| Definition | Streptococcus pneumoniae ATCC 700669, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011900 |
| Length | 2,221,315 |
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The map label for this gene is 221232121
Identifier: 221232121
GI number: 221232121
Start: 1316333
End: 1317967
Strand: Reverse
Name: 221232121
Synonym: SPN23F_13450
Alternate gene names: NA
Gene position: 1317967-1316333 (Counterclockwise)
Preceding gene: 221232122
Following gene: 221232120
Centisome position: 59.33
GC content: 39.69
Gene sequence:
>1635_bases ATGCGTCTCAAGGTCATTAAAAAATTAGTTGATATCAATATCCTCTATTCATCTCAAGAAGCTAATCTGGCTAATCTACG AAAGAAGCAGGCTAAGAATCCTGGGAAAAAAGTAAATGTTTCTGCTAGAGTCCTAAGTTCTTACATTTTTTCCAGTCTCT TGATGCTCATCTGTTTTAGTAATATAGCCATTCATTTTCCTTTTGAGGAAATGCCTATTTATTTTAGCTCGATGGTTGCT ATTTTACTGGTGCTGGCCTTTTCAACTTCTTTCACTGCCTTTTACAATGTCTTTTATGAGAGTAAGGACCTGGCCTCCTA TAGGCCCTATGCCTTTAAAGAATCAGAGATTATAATGGCCAAAGGTCTGTCTGTCCTCTTGCCAGCTCTAACTGGAATTG TACCAATCCTAGCTTATTTTCTAGCCCTCTATATTAGTCTAGCTCCTTCTCTTTGGCTGGGTTTGCCTTTGATGCTACTG TCCTTGACCTTATTATTTGTCTCTGTTACTTTAGTGACGGTAGTGGCAGTACATTTCTTGGCTCAGACTAGGGTCTTCAG AAAGTATCAGTCTATTTTTTCGAATGTGATGATTGGGATAGGAGTTCTCATACCTTTAATATTTATCTTCTTTCTTCAGT CGACTTTTGGAAGTATTGTTGACAAAGTTAGAGACATTCCATTTCTCCTTTATCCTCTTCATATCTTTTACAAAATAGCA GTGGAGCCTTTTTCGACAGAAGCCTTAGTGGGTCTGCTCGCTTGGATAGGACTAACTCTCTTCCTGCTTTATCTGACCAA AAAGAAGGTCCTTCCTCGTTTTTATGACGTGATCCTGCTTAACAGTGAGGAGAAGGTCAAAAAAGAACGTCGCAGCAAGG AGAGGATTTCAACTACTAAAAAGGGCTTTTTCCGTATGGTTTTACGCTACCACCTCACCCTCTTGGGACAGGGGACTGGT GTGATTACAGTGCTTTTTACAAGTGCTTTCCTTCCTTATCTCATGATGATCAGTCTGATTTCCAAAATCCGAGATTCTCA GATAGTTCCAGACATTCATCCTCCATACTGGTTACCCTTGTTTTTTGTAGGAGTGTTTATAGCAGTTGTCAATAACAATA TCACCAGCCTGCATTCAATTGCCTTGTCCTTGGAGAGGGAAAATGTTGATTTTCTGAAGAGTTTACCCTTTGACTTTGCT CGTTATGTGAAAGTGAAATTTTGGATTATCTTTGCTGTTCAGTCCTTTTTACCAGTTCTGACTTTGCTCGGTCTTTCTCT ATATCTAGGCTTGTCCATCCTTTCGATGATTTACCTTCTTGTAGTCTGGATCATTGCCAGTGTCATCCTTTCTTGCCACC ATTACTTTAAGGACGTTAAAAATCTGTCAACCAATTGGAGTAGCATTACGGACCTGGTGAATCGTTCAAATGGCATAGTC GCCATAGTTTTATTGTTTATTTATAGTGCAATCCTGATGGCCCTTGTAATTGGGAGCATATTCTTGGTTCAGTCTCTCTC CCCTATCCTTGCCATCAACTTGGGAGTAGGAGCTCTTATCGTCTTGCTTGCTCTTGCTATTTTTGGCTATCATTATTACC TGTCACGCATATTGGCAGAAATAGAAAAAAGATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATCTATTGTGGTAGTGTAGAGAACTTGAGGAAAGACCACCCAGACCAGTTTTTGGAAAGTATCTACCTTAGTCTTGCTGG TAGAAAAGAGGAGGTTGCGG
Downstream 100 bases:
>100_bases GATAGTTGGTTGCTTGCTTGATAAATTCAATTCGACAAACGCTTTTATAGTTTGTTAGAATGTAGTTGTAAATGATTAAG ATTGGTAATCAAAAATATAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein; Ypothetical Protein SMU.
Number of amino acids: Translated: 544; Mature: 544
Protein sequence:
>544_residues MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMLICFSNIAIHFPFEEMPIYFSSMVA ILLVLAFSTSFTAFYNVFYESKDLASYRPYAFKESEIIMAKGLSVLLPALTGIVPILAYFLALYISLAPSLWLGLPLMLL SLTLLFVSVTLVTVVAVHFLAQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEEKVKKERRSKERISTTKKGFFRMVLRYHLTLLGQGTG VITVLFTSAFLPYLMMISLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPLFFVGVFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFA RYVKVKFWIIFAVQSFLPVLTLLGLSLYLGLSILSMIYLLVVWIIASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSPILAINLGVGALIVLLALAIFGYHYYLSRILAEIEKR
Sequences:
>Translated_544_residues MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMLICFSNIAIHFPFEEMPIYFSSMVA ILLVLAFSTSFTAFYNVFYESKDLASYRPYAFKESEIIMAKGLSVLLPALTGIVPILAYFLALYISLAPSLWLGLPLMLL SLTLLFVSVTLVTVVAVHFLAQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEEKVKKERRSKERISTTKKGFFRMVLRYHLTLLGQGTG VITVLFTSAFLPYLMMISLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPLFFVGVFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFA RYVKVKFWIIFAVQSFLPVLTLLGLSLYLGLSILSMIYLLVVWIIASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSPILAINLGVGALIVLLALAIFGYHYYLSRILAEIEKR >Mature_544_residues MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMLICFSNIAIHFPFEEMPIYFSSMVA ILLVLAFSTSFTAFYNVFYESKDLASYRPYAFKESEIIMAKGLSVLLPALTGIVPILAYFLALYISLAPSLWLGLPLMLL SLTLLFVSVTLVTVVAVHFLAQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEEKVKKERRSKERISTTKKGFFRMVLRYHLTLLGQGTG VITVLFTSAFLPYLMMISLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPLFFVGVFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFA RYVKVKFWIIFAVQSFLPVLTLLGLSLYLGLSILSMIYLLVVWIIASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSPILAINLGVGALIVLLALAIFGYHYYLSRILAEIEKR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 61539; Mature: 61539
Theoretical pI: Translated: 10.16; Mature: 10.16
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMLICFS CHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIAIHFPFEEMPIYFSSMVAILLVLAFSTSFTAFYNVFYESKDLASYRPYAFKESEIIMA HHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH KGLSVLLPALTGIVPILAYFLALYISLAPSLWLGLPLMLLSLTLLFVSVTLVTVVAVHFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEEKVKKERRSKERISTTK HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH KGFFRMVLRYHLTLLGQGTGVITVLFTSAFLPYLMMISLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHH FFVGVFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFARYVKVKFWIIFAVQSFLPVL HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLLGLSLYLGLSILSMIYLLVVWIIASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHH AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSPILAINLGVGALIVLLALAIFGYHYYLSRILAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEKR HHCC >Mature Secondary Structure MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMLICFS CHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIAIHFPFEEMPIYFSSMVAILLVLAFSTSFTAFYNVFYESKDLASYRPYAFKESEIIMA HHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH KGLSVLLPALTGIVPILAYFLALYISLAPSLWLGLPLMLLSLTLLFVSVTLVTVVAVHFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEEKVKKERRSKERISTTK HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH KGFFRMVLRYHLTLLGQGTGVITVLFTSAFLPYLMMISLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHH FFVGVFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFARYVKVKFWIIFAVQSFLPVL HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLLGLSLYLGLSILSMIYLLVVWIIASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHH AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSPILAINLGVGALIVLLALAIFGYHYYLSRILAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEKR HHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA