Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 220931128

Identifier: 220931128

GI number: 220931128

Start: 281890

End: 283560

Strand: Direct

Name: 220931128

Synonym: Hore_02800

Alternate gene names: NA

Gene position: 281890-283560 (Clockwise)

Preceding gene: 220931127

Following gene: 220931129

Centisome position: 10.93

GC content: 34.05

Gene sequence:

>1671_bases
GTGGAAGACTTTAAATCACTCAAAATACTGGATAGGTTTAAATTTATTTTTGAAAAATTTAATATAGATTATAAGGTAAT
GAGGGAGATTGTCCGGCTTAAATTAATAATGGATCAACGAAGGAGACATGTTATTTTTGGCAATACTGGAAAGAAAGAAG
GGGGGAAAAAGAAAAATCAGTTTAAAAATTCATTAATTATATATGGATTTTATGGGTTTATGGTTATGATGGTTTTTTTA
ATACCTGTTTCCCTTTTTTTGAAAATGTCCCTGACAACCGGATTCATTATGTTTTTCATGATGTCACAGATGCTGCTCGA
CTTTTCATCAGTTCTTCTTGACCTATCAGATAAATTAATTTTATTACCAGGCCCCCTGAATTCAAGGACGCTAAATGCAG
CTAAATTAATACATATTTTTATTTACCTTACTATCATATCACTGGTCCTGGTGGCACCGACTTTATTTATTGGGACTATA
AAAATGGGATTAAGTTTTCTGTTTGTTTTCTTTATAGAGGTTTTTTTAATGTTATTTTTAGTTATTTTTATTACAGCCTG
TCTTTATGGATTGATACTCAAATTTTTTGATGGAGAAAAATTAAAAAATGCTATCAATTATTTTCAGATTGGGGTAGCCA
TTATCTTGCCTATTAGTTACCAATTTGTCGGGGATATGTTTGATGTATTTGGAGAAAAGGTAGTTTTCACCCCGGACTGG
TGGACATACCTGCTCCCTCCGGTCTGGTTTGCCGGGCCATATGAGTTGTTTCTGGGAGGCAATACTGCTCCTTATGTTAT
CGGTATGACTGTTTTGACTGTATTGGTACCTGTACTGGGTTTATTACTTTATTTGAAATTAATCAATCCCTATTTTGAAA
AAAATCTTTCTAAACTCAATAATAATAAAAGTGGGCAGAATAATTTTGAAAAGACATGGGACATGGTATCATATAAAATA
ACTGGTTTTTTCTGTAAAGGTAATCAGGAGACCGTATTTTTCAGGTTTATAAGACAAATGCTGTCCCGGGAGAGGAGGTT
AAAACTTTCTATTTACCCTGTCCTCGGGTTTGCCGTTATATTTCCCTTTATAATGTTAAAGAATGAAATTGACTTTAGCG
CCTTCAGGGAATCCCTGAAAAATTTATCCCGGGGAGTCGGTTATTACAAACTATATTTAGCTATTATATTTTTACCATCT
ATATTGCCCATCCTCAGTTACAGTGAGCATCATAGGGGTTCCTGGATTTATAGGGTTTTACCCATCAGGGATTATAATAT
TATCCACCGGGCTAAAATTAAAGCAGTTTTTTATAAATATAATGTATTTGTATTTGGGTTGTTAGCATTACTTTTTGGCT
GGATTTATGGCCTGAAAATACTTGATGACCTGCTGATAATGGGTCTAAATATGGTATTACTGACCCTGGTTATAGGCATA
TTTTTCAGGGATGACCTTCCTTTTACAAAGGAAATGGGATACCAGGTTGATGCCGGTAAAAAGAAAACCTCCATTTTTAT
ACTGTTTCTGGGCTTGTTGCTGGGTGGTTTTCATTTTATATCAGCATTTTACCCTTACTTGATTTTGATATATGGTGTAT
TATTAATCACTGCCATTATTGTCGTCTGGAGAAAGGTATTTAGCTATAGGGTTCCGGGGGAAAATGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACAGGGCTCATTAGAAGGAATATTTAATCAGCTGACAGGGTTTAGCGAACATCAGAAAATAGCTGATGAGATAATTTCAA
CATTAGGGGAGTGAGATCAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATTGGAGGTATAAGAACAATGGAAAAAATAAAATACAGAAACATAAGTAAGGATGAGGAGCATAAATTTTTCCAGTT
TACCAGTTACTCCTTTAAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 556; Mature: 556

Protein sequence:

>556_residues
MEDFKSLKILDRFKFIFEKFNIDYKVMREIVRLKLIMDQRRRHVIFGNTGKKEGGKKKNQFKNSLIIYGFYGFMVMMVFL
IPVSLFLKMSLTTGFIMFFMMSQMLLDFSSVLLDLSDKLILLPGPLNSRTLNAAKLIHIFIYLTIISLVLVAPTLFIGTI
KMGLSFLFVFFIEVFLMLFLVIFITACLYGLILKFFDGEKLKNAINYFQIGVAIILPISYQFVGDMFDVFGEKVVFTPDW
WTYLLPPVWFAGPYELFLGGNTAPYVIGMTVLTVLVPVLGLLLYLKLINPYFEKNLSKLNNNKSGQNNFEKTWDMVSYKI
TGFFCKGNQETVFFRFIRQMLSRERRLKLSIYPVLGFAVIFPFIMLKNEIDFSAFRESLKNLSRGVGYYKLYLAIIFLPS
ILPILSYSEHHRGSWIYRVLPIRDYNIIHRAKIKAVFYKYNVFVFGLLALLFGWIYGLKILDDLLIMGLNMVLLTLVIGI
FFRDDLPFTKEMGYQVDAGKKKTSIFILFLGLLLGGFHFISAFYPYLILIYGVLLITAIIVVWRKVFSYRVPGENV

Sequences:

>Translated_556_residues
MEDFKSLKILDRFKFIFEKFNIDYKVMREIVRLKLIMDQRRRHVIFGNTGKKEGGKKKNQFKNSLIIYGFYGFMVMMVFL
IPVSLFLKMSLTTGFIMFFMMSQMLLDFSSVLLDLSDKLILLPGPLNSRTLNAAKLIHIFIYLTIISLVLVAPTLFIGTI
KMGLSFLFVFFIEVFLMLFLVIFITACLYGLILKFFDGEKLKNAINYFQIGVAIILPISYQFVGDMFDVFGEKVVFTPDW
WTYLLPPVWFAGPYELFLGGNTAPYVIGMTVLTVLVPVLGLLLYLKLINPYFEKNLSKLNNNKSGQNNFEKTWDMVSYKI
TGFFCKGNQETVFFRFIRQMLSRERRLKLSIYPVLGFAVIFPFIMLKNEIDFSAFRESLKNLSRGVGYYKLYLAIIFLPS
ILPILSYSEHHRGSWIYRVLPIRDYNIIHRAKIKAVFYKYNVFVFGLLALLFGWIYGLKILDDLLIMGLNMVLLTLVIGI
FFRDDLPFTKEMGYQVDAGKKKTSIFILFLGLLLGGFHFISAFYPYLILIYGVLLITAIIVVWRKVFSYRVPGENV
>Mature_556_residues
MEDFKSLKILDRFKFIFEKFNIDYKVMREIVRLKLIMDQRRRHVIFGNTGKKEGGKKKNQFKNSLIIYGFYGFMVMMVFL
IPVSLFLKMSLTTGFIMFFMMSQMLLDFSSVLLDLSDKLILLPGPLNSRTLNAAKLIHIFIYLTIISLVLVAPTLFIGTI
KMGLSFLFVFFIEVFLMLFLVIFITACLYGLILKFFDGEKLKNAINYFQIGVAIILPISYQFVGDMFDVFGEKVVFTPDW
WTYLLPPVWFAGPYELFLGGNTAPYVIGMTVLTVLVPVLGLLLYLKLINPYFEKNLSKLNNNKSGQNNFEKTWDMVSYKI
TGFFCKGNQETVFFRFIRQMLSRERRLKLSIYPVLGFAVIFPFIMLKNEIDFSAFRESLKNLSRGVGYYKLYLAIIFLPS
ILPILSYSEHHRGSWIYRVLPIRDYNIIHRAKIKAVFYKYNVFVFGLLALLFGWIYGLKILDDLLIMGLNMVLLTLVIGI
FFRDDLPFTKEMGYQVDAGKKKTSIFILFLGLLLGGFHFISAFYPYLILIYGVLLITAIIVVWRKVFSYRVPGENV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64581; Mature: 64581

Theoretical pI: Translated: 10.15; Mature: 10.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA