| Definition | Bacillus cereus AH820, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011773 |
| Length | 5,302,683 |
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The map label for this gene is 218901736
Identifier: 218901736
GI number: 218901736
Start: 555792
End: 557942
Strand: Direct
Name: 218901736
Synonym: BCAH820_0597
Alternate gene names: NA
Gene position: 555792-557942 (Clockwise)
Preceding gene: 218901735
Following gene: 218901737
Centisome position: 10.48
GC content: 36.22
Gene sequence:
>2151_bases ATGACAATGTATGAAGATCAAGGGCAAAATATCATTAATACTTTGCTAGGTGCGAAAGATAAAACTATTGATTTCGGAAA GCAACAGGACCAATTGAATGATTCCATTAAGAAAATGGATGCAAACCCAGCAGTTAAATTCCAAAAAGCAATGCAAGATT TACAAATGGCCCTTAAACCTGTTCTTGGAGTTATAGCTGATGTTGTTGCTAAAATCGCGGATTGGATTTCTAATAATCCC AAGTTAGCGGCTACCTTGGGAGCTATAGCAATAGCTATAGGAGTGATTTCAGGAGCGTTTATGGCGTTAGCGCCAATAGT TGTCGTCATATCGGGGATAGGAGCCGCAATGATGGGGTGGATAGCAGCAATCGCTTTGATTGTAGCCGCTGTGGTTGCTT TAGGTGTAGTTATATATAAAAATTGGGATTCTATCACGAAATGGACCATTGACGCTTGGAATGCAATTGGAGATTTCTTA TTAGGAATATGGACAGGTATAGCACAATGGGCGAGTGATACATGGAATAGTATTAGTGAATCCACCTCATTCATATGGAA TTCAATTAAAGAATATTTAATAGAACTATGGAATGGAATAAAGGATTTATTAACTGAAACATGGAATACGATGGTTGAAA ATACTACAGAAATATGGAGTTTAATTGTCGAATACTTAACCGGAGTTTGGAATGGTGTAGTTGAGACATTGTCAGCAGCT TGGAATAGTATTAAACAAACAACTTCTGAAGTGTGGACAGCGATTAGTGAGTTTTTTATTAGTATATGGAATGGACTAGT TGCTTTTATAACACCTGTACTACAAGGAATTGCTGATTTCTTTTCTATGATTTGGAATGGTATTTCAACTGTTATTCAAT CTGTATGGAACTTCATTACTCAATACTTGCAAGCGATTTGGACAGCGATTTTATACTTTGCTACTCCGATATTTGAAAGT ATCAAGAATTTCATTTCTGAATGTTGGAATAAGATTAAATCTACTACTAACCTTGTATGGGAAGCTATTAAGAATTTCTT AGTTTCCTGTTGGAATGGTCTAGTAGCATTTGTTGTGCCAATTTTTGAACAAATTAAGTCTTGGATCATTGCCGTGTGGA ATACAGTTAGCTCAACAACAAAAAATGTATGGAATGCAGTGAGAAACTTCTTACAATCATGTTGGAACGGGCTAGTTGCT TTTGTAGTACCAATTTTCAATTCAATAAAAGATTGGATTGTAAGTACATGGAACAGAATCAGTTCAACAACAAGTGCGGT ATGGAATAATATTAAAGGCTTCCTTTCTAGATTATGGAATTCAATAATTTCTGTGGCAGCTTCTATTTTTAATAGAATTA AAGATGTTATTTCAAGTGTTTGGAATATGATTAGTAGCACAAGTAGTAACGTGTGGTCCGGGCTTAAATGGGTGCTCACT AGTATTTGGAATGACATTAAATCAACAGCATTTTCTGTATGGTATGGATTGACAGATGCAATTATGACGCCAGTGAATTG GGTTACTAATGCTGTTAACAGAGCCTTTTACGGTATGCAATCGGCTGTACTCGGTGTATGGAATGGTCTTAAAAGTGGCA TCAAATCAGCTATCAATGGAATTATTTACATGATAAATAAATTCATTTATGCATTTAATACACCAGCGCAATTATTAAAT CGAATCCCGGGAGTCAGTGCGCCTATGATTCCATATGTCCCAATGCTTGCAAAAGGTGGTCATGTTTTAGGTGATGGACA ATTTATTGCGGGTGAAGCTGGACCTGAGTTATTTAGTAAAAAGGGAAATAAAGTATCTGTAACACCACTAAGTTCTTCTG AAAGAATGGGTGGAATTGGTGGTCAATTAGATTTAGTAACCAAAAATGCAGTAGCCACAATACAAAATGTGGCTTCTCAA TTGGCACAAATTGTGACTTATGATGTCCCAAACGCATTAGGAGACGCACTTTTAGCTAGTGTGCCTAATATTTCCGCAGC AACTTCTGGTGGTGGTAATCAACAACCGATAGAAGTTAATTTTTATAATACTGTACGAAATGAAAGAGATATTGACCGCA TGTTTGAAAAAGCTGATGATTGGTTTACGCAAAAAGGACGTAACTTAAATATTGGGATAGGGAGGAATTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CCCTCCACGAGACCGCGACACTTATTAGTGAAAACGTATGCCGAACTTACAGGAAATGAACTGTAAGAAGTAGAGGATAA AAAGCCTTTACGATAACAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTGCTAGATATAGGAATTGATACGGAATTAGCGAGTGACTATAAAATATGCATGGTAGATCGCCCCGCTATTCCAACAG CAAAACAAAAAGTAGAGCAT
Product: putative prophage membrane protein
