Definition Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome.
Accession NC_011999
Length 2,102,324

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The map label for this gene is 222150553

Identifier: 222150553

GI number: 222150553

Start: 310140

End: 311471

Strand: Direct

Name: 222150553

Synonym: MCCL_0303

Alternate gene names: NA

Gene position: 310140-311471 (Clockwise)

Preceding gene: 222150552

Following gene: 222150556

Centisome position: 14.75

GC content: 37.99

Gene sequence:

>1332_bases
ATGGGGAAGGTGGGACATTTTAAATTTATTATTCCTAGTCTCATCGGAATATTCTTATTTTTAACGCCACTCAATGTTGA
AGGTAAGACGAGTTTGCCCGTTGCAGTTTTAGCAAAGTGGCTGTTATCGATCCTCGGTAATTTCACACCAACTTTAATCT
TCATCGTTATTATTCTTTCTACGTTACTAACATTTTACTTTAGTTTCATTAATCATCCAAAGACGAGTTATTTCAAACAA
CTGTTTGAGGTGAACTGGATCTGGTTTATCATTCGTCTTATTGGTGCTATTTTTGCAACCATTGTTTATTTTAAGATGAA
GATCCCATTTGTTGATACTGAAAATACAGGGCAGCTTATATATAGTGAATTATTGCCGACATTGATCGCTGTATTTTTCT
TTGCAGGCTTATTTCTGCCATTTTTAATGGACTATGGATTACTGGAATTTCTTGGACCGATATTCTCTAAGGTGATGCGC
CCACTCTTTACATTACCTGGACGCTCTGCAGTGGATAATTTAGCTTCATTTATTGGAGATGGCACTGTAGGCGTTATGAT
CACATCTAGACAATACGAAGGAAACTTCTTTACGAGACGTGAAGCAACAGTTATTGCGACAAGTTTCTCCGTTGTGTCAA
TCACGTTTGCGATTGTTGTTTGTGAACAGATTGGACTAATGAATCACTTCTTCTATTTCTATGGAACTGTTATTGTGTCA
TGTTTGGTTGCAGCGATGATTATGCCGCGTATTTGGCCGTTGTCGAAGATTCCGGACCATTATGCTGATGGAACAACTGA
AATTAAAGATGAAGAGATTCCTGATAATCATAATGTCCTCAGCTACGGATACGAAAATGCGACTAGAACAGCGATTAAAG
CACCCGGATTTAAAACATTCTGGTATCAAGGATTTAAAACAATAGGAGATATGTGGTTTGCGGTACTGCCAGTCGTAATG
TGTATCGGTACAGCAGCAACAATCATTGCTGAGTATACACCGTTCTTCCAGTGGATTGGAATGCCGTTCGTACCTTTGTT
AGAATTGCTCCAGATTCCTGATGCAGTTACAGCATCTCAGACGATATTGATTGGATTTGCAGATATGTTCTTACCTTCGA
TACTTATAACAGATTCTGAATATGATCTTACACGTTTTGTTATTGGTGCGTTAAGTATCTCTCAGCTGATCTATTTATCA
GAAGTAGGTGGTGTTATATTAGGCTCTAAAATACCGGTAAGCTTACCTAAGCTGTTTGTCATCTTCTTGATGAGAACGAT
CATCTGTTTACCGATTATCGTGCTAATGGGACATCTACTATTTAGCGTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTCTTCTTTTCGTACACTATCTTATATGCTAAAATGAATAAATATTAATTTTTACGTATAAAAAATGGAGGGTATTATG
ATGCATTCTGATCAGACAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAGTCGTGACACGAGCGTTTAGACACGAGTAAAATCGCGAAAAGAGGACAGGGAATGCTTTATTTCCTGTCCTCTTTT
CGTTATATAGTTCTCTTAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF A [H]

Number of amino acids: Translated: 443; Mature: 442

Protein sequence:

>443_residues
MGKVGHFKFIIPSLIGIFLFLTPLNVEGKTSLPVAVLAKWLLSILGNFTPTLIFIVIILSTLLTFYFSFINHPKTSYFKQ
LFEVNWIWFIIRLIGAIFATIVYFKMKIPFVDTENTGQLIYSELLPTLIAVFFFAGLFLPFLMDYGLLEFLGPIFSKVMR
PLFTLPGRSAVDNLASFIGDGTVGVMITSRQYEGNFFTRREATVIATSFSVVSITFAIVVCEQIGLMNHFFYFYGTVIVS
CLVAAMIMPRIWPLSKIPDHYADGTTEIKDEEIPDNHNVLSYGYENATRTAIKAPGFKTFWYQGFKTIGDMWFAVLPVVM
CIGTAATIIAEYTPFFQWIGMPFVPLLELLQIPDAVTASQTILIGFADMFLPSILITDSEYDLTRFVIGALSISQLIYLS
EVGGVILGSKIPVSLPKLFVIFLMRTIICLPIIVLMGHLLFSV

Sequences:

>Translated_443_residues
MGKVGHFKFIIPSLIGIFLFLTPLNVEGKTSLPVAVLAKWLLSILGNFTPTLIFIVIILSTLLTFYFSFINHPKTSYFKQ
LFEVNWIWFIIRLIGAIFATIVYFKMKIPFVDTENTGQLIYSELLPTLIAVFFFAGLFLPFLMDYGLLEFLGPIFSKVMR
PLFTLPGRSAVDNLASFIGDGTVGVMITSRQYEGNFFTRREATVIATSFSVVSITFAIVVCEQIGLMNHFFYFYGTVIVS
CLVAAMIMPRIWPLSKIPDHYADGTTEIKDEEIPDNHNVLSYGYENATRTAIKAPGFKTFWYQGFKTIGDMWFAVLPVVM
CIGTAATIIAEYTPFFQWIGMPFVPLLELLQIPDAVTASQTILIGFADMFLPSILITDSEYDLTRFVIGALSISQLIYLS
EVGGVILGSKIPVSLPKLFVIFLMRTIICLPIIVLMGHLLFSV
>Mature_442_residues
GKVGHFKFIIPSLIGIFLFLTPLNVEGKTSLPVAVLAKWLLSILGNFTPTLIFIVIILSTLLTFYFSFINHPKTSYFKQL
FEVNWIWFIIRLIGAIFATIVYFKMKIPFVDTENTGQLIYSELLPTLIAVFFFAGLFLPFLMDYGLLEFLGPIFSKVMRP
LFTLPGRSAVDNLASFIGDGTVGVMITSRQYEGNFFTRREATVIATSFSVVSITFAIVVCEQIGLMNHFFYFYGTVIVSC
LVAAMIMPRIWPLSKIPDHYADGTTEIKDEEIPDNHNVLSYGYENATRTAIKAPGFKTFWYQGFKTIGDMWFAVLPVVMC
IGTAATIIAEYTPFFQWIGMPFVPLLELLQIPDAVTASQTILIGFADMFLPSILITDSEYDLTRFVIGALSISQLIYLSE
VGGVILGSKIPVSLPKLFVIFLMRTIICLPIIVLMGHLLFSV

Specific function: Unknown

COG id: COG3314

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011642 [H]

Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49670; Mature: 49539

Theoretical pI: Translated: 6.51; Mature: 6.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGKVGHFKFIIPSLIGIFLFLTPLNVEGKTSLPVAVLAKWLLSILGNFTPTLIFIVIILS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
TLLTFYFSFINHPKTSYFKQLFEVNWIWFIIRLIGAIFATIVYFKMKIPFVDTENTGQLI
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCHHHH
YSELLPTLIAVFFFAGLFLPFLMDYGLLEFLGPIFSKVMRPLFTLPGRSAVDNLASFIGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCC
GTVGVMITSRQYEGNFFTRREATVIATSFSVVSITFAIVVCEQIGLMNHFFYFYGTVIVS
CCEEEEEEEEECCCCEEECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CLVAAMIMPRIWPLSKIPDHYADGTTEIKDEEIPDNHNVLSYGYENATRTAIKAPGFKTF
HHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCHHH
WYQGFKTIGDMWFAVLPVVMCIGTAATIIAEYTPFFQWIGMPFVPLLELLQIPDAVTASQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCH
TILIGFADMFLPSILITDSEYDLTRFVIGALSISQLIYLSEVGGVILGSKIPVSLPKLFV
HHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCHHHHHHH
IFLMRTIICLPIIVLMGHLLFSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
GKVGHFKFIIPSLIGIFLFLTPLNVEGKTSLPVAVLAKWLLSILGNFTPTLIFIVIILS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
TLLTFYFSFINHPKTSYFKQLFEVNWIWFIIRLIGAIFATIVYFKMKIPFVDTENTGQLI
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCHHHH
YSELLPTLIAVFFFAGLFLPFLMDYGLLEFLGPIFSKVMRPLFTLPGRSAVDNLASFIGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCC
GTVGVMITSRQYEGNFFTRREATVIATSFSVVSITFAIVVCEQIGLMNHFFYFYGTVIVS
CCEEEEEEEEECCCCEEECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CLVAAMIMPRIWPLSKIPDHYADGTTEIKDEEIPDNHNVLSYGYENATRTAIKAPGFKTF
HHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCHHH
WYQGFKTIGDMWFAVLPVVMCIGTAATIIAEYTPFFQWIGMPFVPLLELLQIPDAVTASQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCH
TILIGFADMFLPSILITDSEYDLTRFVIGALSISQLIYLSEVGGVILGSKIPVSLPKLFV
HHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCHHHHHHH
IFLMRTIICLPIIVLMGHLLFSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA