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The map label for this gene is norM [H]

Identifier: 220931771

GI number: 220931771

Start: 1000866

End: 1002227

Strand: Reverse

Name: norM [H]

Synonym: Hore_09280

Alternate gene names: 220931771

Gene position: 1002227-1000866 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220931806

Following gene: 220931739

Centisome position: 38.87

GC content: 38.55

Gene sequence:

>1362_bases
ATGCTGTTAATCAATGAAATAAACCGAAGAAAAGAAATGATAAAAAATATACTTGTCCTGGCCTTTCCGGCAGTAATGGA
AATGAGCCTCAATACCATGCTGGGGTTTGCCGATACCTTGATGATTAGCCGGATAATTGGAAAAGAAGGTCTTGCTGCCG
TAGGTTTTGCCAATCAAATTATTTTTACCCTGATATTTATATTTTCCTCTTTCAATGCTGGAGCCACAGCTATGGTGGCC
AGAAGCTATGGTGAGAAAAATTATAAACGTTTGAATAAGATTGTCGGTGAAAATTTAACCCTAAACCTGTTTATTGGCAT
TATTATTTTTATGGCATCCTACTTTTATGGAGATCAAATTCTTAAAGTATTTGATATCTCAAAAAACGTATACCAGATGG
GGCTTAGCTATCTAAAAGTTGTCTCATTCAGTCAGTTATTTATGTTTATTTCGTTTGCGGCCGCTGCCAGCCTCAGGGGA
GCGGGAGACACCAAAACACCAATGTATATAACCGGTATGGCTAACATTTTAAATATCTTTGGGAACTATGCCCTGATGAC
AGGTTTCTATGTCTTCCCCGAGCTCGGTATAGCCGGGGCTGCCCTTTCTACAACTATTTCCCGGGCTATTGCTGCCTTTT
TGTACCTTTATATTTTAATATCAGGCGAAAGAAAGATTAAACTTCATTTCCATAGTCTCAGGATTTCTACTTATATTATA
AAACCCCTCTGGAAGTTAAGTTATGCTGCCGCCCTGGAACAATTTTTTATGCAGCTGGCTTTTTTTACTAATGGTATAAT
TATTTCAAAACTGGATACAACATCAGAAGCAGCTTTCAGAATACTAATAAATATTGAATCAACCTCATTTATGCCGGCCA
TCGGAATAGCTATAGCCACTACAACCCTGGTGGGGAAACACCTTGGAGAAAAAAATCCTGAAAAATCCCTGGATACCGGG
TATACTGCTGCCCTGCTGGGAATAGTCTGGGGTATTTTTATGGGAACTATTTTCTTCCTGTTACCGGTACCAATACTCAG
TATTTTTACCAGTGAATCTCCTTTGATATCAAGGGCCATTAATTCTCTTAAGATTGCCGGTTTTAATCAACCCCTCCTGG
CTTTTATGATCATTATGGCCGGGGCTCTGAGGGGAGCCGGTGATACCAGGGGAGCCATGATCTTGACATCATTAAGACTC
TGGACTATTTTTATTCCTTTATCCTATGTCTTTGCCATCATTTTACAATATGGAGTAGCCGGAGTCTGGATAGCAGAAAT
AAGTTCCTTTATAATTTTCTCAATACTAATAAATCGCCGCTTTAAATCTATGAAATGGGCTAAAATAAAAATATTTGATT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATAACGATTGTGGTATGATTATGTTTGTAACTTACATACTTAAATTTATTTGTATATATAAAATTACAATAATCTAT
TAAATGAAGGGGAAATTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAATATTATAAACCAGAAAAAAATAAATAAACAGGTTAAAAGTAAATAAGCCCCGTGACCCGGAAAAAGGTCAGGGGG
CTTGTTATTTTATTCCTGTC

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: Multidrug-efflux transporter [H]

Number of amino acids: Translated: 453; Mature: 453

Protein sequence:

>453_residues
MLLINEINRRKEMIKNILVLAFPAVMEMSLNTMLGFADTLMISRIIGKEGLAAVGFANQIIFTLIFIFSSFNAGATAMVA
RSYGEKNYKRLNKIVGENLTLNLFIGIIIFMASYFYGDQILKVFDISKNVYQMGLSYLKVVSFSQLFMFISFAAAASLRG
AGDTKTPMYITGMANILNIFGNYALMTGFYVFPELGIAGAALSTTISRAIAAFLYLYILISGERKIKLHFHSLRISTYII
KPLWKLSYAAALEQFFMQLAFFTNGIIISKLDTTSEAAFRILINIESTSFMPAIGIAIATTTLVGKHLGEKNPEKSLDTG
YTAALLGIVWGIFMGTIFFLLPVPILSIFTSESPLISRAINSLKIAGFNQPLLAFMIIMAGALRGAGDTRGAMILTSLRL
WTIFIPLSYVFAIILQYGVAGVWIAEISSFIIFSILINRRFKSMKWAKIKIFD

Sequences:

>Translated_453_residues
MLLINEINRRKEMIKNILVLAFPAVMEMSLNTMLGFADTLMISRIIGKEGLAAVGFANQIIFTLIFIFSSFNAGATAMVA
RSYGEKNYKRLNKIVGENLTLNLFIGIIIFMASYFYGDQILKVFDISKNVYQMGLSYLKVVSFSQLFMFISFAAAASLRG
AGDTKTPMYITGMANILNIFGNYALMTGFYVFPELGIAGAALSTTISRAIAAFLYLYILISGERKIKLHFHSLRISTYII
KPLWKLSYAAALEQFFMQLAFFTNGIIISKLDTTSEAAFRILINIESTSFMPAIGIAIATTTLVGKHLGEKNPEKSLDTG
YTAALLGIVWGIFMGTIFFLLPVPILSIFTSESPLISRAINSLKIAGFNQPLLAFMIIMAGALRGAGDTRGAMILTSLRL
WTIFIPLSYVFAIILQYGVAGVWIAEISSFIIFSILINRRFKSMKWAKIKIFD
>Mature_453_residues
MLLINEINRRKEMIKNILVLAFPAVMEMSLNTMLGFADTLMISRIIGKEGLAAVGFANQIIFTLIFIFSSFNAGATAMVA
RSYGEKNYKRLNKIVGENLTLNLFIGIIIFMASYFYGDQILKVFDISKNVYQMGLSYLKVVSFSQLFMFISFAAAASLRG
AGDTKTPMYITGMANILNIFGNYALMTGFYVFPELGIAGAALSTTISRAIAAFLYLYILISGERKIKLHFHSLRISTYII
KPLWKLSYAAALEQFFMQLAFFTNGIIISKLDTTSEAAFRILINIESTSFMPAIGIAIATTTLVGKHLGEKNPEKSLDTG
YTAALLGIVWGIFMGTIFFLLPVPILSIFTSESPLISRAINSLKIAGFNQPLLAFMIIMAGALRGAGDTRGAMILTSLRL
WTIFIPLSYVFAIILQYGVAGVWIAEISSFIIFSILINRRFKSMKWAKIKIFD

Specific function: Multidrug efflux pump [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=446, Percent_Identity=25.7847533632287, Blast_Score=142, Evalue=5e-35,
Organism=Escherichia coli, GI48994890, Length=442, Percent_Identity=23.7556561085973, Blast_Score=90, Evalue=3e-19,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50210; Mature: 50210

Theoretical pI: Translated: 10.28; Mature: 10.28

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLLINEINRRKEMIKNILVLAFPAVMEMSLNTMLGFADTLMISRIIGKEGLAAVGFANQI
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
IFTLIFIFSSFNAGATAMVARSYGEKNYKRLNKIVGENLTLNLFIGIIIFMASYFYGDQI
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKVFDISKNVYQMGLSYLKVVSFSQLFMFISFAAAASLRGAGDTKTPMYITGMANILNIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH
GNYALMTGFYVFPELGIAGAALSTTISRAIAAFLYLYILISGERKIKLHFHSLRISTYII
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHH
KPLWKLSYAAALEQFFMQLAFFTNGIIISKLDTTSEAAFRILINIESTSFMPAIGIAIAT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHH
TTLVGKHLGEKNPEKSLDTGYTAALLGIVWGIFMGTIFFLLPVPILSIFTSESPLISRAI
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
NSLKIAGFNQPLLAFMIIMAGALRGAGDTRGAMILTSLRLWTIFIPLSYVFAIILQYGVA
HHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GVWIAEISSFIIFSILINRRFKSMKWAKIKIFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MLLINEINRRKEMIKNILVLAFPAVMEMSLNTMLGFADTLMISRIIGKEGLAAVGFANQI
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
IFTLIFIFSSFNAGATAMVARSYGEKNYKRLNKIVGENLTLNLFIGIIIFMASYFYGDQI
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKVFDISKNVYQMGLSYLKVVSFSQLFMFISFAAAASLRGAGDTKTPMYITGMANILNIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH
GNYALMTGFYVFPELGIAGAALSTTISRAIAAFLYLYILISGERKIKLHFHSLRISTYII
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHH
KPLWKLSYAAALEQFFMQLAFFTNGIIISKLDTTSEAAFRILINIESTSFMPAIGIAIAT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHH
TTLVGKHLGEKNPEKSLDTGYTAALLGIVWGIFMGTIFFLLPVPILSIFTSESPLISRAI
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
NSLKIAGFNQPLLAFMIIMAGALRGAGDTRGAMILTSLRLWTIFIPLSYVFAIILQYGVA
HHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GVWIAEISSFIIFSILINRRFKSMKWAKIKIFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10360571 [H]