Definition Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome.
Accession NC_011999
Length 2,102,324

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The map label for this gene is 222151182

Identifier: 222151182

GI number: 222151182

Start: 1022143

End: 1025400

Strand: Direct

Name: 222151182

Synonym: MCCL_0933

Alternate gene names: NA

Gene position: 1022143-1025400 (Clockwise)

Preceding gene: 222151181

Following gene: 222151183

Centisome position: 48.62

GC content: 39.5

Gene sequence:

>3258_bases
ATGTCAGATATAAAAGATAGTTATACGTTAGAAGCCTTGCTTACAGGCGATAACAGTCGCTTAAAGCGTGTTATTGATCA
AGCGGTCGTGATGTTAGAAAAACTTGAAAATAAAAAGGTTGACGATATTGAAATTGATGGTGATGTGAAGCCTTTACAAA
AAAAAGTTGAGAGCGCTAAACGACTTACTGAAATGCTAGACGGCAAACGAGCACAAATTGAAATTATCGCTAGAAACGCT
GAAGCAATAAAGAATCTACGTCAAGTCAGACTGAGTGCAAAACAATTATCTAAAGAACGTCCGAAAGTCGATGTAGATGT
TCAGACAGGTGCAGCAAATGCGAATATCAAACGTTTCAAAGCTATGCTTAAATCCATTCCAAACAAAGTACGTACTCGAG
TTGATGTGGATTATGACAGAAACGTATTCAAAAGAATCACATCGGGTTGGAGACAGATTCAGAATGCGAATAATAAATTT
GGCGATGATATGGACCAACTAGCGAATAGTATTCGTGCTTTTGGTACTGTCAGTGCAAATATGATAAAAGGTTCGCTAGT
GAGTTCTTTTACTGCTTTGATACCTATTGTTGCAGCACTTGTCCCAGCAATTATGGCAGTGGGTAACGCTATAGCAGTAG
TTGGTGGTGGCGCTTTAGGATTAGCAGGAGCGTTTGCAGTTGCAGGTGGTGGCGTAGCTTCATTTGGCGCTTTGGCAATA
TCAGCGTATAAGATGTATAAAGATGGCGCAATTCAAGCGAGTGATGCAACGCAGAAATTTGAAAGTTCGTTAAGTTCGTT
CAAATCAGAATGGGAAAGCCTGGCGCAGAAGAATGCTGACAGTATTTTCTCAACGATGGCGAATGGTATTAATATTGCTA
AAACAGCACTTACAGGTCTTACACCGTTTATTACAGGTGTCACAAAAAGCATAGAAGGATTATCTGCAAGTGTGCTTAAA
TGGTCACAGACAAGTGCTGTAGCGAAGAGTTTTTTTGATGTGATGAAAACGTCAGGTGTAACTGTATTTCAGGATATCAT
GAGTGCTGCAGGAAAATTTGGTAGTGGATTAATATCTTTATTTACTAGCTTTATGCCTTTATTCGAATGGGTGGCTAAAG
GTTTCTCAAATATGGGCACTCAATTCAATAACTGGTCTCAGAAAGTAAGTACAGCTGAAGGTATTAAGAATTTTATTGCT
TTCGTGCAGGAAAGCTTACCTAAAATAGGTCAGATTTTCGGCAACGTATTTGAAGGTATCTTTAATCTATTCAAAGCCTT
CGCACCTAATTCACAGACCTTATTCGATTCATTGGTGCAGATGAGTACAAAATTTGCAGAATGGAGCGCCACGATAGCAG
CATCAGATGGATTCCAGAAGTTTATCGAGTATGTGCAGACGAATGGCCCGACGATTATGAGTTTAATCGGTAGTATCGTT
ATGGCAGTAGTCAACTTTGGTATTGCAGTTGCGCCTTTGGGACAGGTGGTGTTGCAATTAGTCACTGCATTTGCTCAATG
GTTAAGTACACTATTTCAAACGAATCCTGTTGTAGCACAAATTGTAGGTGCTTTAATTAGTTTGATCGGTGTTGCAATGG
CAACTATTCCGACAATTTTAGGGATATATGATGCGTTGCAGCCTTTAATAATGAAGTTTATTGAATTTAAAGGTGAGTCC
ACTTTACTCCAAGGAGCTCTGAGGTTGTTAGGTAGTGCTTTCACTGCACTTTCAGGACCTGTATTAGCAATTATAGGTGT
TTTTGTAGCTATAGGTATGGCTATCGTAGGATTATGGCAATCTAACGAACAATTTAGAAGTAACGTATCTATTATATGGC
AAAATATACAGACAATTATAAGCGCAGTAGGTCAAGTTATTATGAATATCTTCGGACTAATTGTTTCTTCTTTAGGCATT
TTATCACAAGCATTTATGCCTGTGATCTCTGGTATTGTATCATTAGTGGCAACTATTACGACATGGATAGCATCATTTAT
AGAAGCGAATCAATGGATTATTACAGTTGTTAGCGTTATTGCAGGCCTGGTCGTTGCTTTTTTTGCAGTACAAAGTGCAA
TAGCTTTAGTAACGACAATTGTAGGAGTTTTAACTACAGCATTAGGAATATTAGGTACTATAATATCGGTTGTTGCTGGT
GTTTTCGCATTTTTGTTAACGCCTGTTGGATTAGTGGTGGCTGCGATTGGTTTAGTGATTGCTGCTGTCGTTATCTGTTA
TCAAAAATTCGAAGCCTTCAGGAATTTCTTGGCGCCATTAGTAGATTTCTTTATTGGAATCGGTGAGGGTATCAAGCAAG
GTTTAGGAAGTGCTTTGGATTGGATTTCTGAAAAATTAGGAATGACAGCAACAAAAACTGAGGAAGCAACTGGTAGGATG
GCGAATGCCACTAATATTAATACTGCTAAGATGGCTAGTGATGTTACTTCAAATAGTGCTTTGATGACTAGTGGCTTTGA
TGTGAATATGAATAGAATGAGTATGATTAACGATTCTCAATGGGCAATGATTAATGGGACTGCCACTTCTCAATCAGGTG
CAATGCAAGCTGCTGTATTAGGTAGTGTAGGTGGCATGTCTGCTCAAACAACTGGATTACTTGCAGGAATGTCAGGTAGT
GCACAGGCAGAATTTGCGAGTTTATACAGTGCTGGTTCAGGTCAAGCTAGTAGTTTAAATGCTGATGTACTATCCTCACT
TGGCGGAATGAGTAGTCAAGGTGTTGGTGATATCGCTAGTATGACATCAGGAATAAACTCTGAGTTCCAAAATATGAGTA
GCACTTCGAGCTCAGCTACTTCTAATATGAGTAGTAATGTTCAATCGAATATGAATTCTATGAGGTCGTCATTCACTTCA
GGAGCTAGTGGTATTGCTCAAGCATGGGCGAGTGCAATGCAGAGAATTACTTCAATTACTTCAAGTGGAATGAGTGCAGT
AAGAAGCGCATCTGTGTCAGGAATGCAGGCGGTGGTATCAGCATTCAGAAGTGGTGGGCAACAAGCCGTATCAGTTACAA
CATCATCTATGGCAGCTTGTGCTAGCGTAATGAGGTCAGCCTATGGACAATTTAGTTCCGCCGGTAGTTATGTTATGAGT
GGATTTATCGCCGGTATGAATAGTCAACGTGGTGCAGTAATGGCTACTGCTGCTAGTATTGCAAATGCTGCATCTGCTCA
AATTAGAAGTGCATTAAAAATTCATTCTCCTTCTCGAGTTACTATGAAAGAATGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTCCACGATGATGTCGAGAAGAAAACGAATGGTCCATCAAAGAAAAAAATAGCAGACATGTTAGCAGAAAGAAATAAA
AAGTAAAGTGAGGTGATGGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGGTTCGTCAAGGTTTCGCAATCGGTATTATGAAAAAAGTACCACAAGTTATCCAGGCTTCTAAAACTATGGCGAATAG
TGCTGTTAAAAGCATTAAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Phage Related Protein; Phage Tail Length Tape-Measure Protein; Transglycosylase Domain Protein; Phage-Related Protein-Like Protein; TMP Repeat-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 1085; Mature: 1084

Protein sequence:

>1085_residues
MSDIKDSYTLEALLTGDNSRLKRVIDQAVVMLEKLENKKVDDIEIDGDVKPLQKKVESAKRLTEMLDGKRAQIEIIARNA
EAIKNLRQVRLSAKQLSKERPKVDVDVQTGAANANIKRFKAMLKSIPNKVRTRVDVDYDRNVFKRITSGWRQIQNANNKF
GDDMDQLANSIRAFGTVSANMIKGSLVSSFTALIPIVAALVPAIMAVGNAIAVVGGGALGLAGAFAVAGGGVASFGALAI
SAYKMYKDGAIQASDATQKFESSLSSFKSEWESLAQKNADSIFSTMANGINIAKTALTGLTPFITGVTKSIEGLSASVLK
WSQTSAVAKSFFDVMKTSGVTVFQDIMSAAGKFGSGLISLFTSFMPLFEWVAKGFSNMGTQFNNWSQKVSTAEGIKNFIA
FVQESLPKIGQIFGNVFEGIFNLFKAFAPNSQTLFDSLVQMSTKFAEWSATIAASDGFQKFIEYVQTNGPTIMSLIGSIV
MAVVNFGIAVAPLGQVVLQLVTAFAQWLSTLFQTNPVVAQIVGALISLIGVAMATIPTILGIYDALQPLIMKFIEFKGES
TLLQGALRLLGSAFTALSGPVLAIIGVFVAIGMAIVGLWQSNEQFRSNVSIIWQNIQTIISAVGQVIMNIFGLIVSSLGI
LSQAFMPVISGIVSLVATITTWIASFIEANQWIITVVSVIAGLVVAFFAVQSAIALVTTIVGVLTTALGILGTIISVVAG
VFAFLLTPVGLVVAAIGLVIAAVVICYQKFEAFRNFLAPLVDFFIGIGEGIKQGLGSALDWISEKLGMTATKTEEATGRM
ANATNINTAKMASDVTSNSALMTSGFDVNMNRMSMINDSQWAMINGTATSQSGAMQAAVLGSVGGMSAQTTGLLAGMSGS
AQAEFASLYSAGSGQASSLNADVLSSLGGMSSQGVGDIASMTSGINSEFQNMSSTSSSATSNMSSNVQSNMNSMRSSFTS
GASGIAQAWASAMQRITSITSSGMSAVRSASVSGMQAVVSAFRSGGQQAVSVTTSSMAACASVMRSAYGQFSSAGSYVMS
GFIAGMNSQRGAVMATAASIANAASAQIRSALKIHSPSRVTMKEW

Sequences:

>Translated_1085_residues
MSDIKDSYTLEALLTGDNSRLKRVIDQAVVMLEKLENKKVDDIEIDGDVKPLQKKVESAKRLTEMLDGKRAQIEIIARNA
EAIKNLRQVRLSAKQLSKERPKVDVDVQTGAANANIKRFKAMLKSIPNKVRTRVDVDYDRNVFKRITSGWRQIQNANNKF
GDDMDQLANSIRAFGTVSANMIKGSLVSSFTALIPIVAALVPAIMAVGNAIAVVGGGALGLAGAFAVAGGGVASFGALAI
SAYKMYKDGAIQASDATQKFESSLSSFKSEWESLAQKNADSIFSTMANGINIAKTALTGLTPFITGVTKSIEGLSASVLK
WSQTSAVAKSFFDVMKTSGVTVFQDIMSAAGKFGSGLISLFTSFMPLFEWVAKGFSNMGTQFNNWSQKVSTAEGIKNFIA
FVQESLPKIGQIFGNVFEGIFNLFKAFAPNSQTLFDSLVQMSTKFAEWSATIAASDGFQKFIEYVQTNGPTIMSLIGSIV
MAVVNFGIAVAPLGQVVLQLVTAFAQWLSTLFQTNPVVAQIVGALISLIGVAMATIPTILGIYDALQPLIMKFIEFKGES
TLLQGALRLLGSAFTALSGPVLAIIGVFVAIGMAIVGLWQSNEQFRSNVSIIWQNIQTIISAVGQVIMNIFGLIVSSLGI
LSQAFMPVISGIVSLVATITTWIASFIEANQWIITVVSVIAGLVVAFFAVQSAIALVTTIVGVLTTALGILGTIISVVAG
VFAFLLTPVGLVVAAIGLVIAAVVICYQKFEAFRNFLAPLVDFFIGIGEGIKQGLGSALDWISEKLGMTATKTEEATGRM
ANATNINTAKMASDVTSNSALMTSGFDVNMNRMSMINDSQWAMINGTATSQSGAMQAAVLGSVGGMSAQTTGLLAGMSGS
AQAEFASLYSAGSGQASSLNADVLSSLGGMSSQGVGDIASMTSGINSEFQNMSSTSSSATSNMSSNVQSNMNSMRSSFTS
GASGIAQAWASAMQRITSITSSGMSAVRSASVSGMQAVVSAFRSGGQQAVSVTTSSMAACASVMRSAYGQFSSAGSYVMS
GFIAGMNSQRGAVMATAASIANAASAQIRSALKIHSPSRVTMKEW
>Mature_1084_residues
SDIKDSYTLEALLTGDNSRLKRVIDQAVVMLEKLENKKVDDIEIDGDVKPLQKKVESAKRLTEMLDGKRAQIEIIARNAE
AIKNLRQVRLSAKQLSKERPKVDVDVQTGAANANIKRFKAMLKSIPNKVRTRVDVDYDRNVFKRITSGWRQIQNANNKFG
DDMDQLANSIRAFGTVSANMIKGSLVSSFTALIPIVAALVPAIMAVGNAIAVVGGGALGLAGAFAVAGGGVASFGALAIS
AYKMYKDGAIQASDATQKFESSLSSFKSEWESLAQKNADSIFSTMANGINIAKTALTGLTPFITGVTKSIEGLSASVLKW
SQTSAVAKSFFDVMKTSGVTVFQDIMSAAGKFGSGLISLFTSFMPLFEWVAKGFSNMGTQFNNWSQKVSTAEGIKNFIAF
VQESLPKIGQIFGNVFEGIFNLFKAFAPNSQTLFDSLVQMSTKFAEWSATIAASDGFQKFIEYVQTNGPTIMSLIGSIVM
AVVNFGIAVAPLGQVVLQLVTAFAQWLSTLFQTNPVVAQIVGALISLIGVAMATIPTILGIYDALQPLIMKFIEFKGEST
LLQGALRLLGSAFTALSGPVLAIIGVFVAIGMAIVGLWQSNEQFRSNVSIIWQNIQTIISAVGQVIMNIFGLIVSSLGIL
SQAFMPVISGIVSLVATITTWIASFIEANQWIITVVSVIAGLVVAFFAVQSAIALVTTIVGVLTTALGILGTIISVVAGV
FAFLLTPVGLVVAAIGLVIAAVVICYQKFEAFRNFLAPLVDFFIGIGEGIKQGLGSALDWISEKLGMTATKTEEATGRMA
NATNINTAKMASDVTSNSALMTSGFDVNMNRMSMINDSQWAMINGTATSQSGAMQAAVLGSVGGMSAQTTGLLAGMSGSA
QAEFASLYSAGSGQASSLNADVLSSLGGMSSQGVGDIASMTSGINSEFQNMSSTSSSATSNMSSNVQSNMNSMRSSFTSG
ASGIAQAWASAMQRITSITSSGMSAVRSASVSGMQAVVSAFRSGGQQAVSVTTSSMAACASVMRSAYGQFSSAGSYVMSG
FIAGMNSQRGAVMATAASIANAASAQIRSALKIHSPSRVTMKEW

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 113833; Mature: 113702

Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSDIKDSYTLEALLTGDNSRLKRVIDQAVVMLEKLENKKVDDIEIDGDVKPLQKKVESAK
CCCCCCCCEEEHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHH
RLTEMLDGKRAQIEIIARNAEAIKNLRQVRLSAKQLSKERPKVDVDVQTGAANANIKRFK
HHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHH
AMLKSIPNKVRTRVDVDYDRNVFKRITSGWRQIQNANNKFGDDMDQLANSIRAFGTVSAN
HHHHHCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
SAYKMYKDGAIQASDATQKFESSLSSFKSEWESLAQKNADSIFSTMANGINIAKTALTGL
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCHHCHHHHHH
FTSFMPLFEWVAKGFSNMGTQFNNWSQKVSTAEGIKNFIAFVQESLPKIGQIFGNVFEGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
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HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH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EEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
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GASGIAQAWASAMQRITSITSSGMSAVRSASVSGMQAVVSAFRSGGQQAVSVTTSSMAAC
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHH
ASVMRSAYGQFSSAGSYVMSGFIAGMNSQRGAVMATAASIANAASAQIRSALKIHSPSRV
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
TMKEW
CCCCC
>Mature Secondary Structure 
SDIKDSYTLEALLTGDNSRLKRVIDQAVVMLEKLENKKVDDIEIDGDVKPLQKKVESAK
CCCCCCCEEEHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHH
RLTEMLDGKRAQIEIIARNAEAIKNLRQVRLSAKQLSKERPKVDVDVQTGAANANIKRFK
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HHHHHCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCHHCHHHHHH
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HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SNEQFRSNVSIIWQNIQTIISAVGQVIMNIFGLIVSSLGILSQAFMPVISGIVSLVATIT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TWIASFIEANQWIITVVSVIAGLVVAFFAVQSAIALVTTIVGVLTTALGILGTIISVVAG
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFAFLLTPVGLVVAAIGLVIAAVVICYQKFEAFRNFLAPLVDFFIGIGEGIKQGLGSALD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
WISEKLGMTATKTEEATGRMANATNINTAKMASDVTSNSALMTSGFDVNMNRMSMINDSQ
HHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHCCCCC
WAMINGTATSQSGAMQAAVLGSVGGMSAQTTGLLAGMSGSAQAEFASLYSAGSGQASSLN
EEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
ADVLSSLGGMSSQGVGDIASMTSGINSEFQNMSSTSSSATSNMSSNVQSNMNSMRSSFTS
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GASGIAQAWASAMQRITSITSSGMSAVRSASVSGMQAVVSAFRSGGQQAVSVTTSSMAAC
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHH
ASVMRSAYGQFSSAGSYVMSGFIAGMNSQRGAVMATAASIANAASAQIRSALKIHSPSRV
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
TMKEW
CCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA