGGCGCAACTGGTTCGGT
TGGTGGCTTGAAAGGTGCATTTAAAGGATTAGGACCTGTTATTGGAGGCGCATTAGCTACTGTAAGCATAACGGAATTTA
CAAAGAAGATAGTTGAATCTACTGCTGAAATTGAAGCGTTAAACTCTCAGTACGAACAAGTTATGGGCAAAATGAAGAAT
ACAACTGATAAGTATCTTGGAGAGATGGCTCAGAAGTATAATGTGCATCCTAACGAATTAAAGAAGTCGATGCTTCAATA
TCAAGCGATTCTTAAATCGAAAGGATTAAATGAACAAGATGCATACGAAACTTCTAAAATGTGGTTAGAACGTACTGTTG
ACGGTTCAGCATTTGCTAATGAATCGATTGAAGAATCAACTGGACGTATGATGGCTGTTATTAAAGGCGAATACGATTCT
GCAGATACAGTTATGATTAACTTGTCTCAAACAATGCTTAATGATAAAGCTCAAGAGAAATACGGTAAGAAATGGGAGCA
GTTAAGTGTTACTCAACAGGAACAGCTAAAAGTACAAGAATCAATAAGACAACATACTTCAGCTGGTGTACTTGGTCAGG
GTGTAAAAGAAGCGGATAGCTATGAAAAGAACTTAGCTCAATTGAAGAACACCTGGAAAGACTTTCTTGCTTCTTATGGT
GGACCTGCGCTAGATATCGCTAATAAAGGTTTGAAAGGCGGTATCAAAATCATTGAAGGTATGGCTAAAGGGTTTAGTAC
TATCGGTAAATTGATTAAGGAACTAACTGGTGGTAAACAAGTTAACATACTTCAAAAGCTAGGTTTTAGTAACGGAGAAG
CAAATAACATCATAAATTGGTTCAATACGTTAAAACAACAATTGTCAATTGCAGGACGGGCTATAAGTGACTTCGTCAAA
GATGGTTTCGGTAAAATCAAAGCGTTTTTTACTGGACCTGATGGGCAACAGATTATGCAAGCTTACAAAAATATATTTAA
CGGATTGCTAGCTGTCGTGAAATTTGTTATGCCAGTAGTTCTGTATATAGTTAAAGATATATTTGGAAACATAACAGGTT
TCTTAAAAGGGTTGTTTCAGTGGTGGAAAGGCTTATTACAAGTCTTTGCAGGTCTATTTACAGGTGATTGGAAGAAGATG
TGGGAAGGTGTCAAAAATCTATTTTTTGGCGCAATAAAGATGATATGGAATGGTGTCCAATTATTATTCTATGGAAAACT
GCTTAAAGGCGGTTTAGCCTTTGCTAAATTATTCGCCGGTAGCTTTAAATCCATGTGGAAAGGTATCCTCAATTTATTTA
AGAATTTCGGTAAATTTATATGGGATACTTCAACAAAAGTATCGAAAAACGTCATTGGTGCTTTCAAGAATCTATGGACA
GGTTCAATGAATATCATAAAGAATTTAAAATCAGGACTTTATAATTCTTGGGTGTCTATAAAGAAAACAACAGTAGATGC
AGCGGTTGGATTAAAAGACGGTGTCGTTGGTGCATTTAAAAACACTTGGAATGGTATAAAAGGATGGATTAAATCGATTA
AAGATGGCGTAGTCGGCATGAAAGATTCCGTCATTGAAACAGGTAAAAAGATGGCGTCTGGTCTAAAGGATAAAGTCGTT
GGTGGACTAAATTCTATGATCGATGGCGTAAACTGGGTAGCTGATAAATTAGGAATGGGTAAACCATTATCTAAAATTGA
TGCTAGTAAATATTCTACAGGTACCGGAGGGCATCCTGAAGATGGATGGGCAACTGTAGGAGATAAAGGTCCAGGTAACG
GAAAAGGCACAAGAGAAATTGTTCAATTCCCAAACGGACGCACAGCATTATTCGAGAAAGAAACAACGTTCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCCTAAAGAATTAGAGTGGAATTTCGAGCAACTTGAACAATTAAAAGCATTACAAACTTAATTAATTATTTAAATGAATA
TATAAGGAAAGGAGGATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGCCTAAAGGAACACATGTTTATAACAATAAGCAAACTGAAGAATTATTAGAACCTGCTAGGTATTCAAGAGGTACTCC
TGGTATGGGAATGCTTGTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Phage Tail Tape Measure Protein; Phage Related Protein; Prophage; Phage-Related Protein YqbO; Tail Protein

Number of amino acids: Translated: 877; Mature: 876

Protein sequence:

>877_residues
MANIQEIGTKFTMSVDGMLNKFKVLEQNFDNLPKVAEKSTKRMDKAFGAIDDSLKTFDKRLSETGKDFDTKKLQSELQKA
QKEFKDTGNINKETMQSLQKEIKSVDWKSLDANSRDTFKTVIRNVNSVERNMNKLNDVKFLEGLPDDAKEAGKHLLALQK
DVEKTSKSLEKTDDKVDFNKLNSELNKAKKELQSTGKVADNTLDQINKDIKDVDFESMSMSANVAFGKVEERAEQLDRKL
RNVGEDVNLSNSTKNISEDIDGATGSVGGLKGAFKGLGPVIGGALATVSITEFTKKIVESTAEIEALNSQYEQVMGKMKN
TTDKYLGEMAQKYNVHPNELKKSMLQYQAILKSKGLNEQDAYETSKMWLERTVDGSAFANESIEESTGRMMAVIKGEYDS
ADTVMINLSQTMLNDKAQEKYGKKWEQLSVTQQEQLKVQESIRQHTSAGVLGQGVKEADSYEKNLAQLKNTWKDFLASYG
GPALDIANKGLKGGIKIIEGMAKGFSTIGKLIKELTGGKQVNILQKLGFSNGEANNIINWFNTLKQQLSIAGRAISDFVK
DGFGKIKAFFTGPDGQQIMQAYKNIFNGLLAVVKFVMPVVLYIVKDIFGNITGFLKGLFQWWKGLLQVFAGLFTGDWKKM
WEGVKNLFFGAIKMIWNGVQLLFYGKLLKGGLAFAKLFAGSFKSMWKGILNLFKNFGKFIWDTSTKVSKNVIGAFKNLWT
GSMNIIKNLKSGLYNSWVSIKKTTVDAAVGLKDGVVGAFKNTWNGIKGWIKSIKDGVVGMKDSVIETGKKMASGLKDKVV
GGLNSMIDGVNWVADKLGMGKPLSKIDASKYSTGTGGHPEDGWATVGDKGPGNGKGTREIVQFPNGRTALFEKETTF

Sequences:

