Definition Streptococcus pneumoniae ATCC 700669, complete genome.
Accession NC_011900
Length 2,221,315

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The map label for this gene is 221232121

Identifier: 221232121

GI number: 221232121

Start: 1316333

End: 1317967

Strand: Reverse

Name: 221232121

Synonym: SPN23F_13450

Alternate gene names: NA

Gene position: 1317967-1316333 (Counterclockwise)

Preceding gene: 221232122

Following gene: 221232120

Centisome position: 59.33

GC content: 39.69

Gene sequence:

>1635_bases
ATGCGTCTCAAGGTCATTAAAAAATTAGTTGATATCAATATCCTCTATTCATCTCAAGAAGCTAATCTGGCTAATCTACG
AAAGAAGCAGGCTAAGAATCCTGGGAAAAAAGTAAATGTTTCTGCTAGAGTCCTAAGTTCTTACATTTTTTCCAGTCTCT
TGATGCTCATCTGTTTTAGTAATATAGCCATTCATTTTCCTTTTGAGGAAATGCCTATTTATTTTAGCTCGATGGTTGCT
ATTTTACTGGTGCTGGCCTTTTCAACTTCTTTCACTGCCTTTTACAATGTCTTTTATGAGAGTAAGGACCTGGCCTCCTA
TAGGCCCTATGCCTTTAAAGAATCAGAGATTATAATGGCCAAAGGTCTGTCTGTCCTCTTGCCAGCTCTAACTGGAATTG
TACCAATCCTAGCTTATTTTCTAGCCCTCTATATTAGTCTAGCTCCTTCTCTTTGGCTGGGTTTGCCTTTGATGCTACTG
TCCTTGACCTTATTATTTGTCTCTGTTACTTTAGTGACGGTAGTGGCAGTACATTTCTTGGCTCAGACTAGGGTCTTCAG
AAAGTATCAGTCTATTTTTTCGAATGTGATGATTGGGATAGGAGTTCTCATACCTTTAATATTTATCTTCTTTCTTCAGT
CGACTTTTGGAAGTATTGTTGACAAAGTTAGAGACATTCCATTTCTCCTTTATCCTCTTCATATCTTTTACAAAATAGCA
GTGGAGCCTTTTTCGACAGAAGCCTTAGTGGGTCTGCTCGCTTGGATAGGACTAACTCTCTTCCTGCTTTATCTGACCAA
AAAGAAGGTCCTTCCTCGTTTTTATGACGTGATCCTGCTTAACAGTGAGGAGAAGGTCAAAAAAGAACGTCGCAGCAAGG
AGAGGATTTCAACTACTAAAAAGGGCTTTTTCCGTATGGTTTTACGCTACCACCTCACCCTCTTGGGACAGGGGACTGGT
GTGATTACAGTGCTTTTTACAAGTGCTTTCCTTCCTTATCTCATGATGATCAGTCTGATTTCCAAAATCCGAGATTCTCA
GATAGTTCCAGACATTCATCCTCCATACTGGTTACCCTTGTTTTTTGTAGGAGTGTTTATAGCAGTTGTCAATAACAATA
TCACCAGCCTGCATTCAATTGCCTTGTCCTTGGAGAGGGAAAATGTTGATTTTCTGAAGAGTTTACCCTTTGACTTTGCT
CGTTATGTGAAAGTGAAATTTTGGATTATCTTTGCTGTTCAGTCCTTTTTACCAGTTCTGACTTTGCTCGGTCTTTCTCT
ATATCTAGGCTTGTCCATCCTTTCGATGATTTACCTTCTTGTAGTCTGGATCATTGCCAGTGTCATCCTTTCTTGCCACC
ATTACTTTAAGGACGTTAAAAATCTGTCAACCAATTGGAGTAGCATTACGGACCTGGTGAATCGTTCAAATGGCATAGTC
GCCATAGTTTTATTGTTTATTTATAGTGCAATCCTGATGGCCCTTGTAATTGGGAGCATATTCTTGGTTCAGTCTCTCTC
CCCTATCCTTGCCATCAACTTGGGAGTAGGAGCTCTTATCGTCTTGCTTGCTCTTGCTATTTTTGGCTATCATTATTACC
TGTCACGCATATTGGCAGAAATAGAAAAAAGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCTATTGTGGTAGTGTAGAGAACTTGAGGAAAGACCACCCAGACCAGTTTTTGGAAAGTATCTACCTTAGTCTTGCTGG
TAGAAAAGAGGAGGTTGCGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATAGTTGGTTGCTTGCTTGATAAATTCAATTCGACAAACGCTTTTATAGTTTGTTAGAATGTAGTTGTAAATGATTAAG
ATTGGTAATCAAAAATATAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein; Ypothetical Protein SMU.

Number of amino acids: Translated: 544; Mature: 544

Protein sequence:

>544_residues
MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMLICFSNIAIHFPFEEMPIYFSSMVA
ILLVLAFSTSFTAFYNVFYESKDLASYRPYAFKESEIIMAKGLSVLLPALTGIVPILAYFLALYISLAPSLWLGLPLMLL
SLTLLFVSVTLVTVVAVHFLAQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA
VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEEKVKKERRSKERISTTKKGFFRMVLRYHLTLLGQGTG
VITVLFTSAFLPYLMMISLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPLFFVGVFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFA
RYVKVKFWIIFAVQSFLPVLTLLGLSLYLGLSILSMIYLLVVWIIASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV
AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSPILAINLGVGALIVLLALAIFGYHYYLSRILAEIEKR

Sequences:

>Translated_544_residues
MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMLICFSNIAIHFPFEEMPIYFSSMVA
ILLVLAFSTSFTAFYNVFYESKDLASYRPYAFKESEIIMAKGLSVLLPALTGIVPILAYFLALYISLAPSLWLGLPLMLL
SLTLLFVSVTLVTVVAVHFLAQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA
VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEEKVKKERRSKERISTTKKGFFRMVLRYHLTLLGQGTG
VITVLFTSAFLPYLMMISLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPLFFVGVFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFA
RYVKVKFWIIFAVQSFLPVLTLLGLSLYLGLSILSMIYLLVVWIIASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV
AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSPILAINLGVGALIVLLALAIFGYHYYLSRILAEIEKR
>Mature_544_residues
MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMLICFSNIAIHFPFEEMPIYFSSMVA
ILLVLAFSTSFTAFYNVFYESKDLASYRPYAFKESEIIMAKGLSVLLPALTGIVPILAYFLALYISLAPSLWLGLPLMLL
SLTLLFVSVTLVTVVAVHFLAQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA
VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEEKVKKERRSKERISTTKKGFFRMVLRYHLTLLGQGTG
VITVLFTSAFLPYLMMISLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPLFFVGVFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFA
RYVKVKFWIIFAVQSFLPVLTLLGLSLYLGLSILSMIYLLVVWIIASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV
AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSPILAINLGVGALIVLLALAIFGYHYYLSRILAEIEKR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61539; Mature: 61539

Theoretical pI: Translated: 10.16; Mature: 10.16

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMLICFS
CHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIAIHFPFEEMPIYFSSMVAILLVLAFSTSFTAFYNVFYESKDLASYRPYAFKESEIIMA
HHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH
KGLSVLLPALTGIVPILAYFLALYISLAPSLWLGLPLMLLSLTLLFVSVTLVTVVAVHFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEEKVKKERRSKERISTTK
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KGFFRMVLRYHLTLLGQGTGVITVLFTSAFLPYLMMISLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHH
FFVGVFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFARYVKVKFWIIFAVQSFLPVL
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLLGLSLYLGLSILSMIYLLVVWIIASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHH
AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSPILAINLGVGALIVLLALAIFGYHYYLSRILAE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IEKR
HHCC
>Mature Secondary Structure
MRLKVIKKLVDINILYSSQEANLANLRKKQAKNPGKKVNVSARVLSSYIFSSLLMLICFS
CHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIAIHFPFEEMPIYFSSMVAILLVLAFSTSFTAFYNVFYESKDLASYRPYAFKESEIIMA
HHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH
KGLSVLLPALTGIVPILAYFLALYISLAPSLWLGLPLMLLSLTLLFVSVTLVTVVAVHFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQTRVFRKYQSIFSNVMIGIGVLIPLIFIFFLQSTFGSIVDKVRDIPFLLYPLHIFYKIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
VEPFSTEALVGLLAWIGLTLFLLYLTKKKVLPRFYDVILLNSEEKVKKERRSKERISTTK
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KGFFRMVLRYHLTLLGQGTGVITVLFTSAFLPYLMMISLISKIRDSQIVPDIHPPYWLPL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHH
FFVGVFIAVVNNNITSLHSIALSLERENVDFLKSLPFDFARYVKVKFWIIFAVQSFLPVL
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLLGLSLYLGLSILSMIYLLVVWIIASVILSCHHYFKDVKNLSTNWSSITDLVNRSNGIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHH
AIVLLFIYSAILMALVIGSIFLVQSLSPILAINLGVGALIVLLALAIFGYHYYLSRILAE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IEKR
HHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA