| Definition | Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011999 |
| Length | 2,102,324 |
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The map label for this gene is 222151223
Identifier: 222151223
GI number: 222151223
Start: 1065567
End: 1068200
Strand: Direct
Name: 222151223
Synonym: MCCL_0974
Alternate gene names: NA
Gene position: 1065567-1068200 (Clockwise)
Preceding gene: 222151222
Following gene: 222151224
Centisome position: 50.69
GC content: 36.07
Gene sequence:
>2634_bases ATGGCTAACATACAAGAAATAGGCACTAAATTTACGATGTCTGTAGATGGGATGTTGAATAAGTTCAAGGTACTTGAACA GAACTTTGATAATTTGCCAAAAGTTGCTGAAAAATCAACAAAGCGTATGGATAAAGCATTTGGTGCTATAGATGATTCAC TTAAGACATTTGACAAGCGTTTATCTGAAACGGGTAAAGATTTCGACACTAAGAAGTTGCAGTCTGAATTACAAAAGGCT CAAAAGGAATTTAAAGATACAGGTAATATCAATAAAGAGACGATGCAATCACTTCAAAAGGAAATTAAGAGTGTTGATTG GAAGTCTTTAGATGCAAATTCACGTGATACATTTAAAACTGTTATTCGTAATGTTAACAGTGTAGAGCGCAATATGAATA AGCTGAATGATGTTAAGTTTCTTGAAGGACTACCTGATGATGCGAAAGAAGCAGGTAAGCATTTACTAGCACTACAAAAA GATGTTGAGAAGACAAGTAAATCACTTGAGAAAACTGATGATAAGGTTGATTTTAATAAGCTCAATAGTGAGCTCAATAA AGCTAAAAAAGAATTACAATCAACGGGTAAGGTTGCAGATAACACACTTGATCAGATAAATAAGGATATTAAAGATGTTG ATTTTGAATCGATGTCTATGAGTGCTAATGTAGCATTCGGTAAGGTCGAAGAACGTGCTGAACAACTCGATAGAAAACTT AGGAACGTTGGAGAGGATGTTAATCTATCTAATTCTACTAAAAACATTTCTGAGGACATTGATGGCGCAACTGGTTCGGT TGGTGGCTTGAAAGGTGCATTTAAAGGATTAGGACCTGTTATTGGAGGCGCATTAGCTACTGTAAGCATAACGGAATTTA CAAAGAAGATAGTTGAATCTACTGCTGAAATTGAAGCGTTAAACTCTCAGTACGAACAAGTTATGGGCAAAATGAAGAAT ACAACTGATAAGTATCTTGGAGAGATGGCTCAGAAGTATAATGTGCATCCTAACGAATTAAAGAAGTCGATGCTTCAATA TCAAGCGATTCTTAAATCGAAAGGATTAAATGAACAAGATGCATACGAAACTTCTAAAATGTGGTTAGAACGTACTGTTG ACGGTTCAGCATTTGCTAATGAATCGATTGAAGAATCAACTGGACGTATGATGGCTGTTATTAAAGGCGAATACGATTCT GCAGATACAGTTATGATTAACTTGTCTCAAACAATGCTTAATGATAAAGCTCAAGAGAAATACGGTAAGAAATGGGAGCA GTTAAGTGTTACTCAACAGGAACAGCTAAAAGTACAAGAATCAATAAGACAACATACTTCAGCTGGTGTACTTGGTCAGG GTGTAAAAGAAGCGGATAGCTATGAAAAGAACTTAGCTCAATTGAAGAACACCTGGAAAGACTTTCTTGCTTCTTATGGT GGACCTGCGCTAGATATCGCTAATAAAGGTTTGAAAGGCGGTATCAAAATCATTGAAGGTATGGCTAAAGGGTTTAGTAC TATCGGTAAATTGATTAAGGAACTAACTGGTGGTAAACAAGTTAACATACTTCAAAAGCTAGGTTTTAGTAACGGAGAAG CAAATAACATCATAAATTGGTTCAATACGTTAAAACAACAATTGTCAATTGCAGGACGGGCTATAAGTGACTTCGTCAAA GATGGTTTCGGTAAAATCAAAGCGTTTTTTACTGGACCTGATGGGCAACAGATTATGCAAGCTTACAAAAATATATTTAA CGGATTGCTAGCTGTCGTGAAATTTGTTATGCCAGTAGTTCTGTATATAGTTAAAGATATATTTGGAAACATAACAGGTT TCTTAAAAGGGTTGTTTCAGTGGTGGAAAGGCTTATTACAAGTCTTTGCAGGTCTATTTACAGGTGATTGGAAGAAGATG TGGGAAGGTGTCAAAAATCTATTTTTTGGCGCAATAAAGATGATATGGAATGGTGTCCAATTATTATTCTATGGAAAACT GCTTAAAGGCGGTTTAGCCTTTGCTAAATTATTCGCCGGTAGCTTTAAATCCATGTGGAAAGGTATCCTCAATTTATTTA AGAATTTCGGTAAATTTATATGGGATACTTCAACAAAAGTATCGAAAAACGTCATTGGTGCTTTCAAGAATCTATGGACA GGTTCAATGAATATCATAAAGAATTTAAAATCAGGACTTTATAATTCTTGGGTGTCTATAAAGAAAACAACAGTAGATGC AGCGGTTGGATTAAAAGACGGTGTCGTTGGTGCATTTAAAAACACTTGGAATGGTATAAAAGGATGGATTAAATCGATTA AAGATGGCGTAGTCGGCATGAAAGATTCCGTCATTGAAACAGGTAAAAAGATGGCGTCTGGTCTAAAGGATAAAGTCGTT GGTGGACTAAATTCTATGATCGATGGCGTAAACTGGGTAGCTGATAAATTAGGAATGGGTAAACCATTATCTAAAATTGA TGCTAGTAAATATTCTACAGGTACCGGAGGGCATCCTGAAGATGGATGGGCAACTGTAGGAGATAAAGGTCCAGGTAACG GAAAAGGCACAAGAGAAATTGTTCAATTCCCAAACGGACGCACAGCATTATTCGAGAAAGAAACAACGTTCTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCCTAAAGAATTAGAGTGGAATTTCGAGCAACTTGAACAATTAAAAGCATTACAAACTTAATTAATTATTTAAATGAATA TATAAGGAAAGGAGGATAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATGCCTAAAGGAACACATGTTTATAACAATAAGCAAACTGAAGAATTATTAGAACCTGCTAGGTATTCAAGAGGTACTCC TGGTATGGGAATGCTTGTTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Phage Tail Tape Measure Protein; Phage Related Protein; Prophage; Phage-Related Protein YqbO; Tail Protein
Number of amino acids: Translated: 877; Mature: 876
Protein sequence:
>877_residues MANIQEIGTKFTMSVDGMLNKFKVLEQNFDNLPKVAEKSTKRMDKAFGAIDDSLKTFDKRLSETGKDFDTKKLQSELQKA QKEFKDTGNINKETMQSLQKEIKSVDWKSLDANSRDTFKTVIRNVNSVERNMNKLNDVKFLEGLPDDAKEAGKHLLALQK DVEKTSKSLEKTDDKVDFNKLNSELNKAKKELQSTGKVADNTLDQINKDIKDVDFESMSMSANVAFGKVEERAEQLDRKL RNVGEDVNLSNSTKNISEDIDGATGSVGGLKGAFKGLGPVIGGALATVSITEFTKKIVESTAEIEALNSQYEQVMGKMKN TTDKYLGEMAQKYNVHPNELKKSMLQYQAILKSKGLNEQDAYETSKMWLERTVDGSAFANESIEESTGRMMAVIKGEYDS ADTVMINLSQTMLNDKAQEKYGKKWEQLSVTQQEQLKVQESIRQHTSAGVLGQGVKEADSYEKNLAQLKNTWKDFLASYG GPALDIANKGLKGGIKIIEGMAKGFSTIGKLIKELTGGKQVNILQKLGFSNGEANNIINWFNTLKQQLSIAGRAISDFVK DGFGKIKAFFTGPDGQQIMQAYKNIFNGLLAVVKFVMPVVLYIVKDIFGNITGFLKGLFQWWKGLLQVFAGLFTGDWKKM WEGVKNLFFGAIKMIWNGVQLLFYGKLLKGGLAFAKLFAGSFKSMWKGILNLFKNFGKFIWDTSTKVSKNVIGAFKNLWT GSMNIIKNLKSGLYNSWVSIKKTTVDAAVGLKDGVVGAFKNTWNGIKGWIKSIKDGVVGMKDSVIETGKKMASGLKDKVV GGLNSMIDGVNWVADKLGMGKPLSKIDASKYSTGTGGHPEDGWATVGDKGPGNGKGTREIVQFPNGRTALFEKETTF
Sequences:
>Translated_877_residues MANIQEIGTKFTMSVDGMLNKFKVLEQNFDNLPKVAEKSTKRMDKAFGAIDDSLKTFDKRLSETGKDFDTKKLQSELQKA QKEFKDTGNINKETMQSLQKEIKSVDWKSLDANSRDTFKTVIRNVNSVERNMNKLNDVKFLEGLPDDAKEAGKHLLALQK DVEKTSKSLEKTDDKVDFNKLNSELNKAKKELQSTGKVADNTLDQINKDIKDVDFESMSMSANVAFGKVEERAEQLDRKL RNVGEDVNLSNSTKNISEDIDGATGSVGGLKGAFKGLGPVIGGALATVSITEFTKKIVESTAEIEALNSQYEQVMGKMKN TTDKYLGEMAQKYNVHPNELKKSMLQYQAILKSKGLNEQDAYETSKMWLERTVDGSAFANESIEESTGRMMAVIKGEYDS ADTVMINLSQTMLNDKAQEKYGKKWEQLSVTQQEQLKVQESIRQHTSAGVLGQGVKEADSYEKNLAQLKNTWKDFLASYG GPALDIANKGLKGGIKIIEGMAKGFSTIGKLIKELTGGKQVNILQKLGFSNGEANNIINWFNTLKQQLSIAGRAISDFVK DGFGKIKAFFTGPDGQQIMQAYKNIFNGLLAVVKFVMPVVLYIVKDIFGNITGFLKGLFQWWKGLLQVFAGLFTGDWKKM WEGVKNLFFGAIKMIWNGVQLLFYGKLLKGGLAFAKLFAGSFKSMWKGILNLFKNFGKFIWDTSTKVSKNVIGAFKNLWT GSMNIIKNLKSGLYNSWVSIKKTTVDAAVGLKDGVVGAFKNTWNGIKGWIKSIKDGVVGMKDSVIETGKKMASGLKDKVV GGLNSMIDGVNWVADKLGMGKPLSKIDASKYSTGTGGHPEDGWATVGDKGPGNGKGTREIVQFPNGRTALFEKETTF >Mature_876_residues ANIQEIGTKFTMSVDGMLNKFKVLEQNFDNLPKVAEKSTKRMDKAFGAIDDSLKTFDKRLSETGKDFDTKKLQSELQKAQ KEFKDTGNINKETMQSLQKEIKSVDWKSLDANSRDTFKTVIRNVNSVERNMNKLNDVKFLEGLPDDAKEAGKHLLALQKD VEKTSKSLEKTDDKVDFNKLNSELNKAKKELQSTGKVADNTLDQINKDIKDVDFESMSMSANVAFGKVEERAEQLDRKLR NVGEDVNLSNSTKNISEDIDGATGSVGGLKGAFKGLGPVIGGALATVSITEFTKKIVESTAEIEALNSQYEQVMGKMKNT TDKYLGEMAQKYNVHPNELKKSMLQYQAILKSKGLNEQDAYETSKMWLERTVDGSAFANESIEESTGRMMAVIKGEYDSA DTVMINLSQTMLNDKAQEKYGKKWEQLSVTQQEQLKVQESIRQHTSAGVLGQGVKEADSYEKNLAQLKNTWKDFLASYGG PALDIANKGLKGGIKIIEGMAKGFSTIGKLIKELTGGKQVNILQKLGFSNGEANNIINWFNTLKQQLSIAGRAISDFVKD GFGKIKAFFTGPDGQQIMQAYKNIFNGLLAVVKFVMPVVLYIVKDIFGNITGFLKGLFQWWKGLLQVFAGLFTGDWKKMW EGVKNLFFGAIKMIWNGVQLLFYGKLLKGGLAFAKLFAGSFKSMWKGILNLFKNFGKFIWDTSTKVSKNVIGAFKNLWTG SMNIIKNLKSGLYNSWVSIKKTTVDAAVGLKDGVVGAFKNTWNGIKGWIKSIKDGVVGMKDSVIETGKKMASGLKDKVVG GLNSMIDGVNWVADKLGMGKPLSKIDASKYSTGTGGHPEDGWATVGDKGPGNGKGTREIVQFPNGRTALFEKETTF
Specific function: Unknown
COG id: COG5412
COG function: function code S; Phage-related protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 96876; Mature: 96745
Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MANIQEIGTKFTMSVDGMLNKFKVLEQNFDNLPKVAEKSTKRMDKAFGAIDDSLKTFDKR CCCHHHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSETGKDFDTKKLQSELQKAQKEFKDTGNINKETMQSLQKEIKSVDWKSLDANSRDTFKT HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH VIRNVNSVERNMNKLNDVKFLEGLPDDAKEAGKHLLALQKDVEKTSKSLEKTDDKVDFNK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH LNSELNKAKKELQSTGKVADNTLDQINKDIKDVDFESMSMSANVAFGKVEERAEQLDRKL HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH RNVGEDVNLSNSTKNISEDIDGATGSVGGLKGAFKGLGPVIGGALATVSITEFTKKIVES HHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAEIEALNSQYEQVMGKMKNTTDKYLGEMAQKYNVHPNELKKSMLQYQAILKSKGLNEQD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH AYETSKMWLERTVDGSAFANESIEESTGRMMAVIKGEYDSADTVMINLSQTMLNDKAQEK HHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHH YGKKWEQLSVTQQEQLKVQESIRQHTSAGVLGQGVKEADSYEKNLAQLKNTWKDFLASYG HCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GPALDIANKGLKGGIKIIEGMAKGFSTIGKLIKELTGGKQVNILQKLGFSNGEANNIINW CCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH FNTLKQQLSIAGRAISDFVKDGFGKIKAFFTGPDGQQIMQAYKNIFNGLLAVVKFVMPVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYIVKDIFGNITGFLKGLFQWWKGLLQVFAGLFTGDWKKMWEGVKNLFFGAIKMIWNGVQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLFYGKLLKGGLAFAKLFAGSFKSMWKGILNLFKNFGKFIWDTSTKVSKNVIGAFKNLWT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHC GSMNIIKNLKSGLYNSWVSIKKTTVDAAVGLKDGVVGAFKNTWNGIKGWIKSIKDGVVGM CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC KDSVIETGKKMASGLKDKVVGGLNSMIDGVNWVADKLGMGKPLSKIDASKYSTGTGGHPE HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHCCCCCCCCCC DGWATVGDKGPGNGKGTREIVQFPNGRTALFEKETTF CCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEECCCCCCC >Mature Secondary Structure ANIQEIGTKFTMSVDGMLNKFKVLEQNFDNLPKVAEKSTKRMDKAFGAIDDSLKTFDKR CCHHHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSETGKDFDTKKLQSELQKAQKEFKDTGNINKETMQSLQKEIKSVDWKSLDANSRDTFKT HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH VIRNVNSVERNMNKLNDVKFLEGLPDDAKEAGKHLLALQKDVEKTSKSLEKTDDKVDFNK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH LNSELNKAKKELQSTGKVADNTLDQINKDIKDVDFESMSMSANVAFGKVEERAEQLDRKL HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH RNVGEDVNLSNSTKNISEDIDGATGSVGGLKGAFKGLGPVIGGALATVSITEFTKKIVES HHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAEIEALNSQYEQVMGKMKNTTDKYLGEMAQKYNVHPNELKKSMLQYQAILKSKGLNEQD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH AYETSKMWLERTVDGSAFANESIEESTGRMMAVIKGEYDSADTVMINLSQTMLNDKAQEK HHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHH YGKKWEQLSVTQQEQLKVQESIRQHTSAGVLGQGVKEADSYEKNLAQLKNTWKDFLASYG HCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GPALDIANKGLKGGIKIIEGMAKGFSTIGKLIKELTGGKQVNILQKLGFSNGEANNIINW CCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH FNTLKQQLSIAGRAISDFVKDGFGKIKAFFTGPDGQQIMQAYKNIFNGLLAVVKFVMPVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYIVKDIFGNITGFLKGLFQWWKGLLQVFAGLFTGDWKKMWEGVKNLFFGAIKMIWNGVQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLFYGKLLKGGLAFAKLFAGSFKSMWKGILNLFKNFGKFIWDTSTKVSKNVIGAFKNLWT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHC GSMNIIKNLKSGLYNSWVSIKKTTVDAAVGLKDGVVGAFKNTWNGIKGWIKSIKDGVVGM CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC KDSVIETGKKMASGLKDKVVGGLNSMIDGVNWVADKLGMGKPLSKIDASKYSTGTGGHPE HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHCCCCCCCCCC DGWATVGDKGPGNGKGTREIVQFPNGRTALFEKETTF CCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA