Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 218903059

GI number: 218903059

Start: 1850905

End: 1852125

Strand: Direct

Name: yfiS [H]

Synonym: BCAH820_1942

Alternate gene names: 218903059

Gene position: 1850905-1852125 (Clockwise)

Preceding gene: 218903058

Following gene: 218903061

Centisome position: 34.91

GC content: 32.43

Gene sequence:

>1221_bases
GTGTATAATCAAGTTGGGGGGTTAGAAGAGAATAGCACTAGTAGTATTTGGAGCAATAAAATTTTTTCGTATTTTTTCTT
AGCAAGTTGCATTTCTTTAATAGGTAATTCTATGGTTACGCTCGTTTTACCGTTATGGGTAATGAAATTAACGAACTCTC
CATTACTTGTCTCGGGAGTAAACGTTGCAATTGCGACGGCGGCGATTTTATTTGCACCTGTAACAGGAACGTTAGCAGAT
CGAATGTCGAGAAGAAAGCTTATGATAATTGCGGATGTTATGAGATGTATCGTCATGATTTTAATTGCAGTTATAGCATT
TTATAATAAAATGCTATACATTCCTTTACTAATTTTACTTATAATACGTTCAATTGGGAGTGCTTTATTTACTCCAGCTT
CAAATGCAGCATTAGTGACATATGTGGAAGAAAAGCATGTTCAACAGGCGATTACACTGAGACAAATCTCAATACAAATC
ATATCGTTAGCCATTCCTTTAATGGCTAGCTTTTTAATTAGTCTTTTTAATTTTCATGGAGTATTTGTGTTAGATGCAAT
TACATTTTTTATATCATTTTTAATTTTAATGAACATCAAATTTCCACGTGAACTGAAAATTGAAAAGAAAAAGCCTTTTT
ACGAAGACTTTAAAGAGGGTTTCTCCATATTTAATAGTAATCAATCATTGAAAACATTGCTTATGAGCGCTGCGGTTATT
AATTTACTTGGAGCGGCGTGTATGCTTTCACTCCAAGTAATAGTTGTTAGAGAAATGGACCTTTCTACGCGGTGGTATAG
TATAGTTTTTGCGGCATCACCGATAGGGATTTTAATAGGAGCATTTATTACCAAAAAGATTCGTACATATAAAACGATTA
CGACTGCTTTTATATTTACTGCTATTATGGGGATTTTTAATGCTGCAATGGGTACGACAGTAAATCCGGTGTTATTTTCT
GTTTATTATTTTCTATCAGGGATTGCATTTGGAGTGAGTAATGTATATTTTGGAGTGTTGTATAGAAAGTTAGTTCCAAA
TGAAGTGCAAGGAAGATTTTTCGGTTTTTTAAGTTCGTTATTATTAGTATCTACTCCAGTTGGAATTGCACTAACAGGAT
ATTTCTTAGAGTCAATTTCAGCTTCTATTGTATTTATTATAATTGGTATTATTACGTTTCTAGTTTCGGTTATTTCATTT
GTAATGATAAATAAGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGAAGAAGGTTTTTTGTCATTTAAATAGAGAATTTAAAAGGTGGTGATACAGAAGAGAAAGCATTAAAGAGAATATAGA
AAGAGAAACCGGAGGGCATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTGTTGTATGAGATTTTTCAAAAATAAAAAACGTCCTGCTATAGGACGTTTTTTATTATGTATATTGCTGCTTCTTCTTA
ATAAGTAACAACACTTGTGA

Product: multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 406; Mature: 406

Protein sequence:

>406_residues
MYNQVGGLEENSTSSIWSNKIFSYFFLASCISLIGNSMVTLVLPLWVMKLTNSPLLVSGVNVAIATAAILFAPVTGTLAD
RMSRRKLMIIADVMRCIVMILIAVIAFYNKMLYIPLLILLIIRSIGSALFTPASNAALVTYVEEKHVQQAITLRQISIQI
ISLAIPLMASFLISLFNFHGVFVLDAITFFISFLILMNIKFPRELKIEKKKPFYEDFKEGFSIFNSNQSLKTLLMSAAVI
NLLGAACMLSLQVIVVREMDLSTRWYSIVFAASPIGILIGAFITKKIRTYKTITTAFIFTAIMGIFNAAMGTTVNPVLFS
VYYFLSGIAFGVSNVYFGVLYRKLVPNEVQGRFFGFLSSLLLVSTPVGIALTGYFLESISASIVFIIIGIITFLVSVISF
VMINKK

Sequences:

>Translated_406_residues
MYNQVGGLEENSTSSIWSNKIFSYFFLASCISLIGNSMVTLVLPLWVMKLTNSPLLVSGVNVAIATAAILFAPVTGTLAD
RMSRRKLMIIADVMRCIVMILIAVIAFYNKMLYIPLLILLIIRSIGSALFTPASNAALVTYVEEKHVQQAITLRQISIQI
ISLAIPLMASFLISLFNFHGVFVLDAITFFISFLILMNIKFPRELKIEKKKPFYEDFKEGFSIFNSNQSLKTLLMSAAVI
NLLGAACMLSLQVIVVREMDLSTRWYSIVFAASPIGILIGAFITKKIRTYKTITTAFIFTAIMGIFNAAMGTTVNPVLFS
VYYFLSGIAFGVSNVYFGVLYRKLVPNEVQGRFFGFLSSLLLVSTPVGIALTGYFLESISASIVFIIIGIITFLVSVISF
VMINKK
>Mature_406_residues
MYNQVGGLEENSTSSIWSNKIFSYFFLASCISLIGNSMVTLVLPLWVMKLTNSPLLVSGVNVAIATAAILFAPVTGTLAD
RMSRRKLMIIADVMRCIVMILIAVIAFYNKMLYIPLLILLIIRSIGSALFTPASNAALVTYVEEKHVQQAITLRQISIQI
ISLAIPLMASFLISLFNFHGVFVLDAITFFISFLILMNIKFPRELKIEKKKPFYEDFKEGFSIFNSNQSLKTLLMSAAVI
NLLGAACMLSLQVIVVREMDLSTRWYSIVFAASPIGILIGAFITKKIRTYKTITTAFIFTAIMGIFNAAMGTTVNPVLFS
VYYFLSGIAFGVSNVYFGVLYRKLVPNEVQGRFFGFLSSLLLVSTPVGIALTGYFLESISASIVFIIIGIITFLVSVISF
VMINKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44926; Mature: 44926

Theoretical pI: Translated: 10.14; Mature: 10.14

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYNQVGGLEENSTSSIWSNKIFSYFFLASCISLIGNSMVTLVLPLWVMKLTNSPLLVSGV
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECC
NVAIATAAILFAPVTGTLADRMSRRKLMIIADVMRCIVMILIAVIAFYNKMLYIPLLILL
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIRSIGSALFTPASNAALVTYVEEKHVQQAITLRQISIQIISLAIPLMASFLISLFNFHG
HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
VFVLDAITFFISFLILMNIKFPRELKIEKKKPFYEDFKEGFSIFNSNQSLKTLLMSAAVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
NLLGAACMLSLQVIVVREMDLSTRWYSIVFAASPIGILIGAFITKKIRTYKTITTAFIFT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIMGIFNAAMGTTVNPVLFSVYYFLSGIAFGVSNVYFGVLYRKLVPNEVQGRFFGFLSSL
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
LLVSTPVGIALTGYFLESISASIVFIIIGIITFLVSVISFVMINKK
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MYNQVGGLEENSTSSIWSNKIFSYFFLASCISLIGNSMVTLVLPLWVMKLTNSPLLVSGV
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECC
NVAIATAAILFAPVTGTLADRMSRRKLMIIADVMRCIVMILIAVIAFYNKMLYIPLLILL
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIRSIGSALFTPASNAALVTYVEEKHVQQAITLRQISIQIISLAIPLMASFLISLFNFHG
HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
VFVLDAITFFISFLILMNIKFPRELKIEKKKPFYEDFKEGFSIFNSNQSLKTLLMSAAVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
NLLGAACMLSLQVIVVREMDLSTRWYSIVFAASPIGILIGAFITKKIRTYKTITTAFIFT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIMGIFNAAMGTTVNPVLFSVYYFLSGIAFGVSNVYFGVLYRKLVPNEVQGRFFGFLSSL
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
LLVSTPVGIALTGYFLESISASIVFIIIGIITFLVSVISFVMINKK
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]