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The map label for this gene is csaA [H]

Identifier: 222094633

GI number: 222094633

Start: 956935

End: 958308

Strand: Direct

Name: csaA [H]

Synonym: BCQ_0971

Alternate gene names: 222094633

Gene position: 956935-958308 (Clockwise)

Preceding gene: 222094630

Following gene: 222094634

Centisome position: 18.35

GC content: 35.23

Gene sequence:

>1374_bases
ATGATAGCTTTAACTTTATCAGTAGCGGGAGTACCGCTAGCTATATCAAAATTAATCGCTGAACTTCATGAGAAGAATGA
CGAGAACGGAATTGCCAAACTATTTACTTCAGCATCTATTATTGGAGTAATATTTGGAGTGCTTGGATTTTCAGTTATTA
TGATTGGATCAAGTATGTTTGCAAATATGCTTGGTGGACAAGATACAAGACTTCCATTAATCGTAACTTCGTTTGCGTTA
TTAATCGCACCATATATGGCGGTATATCGAGGATATTTCCAAGGTTTTGGAGATATGATTCCTACCGGGGTGTCACAAGT
AATTGAGCAGTTCATTCGTGTTTTCTTTATGTTAGCAATTGCATTTTTATTTGTATATTGGAATAAAGAGAGTGATGTTG
TAACAGGCGGCGCAATGATTGGTTCTTGCCTTGGAGTAATTACGTCACTTATCTATTTGAGAATGAAGTATGTAAAAAGT
ATATATCGTTATAAAAGTAATACATATTCACTACAAGATTTTAAAGATAATGCAAAAAAGATACTTCAGGTCTCGATTCC
AATTGCAGTTGGAGCATTATCGATGCCGGTGTTAAATTTAGTTGATTCTGTAACGATTCCACATATGTTGCATGAATCCA
CTACAACGATTCAAGAACAATTTGGTATATATAGTCGTGGATTTGCGTTTACACAATTAATTGTCGTGTTTGCAAGTGCG
ATGGTATTTCCGTTAATCCCGTTGTTAACGGCTGCATTAACAAAGAAGGATGTAGCGTTAGCAAAACAAACAATTGAACG
AACAAATGAGCTTGCCCATGTTTTAACAACGCCGATAACAATCTGGCTCATGGCACTTGCAGTCCCGTTAAATGTTGGAT
TGTTTACAGATGCGAAAGGGAGCGGAATGTTAGCTATTTTAATTGGTAGTTCGTATTTCACATCACTTATGGTATTATCA
ATAGGAATTTTGCAAGGAATTAACCGTTCTAAGCAAGCGGCGTGGATAGTTGTTGGAGCGAGTTTTGTAAAAGTCATATT
AAATATAGTACTTGTAAGTCAATTTGGCATAACTGGTGCGGCTTATAGTACACTTATCATATATATCATGATTTGTATCG
TAAACTATATATACATTCGAAAAGAATTGGCTTATTCAATTCACATGGGGAGATTTTTTGCTGTAATTGGGGTATCTAGT
ATAGTAGGTATAGGATTATATTTCACATCTACTTTCATAAATGTGGTAGATTCTAGACTTATTGCAATAATATATAGCGG
TGTAGCGTTTTGTGTGGCCTTGTTCATATATGGCATATGCGCATTAAAGTTGAACTGGATATCCAAAAAGCAAATCCCAT
TTTTACGTAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTCTATCGAAAGTGTTGGGAAGTTTTTTTCAAATCCCATTACAAAATATAGCAGGAGATGAAGTACTGGGGATTTTTC
GCCTTGTTTTTCCTGTGTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAGTCCATAAATGAGTATGGCTATTTGTATGTTTGTGAAAGAAATCAATTTAAAGTTATCCAACTTTTCTTATTAAAG
AGTTGATAGCGATTTGTTGA

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 457; Mature: 457

Protein sequence:

>457_residues
MIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDENGIAKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMFANMLGGQDTRLPLIVTSFAL
LIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQFIRVFFMLAIAFLFVYWNKESDVVTGGAMIGSCLGVITSLIYLRMKYVKS
IYRYKSNTYSLQDFKDNAKKILQVSIPIAVGALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASA
MVFPLIPLLTAALTKKDVALAKQTIERTNELAHVLTTPITIWLMALAVPLNVGLFTDAKGSGMLAILIGSSYFTSLMVLS
IGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVLVSQFGITGAAYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIGVSS
IVGIGLYFTSTFINVVDSRLIAIIYSGVAFCVALFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK

Sequences:

>Translated_457_residues
MIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDENGIAKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMFANMLGGQDTRLPLIVTSFAL
LIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQFIRVFFMLAIAFLFVYWNKESDVVTGGAMIGSCLGVITSLIYLRMKYVKS
IYRYKSNTYSLQDFKDNAKKILQVSIPIAVGALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASA
MVFPLIPLLTAALTKKDVALAKQTIERTNELAHVLTTPITIWLMALAVPLNVGLFTDAKGSGMLAILIGSSYFTSLMVLS
IGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVLVSQFGITGAAYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIGVSS
IVGIGLYFTSTFINVVDSRLIAIIYSGVAFCVALFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK
>Mature_457_residues
MIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDENGIAKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMFANMLGGQDTRLPLIVTSFAL
LIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQFIRVFFMLAIAFLFVYWNKESDVVTGGAMIGSCLGVITSLIYLRMKYVKS
IYRYKSNTYSLQDFKDNAKKILQVSIPIAVGALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASA
MVFPLIPLLTAALTKKDVALAKQTIERTNELAHVLTTPITIWLMALAVPLNVGLFTDAKGSGMLAILIGSSYFTSLMVLS
IGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVLVSQFGITGAAYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIGVSS
IVGIGLYFTSTFINVVDSRLIAIIYSGVAFCVALFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49973; Mature: 49973

Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDENGIAKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMF
CEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANMLGGQDTRLPLIVTSFALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQFIRVFFMLAI
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLFVYWNKESDVVTGGAMIGSCLGVITSLIYLRMKYVKSIYRYKSNTYSLQDFKDNAKK
HHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
ILQVSIPIAVGALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASA
HHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHH
MVFPLIPLLTAALTKKDVALAKQTIERTNELAHVLTTPITIWLMALAVPLNVGLFTDAKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCC
SGMLAILIGSSYFTSLMVLSIGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVLVSQFGITGA
CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
AYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIGVSSIVGIGLYFTSTFINVVDSRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAIIYSGVAFCVALFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIALTLSVAGVPLAISKLIAELHEKNDENGIAKLFTSASIIGVIFGVLGFSVIMIGSSMF
CEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANMLGGQDTRLPLIVTSFALLIAPYMAVYRGYFQGFGDMIPTGVSQVIEQFIRVFFMLAI
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLFVYWNKESDVVTGGAMIGSCLGVITSLIYLRMKYVKSIYRYKSNTYSLQDFKDNAKK
HHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
ILQVSIPIAVGALSMPVLNLVDSVTIPHMLHESTTTIQEQFGIYSRGFAFTQLIVVFASA
HHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHH
MVFPLIPLLTAALTKKDVALAKQTIERTNELAHVLTTPITIWLMALAVPLNVGLFTDAKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCC
SGMLAILIGSSYFTSLMVLSIGILQGINRSKQAAWIVVGASFVKVILNIVLVSQFGITGA
CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
AYSTLIIYIMICIVNYIYIRKELAYSIHMGRFFAVIGVSSIVGIGLYFTSTFINVVDSRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAIIYSGVAFCVALFIYGICALKLNWISKKQIPFLRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 9384377 [H]