Products: NA
Alternate protein names: Phage Tail Tape Measure Protein; Phage Protein; Tail Tape Measure Protein; Phage Minor Tail Protein; Phage-Related Tail Protein; TMP Repeat-Containing Protein; Tail Length Tape Measure Protein; TMP Repeat Family; Tape Measure Protein; Phage Tail Tape Measure Protein TP; TMP Repeat Protein; Tail Tape Meausure Protein; Phage Related Protein Minor Tail Protein; Phage Related Protein; Phage Tail Length Tape-Measure Protein; Minor Tail -Like Protein; Prophage Membrane Protein; Phage-Like Protein; Phage Tape Measure Protein; Prophage Lp2 Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Family; Endoglucanase Y; Tail Protein; Mu-Like Phage Minor Tail Protein
Number of amino acids: Translated: 716; Mature: 715
Protein sequence:
>716_residues MTMYEDQGQNIINTLLGAKDKTIDFGKQQDQLNDSIKKMDANPAVKFQKAMQDLQMALKPVLGVIADVVAKIADWISNNP KLAATLGAIAIAIGVISGAFMALAPIVVVISGIGAAMMGWIAAIALIVAAVVALGVVIYKNWDSITKWTIDAWNAIGDFL LGIWTGIAQWASDTWNSISESTSFIWNSIKEYLIELWNGIKDLLTETWNTMVENTTEIWSLIVEYLTGVWNGVVETLSAA WNSIKQTTSEVWTAISEFFISIWNGLVAFITPVLQGIADFFSMIWNGISTVIQSVWNFITQYLQAIWTAILYFATPIFES IKNFISECWNKIKSTTNLVWEAIKNFLVSCWNGLVAFVVPIFEQIKSWIIAVWNTVSSTTKNVWNAVRNFLQSCWNGLVA FVVPIFNSIKDWIVSTWNRISSTTSAVWNNIKGFLSRLWNSIISVAASIFNRIKDVISSVWNMISSTSSNVWSGLKWVLT SIWNDIKSTAFSVWYGLTDAIMTPVNWVTNAVNRAFYGMQSAVLGVWNGLKSGIKSAINGIIYMINKFIYAFNTPAQLLN RIPGVSAPMIPYVPMLAKGGHVLGDGQFIAGEAGPELFSKKGNKVSVTPLSSSERMGGIGGQLDLVTKNAVATIQNVASQ LAQIVTYDVPNALGDALLASVPNISAATSGGGNQQPIEVNFYNTVRNERDIDRMFEKADDWFTQKGRNLNIGIGRN
Sequences:
>Translated_716_residues MTMYEDQGQNIINTLLGAKDKTIDFGKQQDQLNDSIKKMDANPAVKFQKAMQDLQMALKPVLGVIADVVAKIADWISNNP KLAATLGAIAIAIGVISGAFMALAPIVVVISGIGAAMMGWIAAIALIVAAVVALGVVIYKNWDSITKWTIDAWNAIGDFL LGIWTGIAQWASDTWNSISESTSFIWNSIKEYLIELWNGIKDLLTETWNTMVENTTEIWSLIVEYLTGVWNGVVETLSAA WNSIKQTTSEVWTAISEFFISIWNGLVAFITPVLQGIADFFSMIWNGISTVIQSVWNFITQYLQAIWTAILYFATPIFES IKNFISECWNKIKSTTNLVWEAIKNFLVSCWNGLVAFVVPIFEQIKSWIIAVWNTVSSTTKNVWNAVRNFLQSCWNGLVA FVVPIFNSIKDWIVSTWNRISSTTSAVWNNIKGFLSRLWNSIISVAASIFNRIKDVISSVWNMISSTSSNVWSGLKWVLT SIWNDIKSTAFSVWYGLTDAIMTPVNWVTNAVNRAFYGMQSAVLGVWNGLKSGIKSAINGIIYMINKFIYAFNTPAQLLN RIPGVSAPMIPYVPMLAKGGHVLGDGQFIAGEAGPELFSKKGNKVSVTPLSSSERMGGIGGQLDLVTKNAVATIQNVASQ LAQIVTYDVPNALGDALLASVPNISAATSGGGNQQPIEVNFYNTVRNERDIDRMFEKADDWFTQKGRNLNIGIGRN >Mature_715_residues TMYEDQGQNIINTLLGAKDKTIDFGKQQDQLNDSIKKMDANPAVKFQKAMQDLQMALKPVLGVIADVVAKIADWISNNPK LAATLGAIAIAIGVISGAFMALAPIVVVISGIGAAMMGWIAAIALIVAAVVALGVVIYKNWDSITKWTIDAWNAIGDFLL GIWTGIAQWASDTWNSISESTSFIWNSIKEYLIELWNGIKDLLTETWNTMVENTTEIWSLIVEYLTGVWNGVVETLSAAW NSIKQTTSEVWTAISEFFISIWNGLVAFITPVLQGIADFFSMIWNGISTVIQSVWNFITQYLQAIWTAILYFATPIFESI KNFISECWNKIKSTTNLVWEAIKNFLVSCWNGLVAFVVPIFEQIKSWIIAVWNTVSSTTKNVWNAVRNFLQSCWNGLVAF VVPIFNSIKDWIVSTWNRISSTTSAVWNNIKGFLSRLWNSIISVAASIFNRIKDVISSVWNMISSTSSNVWSGLKWVLTS IWNDIKSTAFSVWYGLTDAIMTPVNWVTNAVNRAFYGMQSAVLGVWNGLKSGIKSAINGIIYMINKFIYAFNTPAQLLNR IPGVSAPMIPYVPMLAKGGHVLGDGQFIAGEAGPELFSKKGNKVSVTPLSSSERMGGIGGQLDLVTKNAVATIQNVASQL AQIVTYDVPNALGDALLASVPNISAATSGGGNQQPIEVNFYNTVRNERDIDRMFEKADDWFTQKGRNLNIGIGRN
Specific function: Unknown
COG id: COG5280
COG function: function code S; Phage-related minor tail protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 78907; Mature: 78776
Theoretical pI: Translated: 7.19; Mature: 7.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTMYEDQGQNIINTLLGAKDKTIDFGKQQDQLNDSIKKMDANPAVKFQKAMQDLQMALKP CCCCHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VLGVIADVVAKIADWISNNPKLAATLGAIAIAIGVISGAFMALAPIVVVISGIGAAMMGW HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IAAIALIVAAVVALGVVIYKNWDSITKWTIDAWNAIGDFLLGIWTGIAQWASDTWNSISE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH STSFIWNSIKEYLIELWNGIKDLLTETWNTMVENTTEIWSLIVEYLTGVWNGVVETLSAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WNSIKQTTSEVWTAISEFFISIWNGLVAFITPVLQGIADFFSMIWNGISTVIQSVWNFIT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QYLQAIWTAILYFATPIFESIKNFISECWNKIKSTTNLVWEAIKNFLVSCWNGLVAFVVP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFEQIKSWIIAVWNTVSSTTKNVWNAVRNFLQSCWNGLVAFVVPIFNSIKDWIVSTWNRI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSTTSAVWNNIKGFLSRLWNSIISVAASIFNRIKDVISSVWNMISSTSSNVWSGLKWVLT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH SIWNDIKSTAFSVWYGLTDAIMTPVNWVTNAVNRAFYGMQSAVLGVWNGLKSGIKSAING HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIYMINKFIYAFNTPAQLLNRIPGVSAPMIPYVPMLAKGGHVLGDGQFIAGEAGPELFSK HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEECCCCEECCCCCHHHHHC KGNKVSVTPLSSSERMGGIGGQLDLVTKNAVATIQNVASQLAQIVTYDVPNALGDALLAS CCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH VPNISAATSGGGNQQPIEVNFYNTVRNERDIDRMFEKADDWFTQKGRNLNIGIGRN CCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCC >Mature Secondary Structure TMYEDQGQNIINTLLGAKDKTIDFGKQQDQLNDSIKKMDANPAVKFQKAMQDLQMALKP CCCHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VLGVIADVVAKIADWISNNPKLAATLGAIAIAIGVISGAFMALAPIVVVISGIGAAMMGW HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IAAIALIVAAVVALGVVIYKNWDSITKWTIDAWNAIGDFLLGIWTGIAQWASDTWNSISE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH STSFIWNSIKEYLIELWNGIKDLLTETWNTMVENTTEIWSLIVEYLTGVWNGVVETLSAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WNSIKQTTSEVWTAISEFFISIWNGLVAFITPVLQGIADFFSMIWNGISTVIQSVWNFIT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QYLQAIWTAILYFATPIFESIKNFISECWNKIKSTTNLVWEAIKNFLVSCWNGLVAFVVP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFEQIKSWIIAVWNTVSSTTKNVWNAVRNFLQSCWNGLVAFVVPIFNSIKDWIVSTWNRI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSTTSAVWNNIKGFLSRLWNSIISVAASIFNRIKDVISSVWNMISSTSSNVWSGLKWVLT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH SIWNDIKSTAFSVWYGLTDAIMTPVNWVTNAVNRAFYGMQSAVLGVWNGLKSGIKSAING HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIYMINKFIYAFNTPAQLLNRIPGVSAPMIPYVPMLAKGGHVLGDGQFIAGEAGPELFSK HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEECCCCEECCCCCHHHHHC KGNKVSVTPLSSSERMGGIGGQLDLVTKNAVATIQNVASQLAQIVTYDVPNALGDALLAS CCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH VPNISAATSGGGNQQPIEVNFYNTVRNERDIDRMFEKADDWFTQKGRNLNIGIGRN CCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA