| Definition | Bacillus cereus AH820, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011773 |
| Length | 5,302,683 |
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The map label for this gene is 218905489
Identifier: 218905489
GI number: 218905489
Start: 4150660
End: 4155309
Strand: Reverse
Name: 218905489
Synonym: BCAH820_4374
Alternate gene names: NA
Gene position: 4155309-4150660 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218905490
Following gene: 218905488
Centisome position: 78.36
GC content: 38.6
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases CAAAATGATGAGCCTAAGCTAGCAACAGCGGAACAAGTACCTTGGTTGTAAGGGAGGTGGTAGCTTGTCACAAGATATGG AATTAGGCGTCAAGGTCTCC
Downstream 100 bases:
>100_bases TGCATTTAACTATAATAAGAAAGAGTGGGAAACGATATAAGCTTTCTCAAGAAACAGGATATCATGTTTTATATTTTCGT CCTGATTCAATAAGAGTGAA
Product: phage tail tape measure protein, family, core region
Products: NA
Alternate protein names: Phage Protein; Phage-Related Tail Protein; Phage Related Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Family Core Region; Phage Tail Tape Measure Protein Family; Minor Tail -Like; Tail Length Tape Measure Protein; Phage Tail Tape Measure Core Region; Phage Tail Length Tape-Measure Protein; Phage Tail Fiber Protein; Tape Measure Protein; Phage-Like Protein; Phage Minor Tail Protein; Tail Tape Measure Protein; Tail Tape Meausure Protein; Phage Tail Protein; Truncated PhiSLT; Bacteriophage-Related Protein; Bacteriophage Tape Measure Protein; Prophage; Prophage Tail Length Determinator; Phage Tail Tape Mesure Protein; Tail Fiber Protein T; Phage Tape Measure Protein; Phage Tail Like Protein; Bacteriophage P2 Tail Protein GpT; Prophage Pi3 Protein; Bacteriophage Tail Fiber Protein T; Minor Tail Protein Gp; Phage Tail; Phage Protein Tail Length Tape Measure Protein; Tail Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Core Region; Phage Tail Tape Measure Protein TMP; Tape-Measure
Number of amino acids: Translated: 1549; Mature: 1549
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_1549_residues MDLRNFDSGVAGMNRKLKMVDSEFKAASEEAKRYGNSVSQLRTKMDYLTQKLDIQKQKVSHFSQEIEKLRNKQQQLRTSS ENLAGKMQRLEREYKQSAQATGKNSEQTKRLKQELDSVKTQYTQNIQSLSRVNAAIEKNTTDLNRAREAEARLKNQIHQT NEALERQTSLFHRAGERMRSIGNRMQDVGATMGASFMAGATTMGYALGKTITTAANFESAMSRVAALSGASDAELQKLTQ TARDLGASTSFSASQAAEGMQYLAMAGFKTNDVIAAMPGLLDLAASGQMDLGAAADITSNIMSGFGIAAQDAGRVADVLA KASTNANTDVAQLGEAMVYLAPVSKSLGWSLEEATAAVMAMSDAGIQGAQAGAAFSTSMGRLAKPTGEMEKTMKKLKIEI FDANGKMKSMPGVIKELEKATRGMTDQQKSATLTTIFGAEAYKHWAVLIDKSSDALASNTDMLKKSAGTAKEIAAKQLDN LKGKIVILQSSIESASITIGHALIPAIDAIASGVQSAVDWFNNLDEGTQQMIATGAALTVGIMGIVGVLGLMSMAIGALL ANPVVIAIAAATGAIAGLSLAVIKLMEDTKKADNDARNFGDGVSEGTKKAASGYVKMRDQALVALNDLAFSTGEKSKEAV QKAHEEFAKLTDEAIKALEKDKAKFNNFMGKFFGDAADEGTKKLSERIRSKANEYYAQQEEAIRNADKTMHDLISKYGNN LFDMSEKDFQRYTAAWQAFDKSTATSVSKSIGELKKVNDAFNKIDKGVSLEQAQKHVTELTNSTTKSLSEISKARDKDVD NAKKYAKQIGLQGQEETAFIDQVKRKYGEQEVAVRENYYTKMNKIRDVLGAKQSELDFEGQMTKAEKDRFDAFLVGTGSA SAGFEDLYDKNNKFFDKLKGNFDKSVSDWTKYEESVKRFGDALPESLNQFYDTLKSGGEKAKIATELIAIEMENGVKAVD LGPAGKVKVDEFIAGIQNGTYNIEHVSIATINQMRDTFGQQSLTQEGISTMKSYVDGLRETESVKAIAKNLKLDLQNETK IDLGPYGQHTAKTFAEGLKDGSMGIDAVYIYFQQKLKGVTQVDLNPEGRQTIATLKTGLQNGFLDVNQVLEKFKLDVKSD VKVDVKGEGQFTVQTLAEGLSSGQINVDTAIKAIKGLVEQGATINLTEQGKQIPQTQADGIQQNQQAPFAAAEQTKQGIE