| Definition | Bacillus cereus AH820, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011773 |
| Length | 5,302,683 |
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The map label for this gene is yhgE [H]
Identifier: 218902278
GI number: 218902278
Start: 1107898
End: 1110507
Strand: Direct
Name: yhgE [H]
Synonym: BCAH820_1160
Alternate gene names: 218902278
Gene position: 1107898-1110507 (Clockwise)
Preceding gene: 218902277
Following gene: 218902279
Centisome position: 20.89
GC content: 37.59
Gene sequence:
>2610_bases ATGAAAGGAAATCAGTTACTTCGTAAAGAGTTCACACAAATTATAAAAAGTAAAAAAATATTAATTCCAATTATCGCAGT TCTATTCGTACCGATTTTATATGCAGGCATGTTTTTATGGGCCTTTTGGGATCCGTATAAACAGTTAGATGATTTACCAG TTGCGGTAGTCAATTTAGATAAAGGGGCAGTATTTGATGGGAAACCAATTGAGGTCGGAAAAGGGCTCGTTGATAATTTA AAAGATAATACCAGCTTTAAATGGGAATTTGTAAGTGAAAAAGAAGCGAAAAAAGGAATGGAAGGCAGAAAGTATTACAT GTTAGTACGCATTCCAGATGACTTCTCAAGTAACGCTACAACGTTATTAAAAGACGATCCGAAGCCATTAAACTTAGAAT ACATTCCAAACGAAAGCTTAAACTTCTTATCTTCCCAAATTGGCGGAACAGCCATTGAAAAAATTAAAGGTGAAGTAGCA AGTACGTTAACGAAAACATATGCAGAGAAAATGTTTGATTCCATTCAAGACGTCTCAAAAGGATTAGCAGATGGGGCGGA AGGAGCAAGTAAACTACATGACGGATCAAGTGAGTTGCATGATGGTTCAAGTAAAGTAACGGATGGACTTCATACACTTC AAGGGAAGTCTGGGGAGATGAAGGATGGAGTTCAGAAATTAGCAGATGGATCTAATAAATTAGTAGATGGGTCAGGAAAA GTGACAGCAGGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAAGCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGACGG TTTAAATACGTTAAATAGTAAAACCGGTGAAATGCAAAAAGGAATTAGTGAATTGCATGATGGATCTGAGAAAGTAACTA ACGGTTTGAGCATATTGGTAAGTAAAACCGGTGAATTAAAAACAGGAACAACTGAACTATCAAATGGTATGGAAAAACTT GCGGGAGGGCAAAGGCAATTAGAGGAAGGTTCTCAAGAGATTCAAAAGGGTTTGCAAGAGTTAAATAATAAAGTACAAAG CTCTGTTGCAGGATTAGGGGAAATGCAGTCGAAAGTTCCTTCTATATTGAATACAGTAAATGAGAAAATAGATGGAGCTG GGGCGAATGTAAATCAGTTAAATGAACTTACACAATCAACAGCAGGAGATGCAAAAAATGCAACGCAAGATGTAGCGAAT TTACAAAAGCAAATTGAAAGTTTACCAAAAGAATATCAAGAGCAGTTACAACCATTCATAACAAATGCGGTAAAAAGTAC AGCGACAGTTCAGCAAAAAGCTGCCGGAGTAGCAGGCGGAACAAATAAATTAAATGAAGAAGTAAAACAATTAAAAGGCG AAATCAGTGAAAAGACAAGTGGGATGCAAAGCAAAATGCCGAATCCAGAAGATGTAGGAAATTTAACGAGTGGTATTAAA AAATTAACGAATGCACAAAACGAATTTGTAAGTAAGTTTCATGGATTAGGTGAAGGGTTAGGTAATGCTAAAGTAGGTGT AGATCGATTAAAAAACGGATCAGGGCAATTAATTGATGGGGTAAATCAATTGTTTGATGGATCTGGAAAGGTAACAGAAG GCTTAGGAACATTATCTGTAGGAGCAAACCAAATGGCAGGTGGAATAAATCAATTAGCAGATGGCTCAAGCCAAGTGACA GGCGGTTTAGGAACATTATCTGTAGGGGTAACAAAATTAGCAGATGGATCTGATCAAGTAACAACTGGCATAGGTACTCT AAATGGTGGTCTAAATAAAATGTCAACCGGCTCAACCCAGCTAATCGACGGAGTTAATAAACTAGCGGACGGTTCCGGAA AAGTAACGGATGGCCTCGTAAAAGTAAACGATGGTTCAGGTGAACTTGCTGAGAAACTTGGCGAAGGGGCAGAGAAAACT GGTGAAGTAAAAGGAACGGATAAAACGTATGATATGTTTGCAAGTCCTGTAAAAGTGAAGACGGAGAAAATGGCGGAAGT TCCAAACTACGGAACTGGATTCACACCGTATTTCTTATCACTCGGTTTATTCGTTGGGGCATTACTATTATCAATCGTAT ATCCATTACGTGATACAGTTGGCATTCCAAAATCAGGGTTTAGCTGGTTTATTAGTAAGTTCGGCGTTTTACTATCAGTC GGTGTTATTCAAGCGGTAGTAGCTGATGTTATATTACTGTTCGGATTAGGTGTAGAAGTACAAAGTATTCCATACTTCAT ACTCTTTAGCATCGTTACAAGTTTAGCGTTTATCGCATTAATTCAATGTTTAGTAACAGCATTCGGTGATGCAGGGCGTT TCATCGCTATCATCACATTAATTATTCAGCTTACAACAAGTGCTGGAACATTCCCGCTAGAATTGATTCCGAAGTTTTTA CAACCATTTAATGCTTGGTTACCGATGACATACTCTGTATCTGGATTGAAAGCAGTCGTATCTAGCGGAGACTTTAACTT CATGTGGCAAAACATAGGAATACTCATGATTTTCATCGTTGTATTATCACTTGGAACAATCGCTTCATTAACGTGGATGC ATAAACGACAGTTTAAAAATATTGCTGAAAATCAATCGGTTGAAGCATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AATTCGGGGATAAGGCATATGTATGAATCAGTATAGCCTTTTTGTTTGGGTAAAAATGACCGATTGAACAATTTGGTCAT TTTAAAAAGGGGGAGAAATG
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAAAGCACCTTTTTGGTGCTTTTTTATTTTAATATAGGGCATTTTTTCTGTAGTTCGGATAGGAATCTTTCTAAAAAC TATAGAAACGAAAGAAAAGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFB [H]
Number of amino acids: Translated: 869; Mature: 869
Protein sequence:
>869_residues MKGNQLLRKEFTQIIKSKKILIPIIAVLFVPILYAGMFLWAFWDPYKQLDDLPVAVVNLDKGAVFDGKPIEVGKGLVDNL KDNTSFKWEFVSEKEAKKGMEGRKYYMLVRIPDDFSSNATTLLKDDPKPLNLEYIPNESLNFLSSQIGGTAIEKIKGEVA STLTKTYAEKMFDSIQDVSKGLADGAEGASKLHDGSSELHDGSSKVTDGLHTLQGKSGEMKDGVQKLADGSNKLVDGSGK VTAGLNTLNSKSGIGKLQDGSGKVTDGLNTLNSKTGEMQKGISELHDGSEKVTNGLSILVSKTGELKTGTTELSNGMEKL AGGQRQLEEGSQEIQKGLQELNNKVQSSVAGLGEMQSKVPSILNTVNEKIDGAGANVNQLNELTQSTAGDAKNATQDVAN LQKQIESLPKEYQEQLQPFITNAVKSTATVQQKAAGVAGGTNKLNEEVKQLKGEISEKTSGMQSKMPNPEDVGNLTSGIK KLTNAQNEFVSKFHGLGEGLGNAKVGVDRLKNGSGQLIDGVNQLFDGSGKVTEGLGTLSVGANQMAGGINQLADGSSQVT GGLGTLSVGVTKLADGSDQVTTGIGTLNGGLNKMSTGSTQLIDGVNKLADGSGKVTDGLVKVNDGSGELAEKLGEGAEKT GEVKGTDKTYDMFASPVKVKTEKMAEVPNYGTGFTPYFLSLGLFVGALLLSIVYPLRDTVGIPKSGFSWFISKFGVLLSV GVIQAVVADVILLFGLGVEVQSIPYFILFSIVTSLAFIALIQCLVTAFGDAGRFIAIITLIIQLTTSAGTFPLELIPKFL QPFNAWLPMTYSVSGLKAVVSSGDFNFMWQNIGILMIFIVVLSLGTIASLTWMHKRQFKNIAENQSVEA
Sequences:
>Translated_869_residues MKGNQLLRKEFTQIIKSKKILIPIIAVLFVPILYAGMFLWAFWDPYKQLDDLPVAVVNLDKGAVFDGKPIEVGKGLVDNL KDNTSFKWEFVSEKEAKKGMEGRKYYMLVRIPDDFSSNATTLLKDDPKPLNLEYIPNESLNFLSSQIGGTAIEKIKGEVA STLTKTYAEKMFDSIQDVSKGLADGAEGASKLHDGSSELHDGSSKVTDGLHTLQGKSGEMKDGVQKLADGSNKLVDGSGK VTAGLNTLNSKSGIGKLQDGSGKVTDGLNTLNSKTGEMQKGISELHDGSEKVTNGLSILVSKTGELKTGTTELSNGMEKL AGGQRQLEEGSQEIQKGLQELNNKVQSSVAGLGEMQSKVPSILNTVNEKIDGAGANVNQLNELTQSTAGDAKNATQDVAN LQKQIESLPKEYQEQLQPFITNAVKSTATVQQKAAGVAGGTNKLNEEVKQLKGEISEKTSGMQSKMPNPEDVGNLTSGIK KLTNAQNEFVSKFHGLGEGLGNAKVGVDRLKNGSGQLIDGVNQLFDGSGKVTEGLGTLSVGANQMAGGINQLADGSSQVT GGLGTLSVGVTKLADGSDQVTTGIGTLNGGLNKMSTGSTQLIDGVNKLADGSGKVTDGLVKVNDGSGELAEKLGEGAEKT GEVKGTDKTYDMFASPVKVKTEKMAEVPNYGTGFTPYFLSLGLFVGALLLSIVYPLRDTVGIPKSGFSWFISKFGVLLSV GVIQAVVADVILLFGLGVEVQSIPYFILFSIVTSLAFIALIQCLVTAFGDAGRFIAIITLIIQLTTSAGTFPLELIPKFL QPFNAWLPMTYSVSGLKAVVSSGDFNFMWQNIGILMIFIVVLSLGTIASLTWMHKRQFKNIAENQSVEA >Mature_869_residues MKGNQLLRKEFTQIIKSKKILIPIIAVLFVPILYAGMFLWAFWDPYKQLDDLPVAVVNLDKGAVFDGKPIEVGKGLVDNL KDNTSFKWEFVSEKEAKKGMEGRKYYMLVRIPDDFSSNATTLLKDDPKPLNLEYIPNESLNFLSSQIGGTAIEKIKGEVA STLTKTYAEKMFDSIQDVSKGLADGAEGASKLHDGSSELHDGSSKVTDGLHTLQGKSGEMKDGVQKLADGSNKLVDGSGK VTAGLNTLNSKSGIGKLQDGSGKVTDGLNTLNSKTGEMQKGISELHDGSEKVTNGLSILVSKTGELKTGTTELSNGMEKL AGGQRQLEEGSQEIQKGLQELNNKVQSSVAGLGEMQSKVPSILNTVNEKIDGAGANVNQLNELTQSTAGDAKNATQDVAN LQKQIESLPKEYQEQLQPFITNAVKSTATVQQKAAGVAGGTNKLNEEVKQLKGEISEKTSGMQSKMPNPEDVGNLTSGIK KLTNAQNEFVSKFHGLGEGLGNAKVGVDRLKNGSGQLIDGVNQLFDGSGKVTEGLGTLSVGANQMAGGINQLADGSSQVT GGLGTLSVGVTKLADGSDQVTTGIGTLNGGLNKMSTGSTQLIDGVNKLADGSGKVTDGLVKVNDGSGELAEKLGEGAEKT GEVKGTDKTYDMFASPVKVKTEKMAEVPNYGTGFTPYFLSLGLFVGALLLSIVYPLRDTVGIPKSGFSWFISKFGVLLSV GVIQAVVADVILLFGLGVEVQSIPYFILFSIVTSLAFIALIQCLVTAFGDAGRFIAIITLIIQLTTSAGTFPLELIPKFL QPFNAWLPMTYSVSGLKAVVSSGDFNFMWQNIGILMIFIVVLSLGTIASLTWMHKRQFKNIAENQSVEA
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR022703 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 92230; Mature: 92230
Theoretical pI: Translated: 5.55; Mature: 5.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKGNQLLRKEFTQIIKSKKILIPIIAVLFVPILYAGMFLWAFWDPYKQLDDLPVAVVNLD CCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCEEEEECC KGAVFDGKPIEVGKGLVDNLKDNTSFKWEFVSEKEAKKGMEGRKYYMLVRIPDDFSSNAT CCCCCCCCCHHHCCHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCE TLLKDDPKPLNLEYIPNESLNFLSSQIGGTAIEKIKGEVASTLTKTYAEKMFDSIQDVSK EEECCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLADGAEGASKLHDGSSELHDGSSKVTDGLHTLQGKSGEMKDGVQKLADGSNKLVDGSGK HHHCCHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEECCCCC VTAGLNTLNSKSGIGKLQDGSGKVTDGLNTLNSKTGEMQKGISELHDGSEKVTNGLSILV EEECCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHEEE SKTGELKTGTTELSNGMEKLAGGQRQLEEGSQEIQKGLQELNNKVQSSVAGLGEMQSKVP ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SILNTVNEKIDGAGANVNQLNELTQSTAGDAKNATQDVANLQKQIESLPKEYQEQLQPFI HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TNAVKSTATVQQKAAGVAGGTNKLNEEVKQLKGEISEKTSGMQSKMPNPEDVGNLTSGIK HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHH KLTNAQNEFVSKFHGLGEGLGNAKVGVDRLKNGSGQLIDGVNQLFDGSGKVTEGLGTLSV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHC GANQMAGGINQLADGSSQVTGGLGTLSVGVTKLADGSDQVTTGIGTLNGGLNKMSTGSTQ CCHHHHCCHHHHCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCHH LIDGVNKLADGSGKVTDGLVKVNDGSGELAEKLGEGAEKTGEVKGTDKTYDMFASPVKVK HHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHH TEKMAEVPNYGTGFTPYFLSLGLFVGALLLSIVYPLRDTVGIPKSGFSWFISKFGVLLSV HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH GVIQAVVADVILLFGLGVEVQSIPYFILFSIVTSLAFIALIQCLVTAFGDAGRFIAIITL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH IIQLTTSAGTFPLELIPKFLQPFNAWLPMTYSVSGLKAVVSSGDFNFMWQNIGILMIFIV HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH VLSLGTIASLTWMHKRQFKNIAENQSVEA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKGNQLLRKEFTQIIKSKKILIPIIAVLFVPILYAGMFLWAFWDPYKQLDDLPVAVVNLD CCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCEEEEECC KGAVFDGKPIEVGKGLVDNLKDNTSFKWEFVSEKEAKKGMEGRKYYMLVRIPDDFSSNAT CCCCCCCCCHHHCCHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCE TLLKDDPKPLNLEYIPNESLNFLSSQIGGTAIEKIKGEVASTLTKTYAEKMFDSIQDVSK EEECCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLADGAEGASKLHDGSSELHDGSSKVTDGLHTLQGKSGEMKDGVQKLADGSNKLVDGSGK HHHCCHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEECCCCC VTAGLNTLNSKSGIGKLQDGSGKVTDGLNTLNSKTGEMQKGISELHDGSEKVTNGLSILV EEECCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHEEE SKTGELKTGTTELSNGMEKLAGGQRQLEEGSQEIQKGLQELNNKVQSSVAGLGEMQSKVP ECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SILNTVNEKIDGAGANVNQLNELTQSTAGDAKNATQDVANLQKQIESLPKEYQEQLQPFI HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TNAVKSTATVQQKAAGVAGGTNKLNEEVKQLKGEISEKTSGMQSKMPNPEDVGNLTSGIK HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHH KLTNAQNEFVSKFHGLGEGLGNAKVGVDRLKNGSGQLIDGVNQLFDGSGKVTEGLGTLSV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHC GANQMAGGINQLADGSSQVTGGLGTLSVGVTKLADGSDQVTTGIGTLNGGLNKMSTGSTQ CCHHHHCCHHHHCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCHH LIDGVNKLADGSGKVTDGLVKVNDGSGELAEKLGEGAEKTGEVKGTDKTYDMFASPVKVK HHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHH TEKMAEVPNYGTGFTPYFLSLGLFVGALLLSIVYPLRDTVGIPKSGFSWFISKFGVLLSV HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH GVIQAVVADVILLFGLGVEVQSIPYFILFSIVTSLAFIALIQCLVTAFGDAGRFIAIITL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH IIQLTTSAGTFPLELIPKFLQPFNAWLPMTYSVSGLKAVVSSGDFNFMWQNIGILMIFIV HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH VLSLGTIASLTWMHKRQFKNIAENQSVEA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]