>Translated_877_residues
MANIQEIGTKFTMSVDGMLNKFKVLEQNFDNLPKVAEKSTKRMDKAFGAIDDSLKTFDKRLSETGKDFDTKKLQSELQKA
QKEFKDTGNINKETMQSLQKEIKSVDWKSLDANSRDTFKTVIRNVNSVERNMNKLNDVKFLEGLPDDAKEAGKHLLALQK
DVEKTSKSLEKTDDKVDFNKLNSELNKAKKELQSTGKVADNTLDQINKDIKDVDFESMSMSANVAFGKVEERAEQLDRKL
RNVGEDVNLSNSTKNISEDIDGATGSVGGLKGAFKGLGPVIGGALATVSITEFTKKIVESTAEIEALNSQYEQVMGKMKN
TTDKYLGEMAQKYNVHPNELKKSMLQYQAILKSKGLNEQDAYETSKMWLERTVDGSAFANESIEESTGRMMAVIKGEYDS
ADTVMINLSQTMLNDKAQEKYGKKWEQLSVTQQEQLKVQESIRQHTSAGVLGQGVKEADSYEKNLAQLKNTWKDFLASYG
GPALDIANKGLKGGIKIIEGMAKGFSTIGKLIKELTGGKQVNILQKLGFSNGEANNIINWFNTLKQQLSIAGRAISDFVK
DGFGKIKAFFTGPDGQQIMQAYKNIFNGLLAVVKFVMPVVLYIVKDIFGNITGFLKGLFQWWKGLLQVFAGLFTGDWKKM
WEGVKNLFFGAIKMIWNGVQLLFYGKLLKGGLAFAKLFAGSFKSMWKGILNLFKNFGKFIWDTSTKVSKNVIGAFKNLWT
GSMNIIKNLKSGLYNSWVSIKKTTVDAAVGLKDGVVGAFKNTWNGIKGWIKSIKDGVVGMKDSVIETGKKMASGLKDKVV
GGLNSMIDGVNWVADKLGMGKPLSKIDASKYSTGTGGHPEDGWATVGDKGPGNGKGTREIVQFPNGRTALFEKETTF
>Mature_876_residues
ANIQEIGTKFTMSVDGMLNKFKVLEQNFDNLPKVAEKSTKRMDKAFGAIDDSLKTFDKRLSETGKDFDTKKLQSELQKAQ
KEFKDTGNINKETMQSLQKEIKSVDWKSLDANSRDTFKTVIRNVNSVERNMNKLNDVKFLEGLPDDAKEAGKHLLALQKD
VEKTSKSLEKTDDKVDFNKLNSELNKAKKELQSTGKVADNTLDQINKDIKDVDFESMSMSANVAFGKVEERAEQLDRKLR
NVGEDVNLSNSTKNISEDIDGATGSVGGLKGAFKGLGPVIGGALATVSITEFTKKIVESTAEIEALNSQYEQVMGKMKNT
TDKYLGEMAQKYNVHPNELKKSMLQYQAILKSKGLNEQDAYETSKMWLERTVDGSAFANESIEESTGRMMAVIKGEYDSA
DTVMINLSQTMLNDKAQEKYGKKWEQLSVTQQEQLKVQESIRQHTSAGVLGQGVKEADSYEKNLAQLKNTWKDFLASYGG
PALDIANKGLKGGIKIIEGMAKGFSTIGKLIKELTGGKQVNILQKLGFSNGEANNIINWFNTLKQQLSIAGRAISDFVKD
GFGKIKAFFTGPDGQQIMQAYKNIFNGLLAVVKFVMPVVLYIVKDIFGNITGFLKGLFQWWKGLLQVFAGLFTGDWKKMW
EGVKNLFFGAIKMIWNGVQLLFYGKLLKGGLAFAKLFAGSFKSMWKGILNLFKNFGKFIWDTSTKVSKNVIGAFKNLWTG
SMNIIKNLKSGLYNSWVSIKKTTVDAAVGLKDGVVGAFKNTWNGIKGWIKSIKDGVVGMKDSVIETGKKMASGLKDKVVG
GLNSMIDGVNWVADKLGMGKPLSKIDASKYSTGTGGHPEDGWATVGDKGPGNGKGTREIVQFPNGRTALFEKETTF

Specific function: Unknown

COG id: COG5412

COG function: function code S; Phage-related protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96876; Mature: 96745

Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLFYGKLLKGGLAFAKLFAGSFKSMWKGILNLFKNFGKFIWDTSTKVSKNVIGAFKNLWT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
GSMNIIKNLKSGLYNSWVSIKKTTVDAAVGLKDGVVGAFKNTWNGIKGWIKSIKDGVVGM
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KDSVIETGKKMASGLKDKVVGGLNSMIDGVNWVADKLGMGKPLSKIDASKYSTGTGGHPE
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHCCCCCCCCCC
DGWATVGDKGPGNGKGTREIVQFPNGRTALFEKETTF
CCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ANIQEIGTKFTMSVDGMLNKFKVLEQNFDNLPKVAEKSTKRMDKAFGAIDDSLKTFDKR
CCHHHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSETGKDFDTKKLQSELQKAQKEFKDTGNINKETMQSLQKEIKSVDWKSLDANSRDTFKT
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH
VIRNVNSVERNMNKLNDVKFLEGLPDDAKEAGKHLLALQKDVEKTSKSLEKTDDKVDFNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
LNSELNKAKKELQSTGKVADNTLDQINKDIKDVDFESMSMSANVAFGKVEERAEQLDRKL
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RNVGEDVNLSNSTKNISEDIDGATGSVGGLKGAFKGLGPVIGGALATVSITEFTKKIVES
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TAEIEALNSQYEQVMGKMKNTTDKYLGEMAQKYNVHPNELKKSMLQYQAILKSKGLNEQD
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GPALDIANKGLKGGIKIIEGMAKGFSTIGKLIKELTGGKQVNILQKLGFSNGEANNIINW
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HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHCCCCCCCCCC
DGWATVGDKGPGNGKGTREIVQFPNGRTALFEKETTF
CCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA