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The map label for this gene is spoVB [H]

Identifier: 220932950

GI number: 220932950

Start: 2305150

End: 2306769

Strand: Reverse

Name: spoVB [H]

Synonym: Hore_21180

Alternate gene names: 220932950

Gene position: 2306769-2305150 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220932951

Following gene: 220932949

Centisome position: 89.47

GC content: 41.67

Gene sequence:

>1620_bases
ATGGTTGAAGATAAGGGGAAAAATTTTATCAAGGGTGCGGTAATCCTCAGTGCCGCTGGTCTAATATCTAAAGTAATGGG
TTTTGTTTACCGGGTCATATTAACAAGGATAATCGGGGCTGAAGGGATGGGGTTATACCAGATGGCCTATCCCATTTATA
CTACACTTTTAGTAGTCTCCCGGTCCGGGATACCTGTTTCCCTTGCCAAGTTAATCTCGGGGAAGATTGCCCGGGGCCAG
AAGAACGATGCCCTGAAAACCTTCAAAGTGGGTCGAAGCTTAAGTATTCTTATTGGCCTATTTTTTTCTATATTAATGAT
GGTTCTGGCCAGACCCCTTGTCAATATTCTGGAGTGGGATTCAAGGGCATATTATGCCGTTCTTGCCATTTCACCGGCTA
TCTTTTTCGTATCTATTATGGCAACCTATCGTGGTTTTTTTCAGGGGCTTCAAAATATGAAGCCAACTGCATATTCCCAG
GTTATCGAGCAGTGGGTCAGGATGGTTACCATGATCTCCCTGGTATATTTTTTAGTGCCATATGGACTCGGGATTGCTGC
TGCCGGGGCTACCTCGGGAGCAGTAACAGGTTCAATGGCTGGACTTTTGACATTAATTTATATATACTATAAAAAGAAAA
AAGAAATATGGAATGGCATATCGATTAAAACTACCTATGCAGATGCGGTCAGGATCACAGGGGAAATTGCCAGATTAGGT
ATTCCTATTACCTTTGCAGCTTTAGTTCAACCATTAATGACTTTAGTGGATACAGTTATAGTTCCCCAGAGGCTTCAGGT
AGCTGGGTATGCCGTGGAAAAGGCGACAGAACTCTTTGGTCAGCTCTCCGGGGTAGCCATGGTTTTAGTTAATTTTCCAA
CTATAATTACTATCTCTCTGGCAGCCAGCCTGGTACCATCTATATCGGAAGCCTATGCCCTGAAAAGGCATGATTTAATT
GACCGTAGAACCAGAACAGCCCTGAGGTTAACTGTATTAATTGGGTTACCGGCAGCAGTCGGACTTTTTATTCTGGCCCG
CCCCCTGACCGGAGTTATTTTTGGTGAGGCGGACGCAGCAATACCTCTGCGCATTGTTGGTTGGGGAGTAATCTTTATAG
CCATACAACAGACTACTTCTGCTATCTTACAGGGTCTGGGTCAGACCGCTATTCCTGCCCGGAATTTATTAACAGGAGCG
GTGGTTAATGCTTTAATTAATTACAGCCTTACAGCTTCACCCCGATTTGGAATAAAAGGGGCAGCCCTGGGGACGGTTAC
TGGATTTGCTGTTGCTGCCTTATTGAATTTAATATCTGTGAAGAAATTTACCGGTTTTAAAATTAAGATAAAAGAGCTTA
TCTTCAAACCAGTACTGGCTGTATTTTTAATGGCCGTTGCTGTTAACAGGGGCTTTGTGATTTTATTAAATCTTTTAGAG
GGTATAACTGATTATAATTACCATATAGCTACATTTTTTATTGTATTTTTTGCTGTTATCATATATTTATTTTTCCTGTT
ATTATTTAATGAGATCAGGTATTCAGATGTGGCGATGATTCCCGGTTATGGGAAAAAAATTGCTGATAAACTTAAAAAAA
TTGGATTGCTGGGGGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATAATCGATCCTGGCTTACTTATATTAGGCGTAAAGGGGATAAAAACTGGAATAAAGGTCAGGAACTGTATTTTCCGTC
AGGCAGGAAGGATGTCGAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTATGGAACAGGAGAGGTTAGCAGAAGAATTTATTAGATTAGTTAAGATCATGGAGAGATTACGGGGACCTGATGGCTG
TCCCTGGGATAAAAAACAGG

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: Stage III sporulation protein F [H]

Number of amino acids: Translated: 539; Mature: 539

Protein sequence:

>539_residues
MVEDKGKNFIKGAVILSAAGLISKVMGFVYRVILTRIIGAEGMGLYQMAYPIYTTLLVVSRSGIPVSLAKLISGKIARGQ
KNDALKTFKVGRSLSILIGLFFSILMMVLARPLVNILEWDSRAYYAVLAISPAIFFVSIMATYRGFFQGLQNMKPTAYSQ
VIEQWVRMVTMISLVYFLVPYGLGIAAAGATSGAVTGSMAGLLTLIYIYYKKKKEIWNGISIKTTYADAVRITGEIARLG
IPITFAALVQPLMTLVDTVIVPQRLQVAGYAVEKATELFGQLSGVAMVLVNFPTIITISLAASLVPSISEAYALKRHDLI
DRRTRTALRLTVLIGLPAAVGLFILARPLTGVIFGEADAAIPLRIVGWGVIFIAIQQTTSAILQGLGQTAIPARNLLTGA
VVNALINYSLTASPRFGIKGAALGTVTGFAVAALLNLISVKKFTGFKIKIKELIFKPVLAVFLMAVAVNRGFVILLNLLE
GITDYNYHIATFFIVFFAVIIYLFFLLLFNEIRYSDVAMIPGYGKKIADKLKKIGLLGD

Sequences:

>Translated_539_residues
MVEDKGKNFIKGAVILSAAGLISKVMGFVYRVILTRIIGAEGMGLYQMAYPIYTTLLVVSRSGIPVSLAKLISGKIARGQ
KNDALKTFKVGRSLSILIGLFFSILMMVLARPLVNILEWDSRAYYAVLAISPAIFFVSIMATYRGFFQGLQNMKPTAYSQ
VIEQWVRMVTMISLVYFLVPYGLGIAAAGATSGAVTGSMAGLLTLIYIYYKKKKEIWNGISIKTTYADAVRITGEIARLG
IPITFAALVQPLMTLVDTVIVPQRLQVAGYAVEKATELFGQLSGVAMVLVNFPTIITISLAASLVPSISEAYALKRHDLI
DRRTRTALRLTVLIGLPAAVGLFILARPLTGVIFGEADAAIPLRIVGWGVIFIAIQQTTSAILQGLGQTAIPARNLLTGA
VVNALINYSLTASPRFGIKGAALGTVTGFAVAALLNLISVKKFTGFKIKIKELIFKPVLAVFLMAVAVNRGFVILLNLLE
GITDYNYHIATFFIVFFAVIIYLFFLLLFNEIRYSDVAMIPGYGKKIADKLKKIGLLGD
>Mature_539_residues
MVEDKGKNFIKGAVILSAAGLISKVMGFVYRVILTRIIGAEGMGLYQMAYPIYTTLLVVSRSGIPVSLAKLISGKIARGQ
KNDALKTFKVGRSLSILIGLFFSILMMVLARPLVNILEWDSRAYYAVLAISPAIFFVSIMATYRGFFQGLQNMKPTAYSQ
VIEQWVRMVTMISLVYFLVPYGLGIAAAGATSGAVTGSMAGLLTLIYIYYKKKKEIWNGISIKTTYADAVRITGEIARLG
IPITFAALVQPLMTLVDTVIVPQRLQVAGYAVEKATELFGQLSGVAMVLVNFPTIITISLAASLVPSISEAYALKRHDLI
DRRTRTALRLTVLIGLPAAVGLFILARPLTGVIFGEADAAIPLRIVGWGVIFIAIQQTTSAILQGLGQTAIPARNLLTGA
VVNALINYSLTASPRFGIKGAALGTVTGFAVAALLNLISVKKFTGFKIKIKELIFKPVLAVFLMAVAVNRGFVILLNLLE
GITDYNYHIATFFIVFFAVIIYLFFLLLFNEIRYSDVAMIPGYGKKIADKLKKIGLLGD

Specific function: Involved, directly or indirectly, in spore cortex biosynthesis. Affects only indirectly the expression of late sporulation genes [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR002797
- InterPro:   IPR014249 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58452; Mature: 58452

Theoretical pI: Translated: 10.51; Mature: 10.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVEDKGKNFIKGAVILSAAGLISKVMGFVYRVILTRIIGAEGMGLYQMAYPIYTTLLVVS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RSGIPVSLAKLISGKIARGQKNDALKTFKVGRSLSILIGLFFSILMMVLARPLVNILEWD
CCCCCHHHHHHHCCHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SRAYYAVLAISPAIFFVSIMATYRGFFQGLQNMKPTAYSQVIEQWVRMVTMISLVYFLVP
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGLGIAAAGATSGAVTGSMAGLLTLIYIYYKKKKEIWNGISIKTTYADAVRITGEIARLG
HCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHC
IPITFAALVQPLMTLVDTVIVPQRLQVAGYAVEKATELFGQLSGVAMVLVNFPTIITISL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHH
AASLVPSISEAYALKRHDLIDRRTRTALRLTVLIGLPAAVGLFILARPLTGVIFGEADAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCC
IPLRIVGWGVIFIAIQQTTSAILQGLGQTAIPARNLLTGAVVNALINYSLTASPRFGIKG
CCCCEEHHHHHEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCC
AALGTVTGFAVAALLNLISVKKFTGFKIKIKELIFKPVLAVFLMAVAVNRGFVILLNLLE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
GITDYNYHIATFFIVFFAVIIYLFFLLLFNEIRYSDVAMIPGYGKKIADKLKKIGLLGD
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVEDKGKNFIKGAVILSAAGLISKVMGFVYRVILTRIIGAEGMGLYQMAYPIYTTLLVVS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RSGIPVSLAKLISGKIARGQKNDALKTFKVGRSLSILIGLFFSILMMVLARPLVNILEWD
CCCCCHHHHHHHCCHHCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SRAYYAVLAISPAIFFVSIMATYRGFFQGLQNMKPTAYSQVIEQWVRMVTMISLVYFLVP
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGLGIAAAGATSGAVTGSMAGLLTLIYIYYKKKKEIWNGISIKTTYADAVRITGEIARLG
HCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHC
IPITFAALVQPLMTLVDTVIVPQRLQVAGYAVEKATELFGQLSGVAMVLVNFPTIITISL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHH
AASLVPSISEAYALKRHDLIDRRTRTALRLTVLIGLPAAVGLFILARPLTGVIFGEADAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCC
IPLRIVGWGVIFIAIQQTTSAILQGLGQTAIPARNLLTGAVVNALINYSLTASPRFGIKG
CCCCEEHHHHHEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCC
AALGTVTGFAVAALLNLISVKKFTGFKIKIKELIFKPVLAVFLMAVAVNRGFVILLNLLE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
GITDYNYHIATFFIVFFAVIIYLFFLLLFNEIRYSDVAMIPGYGKKIADKLKKIGLLGD
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1744050; 9384377 [H]