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The map label for this gene is 218709834

Identifier: 218709834

GI number: 218709834

Start: 1994189

End: 1996699

Strand: Reverse

Name: 218709834

Synonym: VS_1847

Alternate gene names: NA

Gene position: 1996699-1994189 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218709835

Following gene: 218709833

Centisome position: 60.52

GC content: 46.04

Gene sequence:

>2511_bases
GTGAGAAAGTTGCATTGCATATGGATGGCAGAATTCGCCTACAAGGAGGGCAACTGCATGTTATGGCCCGTAGTTAAAGC
GCTACTTGGTCACTATCGACGTTACCCACTTCAGATTATCTTGGTATGGCTTGGTTTAACCCTAGGCGTATCACTTTTGG
TTGGTGTTACCGCTATCAACCAACACGCCAAGCAAAGTTATACGCATGGCGAAAAACTCTTTTCGAATCCTCTTCCTTAC
CGTATTCGACCGAAACATAACGCGAATAAAATCCCGCAAGGTTTTTACATTCAGCTTCGTCGTGAAGGCTTTCAGCAGTG
TTCTCCTTTTGACCACCATAGTATCACTGATGAAAATGGTGCAAACTTTATGCTTATTGGCATAGACCCTGTTTCTATGC
TTCAGCTTCAGCCTGGTGCTGCCCTAAAAGAACTCACCACGTTAGATCTCATGAAACCACCATATCCGATCCTAGTGAGT
GATGATCTTGCTGAACATATGGAATGGAAGGATGGGGACTACATTCCACTGATGGATGGTTCAGAGCTAGGTCCAGTGGT
AGTGGACCAAAATAACCTGATTAATGGTACAAGGTTGATTGCGGATATCTCTTTGCTCCGAATGCTTAAACGCAGTGCAG
GGCTTTCCGTGATTGCGTGTTCAGACATGTCTCCCGAGAAGTTTGAACGTCTTAAAAACATGTTGCCCAATGGTTTGACA
ATCTCTCGCAGCTCTAAAGCTGAGCTTGAGTCATTGACTAGCGCTTTCCACTTAAATCTAAAAGCGATGGGCATGCTGTC
GTTTGTCGTTGGCTTGTTTATTTTCTATCAAGCGATGTCGCTGTCTTTCATTCAGCGCCAACCACTCGTCGGAATCTTGA
GACAAACAGGTGTGTCTGGTTGGCAACTGACTAAAGCGCTTTGCTTAGAGTTATTGTTATTGGTTCTACTGAGCTGGATC
TGCGGCAATGTATTCGGTGTCATGTTGGCAAACCAACTGTTACCTGCCGTTTCTTCGAGTTTAGGTGATCTTTACGATGC
GAATGTGGGCTTAACCCTTAGCTGGAGTTGGCGTTGGAGTGGTTATAGCTTATTAATGGCGTTGCTTGGTGCATTCCTAG
CGTGTGCATGGCCATTGGTTCGTTTGCTGAGGTCGCAACCGATTCGTTTGTCATCTCGTTTATCTTTGATGCGTTTTGCT
GGCACTGAGTTTACTTGGCAAGCATTGATTGGTTGTGGTTTCTTGGTTGCAGCCGTCGCTGTGTATCAAGCCCCACAAAC
GCAAGAATCTGGTTTTGCGATTATTGCCCTGATGCTTGTCAGTGTGGCTTTGTTTACGCCTTTCTTGATGTGGAAGTTGT
TCAACAGTTTGTCTTATTCACTGCGTTGGGTTCGTGCTCGCTGGTTCTTTGCGGATGCCGCTTCAAGCATGAGTTATCGT
GGTGTGGCGACAATGGCGTTCATGCTAGCGTTAACAGCGAATATTGGTGTAGAAACCATGGTGGGTAGCTTTAGGGATAC
CACCGATAAATGGCTAACACAGCGTTTGGCTGCAGACCTTTACATTTACCCAACCAACAACGCCGCTGCACGTATGAGTA
ATTGGCTGTCAGAACAGCCTGAAGTCGATTCAGTTTGGTGGCGTTGGGAGAAAGATGTCGCTTCCCCTGTCGGAAGTACC
CAGGTGGTCAGTACTGGTCCTTCTGAAGGCGAATTAGAAGCGCTGACGATCAAGTTAGGTATTCCGAATTACTGGTACCA
CCTGCATCATTCGAAAGGTGTGTTGATCAGTGAATCGATGTCTCTCAAGTTAGGGATTCGCCCAGGCGACTATATAGACC
TTTATGACAGTCTTGGCTCTGGTTGGCAGGTTGTTGGTGTTTATTACGATTATGGCAACCCTTACCATCAAGTCATGATG
TCACATCGAAACTGGCTATCTGGGTTTGCTGGACGCGGAAATGTCGGTCTAGGCGTCATACTCAAAGATGATGTCAATTC
CGTAGGACTTCGAAGTCGATTGGAAAGCGTATTCAGGCTTGGATCTGAGCGTATTTTTGATAATAACAATATTCACAGTC
AGGCGATGAGAGTGTTTGATAGAACATTCGCGATAGCTGATACATTGGGTAACATCACTTTGGTCATCGCGGTCTTCGGC
ATCTTTTTCGCGACGGTTGCGGGTGAAGTGTCTCGACAAAGGCATATTTCATTGCAACGTTGCTTAGGGGTCTCGGCAAA
AGAGCTGATTTTTACAGGCAGCTTGCAGTTGTTTGTATTCGGACTTATTTCTTCCTTGATTGCTATCCCGCTCGGATTGG
CGTTAGCCAGCTTGATCGTCGATATTGTCATTAAGCAGTCTTTTGGGTGGTCACTCGAATTACAAGTGATTCCTTGGGAC
TATTTGCAGACATTTGCGTGGGCCATGGCAGCATTAATGTTAGCTGGTGCATTGCCAGTGATGAGAATGATTCGGAACAC
ACCGATGAAATCACTGAGGGATGCGCTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCAACGGGAAGCCTTGATGAGCGCAATGCGGAAGCTGTGATGCGTTTGCTGACCTCTTTGGCCCGCCAATTAGAATGTAC
ATTATTGCTGGTGACACACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGCTTCAACGAAATGGCTCAAAAAAACTCAGACACCGATTTGTTTCTGCTCTATTACTGATTGGTTTCTTTGGCACTA
TTTTAGGTGTCTGGGCTTAC

Product: ABC transporter transmembrane protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 836; Mature: 836

Protein sequence:

>836_residues
MRKLHCIWMAEFAYKEGNCMLWPVVKALLGHYRRYPLQIILVWLGLTLGVSLLVGVTAINQHAKQSYTHGEKLFSNPLPY
RIRPKHNANKIPQGFYIQLRREGFQQCSPFDHHSITDENGANFMLIGIDPVSMLQLQPGAALKELTTLDLMKPPYPILVS
DDLAEHMEWKDGDYIPLMDGSELGPVVVDQNNLINGTRLIADISLLRMLKRSAGLSVIACSDMSPEKFERLKNMLPNGLT
ISRSSKAELESLTSAFHLNLKAMGMLSFVVGLFIFYQAMSLSFIQRQPLVGILRQTGVSGWQLTKALCLELLLLVLLSWI
CGNVFGVMLANQLLPAVSSSLGDLYDANVGLTLSWSWRWSGYSLLMALLGAFLACAWPLVRLLRSQPIRLSSRLSLMRFA
GTEFTWQALIGCGFLVAAVAVYQAPQTQESGFAIIALMLVSVALFTPFLMWKLFNSLSYSLRWVRARWFFADAASSMSYR
GVATMAFMLALTANIGVETMVGSFRDTTDKWLTQRLAADLYIYPTNNAAARMSNWLSEQPEVDSVWWRWEKDVASPVGST
QVVSTGPSEGELEALTIKLGIPNYWYHLHHSKGVLISESMSLKLGIRPGDYIDLYDSLGSGWQVVGVYYDYGNPYHQVMM
SHRNWLSGFAGRGNVGLGVILKDDVNSVGLRSRLESVFRLGSERIFDNNNIHSQAMRVFDRTFAIADTLGNITLVIAVFG
IFFATVAGEVSRQRHISLQRCLGVSAKELIFTGSLQLFVFGLISSLIAIPLGLALASLIVDIVIKQSFGWSLELQVIPWD
YLQTFAWAMAALMLAGALPVMRMIRNTPMKSLRDAL

Sequences:

>Translated_836_residues
MRKLHCIWMAEFAYKEGNCMLWPVVKALLGHYRRYPLQIILVWLGLTLGVSLLVGVTAINQHAKQSYTHGEKLFSNPLPY
RIRPKHNANKIPQGFYIQLRREGFQQCSPFDHHSITDENGANFMLIGIDPVSMLQLQPGAALKELTTLDLMKPPYPILVS
DDLAEHMEWKDGDYIPLMDGSELGPVVVDQNNLINGTRLIADISLLRMLKRSAGLSVIACSDMSPEKFERLKNMLPNGLT
ISRSSKAELESLTSAFHLNLKAMGMLSFVVGLFIFYQAMSLSFIQRQPLVGILRQTGVSGWQLTKALCLELLLLVLLSWI
CGNVFGVMLANQLLPAVSSSLGDLYDANVGLTLSWSWRWSGYSLLMALLGAFLACAWPLVRLLRSQPIRLSSRLSLMRFA
GTEFTWQALIGCGFLVAAVAVYQAPQTQESGFAIIALMLVSVALFTPFLMWKLFNSLSYSLRWVRARWFFADAASSMSYR
GVATMAFMLALTANIGVETMVGSFRDTTDKWLTQRLAADLYIYPTNNAAARMSNWLSEQPEVDSVWWRWEKDVASPVGST
QVVSTGPSEGELEALTIKLGIPNYWYHLHHSKGVLISESMSLKLGIRPGDYIDLYDSLGSGWQVVGVYYDYGNPYHQVMM
SHRNWLSGFAGRGNVGLGVILKDDVNSVGLRSRLESVFRLGSERIFDNNNIHSQAMRVFDRTFAIADTLGNITLVIAVFG
IFFATVAGEVSRQRHISLQRCLGVSAKELIFTGSLQLFVFGLISSLIAIPLGLALASLIVDIVIKQSFGWSLELQVIPWD
YLQTFAWAMAALMLAGALPVMRMIRNTPMKSLRDAL
>Mature_836_residues
MRKLHCIWMAEFAYKEGNCMLWPVVKALLGHYRRYPLQIILVWLGLTLGVSLLVGVTAINQHAKQSYTHGEKLFSNPLPY
RIRPKHNANKIPQGFYIQLRREGFQQCSPFDHHSITDENGANFMLIGIDPVSMLQLQPGAALKELTTLDLMKPPYPILVS
DDLAEHMEWKDGDYIPLMDGSELGPVVVDQNNLINGTRLIADISLLRMLKRSAGLSVIACSDMSPEKFERLKNMLPNGLT
ISRSSKAELESLTSAFHLNLKAMGMLSFVVGLFIFYQAMSLSFIQRQPLVGILRQTGVSGWQLTKALCLELLLLVLLSWI
CGNVFGVMLANQLLPAVSSSLGDLYDANVGLTLSWSWRWSGYSLLMALLGAFLACAWPLVRLLRSQPIRLSSRLSLMRFA
GTEFTWQALIGCGFLVAAVAVYQAPQTQESGFAIIALMLVSVALFTPFLMWKLFNSLSYSLRWVRARWFFADAASSMSYR
GVATMAFMLALTANIGVETMVGSFRDTTDKWLTQRLAADLYIYPTNNAAARMSNWLSEQPEVDSVWWRWEKDVASPVGST
QVVSTGPSEGELEALTIKLGIPNYWYHLHHSKGVLISESMSLKLGIRPGDYIDLYDSLGSGWQVVGVYYDYGNPYHQVMM
SHRNWLSGFAGRGNVGLGVILKDDVNSVGLRSRLESVFRLGSERIFDNNNIHSQAMRVFDRTFAIADTLGNITLVIAVFG
IFFATVAGEVSRQRHISLQRCLGVSAKELIFTGSLQLFVFGLISSLIAIPLGLALASLIVDIVIKQSFGWSLELQVIPWD
YLQTFAWAMAALMLAGALPVMRMIRNTPMKSLRDAL

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 93224; Mature: 93224

Theoretical pI: Translated: 8.80; Mature: 8.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRKLHCIWMAEFAYKEGNCMLWPVVKALLGHYRRYPLQIILVWLGLTLGVSLLVGVTAIN
CCCEEEEEEEEHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QHAKQSYTHGEKLFSNPLPYRIRPKHNANKIPQGFYIQLRREGFQQCSPFDHHSITDENG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
ANFMLIGIDPVSMLQLQPGAALKELTTLDLMKPPYPILVSDDLAEHMEWKDGDYIPLMDG
CEEEEEECCCHHHEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHCCCCCCCEEEECCC
SELGPVVVDQNNLINGTRLIADISLLRMLKRSAGLSVIACSDMSPEKFERLKNMLPNGLT
CCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCEE
ISRSSKAELESLTSAFHLNLKAMGMLSFVVGLFIFYQAMSLSFIQRQPLVGILRQTGVSG
ECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCH
WQLTKALCLELLLLVLLSWICGNVFGVMLANQLLPAVSSSLGDLYDANVGLTLSWSWRWS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCC
GYSLLMALLGAFLACAWPLVRLLRSQPIRLSSRLSLMRFAGTEFTWQALIGCGFLVAAVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VYQAPQTQESGFAIIALMLVSVALFTPFLMWKLFNSLSYSLRWVRARWFFADAASSMSYR
HHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GVATMAFMLALTANIGVETMVGSFRDTTDKWLTQRLAADLYIYPTNNAAARMSNWLSEQP
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCC
EVDSVWWRWEKDVASPVGSTQVVSTGPSEGELEALTIKLGIPNYWYHLHHSKGVLISESM
CCCHHHHEECHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCEEEECCC
SLKLGIRPGDYIDLYDSLGSGWQVVGVYYDYGNPYHQVMMSHRNWLSGFAGRGNVGLGVI
EEEEECCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEE
LKDDVNSVGLRSRLESVFRLGSERIFDNNNIHSQAMRVFDRTFAIADTLGNITLVIAVFG
EECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFFATVAGEVSRQRHISLQRCLGVSAKELIFTGSLQLFVFGLISSLIAIPLGLALASLIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DIVIKQSFGWSLELQVIPWDYLQTFAWAMAALMLAGALPVMRMIRNTPMKSLRDAL
HHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MRKLHCIWMAEFAYKEGNCMLWPVVKALLGHYRRYPLQIILVWLGLTLGVSLLVGVTAIN
CCCEEEEEEEEHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QHAKQSYTHGEKLFSNPLPYRIRPKHNANKIPQGFYIQLRREGFQQCSPFDHHSITDENG
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CEEEEEECCCHHHEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHCCCCCCCEEEECCC
SELGPVVVDQNNLINGTRLIADISLLRMLKRSAGLSVIACSDMSPEKFERLKNMLPNGLT
CCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCEE
ISRSSKAELESLTSAFHLNLKAMGMLSFVVGLFIFYQAMSLSFIQRQPLVGILRQTGVSG
ECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCH
WQLTKALCLELLLLVLLSWICGNVFGVMLANQLLPAVSSSLGDLYDANVGLTLSWSWRWS
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GYSLLMALLGAFLACAWPLVRLLRSQPIRLSSRLSLMRFAGTEFTWQALIGCGFLVAAVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VYQAPQTQESGFAIIALMLVSVALFTPFLMWKLFNSLSYSLRWVRARWFFADAASSMSYR
HHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GVATMAFMLALTANIGVETMVGSFRDTTDKWLTQRLAADLYIYPTNNAAARMSNWLSEQP
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EVDSVWWRWEKDVASPVGSTQVVSTGPSEGELEALTIKLGIPNYWYHLHHSKGVLISESM
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SLKLGIRPGDYIDLYDSLGSGWQVVGVYYDYGNPYHQVMMSHRNWLSGFAGRGNVGLGVI
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LKDDVNSVGLRSRLESVFRLGSERIFDNNNIHSQAMRVFDRTFAIADTLGNITLVIAVFG
EECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFFATVAGEVSRQRHISLQRCLGVSAKELIFTGSLQLFVFGLISSLIAIPLGLALASLIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DIVIKQSFGWSLELQVIPWDYLQTFAWAMAALMLAGALPVMRMIRNTPMKSLRDAL
HHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA