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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 222096113

GI number: 222096113

Start: 2415576

End: 2416862

Strand: Reverse

Name: yfiS [H]

Synonym: BCQ_2453

Alternate gene names: 222096113

Gene position: 2416862-2415576 (Counterclockwise)

Preceding gene: 222096121

Following gene: 222096097

Centisome position: 46.35

GC content: 34.5

Gene sequence:

>1287_bases
ATGACAAGTATTGGACGAATTATTTTCAAATTTCTCTATAATAAAGGTGGTATAAACAGTGTGAAACTTATGCAAGAACG
TAGCCTTACCGTAAAGACAACTTTTACTAAAGAATACAAGATTTTTATTTTGGGTTTACTCATTTCACGAATTGGGGACT
CATTGTATACTTTTGCGTTACCTTGGATTGCCTATCAACTAACCGGTTCAGCTGTAATTATGAGTTCTTTATTTGCTATT
AACGTATTGCCAATCGTTTTATTTGGCCCTTTAGTTGGTGTAATAATTGATCGTTATGATCGAAAAAAGTTACTTTTGGT
AGCGGATATTACTAATATTATTTTAGTAAGTCTTGTTCCAATACTACATTCATTACATCTATTACAAATCTGGCATTTAT
ACATAATTACTTTTATGTTAGCAGTTATGTCCATGCTTTTTGATGTAACAACTGTTACAGTCATTCCGCAAATTGCTGGA
GCATCCTTAACGAAGGCCAATTCTTTCTATCAAATGGTTAATCAATTGGCTAGTTTATTTGGTCCAATGATAGCTGGGGT
TTTCATTTCTTTTATTGGTGGCTTTCAGATGCTTTGGATTAATGTTCTTTCATTTATTGCAACATTAATTGCTGTGATAT
TATTACCGTCTATGAAAACCGTAAACAAGAAATGCCAAGATAAAAATACACTTCAAAATGTACTAGCTGATTTGGTTAAT
GGATGTAAATGGCTCAAAAATGACCGTTTAAATTTAGCTTTATCTTTTCAAGCTATGATTGGAAACTTTGGAGCAAGTGC
GGTTTTAGGTGTGTTCATGTATTATTTACTATCCACATTGCAACTTACGCCCGAACAAAGTGGCTTTAATTATTTACTAA
TTGGAATAGGCGGGCTCTTAGGAAGCTTGATTGCAGTTCCTTTAGAAAAGAGATTGCAACGCGGTCTTCTAATTCCATTA
CTCCTATTTGTTGGAGCAATTGGCTTAACTTTTGCGCTTTGGAGTAGATATTGGCTTGCTCCCGGAATTGCTTTCGGTAT
TGCAATGACTTGCAATATTGCATGGAATACAATTGTAGCCACCGTTCGCCAGGAAACAGTTCCATCAAATATGCAAGGGA
GAGTTTTAGGGTTTTCACGTGTACTTACACGATTAGCTATGCCACTTGGAGCGTTAGTAGGAGGTATTATTTCAGCTTAT
AATCCTGTCTTTGTATTTGCTTTAGCTGCTTTTACTAAATTAATTGAAGTCTTTATTGCTTTATATAGTCCGATACGAAA
ACTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTATTTAAAACAGTACAGACTTTTACATTCTTCATTTTTATTTCCTCCTTAAAATACATGTAAAAAGTAGGATTAACCAA
AAAATTAAAGAATTCTATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGAAGGAAAGATAACTATGATTGGTTAATTGCAATTATGGATAAGTTTATAAAGAAAAAGGCATATTATAATGCCTTTT
TTCTTTACAATCATTTAACT

Product: macrolide-efflux protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 428; Mature: 427

Protein sequence:

>428_residues
MTSIGRIIFKFLYNKGGINSVKLMQERSLTVKTTFTKEYKIFILGLLISRIGDSLYTFALPWIAYQLTGSAVIMSSLFAI
NVLPIVLFGPLVGVIIDRYDRKKLLLVADITNIILVSLVPILHSLHLLQIWHLYIITFMLAVMSMLFDVTTVTVIPQIAG
ASLTKANSFYQMVNQLASLFGPMIAGVFISFIGGFQMLWINVLSFIATLIAVILLPSMKTVNKKCQDKNTLQNVLADLVN
GCKWLKNDRLNLALSFQAMIGNFGASAVLGVFMYYLLSTLQLTPEQSGFNYLLIGIGGLLGSLIAVPLEKRLQRGLLIPL
LLFVGAIGLTFALWSRYWLAPGIAFGIAMTCNIAWNTIVATVRQETVPSNMQGRVLGFSRVLTRLAMPLGALVGGIISAY
NPVFVFALAAFTKLIEVFIALYSPIRKL

Sequences:

>Translated_428_residues
MTSIGRIIFKFLYNKGGINSVKLMQERSLTVKTTFTKEYKIFILGLLISRIGDSLYTFALPWIAYQLTGSAVIMSSLFAI
NVLPIVLFGPLVGVIIDRYDRKKLLLVADITNIILVSLVPILHSLHLLQIWHLYIITFMLAVMSMLFDVTTVTVIPQIAG
ASLTKANSFYQMVNQLASLFGPMIAGVFISFIGGFQMLWINVLSFIATLIAVILLPSMKTVNKKCQDKNTLQNVLADLVN
GCKWLKNDRLNLALSFQAMIGNFGASAVLGVFMYYLLSTLQLTPEQSGFNYLLIGIGGLLGSLIAVPLEKRLQRGLLIPL
LLFVGAIGLTFALWSRYWLAPGIAFGIAMTCNIAWNTIVATVRQETVPSNMQGRVLGFSRVLTRLAMPLGALVGGIISAY
NPVFVFALAAFTKLIEVFIALYSPIRKL
>Mature_427_residues
TSIGRIIFKFLYNKGGINSVKLMQERSLTVKTTFTKEYKIFILGLLISRIGDSLYTFALPWIAYQLTGSAVIMSSLFAIN
VLPIVLFGPLVGVIIDRYDRKKLLLVADITNIILVSLVPILHSLHLLQIWHLYIITFMLAVMSMLFDVTTVTVIPQIAGA
SLTKANSFYQMVNQLASLFGPMIAGVFISFIGGFQMLWINVLSFIATLIAVILLPSMKTVNKKCQDKNTLQNVLADLVNG
CKWLKNDRLNLALSFQAMIGNFGASAVLGVFMYYLLSTLQLTPEQSGFNYLLIGIGGLLGSLIAVPLEKRLQRGLLIPLL
LFVGAIGLTFALWSRYWLAPGIAFGIAMTCNIAWNTIVATVRQETVPSNMQGRVLGFSRVLTRLAMPLGALVGGIISAYN
PVFVFALAAFTKLIEVFIALYSPIRKL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47163; Mature: 47031

Theoretical pI: Translated: 10.41; Mature: 10.41

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TSIGRIIFKFLYNKGGINSVKLMQERSLTVKTTFTKEYKIFILGLLISRIGDSLYTFAL
CHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
PWIAYQLTGSAVIMSSLFAINVLPIVLFGPLVGVIIDRYDRKKLLLVADITNIILVSLVP
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHH
ILHSLHLLQIWHLYIITFMLAVMSMLFDVTTVTVIPQIAGASLTKANSFYQMVNQLASLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GPMIAGVFISFIGGFQMLWINVLSFIATLIAVILLPSMKTVNKKCQDKNTLQNVLADLVN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
GCKWLKNDRLNLALSFQAMIGNFGASAVLGVFMYYLLSTLQLTPEQSGFNYLLIGIGGLL
HHHHHCCCCCEEEEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHHHHH
GSLIAVPLEKRLQRGLLIPLLLFVGAIGLTFALWSRYWLAPGIAFGIAMTCNIAWNTIVA
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TVRQETVPSNMQGRVLGFSRVLTRLAMPLGALVGGIISAYNPVFVFALAAFTKLIEVFIA
HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYSPIRKL
HHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]