| Definition | Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011999 |
| Length | 2,102,324 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is nhaK [H]
Identifier: 222150682
GI number: 222150682
Start: 456726
End: 458762
Strand: Direct
Name: nhaK [H]
Synonym: MCCL_0432
Alternate gene names: 222150682
Gene position: 456726-458762 (Clockwise)
Preceding gene: 222150681
Following gene: 222150685
Centisome position: 21.72
GC content: 36.08
Gene sequence:
>2037_bases TTGGAGAATTTTATCGTAATACTCAGTTTGGTACTTGCAGTTATCATTTCCACCGTGATTCATTTTTACATTCCTAAAGT TCCGCTCGCTTTTATCCAGATAGCTATAGGGATGCTCATTTTTTTAACACCTATTCCTCTAAATGTAGATTTTGAACCAG AACTCTTTCTAATTGGTATTATCGCACCATTACTATTTCTTGAAGGTTACACTGTATCCAGGCTTTATATGATCAAATAT TTAAAACCGATTATATTGATGGCGCTAGGCCTTGTCTTCACAACTGTAATTGGTCTGGGATACATCACACATAGTATGAT TCCATTTCTACCTATGGCGGCATGCTTTGCACTGGCCGCCATTATTTGTCCGACAGATGCAGTGGCAGTTCAGGCTATTG CACAAGATAAGAAACTCCCACGCGGGCTGATGACGATATTGGAAGGAGAGTCTTTACTGAACGACGCTGCTGGGATATTA AGTTTTAATATCGCGATTGTCGCTCTAACGACAGGTGTATTCACTATCACAGGATCGATCACGCAGTTTTTTATTTCTTC ATTAGGAGGATTATTAGTTGGTCTGTTTATTGGTCTCATCTTTGTCCAGATCAGAATTCTTCTTATCAGAAAAGGATTTG AAAATGAATATATCTATATATTAATACAGCTGCTTACACCTTTTGTTATCTACATGGCTGCTGAAAGTATTCATGTTTCA GGTATTATTGCAGCTGTAGTTGGTGGAATTATCCATGGAATTGAACGAGATAGATTATCTCAAGCGACAACACGTTTACA GCTTGGCTACAATAATACGTGGGGACTACTCTCTACTGTTCTGAATGGCCTTGTCTTTACATTGCTGGGATATTTAATCC CGCAAGTCACTCTTTCATTGATTGAACATGATGGAAAAAGTATTTTTTCAACGATCATATACACGCTTGTAATCGCATTA CTTGTTTATATTTTTAGGTTTGTATGGGTATTTGTACTATATGATAAGTTTTATATTCCAGAAAGCCGTTTTGAAAGAAT ACTCAAGCATGAAGATGTTAAAAAATATGACGTTAGACCCCACCGCTTTAAGTATGCATTGATTGCTACAGTTTGTGGTG TACATGGTACAATCTCTATGGCTATCGCATTGACGATACCTGTAGAAATTATGAATGGTGAGTACTTTAACTATCGCGAT AATTTACTATTTATCACGGCAGGTGTGGTGGTGATTAGTTTAGTTGTTGCACAAATTTTCTTACCACTATTAACACCAAA AATAGAAGATGATAATGTAGATTCCCACCTTAATTTCAAAGAGGCATATATACTGATCAAAGAATTTGGGATGAAATATA TTCATAAGCAAACTACACCTGAAAACAGTATGATCGCAGGAAATCTTATACGCCAGTATACGATGCAAATCGGTTTTTAT AGTGAAGTAAACGACAGAGATTATAATCCGAAAGAGTTTGATAGGTTACATACAATTGCTTTAGAAACAGAGATGAAGAC GCTCGATGAACTAGTAGAAAATGATGAGATTACACAAAGTGCGTTCAATAACTACGTTCAGTATATTGAAAGAACAAAGA TATTCGCCTCGACCAGTTTCTTTAGAAGGATACTATTTTTAATTCGCATGCATGGTAGGCGCAAAGCATTCGAAAATAGA TTGAACCAGTCGAGTTCTCTATCGCTAAAAAATAGTCTGTTAGAAATTCAAAAAATTGCATCACGTGTACACTATAACGT CGTGCAACGATTGTCCGAAGAAGTAAGTAGAAAGAATCGGATAGAAGTTGCGCTTATTTCAGATAATTATTTGAATCGGG TAAATCAGATTAAGAGAAATGCCACAAATGAAACAATTGATGATGATGAGACTTTGTTTGCCCTTGATGTATTAGCAGTT GAAAAAGATATGGTGGCAAAGCTTGTGAAAAAAGATAAGGTCAGTCGTAAAGTAGCAGTTGAGCTAAGACAAGCTTTGAA CTATGATGAAATGATGTTATTAGATACAGAGGATTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GCGGGCTGTATCTATTTTATACAGCCTGCTTATTTTTTGAAGAATATTTACAAATTTGAATCATTATTAGCATCAAATAT AAATATTGGAGTGGTCAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAAATATCAAGATAAGAAAATAAATAAGAAGGAGCCTGAAATGATATGCTTTCAGGCTCCTTCTTATTCATTCTTATAA AAGTGTCACGCATTTAAGGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 678; Mature: 678
Protein sequence:
>678_residues MENFIVILSLVLAVIISTVIHFYIPKVPLAFIQIAIGMLIFLTPIPLNVDFEPELFLIGIIAPLLFLEGYTVSRLYMIKY LKPIILMALGLVFTTVIGLGYITHSMIPFLPMAACFALAAIICPTDAVAVQAIAQDKKLPRGLMTILEGESLLNDAAGIL SFNIAIVALTTGVFTITGSITQFFISSLGGLLVGLFIGLIFVQIRILLIRKGFENEYIYILIQLLTPFVIYMAAESIHVS GIIAAVVGGIIHGIERDRLSQATTRLQLGYNNTWGLLSTVLNGLVFTLLGYLIPQVTLSLIEHDGKSIFSTIIYTLVIAL LVYIFRFVWVFVLYDKFYIPESRFERILKHEDVKKYDVRPHRFKYALIATVCGVHGTISMAIALTIPVEIMNGEYFNYRD NLLFITAGVVVISLVVAQIFLPLLTPKIEDDNVDSHLNFKEAYILIKEFGMKYIHKQTTPENSMIAGNLIRQYTMQIGFY SEVNDRDYNPKEFDRLHTIALETEMKTLDELVENDEITQSAFNNYVQYIERTKIFASTSFFRRILFLIRMHGRRKAFENR LNQSSSLSLKNSLLEIQKIASRVHYNVVQRLSEEVSRKNRIEVALISDNYLNRVNQIKRNATNETIDDDETLFALDVLAV EKDMVAKLVKKDKVSRKVAVELRQALNYDEMMLLDTED
Sequences:
>Translated_678_residues MENFIVILSLVLAVIISTVIHFYIPKVPLAFIQIAIGMLIFLTPIPLNVDFEPELFLIGIIAPLLFLEGYTVSRLYMIKY LKPIILMALGLVFTTVIGLGYITHSMIPFLPMAACFALAAIICPTDAVAVQAIAQDKKLPRGLMTILEGESLLNDAAGIL SFNIAIVALTTGVFTITGSITQFFISSLGGLLVGLFIGLIFVQIRILLIRKGFENEYIYILIQLLTPFVIYMAAESIHVS GIIAAVVGGIIHGIERDRLSQATTRLQLGYNNTWGLLSTVLNGLVFTLLGYLIPQVTLSLIEHDGKSIFSTIIYTLVIAL LVYIFRFVWVFVLYDKFYIPESRFERILKHEDVKKYDVRPHRFKYALIATVCGVHGTISMAIALTIPVEIMNGEYFNYRD NLLFITAGVVVISLVVAQIFLPLLTPKIEDDNVDSHLNFKEAYILIKEFGMKYIHKQTTPENSMIAGNLIRQYTMQIGFY SEVNDRDYNPKEFDRLHTIALETEMKTLDELVENDEITQSAFNNYVQYIERTKIFASTSFFRRILFLIRMHGRRKAFENR LNQSSSLSLKNSLLEIQKIASRVHYNVVQRLSEEVSRKNRIEVALISDNYLNRVNQIKRNATNETIDDDETLFALDVLAV EKDMVAKLVKKDKVSRKVAVELRQALNYDEMMLLDTED >Mature_678_residues MENFIVILSLVLAVIISTVIHFYIPKVPLAFIQIAIGMLIFLTPIPLNVDFEPELFLIGIIAPLLFLEGYTVSRLYMIKY LKPIILMALGLVFTTVIGLGYITHSMIPFLPMAACFALAAIICPTDAVAVQAIAQDKKLPRGLMTILEGESLLNDAAGIL SFNIAIVALTTGVFTITGSITQFFISSLGGLLVGLFIGLIFVQIRILLIRKGFENEYIYILIQLLTPFVIYMAAESIHVS GIIAAVVGGIIHGIERDRLSQATTRLQLGYNNTWGLLSTVLNGLVFTLLGYLIPQVTLSLIEHDGKSIFSTIIYTLVIAL LVYIFRFVWVFVLYDKFYIPESRFERILKHEDVKKYDVRPHRFKYALIATVCGVHGTISMAIALTIPVEIMNGEYFNYRD NLLFITAGVVVISLVVAQIFLPLLTPKIEDDNVDSHLNFKEAYILIKEFGMKYIHKQTTPENSMIAGNLIRQYTMQIGFY SEVNDRDYNPKEFDRLHTIALETEMKTLDELVENDEITQSAFNNYVQYIERTKIFASTSFFRRILFLIRMHGRRKAFENR LNQSSSLSLKNSLLEIQKIASRVHYNVVQRLSEEVSRKNRIEVALISDNYLNRVNQIKRNATNETIDDDETLFALDVLAV EKDMVAKLVKKDKVSRKVAVELRQALNYDEMMLLDTED
Specific function: Transporter involved in the efflux of sodium, potassium, lithium and rubidium [H]
COG id: COG0025
COG function: function code P; NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family. Nhak (TC 2.A.36.3.2) subfamily [H]
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI15529998, Length=438, Percent_Identity=23.5159817351598, Blast_Score=70, Evalue=7e-12, Organism=Escherichia coli, GI1790501, Length=556, Percent_Identity=32.7338129496403, Blast_Score=233, Evalue=2e-62, Organism=Caenorhabditis elegans, GI71993590, Length=270, Percent_Identity=29.2592592592593, Blast_Score=67, Evalue=4e-11, Organism=Caenorhabditis elegans, GI71993582, Length=270, Percent_Identity=29.2592592592593, Blast_Score=67, Evalue=4e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR006153 - InterPro: IPR018422 - InterPro: IPR018417 - InterPro: IPR004705 - InterPro: IPR002014 [H]
Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76883; Mature: 76883
Theoretical pI: Translated: 6.71; Mature: 6.71
Prosite motif: PS00589 PTS_HPR_SER
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MENFIVILSLVLAVIISTVIHFYIPKVPLAFIQIAIGMLIFLTPIPLNVDFEPELFLIGI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH IAPLLFLEGYTVSRLYMIKYLKPIILMALGLVFTTVIGLGYITHSMIPFLPMAACFALAA HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IICPTDAVAVQAIAQDKKLPRGLMTILEGESLLNDAAGILSFNIAIVALTTGVFTITGSI HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TQFFISSLGGLLVGLFIGLIFVQIRILLIRKGFENEYIYILIQLLTPFVIYMAAESIHVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIIAAVVGGIIHGIERDRLSQATTRLQLGYNNTWGLLSTVLNGLVFTLLGYLIPQVTLSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEHDGKSIFSTIIYTLVIALLVYIFRFVWVFVLYDKFYIPESRFERILKHEDVKKYDVRP HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHCCCCC HRFKYALIATVCGVHGTISMAIALTIPVEIMNGEYFNYRDNLLFITAGVVVISLVVAQIF HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEEEEEEEECCCEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH LPLLTPKIEDDNVDSHLNFKEAYILIKEFGMKYIHKQTTPENSMIAGNLIRQYTMQIGFY HHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCE SEVNDRDYNPKEFDRLHTIALETEMKTLDELVENDEITQSAFNNYVQYIERTKIFASTSF ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FRRILFLIRMHGRRKAFENRLNQSSSLSLKNSLLEIQKIASRVHYNVVQRLSEEVSRKNR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC IEVALISDNYLNRVNQIKRNATNETIDDDETLFALDVLAVEKDMVAKLVKKDKVSRKVAV EEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELRQALNYDEMMLLDTED HHHHHCCCCCEEEEECCC >Mature Secondary Structure MENFIVILSLVLAVIISTVIHFYIPKVPLAFIQIAIGMLIFLTPIPLNVDFEPELFLIGI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH IAPLLFLEGYTVSRLYMIKYLKPIILMALGLVFTTVIGLGYITHSMIPFLPMAACFALAA HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IICPTDAVAVQAIAQDKKLPRGLMTILEGESLLNDAAGILSFNIAIVALTTGVFTITGSI HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TQFFISSLGGLLVGLFIGLIFVQIRILLIRKGFENEYIYILIQLLTPFVIYMAAESIHVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GIIAAVVGGIIHGIERDRLSQATTRLQLGYNNTWGLLSTVLNGLVFTLLGYLIPQVTLSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEHDGKSIFSTIIYTLVIALLVYIFRFVWVFVLYDKFYIPESRFERILKHEDVKKYDVRP HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHCCCCC HRFKYALIATVCGVHGTISMAIALTIPVEIMNGEYFNYRDNLLFITAGVVVISLVVAQIF HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEEEEEEEECCCEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH LPLLTPKIEDDNVDSHLNFKEAYILIKEFGMKYIHKQTTPENSMIAGNLIRQYTMQIGFY HHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCE SEVNDRDYNPKEFDRLHTIALETEMKTLDELVENDEITQSAFNNYVQYIERTKIFASTSF ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FRRILFLIRMHGRRKAFENRLNQSSSLSLKNSLLEIQKIASRVHYNVVQRLSEEVSRKNR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC IEVALISDNYLNRVNQIKRNATNETIDDDETLFALDVLAVEKDMVAKLVKKDKVSRKVAV EEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELRQALNYDEMMLLDTED HHHHHCCCCCEEEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA