Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 218906611

Identifier: 218906611

GI number: 218906611

Start: 5229826

End: 5231277

Strand: Direct

Name: 218906611

Synonym: BCAH820_5525

Alternate gene names: NA

Gene position: 5229826-5231277 (Clockwise)

Preceding gene: 218906610

Following gene: 218906613

Centisome position: 98.63

GC content: 32.78

Gene sequence:

>1452_bases
ATGCAACACACATTCCCCCTAAAGCTTAATACGTTTTTTGTAAAGTGCTTATTAGTACTATGTCTAATTATTTCTGCTGC
TATAACGTGGCAATCAATAGGCATCATTCAAGAAAAAACCGACACACATTCCTTTATTATAATCCCGATTATTATTTTAA
TAGGTCTTCTATTTTTGCTTATTGGCTATATTTCTAACAAGTATATGTCTACATTTATATTTACCGTTTCACTCATTGTT
TTAGCTTTTTCTGTTCGATTAATTTGGGTTCTCAACGTTCCAACCCCTATCGAATCAGATTTTTCAGTGATGTACAATAG
TGCTATTCAAGCTACTAAAGGCGATTTTAGTTTTGCACAAGACGACTATTATACTTCATGGGTTTATCAACTTGGCTTTA
CAATGTACCAAGCTTTCATTATTAAGTTATTCGGCGAAGGGCCTTTCCTTCTAAAACTTTTAAATATCATGTATTGCACA
GGAACAACATGGCTAGTTTACAAAATAACTTCATATGTTTTTAATGAATGGGCTGGAAGAATGGCTGGATTACTATATGC
ATTATATATCCCTAGCATTGTATTGAGCTCTTTACTAACGAATCAACATATTGCCACATTCCTATTTTATCTTGGATTTT
ACTTATTAATTACAAAAGGTCTAACCCATAAATATATGTGGATTTTTATAGGGATATTCCTAGCCTTAGGAGATATTATG
CGTCCACTTGGCGCTTTCGTCTTGATTGCAGTAGCTCTTTACGTCTTTTTACAAGGTATATTAGGAAAATCAAAACAGGA
TATTTTAACTTCTATAAAAAAACTTTCTGGGATTTTCATCGTTTTTTATCTTGTTCATTACATTATAAGCTCTTCATTTA
TATATACCGGAATTACACAATATCCGCTATCTAACCGAGATCCTCTTTGGAAATTCACAGTAGGACTTAATCACGAAACA
AGAGGTGGATATTCTTCAGCAGATGTAGAATATGTTATGTCCTTTAAGCTTGGAAAAGAACGAGAAGCCGTTGAGAAGAA
ATTGATTCAAGAGCGACTAGCTGATCCAGAAAAGGTTTTATCTTTATTTGGTGATAAATTCACGATTATGTGGGCAGATT
ATGATTCCGCCCCAGTATGGAGCCTGGCAACACTAAGTAACACAGAGAGTGATATGGTTACCTTACAAGATGATCTTAAA
ACATACGACAAGTATATTTATATTACAACGATGTTATTTAGTACGTTAGCAACTCTTTATCTCTTATTAACGAAGCAGAA
CAACACACATTACACACTATTTTTATTATTAATAATTGGTTATATAACGATTCACTTCTTAATAGAATATCAAACAAGAT
ATCGATACTTTATCATCCCTAGCTTTACAATCATTCAAGGTTATGGGTTATATGTAGTTTATCGTCTCATGTCTAAAAGA
AAGGCCAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTCTTAATCCCCTAAAAACATCCCTTTACACTAACATTTAATGTGTAAAGGGATTTCATTTTAAAATAACCATGCAAT
TTGATAAGGAGTTTTTAGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAGCGTAAGCTCGGTGCAATTACCGAGCTTACGCTTTTTATTTATATTCTTTTTTTATTGTAAATATGCTTAATGCCA
AAAGCAGCTAAAAAGATCAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 483; Mature: 483

Protein sequence:

>483_residues
MQHTFPLKLNTFFVKCLLVLCLIISAAITWQSIGIIQEKTDTHSFIIIPIIILIGLLFLLIGYISNKYMSTFIFTVSLIV
LAFSVRLIWVLNVPTPIESDFSVMYNSAIQATKGDFSFAQDDYYTSWVYQLGFTMYQAFIIKLFGEGPFLLKLLNIMYCT
GTTWLVYKITSYVFNEWAGRMAGLLYALYIPSIVLSSLLTNQHIATFLFYLGFYLLITKGLTHKYMWIFIGIFLALGDIM
RPLGAFVLIAVALYVFLQGILGKSKQDILTSIKKLSGIFIVFYLVHYIISSSFIYTGITQYPLSNRDPLWKFTVGLNHET
RGGYSSADVEYVMSFKLGKEREAVEKKLIQERLADPEKVLSLFGDKFTIMWADYDSAPVWSLATLSNTESDMVTLQDDLK
TYDKYIYITTMLFSTLATLYLLLTKQNNTHYTLFLLLIIGYITIHFLIEYQTRYRYFIIPSFTIIQGYGLYVVYRLMSKR
KAK

Sequences:

>Translated_483_residues
MQHTFPLKLNTFFVKCLLVLCLIISAAITWQSIGIIQEKTDTHSFIIIPIIILIGLLFLLIGYISNKYMSTFIFTVSLIV
LAFSVRLIWVLNVPTPIESDFSVMYNSAIQATKGDFSFAQDDYYTSWVYQLGFTMYQAFIIKLFGEGPFLLKLLNIMYCT
GTTWLVYKITSYVFNEWAGRMAGLLYALYIPSIVLSSLLTNQHIATFLFYLGFYLLITKGLTHKYMWIFIGIFLALGDIM
RPLGAFVLIAVALYVFLQGILGKSKQDILTSIKKLSGIFIVFYLVHYIISSSFIYTGITQYPLSNRDPLWKFTVGLNHET
RGGYSSADVEYVMSFKLGKEREAVEKKLIQERLADPEKVLSLFGDKFTIMWADYDSAPVWSLATLSNTESDMVTLQDDLK
TYDKYIYITTMLFSTLATLYLLLTKQNNTHYTLFLLLIIGYITIHFLIEYQTRYRYFIIPSFTIIQGYGLYVVYRLMSKR
KAK
>Mature_483_residues
MQHTFPLKLNTFFVKCLLVLCLIISAAITWQSIGIIQEKTDTHSFIIIPIIILIGLLFLLIGYISNKYMSTFIFTVSLIV
LAFSVRLIWVLNVPTPIESDFSVMYNSAIQATKGDFSFAQDDYYTSWVYQLGFTMYQAFIIKLFGEGPFLLKLLNIMYCT
GTTWLVYKITSYVFNEWAGRMAGLLYALYIPSIVLSSLLTNQHIATFLFYLGFYLLITKGLTHKYMWIFIGIFLALGDIM
RPLGAFVLIAVALYVFLQGILGKSKQDILTSIKKLSGIFIVFYLVHYIISSSFIYTGITQYPLSNRDPLWKFTVGLNHET
RGGYSSADVEYVMSFKLGKEREAVEKKLIQERLADPEKVLSLFGDKFTIMWADYDSAPVWSLATLSNTESDMVTLQDDLK
TYDKYIYITTMLFSTLATLYLLLTKQNNTHYTLFLLLIIGYITIHFLIEYQTRYRYFIIPSFTIIQGYGLYVVYRLMSKR
KAK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55643; Mature: 55643

Theoretical pI: Translated: 9.21; Mature: 9.21

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQHTFPLKLNTFFVKCLLVLCLIISAAITWQSIGIIQEKTDTHSFIIIPIIILIGLLFLL
CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IGYISNKYMSTFIFTVSLIVLAFSVRLIWVLNVPTPIESDFSVMYNSAIQATKGDFSFAQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
DDYYTSWVYQLGFTMYQAFIIKLFGEGPFLLKLLNIMYCTGTTWLVYKITSYVFNEWAGR
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MAGLLYALYIPSIVLSSLLTNQHIATFLFYLGFYLLITKGLTHKYMWIFIGIFLALGDIM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RPLGAFVLIAVALYVFLQGILGKSKQDILTSIKKLSGIFIVFYLVHYIISSSFIYTGITQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCEE
YPLSNRDPLWKFTVGLNHETRGGYSSADVEYVMSFKLGKEREAVEKKLIQERLADPEKVL
CCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
SLFGDKFTIMWADYDSAPVWSLATLSNTESDMVTLQDDLKTYDKYIYITTMLFSTLATLY
HHHCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLTKQNNTHYTLFLLLIIGYITIHFLIEYQTRYRYFIIPSFTIIQGYGLYVVYRLMSKR
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEEECCCHHHHCCHHHHHHHHHHHH
KAK
CCC
>Mature Secondary Structure
MQHTFPLKLNTFFVKCLLVLCLIISAAITWQSIGIIQEKTDTHSFIIIPIIILIGLLFLL
CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IGYISNKYMSTFIFTVSLIVLAFSVRLIWVLNVPTPIESDFSVMYNSAIQATKGDFSFAQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
DDYYTSWVYQLGFTMYQAFIIKLFGEGPFLLKLLNIMYCTGTTWLVYKITSYVFNEWAGR
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MAGLLYALYIPSIVLSSLLTNQHIATFLFYLGFYLLITKGLTHKYMWIFIGIFLALGDIM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RPLGAFVLIAVALYVFLQGILGKSKQDILTSIKKLSGIFIVFYLVHYIISSSFIYTGITQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCEE
YPLSNRDPLWKFTVGLNHETRGGYSSADVEYVMSFKLGKEREAVEKKLIQERLADPEKVL
CCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
SLFGDKFTIMWADYDSAPVWSLATLSNTESDMVTLQDDLKTYDKYIYITTMLFSTLATLY
HHHCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLTKQNNTHYTLFLLLIIGYITIHFLIEYQTRYRYFIIPSFTIIQGYGLYVVYRLMSKR
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEEECCCHHHHCCHHHHHHHHHHHH
KAK
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA