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The map label for this gene is 218709523

Identifier: 218709523

GI number: 218709523

Start: 1668675

End: 1670099

Strand: Direct

Name: 218709523

Synonym: VS_1532

Alternate gene names: NA

Gene position: 1668675-1670099 (Clockwise)

Preceding gene: 218709522

Following gene: 218709524

Centisome position: 50.58

GC content: 43.93

Gene sequence:

>1425_bases
ATGAATAATCTTAAGTTACGCTTACTAGTCATCCTAAATGCCATGTGGCGCCAACGCTACGTTATTGTTCTACCAATCTT
TATTTTGCCCTTTGTTGGCTTTGGTGTGAGCAAGTTGGCCCCGACTAAATATGACGCGCATACCAGTATGTTGATTCAAG
AAACAGCCAAGATGAATCCATTTTTGGAAGACATCGCCGTCTCTACCATGCTCAAAGATCGACTTAACGCATTGAGAACA
TTGCTTCACAGTCGACACGTTCTTTACTCGGTCGCTGATGAACTGCAATTAACCACACCAGATATGCCTGAGGTTGAGAA
ACAAGAGATCATTACTGACTTGTCTCAGCGTTTATCAGTTACTCAACTTGGAAAAGACTTTCTAAAGATAAGCTTAACGT
CGAACACTCCAAATGGAATGGAACAAACGCTTCGAGCGGTGAGTGAACATTTTATTGAACAGCTGCTCGCGCCGGAACGC
TCGTCAATTGAGGACTCAAGTAATTTCTTGAAAATCCATATAGACAAACGCAGCGCGGAACTTGAAGAGGCAGAAGAAGC
GCTAGCCGCATACATGAACGAAAACGTCCAATCGACGCCTGAGGTACAGAGCCAAAGTTTGAATCGCTTAGCGTCACTCA
AACAAACACTGGCGGAAAAAGAAGCTGAGTTATCCGGTGTTGAAAAAAGCTTAGGGTCAATCGATCAACAGCTTTCAAAA
ACCAACCCCGTGATAGGTCGAATAGAAGATCAGATCATCGACATTCGCAGTGAGCTGACTCTGCTGCAAGCCAAATACAC
AAATAAACACAGTGCCGTACAAGCTAAAGTCCGTGAATTAGACAGGCTTGAAAATGAGCGAAAAAGTTTGCTCGAGGTAA
CCCAGCCAACGATGAACAGCGACCAGCTTTGGGACATCGCAAGTAGCACGACACTAAACAAGCTTTCTGATACCCAACCT
CTTCTGGTCACTCAATTACACAGCCTACAACTGGTTCGTGCTCGCTTTGAGTCTTTAACTGAAGAGACCAAAAGCCTTCG
TACTATGATTTTCGAATTAGAACACAAGGCGAATAACTTCGGTGAAAATGCCAAAGAGATGTACCGCCTTAAACGTCAAG
TTGAAATCAAGCGTCAACTATATGATGAACTGACAGAGCGTTATGAAATGGCTCAGCTAACGGGTTCGCTTGGTGTATTC
GAGCAAAACAAACGTGTGAAGATTATCGATTTGCCTTTCACGCCTAGCATGAAATCTAACATGCCGACTTTTATCTTTAT
TCTGGCTGGATTTGTTGCGGGCATCGGATTGGGCATTGGTCTGGCGGTATTGTTCGAGCTGTTTGACTCTTCAATCAAGC
GTAAAGACGAAATCGAAGAGATCTTAGGTGTCCCTGTGATAACGGTGATACCTAAAATGGGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGATCATGCACGCCAGCTGAGCAATTCACCGATCTCTGTCGTCGAACAAGAGAGCTGGCAGAACCGTGGTAACTTCGTA
CATTGGATGTTGGAGCTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAGCCTCAAAGGTATTTTAAACTTGCTAGCCTCGTAGCTTCTTAGCTTCTTCTTGTCTTTTTTGCTTCCTAGCACTAAA
CGCCAACATTCGCTTGGCGT

Product: putative polysaccharide export protein

Products: NA

Alternate protein names: Polysaccharide Chain Length Determinant Protein; Polysaccharide Export Protein; Chain Length Regulator; Chain Length Determinant Family Protein

Number of amino acids: Translated: 474; Mature: 474

Protein sequence:

>474_residues
MNNLKLRLLVILNAMWRQRYVIVLPIFILPFVGFGVSKLAPTKYDAHTSMLIQETAKMNPFLEDIAVSTMLKDRLNALRT
LLHSRHVLYSVADELQLTTPDMPEVEKQEIITDLSQRLSVTQLGKDFLKISLTSNTPNGMEQTLRAVSEHFIEQLLAPER
SSIEDSSNFLKIHIDKRSAELEEAEEALAAYMNENVQSTPEVQSQSLNRLASLKQTLAEKEAELSGVEKSLGSIDQQLSK
TNPVIGRIEDQIIDIRSELTLLQAKYTNKHSAVQAKVRELDRLENERKSLLEVTQPTMNSDQLWDIASSTTLNKLSDTQP
LLVTQLHSLQLVRARFESLTEETKSLRTMIFELEHKANNFGENAKEMYRLKRQVEIKRQLYDELTERYEMAQLTGSLGVF
EQNKRVKIIDLPFTPSMKSNMPTFIFILAGFVAGIGLGIGLAVLFELFDSSIKRKDEIEEILGVPVITVIPKMG

Sequences:

>Translated_474_residues
MNNLKLRLLVILNAMWRQRYVIVLPIFILPFVGFGVSKLAPTKYDAHTSMLIQETAKMNPFLEDIAVSTMLKDRLNALRT
LLHSRHVLYSVADELQLTTPDMPEVEKQEIITDLSQRLSVTQLGKDFLKISLTSNTPNGMEQTLRAVSEHFIEQLLAPER
SSIEDSSNFLKIHIDKRSAELEEAEEALAAYMNENVQSTPEVQSQSLNRLASLKQTLAEKEAELSGVEKSLGSIDQQLSK
TNPVIGRIEDQIIDIRSELTLLQAKYTNKHSAVQAKVRELDRLENERKSLLEVTQPTMNSDQLWDIASSTTLNKLSDTQP
LLVTQLHSLQLVRARFESLTEETKSLRTMIFELEHKANNFGENAKEMYRLKRQVEIKRQLYDELTERYEMAQLTGSLGVF
EQNKRVKIIDLPFTPSMKSNMPTFIFILAGFVAGIGLGIGLAVLFELFDSSIKRKDEIEEILGVPVITVIPKMG
>Mature_474_residues
MNNLKLRLLVILNAMWRQRYVIVLPIFILPFVGFGVSKLAPTKYDAHTSMLIQETAKMNPFLEDIAVSTMLKDRLNALRT
LLHSRHVLYSVADELQLTTPDMPEVEKQEIITDLSQRLSVTQLGKDFLKISLTSNTPNGMEQTLRAVSEHFIEQLLAPER
SSIEDSSNFLKIHIDKRSAELEEAEEALAAYMNENVQSTPEVQSQSLNRLASLKQTLAEKEAELSGVEKSLGSIDQQLSK
TNPVIGRIEDQIIDIRSELTLLQAKYTNKHSAVQAKVRELDRLENERKSLLEVTQPTMNSDQLWDIASSTTLNKLSDTQP
LLVTQLHSLQLVRARFESLTEETKSLRTMIFELEHKANNFGENAKEMYRLKRQVEIKRQLYDELTERYEMAQLTGSLGVF
EQNKRVKIIDLPFTPSMKSNMPTFIFILAGFVAGIGLGIGLAVLFELFDSSIKRKDEIEEILGVPVITVIPKMG

Specific function: Unknown

COG id: COG3206

COG function: function code M; Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53757; Mature: 53757

Theoretical pI: Translated: 5.58; Mature: 5.58

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNLKLRLLVILNAMWRQRYVIVLPIFILPFVGFGVSKLAPTKYDAHTSMLIQETAKMNP
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCH
FLEDIAVSTMLKDRLNALRTLLHSRHVLYSVADELQLTTPDMPEVEKQEIITDLSQRLSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TQLGKDFLKISLTSNTPNGMEQTLRAVSEHFIEQLLAPERSSIEDSSNFLKIHIDKRSAE
HHHCHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHH
LEEAEEALAAYMNENVQSTPEVQSQSLNRLASLKQTLAEKEAELSGVEKSLGSIDQQLSK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TNPVIGRIEDQIIDIRSELTLLQAKYTNKHSAVQAKVRELDRLENERKSLLEVTQPTMNS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DQLWDIASSTTLNKLSDTQPLLVTQLHSLQLVRARFESLTEETKSLRTMIFELEHKANNF
CHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GENAKEMYRLKRQVEIKRQLYDELTERYEMAQLTGSLGVFEQNKRVKIIDLPFTPSMKSN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCEEEEECCCCCCCCCC
MPTFIFILAGFVAGIGLGIGLAVLFELFDSSIKRKDEIEEILGVPVITVIPKMG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNNLKLRLLVILNAMWRQRYVIVLPIFILPFVGFGVSKLAPTKYDAHTSMLIQETAKMNP
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCH
FLEDIAVSTMLKDRLNALRTLLHSRHVLYSVADELQLTTPDMPEVEKQEIITDLSQRLSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TQLGKDFLKISLTSNTPNGMEQTLRAVSEHFIEQLLAPERSSIEDSSNFLKIHIDKRSAE
HHHCHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHH
LEEAEEALAAYMNENVQSTPEVQSQSLNRLASLKQTLAEKEAELSGVEKSLGSIDQQLSK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TNPVIGRIEDQIIDIRSELTLLQAKYTNKHSAVQAKVRELDRLENERKSLLEVTQPTMNS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DQLWDIASSTTLNKLSDTQPLLVTQLHSLQLVRARFESLTEETKSLRTMIFELEHKANNF
CHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GENAKEMYRLKRQVEIKRQLYDELTERYEMAQLTGSLGVFEQNKRVKIIDLPFTPSMKSN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCEEEEECCCCCCCCCC
MPTFIFILAGFVAGIGLGIGLAVLFELFDSSIKRKDEIEEILGVPVITVIPKMG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA