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The map label for this gene is yxlH [H]

Identifier: 220932343

GI number: 220932343

Start: 1608942

End: 1610114

Strand: Reverse

Name: yxlH [H]

Synonym: Hore_15060

Alternate gene names: 220932343

Gene position: 1610114-1608942 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220932344

Following gene: 220932342

Centisome position: 62.45

GC content: 34.02

Gene sequence:

>1173_bases
ATGGAAAGTTCAAAAAAATATCGTATTACTTTATATTGCATTGTAACAGGCTTGTTTTGGTTTTCATTTTATAGTTATGT
TCCGACCCTTTCCCCTTATATTGAGTCCCTCGGGGCTTCATATAAAATGATTGGTATTATTTTAGGTTCTTTTGGATTTA
CCCAGATGTTATTAAGAATACCACTGGGTATTATTTCAGATAAAATTAATAGGAGAAAAGTATTTGTAGTATTGGGGGTT
TTTCTGGGATTTGCTAGTGCTTTAGGCATGTGGTTATTTAATGACCTGATTCTAATTCTTATTTTCAGGGCTATGTCGGG
AGCAGCAGCTGCCACCTGGGTTACTTATGTAGTTCTTTTTTCCAGTTATTTTGATAGTAATGATACTCCAAAGGCGATGG
GAATTATTAATGCTTTTTTAAGAGTGGGACAGGTTACAGCTATGCTTATAGGTGGACAAGCAGCCCAATATTACGGTCAA
AAAGCTCCCTTTTTAGTAGCTGTAGTGGGTGGAATTATAGGGTTAGTGTTAAGTACAGGCGTAGTTGAAAAAAAGAATGA
TCACCATAAACAAGTTAGATTAAAATCTTTAATTCTTGTTATGAAAGAGGTAGAATTAATCAAAGTTTCTATATTGGCTA
TTTTGTTTCAAATAATTATTTTTGCGACAGTATTTGGATTTGTTCCAGTAGCGGCAAAAAAAATAGGTGCAACTAGTTTA
CAACTGGGGATGTTAACTACACTATCTACACTTCCAGCAATTTTTTCTTCAGCCCTTAGTGGTACTCTGGCAGAACGTTA
TGGGGAAAAGAAGACAATTATGTTTGGATTTTTGGTTATTGCTTTTTCCTGTATTACAGTTCCCTATATTAGCAGTGTTC
TATTATTGTTTATTATCCAGATAATAGGTGGATTCGCCAGAGGGTTTGTTTTTTCACTACTAATGGGATTAAGTATTAAA
AATATTGAAGAAGATAAGAGAGCAACAGCTATGGGTTTTTATCAGGCGGTTTATGGGATTGGCATGTTTTTGGGACCTAT
TATTGTGGGATTTCTCAGTGATATTGGTAGTTTAACTTTAGGTTTCTGGTTTACAGGAGTTATAGGTTTGTTTGCAGTAG
TTCTTACAGGAATATTTTTAAATGCTTTTAAAACAGTTGAAATAGGTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATATTTAATGGTACATACCAGTAGTATACCAATGGTATTATATATTTAACAAAATCACGTTACTTATAAAGACATCCTG
GCTAAAAAGAGAGGTGGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAACTAATAAGTATACCACTAAAAAATTTTAGAAAAAAAGAAGGATTTTAAAAAAATATATAGAATTAATGGTATATA
CCAACAATATACCAATGGTT

Product: major facilitator superfamily protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 390; Mature: 390

Protein sequence:

>390_residues
MESSKKYRITLYCIVTGLFWFSFYSYVPTLSPYIESLGASYKMIGIILGSFGFTQMLLRIPLGIISDKINRRKVFVVLGV
FLGFASALGMWLFNDLILILIFRAMSGAAAATWVTYVVLFSSYFDSNDTPKAMGIINAFLRVGQVTAMLIGGQAAQYYGQ
KAPFLVAVVGGIIGLVLSTGVVEKKNDHHKQVRLKSLILVMKEVELIKVSILAILFQIIIFATVFGFVPVAAKKIGATSL
QLGMLTTLSTLPAIFSSALSGTLAERYGEKKTIMFGFLVIAFSCITVPYISSVLLLFIIQIIGGFARGFVFSLLMGLSIK
NIEEDKRATAMGFYQAVYGIGMFLGPIIVGFLSDIGSLTLGFWFTGVIGLFAVVLTGIFLNAFKTVEIGL

Sequences:

>Translated_390_residues
MESSKKYRITLYCIVTGLFWFSFYSYVPTLSPYIESLGASYKMIGIILGSFGFTQMLLRIPLGIISDKINRRKVFVVLGV
FLGFASALGMWLFNDLILILIFRAMSGAAAATWVTYVVLFSSYFDSNDTPKAMGIINAFLRVGQVTAMLIGGQAAQYYGQ
KAPFLVAVVGGIIGLVLSTGVVEKKNDHHKQVRLKSLILVMKEVELIKVSILAILFQIIIFATVFGFVPVAAKKIGATSL
QLGMLTTLSTLPAIFSSALSGTLAERYGEKKTIMFGFLVIAFSCITVPYISSVLLLFIIQIIGGFARGFVFSLLMGLSIK
NIEEDKRATAMGFYQAVYGIGMFLGPIIVGFLSDIGSLTLGFWFTGVIGLFAVVLTGIFLNAFKTVEIGL
>Mature_390_residues
MESSKKYRITLYCIVTGLFWFSFYSYVPTLSPYIESLGASYKMIGIILGSFGFTQMLLRIPLGIISDKINRRKVFVVLGV
FLGFASALGMWLFNDLILILIFRAMSGAAAATWVTYVVLFSSYFDSNDTPKAMGIINAFLRVGQVTAMLIGGQAAQYYGQ
KAPFLVAVVGGIIGLVLSTGVVEKKNDHHKQVRLKSLILVMKEVELIKVSILAILFQIIIFATVFGFVPVAAKKIGATSL
QLGMLTTLSTLPAIFSSALSGTLAERYGEKKTIMFGFLVIAFSCITVPYISSVLLLFIIQIIGGFARGFVFSLLMGLSIK
NIEEDKRATAMGFYQAVYGIGMFLGPIIVGFLSDIGSLTLGFWFTGVIGLFAVVLTGIFLNAFKTVEIGL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196
- InterPro:   IPR001958 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 42473; Mature: 42473

Theoretical pI: Translated: 10.08; Mature: 10.08

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969509; 9384377 [H]