NRLGATSDGNGGPKSMLDMQQKMLENQGPVIQQADAVKNNVQNTLSGTSDGNGGANSINTMHGNMINTQGFVFTQAGFIN SNVQGILGSTTDGNGGVRAPSTMATNIANTKGSVDAQASNVKNSSEQILGSATDGGGGKKQGSEHASGLSSQKGNVESAG KSVAESGKEGLGSVKTNSIGESFASGFASGIKNGDGPVMSAAKGLANIALNAMRGELKVNSPSKRVRDEAGHPVGEGFEV GITEKIGAVKNAAQRMAQASIPKVNPADISRATNYLRSSTNSSATGDSYQSSNSPSLRGGASFGSMPMQRNTPIQLVIND QVLGEAVVPWVDLAQGQRVNTTLFFSGAR >Mature_1549_residues MDLRNFDSGVAGMNRKLKMVDSEFKAASEEAKRYGNSVSQLRTKMDYLTQKLDIQKQKVSHFSQEIEKLRNKQQQLRTSS ENLAGKMQRLEREYKQSAQATGKNSEQTKRLKQELDSVKTQYTQNIQSLSRVNAAIEKNTTDLNRAREAEARLKNQIHQT NEALERQTSLFHRAGERMRSIGNRMQDVGATMGASFMAGATTMGYALGKTITTAANFESAMSRVAALSGASDAELQKLTQ TARDLGASTSFSASQAAEGMQYLAMAGFKTNDVIAAMPGLLDLAASGQMDLGAAADITSNIMSGFGIAAQDAGRVADVLA KASTNANTDVAQLGEAMVYLAPVSKSLGWSLEEATAAVMAMSDAGIQGAQAGAAFSTSMGRLAKPTGEMEKTMKKLKIEI FDANGKMKSMPGVIKELEKATRGMTDQQKSATLTTIFGAEAYKHWAVLIDKSSDALASNTDMLKKSAGTAKEIAAKQLDN LKGKIVILQSSIESASITIGHALIPAIDAIASGVQSAVDWFNNLDEGTQQMIATGAALTVGIMGIVGVLGLMSMAIGALL ANPVVIAIAAATGAIAGLSLAVIKLMEDTKKADNDARNFGDGVSEGTKKAASGYVKMRDQALVALNDLAFSTGEKSKEAV QKAHEEFAKLTDEAIKALEKDKAKFNNFMGKFFGDAADEGTKKLSERIRSKANEYYAQQEEAIRNADKTMHDLISKYGNN LFDMSEKDFQRYTAAWQAFDKSTATSVSKSIGELKKVNDAFNKIDKGVSLEQAQKHVTELTNSTTKSLSEISKARDKDVD NAKKYAKQIGLQGQEETAFIDQVKRKYGEQEVAVRENYYTKMNKIRDVLGAKQSELDFEGQMTKAEKDRFDAFLVGTGSA SAGFEDLYDKNNKFFDKLKGNFDKSVSDWTKYEESVKRFGDALPESLNQFYDTLKSGGEKAKIATELIAIEMENGVKAVD LGPAGKVKVDEFIAGIQNGTYNIEHVSIATINQMRDTFGQQSLTQEGISTMKSYVDGLRETESVKAIAKNLKLDLQNETK IDLGPYGQHTAKTFAEGLKDGSMGIDAVYIYFQQKLKGVTQVDLNPEGRQTIATLKTGLQNGFLDVNQVLEKFKLDVKSD VKVDVKGEGQFTVQTLAEGLSSGQINVDTAIKAIKGLVEQGATINLTEQGKQIPQTQADGIQQNQQAPFAAAEQTKQGIE NRLGATSDGNGGPKSMLDMQQKMLENQGPVIQQADAVKNNVQNTLSGTSDGNGGANSINTMHGNMINTQGFVFTQAGFIN SNVQGILGSTTDGNGGVRAPSTMATNIANTKGSVDAQASNVKNSSEQILGSATDGGGGKKQGSEHASGLSSQKGNVESAG KSVAESGKEGLGSVKTNSIGESFASGFASGIKNGDGPVMSAAKGLANIALNAMRGELKVNSPSKRVRDEAGHPVGEGFEV GITEKIGAVKNAAQRMAQASIPKVNPADISRATNYLRSSTNSSATGDSYQSSNSPSLRGGASFGSMPMQRNTPIQLVIND QVLGEAVVPWVDLAQGQRVNTTLFFSGAR
Specific function: Unknown
COG id: COG5283
COG function: function code S; Phage-related tail protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 165618; Mature: 165618
Theoretical pI: Translated: 8.59; Mature: 8.59
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDLRNFDSGVAGMNRKLKMVDSEFKAASEEAKRYGNSVSQLRTKMDYLTQKLDIQKQKVS CCCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HFSQEIEKLRNKQQQLRTSSENLAGKMQRLEREYKQSAQATGKNSEQTKRLKQELDSVKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH QYTQNIQSLSRVNAAIEKNTTDLNRAREAEARLKNQIHQTNEALERQTSLFHRAGERMRS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGNRMQDVGATMGASFMAGATTMGYALGKTITTAANFESAMSRVAALSGASDAELQKLTQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH TARDLGASTSFSASQAAEGMQYLAMAGFKTNDVIAAMPGLLDLAASGQMDLGAAADITSN HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH IMSGFGIAAQDAGRVADVLAKASTNANTDVAQLGEAMVYLAPVSKSLGWSLEEATAAVMA HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCHHEEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHH MSDAGIQGAQAGAAFSTSMGRLAKPTGEMEKTMKKLKIEIFDANGKMKSMPGVIKELEKA HHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH TRGMTDQQKSATLTTIFGAEAYKHWAVLIDKSSDALASNTDMLKKSAGTAKEIAAKQLDN 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA